MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015865	GACC	2	8	658382	658389	25 %	0 %	25 %	50 %	341581774
13502	NC_015865	AGA	2	6	658470	658475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_015865	CCT	2	6	658563	658568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581775
13504	NC_015865	CCT	2	6	658590	658595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581775
13505	NC_015865	GAG	2	6	658762	658767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581775
13506	NC_015865	CCCA	2	8	658784	658791	25 %	0 %	0 %	75 %	341581775
13507	NC_015865	AGG	2	6	658828	658833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581775
13508	NC_015865	AGG	2	6	658855	658860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581775
13509	NC_015865	AAG	2	6	658895	658900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581775
13510	NC_015865	GAG	2	6	658981	658986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581775
13511	NC_015865	GCC	2	6	658991	658996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581775
13512	NC_015865	TCA	2	6	658997	659002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581775
13513	NC_015865	CGA	2	6	659016	659021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581775
13514	NC_015865	TCG	2	6	659033	659038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581775
13515	NC_015865	GGA	2	6	659109	659114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581775
13516	NC_015865	A	6	6	659170	659175	100 %	0 %	0 %	0 %	341581775
13517	NC_015865	GA	3	6	659197	659202	50 %	0 %	50 %	0 %	341581775
13518	NC_015865	GA	3	6	659361	659366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_015865	GA	4	8	659385	659392	50 %	0 %	50 %	0 %	341581776
13520	NC_015865	GAA	2	6	659394	659399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581776
13521	NC_015865	GGC	2	6	659472	659477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581776
13522	NC_015865	GGC	2	6	659497	659502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581776
13523	NC_015865	GAA	2	6	659574	659579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581776
13524	NC_015865	CTG	2	6	659581	659586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581776
13525	NC_015865	AGC	2	6	659717	659722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581776
13526	NC_015865	GATAC	2	10	659736	659745	40 %	20 %	20 %	20 %	341581776
13527	NC_015865	CG	3	6	659747	659752	0 %	0 %	50 %	50 %	341581776
13528	NC_015865	GCAG	2	8	659777	659784	25 %	0 %	50 %	25 %	341581776
13529	NC_015865	TCA	2	6	659807	659812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581776
13530	NC_015865	CGA	2	6	659823	659828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581776
13531	NC_015865	GTC	2	6	659875	659880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581776
13532	NC_015865	GGT	2	6	659898	659903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581776
13533	NC_015865	CTC	2	6	659938	659943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581776
13534	NC_015865	CCAGA	2	10	659960	659969	40 %	0 %	20 %	40 %	341581776
13535	NC_015865	CAC	2	6	659988	659993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581776
13536	NC_015865	GAG	2	6	660019	660024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581776
13537	NC_015865	GA	3	6	660097	660102	50 %	0 %	50 %	0 %	341581776
13538	NC_015865	CAA	2	6	660252	660257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581776
13539	NC_015865	GAG	2	6	660274	660279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581776
13540	NC_015865	AAG	2	6	660370	660375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581776
13541	NC_015865	GAG	2	6	660406	660411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581776
13542	NC_015865	CTT	2	6	660478	660483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13543	NC_015865	ACC	2	6	660495	660500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13544	NC_015865	TGAA	2	8	660571	660578	50 %	25 %	25 %	0 %	341581777
13545	NC_015865	AG	3	6	660651	660656	50 %	0 %	50 %	0 %	341581777
13546	NC_015865	CGA	2	6	660707	660712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581777
13547	NC_015865	TCC	2	6	660759	660764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581777
13548	NC_015865	CCCCT	2	10	660781	660790	0 %	20 %	0 %	80 %	341581777
13549	NC_015865	TGG	2	6	660818	660823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581777
13550	NC_015865	CTC	2	6	660944	660949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581777
13551	NC_015865	GAAG	2	8	661004	661011	50 %	0 %	50 %	0 %	341581777
13552	NC_015865	CGG	2	6	661033	661038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581777
13553	NC_015865	GAG	2	6	661091	661096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581777
13554	NC_015865	GAG	2	6	661158	661163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581777
13555	NC_015865	G	6	6	661178	661183	0 %	0 %	100 %	0 %	341581777
13556	NC_015865	ATGG	2	8	661197	661204	25 %	25 %	50 %	0 %	341581777
13557	NC_015865	GA	3	6	661206	661211	50 %	0 %	50 %	0 %	341581777
13558	NC_015865	AGATG	2	10	661256	661265	40 %	20 %	40 %	0 %	341581777
13559	NC_015865	CTT	2	6	661275	661280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581777
13560	NC_015865	GTG	3	9	661302	661310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581777
13561	NC_015865	ATA	2	6	661365	661370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581777
13562	NC_015865	TAA	2	6	661441	661446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581777
13563	NC_015865	TACGGC	2	12	661554	661565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341581777
13564	NC_015865	AGC	2	6	661623	661628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581777
13565	NC_015865	AAG	2	6	661653	661658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581777
13566	NC_015865	GAT	2	6	661677	661682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581777
13567	NC_015865	GAG	3	9	661718	661726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581777
13568	NC_015865	ACC	2	6	661859	661864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581777
13569	NC_015865	AAG	2	6	661874	661879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_015865	CTC	2	6	661956	661961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581778
13571	NC_015865	TGA	2	6	661964	661969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581778
13572	NC_015865	GAC	2	6	661980	661985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581778
