MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_015865	ATG	2	6	729840	729845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581846
15003	NC_015865	TCT	2	6	729853	729858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581846
15004	NC_015865	GTA	2	6	729977	729982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581846
15005	NC_015865	GA	3	6	729984	729989	50 %	0 %	50 %	0 %	341581846
15006	NC_015865	ACG	3	9	729999	730007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581846
15007	NC_015865	GCCG	2	8	730026	730033	0 %	0 %	50 %	50 %	341581846
15008	NC_015865	TTG	2	6	730044	730049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581846
15009	NC_015865	CGA	2	6	730057	730062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581846
15010	NC_015865	AGT	2	6	730063	730068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581846
15011	NC_015865	TGC	2	6	730192	730197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581846
15012	NC_015865	CTT	2	6	730247	730252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581846
15013	NC_015865	C	6	6	730325	730330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15014	NC_015865	GAG	2	6	730438	730443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581847
15015	NC_015865	GTG	2	6	730465	730470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581847
15016	NC_015865	CAG	2	6	730496	730501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581847
15017	NC_015865	GCC	2	6	730552	730557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581847
15018	NC_015865	CTT	2	6	730564	730569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581847
15019	NC_015865	TAT	2	6	730585	730590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581847
15020	NC_015865	GTA	2	6	730630	730635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581847
15021	NC_015865	GTCC	2	8	730665	730672	0 %	25 %	25 %	50 %	341581847
15022	NC_015865	GAC	2	6	730675	730680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581847
15023	NC_015865	GCA	2	6	730769	730774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581847
15024	NC_015865	GGTG	2	8	730869	730876	0 %	25 %	75 %	0 %	341581847
15025	NC_015865	TCA	2	6	730911	730916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581847
15026	NC_015865	GTA	2	6	730942	730947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581847
15027	NC_015865	AG	3	6	730980	730985	50 %	0 %	50 %	0 %	341581847
15028	NC_015865	CTC	2	6	731032	731037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581847
15029	NC_015865	CGT	2	6	731085	731090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581847
15030	NC_015865	GTT	2	6	731167	731172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581847
15031	NC_015865	CCG	2	6	731327	731332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581847
15032	NC_015865	GC	3	6	731408	731413	0 %	0 %	50 %	50 %	341581847
15033	NC_015865	GAT	2	6	731443	731448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581847
15034	NC_015865	TCG	2	6	731459	731464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581847
15035	NC_015865	GTC	2	6	731479	731484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581847
15036	NC_015865	CCTT	2	8	731514	731521	0 %	50 %	0 %	50 %	341581847
15037	NC_015865	TCG	2	6	731576	731581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581847
15038	NC_015865	ATC	2	6	731585	731590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581847
15039	NC_015865	GT	3	6	731621	731626	0 %	50 %	50 %	0 %	341581847
15040	NC_015865	AGG	2	6	731831	731836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581847
15041	NC_015865	CCCT	2	8	731855	731862	0 %	25 %	0 %	75 %	341581847
15042	NC_015865	CTC	2	6	731878	731883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581847
15043	NC_015865	GGCC	2	8	731943	731950	0 %	0 %	50 %	50 %	341581847
15044	NC_015865	GTGG	2	8	731962	731969	0 %	25 %	75 %	0 %	341581847
15045	NC_015865	CGT	2	6	731977	731982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581847
15046	NC_015865	CTC	2	6	732022	732027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581847
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15050	NC_015865	CTGC	2	8	732397	732404	0 %	25 %	25 %	50 %	341581847
15051	NC_015865	CT	3	6	732410	732415	0 %	50 %	0 %	50 %	341581847
15052	NC_015865	CCTG	2	8	732420	732427	0 %	25 %	25 %	50 %	341581847
15053	NC_015865	TCGC	2	8	732479	732486	0 %	25 %	25 %	50 %	341581847
15054	NC_015865	GCC	2	6	732520	732525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581847
15055	NC_015865	CT	3	6	732620	732625	0 %	50 %	0 %	50 %	341581847
15056	NC_015865	ATC	2	6	732679	732684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581847
15057	NC_015865	GGA	2	6	732690	732695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581847
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15059	NC_015865	CAG	2	6	732724	732729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581847
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15062	NC_015865	ACC	2	6	732911	732916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15063	NC_015865	AT	3	6	732918	732923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_015865	AAG	2	6	733076	733081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581848
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15085	NC_015865	AGCC	2	8	734163	734170	25 %	0 %	25 %	50 %	341581848
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15102	NC_015865	ATT	2	6	734985	734990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_015865	AGG	2	6	735001	735006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15105	NC_015865	GAT	2	6	735193	735198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581849
15106	NC_015865	TTC	2	6	735203	735208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581849
15107	NC_015865	AGGC	2	8	735249	735256	25 %	0 %	50 %	25 %	341581849
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15110	NC_015865	CAA	2	6	735352	735357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581849
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15115	NC_015865	CCCA	2	8	735533	735540	25 %	0 %	0 %	75 %	341581849
15116	NC_015865	ACG	3	9	735561	735569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581849
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15119	NC_015865	ACG	2	6	735771	735776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581849
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15121	NC_015865	CTG	2	6	735833	735838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581849
15122	NC_015865	CGGA	2	8	735848	735855	25 %	0 %	50 %	25 %	341581849
15123	NC_015865	CGG	2	6	735880	735885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581849
15124	NC_015865	GTGC	2	8	735907	735914	0 %	25 %	50 %	25 %	341581849
15125	NC_015865	GGC	2	6	735918	735923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581849
15126	NC_015865	GAC	2	6	735953	735958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581849
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15161	NC_015865	TCA	2	6	737672	737677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15163	NC_015865	GAG	2	6	737799	737804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15182	NC_015865	GGA	2	6	738646	738651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581852
15183	NC_015865	CTGCC	2	10	738660	738669	0 %	20 %	20 %	60 %	341581852
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15226	NC_015865	GAC	2	6	740667	740672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581854
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15229	NC_015865	G	6	6	740838	740843	0 %	0 %	100 %	0 %	341581855
15230	NC_015865	CCT	2	6	740994	740999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581855
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15234	NC_015865	CTG	2	6	741206	741211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581855
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15237	NC_015865	AAC	2	6	741418	741423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581855
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15239	NC_015865	TCC	2	6	741473	741478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581855
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15477	NC_015865	GCC	2	6	751942	751947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581865
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15480	NC_015865	GTA	2	6	752069	752074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581865
15481	NC_015865	GAG	2	6	752186	752191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581865
15482	NC_015865	ACA	2	6	752214	752219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581865
15483	NC_015865	ACC	2	6	752250	752255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15484	NC_015865	GTT	2	6	752263	752268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581866
15485	NC_015865	CT	3	6	752311	752316	0 %	50 %	0 %	50 %	341581866
15486	NC_015865	CTC	2	6	752419	752424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581866
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15488	NC_015865	C	6	6	752470	752475	0 %	0 %	0 %	100 %	341581866
15489	NC_015865	ACG	2	6	752480	752485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581866
15490	NC_015865	CCCG	2	8	752502	752509	0 %	0 %	25 %	75 %	341581866
15491	NC_015865	CCT	2	6	752535	752540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581866
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15493	NC_015865	CTC	2	6	752623	752628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581866
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15500	NC_015865	TCA	2	6	752889	752894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581866

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