MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015865	AGG	2	6	683455	683460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581802
14002	NC_015865	GAA	2	6	683468	683473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581802
14003	NC_015865	GAC	2	6	683511	683516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581802
14004	NC_015865	CCG	2	6	683523	683528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581802
14005	NC_015865	ACC	2	6	683583	683588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581802
14006	NC_015865	AAC	2	6	683654	683659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581802
14007	NC_015865	TCA	2	6	683664	683669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581802
14008	NC_015865	ACCA	2	8	683684	683691	50 %	0 %	0 %	50 %	341581802
14009	NC_015865	CTT	2	6	683825	683830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581803
14010	NC_015865	TCG	2	6	683832	683837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581803
14011	NC_015865	TCT	2	6	683904	683909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581803
14012	NC_015865	CTG	2	6	683977	683982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581803
14013	NC_015865	ATG	2	6	683994	683999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581803
14014	NC_015865	CTT	2	6	684016	684021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581803
14015	NC_015865	CCT	2	6	684040	684045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581803
14016	NC_015865	C	6	6	684076	684081	0 %	0 %	0 %	100 %	341581803
14017	NC_015865	AAG	2	6	684287	684292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581803
14018	NC_015865	TTC	2	6	684329	684334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581803
14019	NC_015865	GTT	2	6	684383	684388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581803
14020	NC_015865	GAA	2	6	684439	684444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581803
14021	NC_015865	CAA	2	6	684591	684596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581803
14022	NC_015865	CAAA	2	8	684609	684616	75 %	0 %	0 %	25 %	341581803
14023	NC_015865	CAAC	2	8	684627	684634	50 %	0 %	0 %	50 %	341581803
14024	NC_015865	GCC	2	6	684683	684688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581803
14025	NC_015865	CTG	2	6	684701	684706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581803
14026	NC_015865	AGA	2	6	684707	684712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581803
14027	NC_015865	AGAA	2	8	684736	684743	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_015865	CTT	2	6	684753	684758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581804
14029	NC_015865	AGCG	2	8	684848	684855	25 %	0 %	50 %	25 %	341581804
14030	NC_015865	GAA	2	6	684870	684875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581804
14031	NC_015865	TCG	2	6	684883	684888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581804
14032	NC_015865	CTT	2	6	684942	684947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581804
14033	NC_015865	GTA	2	6	684948	684953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581804
14034	NC_015865	GGA	2	6	684983	684988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581804
14035	NC_015865	CTTGGC	2	12	685008	685019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581804
14036	NC_015865	TGA	2	6	685037	685042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581804
14037	NC_015865	CGT	2	6	685073	685078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581804
14038	NC_015865	GAG	2	6	685083	685088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581804
14039	NC_015865	CCT	2	6	685103	685108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581804
14040	NC_015865	GAG	2	6	685218	685223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581804
14041	NC_015865	CTC	2	6	685224	685229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581804
14042	NC_015865	CTT	3	9	685236	685244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581804
14043	NC_015865	CTC	2	6	685254	685259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581804
14044	NC_015865	CTC	2	6	685278	685283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581804
14045	NC_015865	GGCT	2	8	685342	685349	0 %	25 %	50 %	25 %	341581804
14046	NC_015865	CTT	2	6	685362	685367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581804
14047	NC_015865	CGT	2	6	685385	685390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581804
14048	NC_015865	CCG	2	6	685430	685435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581804
14049	NC_015865	ACC	3	9	685543	685551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14050	NC_015865	TCA	2	6	685577	685582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_015865	T	6	6	685591	685596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_015865	TGT	2	6	685602	685607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_015865	TAC	2	6	685691	685696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_015865	CAAC	2	8	685863	685870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14055	NC_015865	GAAA	2	8	685872	685879	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_015865	ATT	2	6	685881	685886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581805
14057	NC_015865	CCT	2	6	685941	685946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581805
14058	NC_015865	CTC	2	6	685963	685968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581805
14059	NC_015865	CAT	2	6	685978	685983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581805
14060	NC_015865	CTC	2	6	685984	685989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581805