13573	NC_015865	CTG	2	6	662002	662007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581778
13574	NC_015865	CGA	2	6	662036	662041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581778
13575	NC_015865	ACG	2	6	662098	662103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581778
13576	NC_015865	CTT	2	6	662118	662123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581778
13577	NC_015865	CCG	2	6	662131	662136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581778
13578	NC_015865	CCG	2	6	662185	662190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581778
13579	NC_015865	TCT	4	12	662204	662215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581778
13580	NC_015865	CTCTTC	2	12	662263	662274	0 %	50 %	0 %	50 %	341581778
13581	NC_015865	CTT	2	6	662307	662312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581778
13582	NC_015865	TTC	2	6	662339	662344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581778
13583	NC_015865	A	6	6	662430	662435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13584	NC_015865	GCCCC	2	10	662444	662453	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13585	NC_015865	GTG	2	6	662468	662473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13586	NC_015865	ATG	2	6	662515	662520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581779
13587	NC_015865	TCA	2	6	662642	662647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581779
13588	NC_015865	GGA	3	9	662670	662678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581779
13589	NC_015865	TAA	2	6	662720	662725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581779
13590	NC_015865	TCA	2	6	662729	662734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581779
13591	NC_015865	CAT	2	6	662739	662744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581779
13592	NC_015865	CAT	2	6	662766	662771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581779
13593	NC_015865	TCC	2	6	662783	662788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581779
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13595	NC_015865	CGC	2	6	662898	662903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581779
13596	NC_015865	TTCC	2	8	662938	662945	0 %	50 %	0 %	50 %	341581779
13597	NC_015865	CTC	2	6	662980	662985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581779
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13599	NC_015865	TGGG	2	8	663130	663137	0 %	25 %	75 %	0 %	341581779
13600	NC_015865	GAT	2	6	663153	663158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581779
13601	NC_015865	CGG	2	6	663179	663184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581779
13602	NC_015865	TCC	2	6	663191	663196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581779
13603	NC_015865	TCC	2	6	663227	663232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581779
13604	NC_015865	CTC	2	6	663250	663255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581779
13605	NC_015865	AGA	2	6	663302	663307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581779
13606	NC_015865	GAA	2	6	663310	663315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581779
13607	NC_015865	A	6	6	663319	663324	100 %	0 %	0 %	0 %	341581779
13608	NC_015865	CT	3	6	663376	663381	0 %	50 %	0 %	50 %	341581780
13609	NC_015865	CCT	2	6	663471	663476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581780
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13611	NC_015865	CGT	2	6	663509	663514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581780
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13615	NC_015865	CAT	2	6	663876	663881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581780
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13618	NC_015865	CTC	2	6	663969	663974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581780
13619	NC_015865	CCT	2	6	664034	664039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581780
13620	NC_015865	CGA	2	6	664079	664084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581780
13621	NC_015865	CCT	2	6	664202	664207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581780
13622	NC_015865	CCT	2	6	664265	664270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581780
13623	NC_015865	TCC	2	6	664324	664329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581780
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13646	NC_015865	TGA	2	6	664996	665001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13681	NC_015865	TGA	2	6	667061	667066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13683	NC_015865	CCCAA	2	10	667168	667177	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
13684	NC_015865	TGG	2	6	667182	667187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13723	NC_015865	CA	3	6	668906	668911	50 %	0 %	0 %	50 %	341581785
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13981	NC_015865	GAG	3	9	681566	681574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581800
13982	NC_015865	TGG	2	6	681752	681757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581801
13983	NC_015865	TTG	2	6	681852	681857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581801
13984	NC_015865	ATG	2	6	681918	681923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581801
13985	NC_015865	GGTG	2	8	681939	681946	0 %	25 %	75 %	0 %	341581801
13986	NC_015865	TAT	2	6	681972	681977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581801
13987	NC_015865	AAC	2	6	682097	682102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581801
13988	NC_015865	GAT	2	6	682274	682279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581801
13989	NC_015865	GGC	2	6	682304	682309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581801
13990	NC_015865	TAT	2	6	682340	682345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581801
13991	NC_015865	GACAG	2	10	682505	682514	40 %	0 %	40 %	20 %	341581801
13992	NC_015865	CTA	2	6	682690	682695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581801
13993	NC_015865	AGC	2	6	682772	682777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581802
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13997	NC_015865	GC	3	6	683133	683138	0 %	0 %	50 %	50 %	341581802
13998	NC_015865	CGA	2	6	683282	683287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581802
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14000	NC_015865	TCC	2	6	683443	683448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581802

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