14061	NC_015865	CTT	2	6	686080	686085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581805
14062	NC_015865	GTA	2	6	686107	686112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581805
14063	NC_015865	GGA	2	6	686118	686123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581805
14064	NC_015865	CGTA	2	8	686142	686149	25 %	25 %	25 %	25 %	341581805
14065	NC_015865	GGCC	2	8	686153	686160	0 %	0 %	50 %	50 %	341581805
14066	NC_015865	TCA	2	6	686175	686180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581805
14067	NC_015865	TAT	2	6	686185	686190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581805
14068	NC_015865	CTT	2	6	686230	686235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581805
14069	NC_015865	CGG	2	6	686290	686295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581805
14070	NC_015865	CTC	2	6	686297	686302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581805
14071	NC_015865	CAA	2	6	686322	686327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581805
14072	NC_015865	CTT	2	6	686425	686430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581805
14073	NC_015865	TTC	2	6	686471	686476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581805
14074	NC_015865	GGA	2	6	686484	686489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581805
14075	NC_015865	CTC	2	6	686563	686568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581805
14076	NC_015865	CTC	2	6	686593	686598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581805
14077	NC_015865	GGT	2	6	686670	686675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581805
14078	NC_015865	TGA	2	6	686679	686684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581805
14079	NC_015865	CGG	2	6	686782	686787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581805
14080	NC_015865	CGG	2	6	686842	686847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581805
14081	NC_015865	CCCAG	2	10	686961	686970	20 %	0 %	20 %	60 %	341581805
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14085	NC_015865	GACA	2	8	687339	687346	50 %	0 %	25 %	25 %	341581805
14086	NC_015865	TCC	2	6	687353	687358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581805
14087	NC_015865	TGA	2	6	687371	687376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581805
14088	NC_015865	TCA	2	6	687440	687445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581805
14089	NC_015865	TCGT	2	8	687467	687474	0 %	50 %	25 %	25 %	341581805
14090	NC_015865	CGC	2	6	687495	687500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581805
14091	NC_015865	CAT	2	6	687517	687522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581805
14092	NC_015865	GAA	2	6	687583	687588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581805
14093	NC_015865	TCG	2	6	687728	687733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581805
14094	NC_015865	TCTG	2	8	687786	687793	0 %	50 %	25 %	25 %	341581805
14095	NC_015865	AGG	2	6	687794	687799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581805
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14099	NC_015865	CTC	2	6	688004	688009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581805
14100	NC_015865	CCT	2	6	688135	688140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581805
14101	NC_015865	TCG	2	6	688178	688183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581805
14102	NC_015865	GAG	2	6	688207	688212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581805
14103	NC_015865	GGTC	2	8	688231	688238	0 %	25 %	50 %	25 %	341581805
14104	NC_015865	GTA	2	6	688333	688338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581805
14105	NC_015865	CTC	2	6	688456	688461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581805
14106	NC_015865	AGCCC	2	10	688467	688476	20 %	0 %	20 %	60 %	341581805
14107	NC_015865	GATC	2	8	688479	688486	25 %	25 %	25 %	25 %	341581805
14108	NC_015865	C	7	7	688502	688508	0 %	0 %	0 %	100 %	341581805
14109	NC_015865	TCC	2	6	688529	688534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581805
14110	NC_015865	TAGG	2	8	688564	688571	25 %	25 %	50 %	0 %	341581805
14111	NC_015865	AGC	2	6	688622	688627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581805
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14114	NC_015865	TC	3	6	688765	688770	0 %	50 %	0 %	50 %	341581805
14115	NC_015865	TCG	2	6	688853	688858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581805
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14118	NC_015865	TGCC	2	8	688946	688953	0 %	25 %	25 %	50 %	341581805
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14120	NC_015865	CTT	2	6	689053	689058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581805
14121	NC_015865	GTA	2	6	689074	689079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581805
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14131	NC_015865	GTTC	2	8	689641	689648	0 %	50 %	25 %	25 %	341581806
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14139	NC_015865	TCC	2	6	690206	690211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14140	NC_015865	GGT	2	6	690229	690234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14227	NC_015865	GGGAA	2	10	694505	694514	40 %	0 %	60 %	0 %	341581811
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14233	NC_015865	A	6	6	694685	694690	100 %	0 %	0 %	0 %	341581811
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14238	NC_015865	AG	3	6	694916	694921	50 %	0 %	50 %	0 %	341581811
14239	NC_015865	ACG	2	6	694950	694955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581811
14240	NC_015865	TGA	2	6	695089	695094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581811
14241	NC_015865	TA	3	6	695159	695164	50 %	50 %	0 %	0 %	341581811
14242	NC_015865	G	6	6	695215	695220	0 %	0 %	100 %	0 %	341581811
14243	NC_015865	GAAAG	2	10	695286	695295	60 %	0 %	40 %	0 %	341581811
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14245	NC_015865	A	6	6	695474	695479	100 %	0 %	0 %	0 %	341581811
14246	NC_015865	GAA	2	6	695524	695529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581811
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14248	NC_015865	TCA	3	9	695635	695643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581811
14249	NC_015865	GTTG	2	8	695677	695684	0 %	50 %	50 %	0 %	341581811
14250	NC_015865	TGG	2	6	695767	695772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581811
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14253	NC_015865	T	7	7	695933	695939	0 %	100 %	0 %	0 %	341581812
14254	NC_015865	TTG	2	6	695968	695973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581812
14255	NC_015865	TGA	2	6	695987	695992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581812
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14260	NC_015865	A	6	6	696194	696199	100 %	0 %	0 %	0 %	341581812
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14263	NC_015865	A	6	6	696284	696289	100 %	0 %	0 %	0 %	341581812
14264	NC_015865	GAAA	2	8	696290	696297	75 %	0 %	25 %	0 %	341581812
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14270	NC_015865	TA	3	6	696612	696617	50 %	50 %	0 %	0 %	341581812
14271	NC_015865	GAGATG	2	12	696624	696635	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	341581812
14272	NC_015865	CTT	2	6	696650	696655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581812
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14292	NC_015865	ACC	2	6	697478	697483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581814
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14295	NC_015865	GA	3	6	697586	697591	50 %	0 %	50 %	0 %	341581814
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14300	NC_015865	CGT	2	6	698065	698070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581814
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14302	NC_015865	TCCT	2	8	698314	698321	0 %	50 %	0 %	50 %	341581815
14303	NC_015865	CTA	2	6	698388	698393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581815
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14307	NC_015865	AAGAAA	2	12	698540	698551	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	341581815
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14309	NC_015865	TACA	2	8	698591	698598	50 %	25 %	0 %	25 %	341581815
14310	NC_015865	CATA	2	8	698706	698713	50 %	25 %	0 %	25 %	341581815
14311	NC_015865	CA	3	6	698790	698795	50 %	0 %	0 %	50 %	341581815
14312	NC_015865	TTC	2	6	698815	698820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581815
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14314	NC_015865	TAC	2	6	698888	698893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581815
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14326	NC_015865	GGT	3	9	699494	699502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14327	NC_015865	ACATCT	2	12	699618	699629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581817
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14340	NC_015865	AGG	2	6	700308	700313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581817
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14342	NC_015865	TGG	2	6	700326	700331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581817
14343	NC_015865	GAG	2	6	700343	700348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581817
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14345	NC_015865	AACG	2	8	700381	700388	50 %	0 %	25 %	25 %	341581817
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14347	NC_015865	CGGT	2	8	700450	700457	0 %	25 %	50 %	25 %	341581817
14348	NC_015865	TGG	2	6	700467	700472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581817
14349	NC_015865	GGT	2	6	700484	700489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14350	NC_015865	GAG	2	6	700514	700519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581818
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14352	NC_015865	GGC	2	6	700606	700611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581818
14353	NC_015865	TCG	2	6	700662	700667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581818
14354	NC_015865	GAC	2	6	700709	700714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581818
14355	NC_015865	TGC	2	6	700825	700830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581818
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14357	NC_015865	GGAAA	2	10	700922	700931	60 %	0 %	40 %	0 %	341581818
14358	NC_015865	GAG	2	6	701111	701116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581818
14359	NC_015865	TCC	2	6	701161	701166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581819
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14485	NC_015865	GGA	2	6	707852	707857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581825
14486	NC_015865	AGC	2	6	707891	707896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581825
14487	NC_015865	CGA	2	6	707897	707902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581825
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14489	NC_015865	CGC	3	9	707942	707950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581825
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14491	NC_015865	GGC	2	6	708066	708071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581825
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