MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015865	TTG	2	6	633880	633885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581747
13002	NC_015865	TTC	2	6	633922	633927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581747
13003	NC_015865	TAA	2	6	633936	633941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581747
13004	NC_015865	CCT	2	6	633986	633991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581747
13005	NC_015865	CTC	2	6	634083	634088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581747
13006	NC_015865	TCC	2	6	634159	634164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581747
13007	NC_015865	ACC	2	6	634309	634314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13008	NC_015865	AGG	2	6	634358	634363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581748
13009	NC_015865	TA	3	6	634409	634414	50 %	50 %	0 %	0 %	341581748
13010	NC_015865	ACG	2	6	634415	634420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581748
13011	NC_015865	CG	3	6	634419	634424	0 %	0 %	50 %	50 %	341581748
13012	NC_015865	CTC	2	6	634441	634446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581748
13013	NC_015865	GCT	2	6	634573	634578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581748
13014	NC_015865	GGA	2	6	634587	634592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581748
13015	NC_015865	ATC	2	6	634625	634630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581748
13016	NC_015865	CTC	3	9	634636	634644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581748
13017	NC_015865	TTC	2	6	634727	634732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581748
13018	NC_015865	TAT	2	6	634792	634797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581748
13019	NC_015865	GCG	2	6	634811	634816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581748
13020	NC_015865	GTA	2	6	634819	634824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581748
13021	NC_015865	GCC	2	6	634835	634840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581748
13022	NC_015865	GCC	2	6	634843	634848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581748
13023	NC_015865	CT	3	6	634934	634939	0 %	50 %	0 %	50 %	341581748
13024	NC_015865	AAC	2	6	634948	634953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581748
13025	NC_015865	GCC	2	6	634954	634959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581748
13026	NC_015865	GAC	2	6	635041	635046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581748
13027	NC_015865	TCG	2	6	635052	635057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581748
13028	NC_015865	TGT	2	6	635058	635063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581748
13029	NC_015865	CTGAG	2	10	635084	635093	20 %	20 %	40 %	20 %	341581748
13030	NC_015865	CTC	2	6	635122	635127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581748
13031	NC_015865	AGC	2	6	635240	635245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581748
13032	NC_015865	ACC	2	6	635246	635251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581748
13033	NC_015865	GGC	2	6	635263	635268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581748
13034	NC_015865	CT	3	6	635394	635399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_015865	GGT	2	6	635404	635409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_015865	CA	4	8	635522	635529	50 %	0 %	0 %	50 %	341581749
13037	NC_015865	CGT	2	6	635550	635555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581749
13038	NC_015865	GAC	2	6	635583	635588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581749
13039	NC_015865	CTA	2	6	635655	635660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581749
13040	NC_015865	CAG	2	6	635779	635784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581749
13041	NC_015865	TGG	2	6	635795	635800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581749
13042	NC_015865	CGT	2	6	635859	635864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581749
13043	NC_015865	GCT	2	6	635946	635951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581749
13044	NC_015865	TGAAGG	2	12	636143	636154	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	341581749
13045	NC_015865	CGA	2	6	636179	636184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581749
13046	NC_015865	CCCT	2	8	636261	636268	0 %	25 %	0 %	75 %	341581750
13047	NC_015865	TCT	2	6	636280	636285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581750
13048	NC_015865	GT	3	6	636292	636297	0 %	50 %	50 %	0 %	341581750
13049	NC_015865	TCC	2	6	636338	636343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581750
13050	NC_015865	GA	4	8	636523	636530	50 %	0 %	50 %	0 %	341581750
13051	NC_015865	TC	3	6	636586	636591	0 %	50 %	0 %	50 %	341581750
13052	NC_015865	CAG	2	6	636666	636671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581751
13053	NC_015865	CAG	2	6	636681	636686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581751
13054	NC_015865	GAC	2	6	636708	636713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581751
13055	NC_015865	ACTC	2	8	636806	636813	25 %	25 %	0 %	50 %	341581751
13056	NC_015865	GGA	2	6	636818	636823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581751
13057	NC_015865	CGA	2	6	636893	636898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581751
13058	NC_015865	AGG	2	6	636922	636927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581751
13059	NC_015865	GGC	2	6	636963	636968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581751
13060	NC_015865	TTTC	2	8	636997	637004	0 %	75 %	0 %	25 %	341581751
13061	NC_015865	AGC	2	6	637216	637221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581751
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13064	NC_015865	CTCC	2	8	637283	637290	0 %	25 %	0 %	75 %	341581751
13065	NC_015865	AGG	2	6	637291	637296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581751
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13068	NC_015865	GT	3	6	637333	637338	0 %	50 %	50 %	0 %	341581751
13069	NC_015865	GAG	2	6	637404	637409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581751
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13071	NC_015865	ACG	2	6	637498	637503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581751
13072	NC_015865	GAG	2	6	637527	637532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581751
13073	NC_015865	CCG	2	6	637553	637558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581751
13074	NC_015865	CGG	2	6	637562	637567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581751
13075	NC_015865	CGC	3	9	637625	637633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581751
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13079	NC_015865	CCG	2	6	637832	637837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581751
13080	NC_015865	GCTC	2	8	637894	637901	0 %	25 %	25 %	50 %	341581751
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13082	NC_015865	AAGG	2	8	638012	638019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_015865	CCT	2	6	638088	638093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581752
13084	NC_015865	ACG	2	6	638129	638134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581752
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13086	NC_015865	TGA	2	6	638289	638294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581752
13087	NC_015865	TTC	2	6	638358	638363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581753
13088	NC_015865	TCC	2	6	638385	638390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581753
13089	NC_015865	CCA	2	6	638413	638418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581753
13090	NC_015865	CGG	3	9	638458	638466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581753
13091	NC_015865	GAC	2	6	638471	638476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581753
13092	NC_015865	GGAG	2	8	638500	638507	25 %	0 %	75 %	0 %	341581753
13093	NC_015865	CTC	2	6	638552	638557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581753
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13095	NC_015865	TCC	2	6	638772	638777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581753
13096	NC_015865	GCAG	2	8	638835	638842	25 %	0 %	50 %	25 %	341581753
13097	NC_015865	CTC	2	6	638870	638875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581753
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13102	NC_015865	G	6	6	639024	639029	0 %	0 %	100 %	0 %	341581754
13103	NC_015865	GGTCC	2	10	639066	639075	0 %	20 %	40 %	40 %	341581754
13104	NC_015865	TGG	2	6	639078	639083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581754
13105	NC_015865	AT	3	6	639189	639194	50 %	50 %	0 %	0 %	341581754
13106	NC_015865	TCC	2	6	639233	639238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581754
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13108	NC_015865	CACC	2	8	639312	639319	25 %	0 %	0 %	75 %	341581754
13109	NC_015865	TCCTG	2	10	639366	639375	0 %	40 %	20 %	40 %	341581754
13110	NC_015865	CTC	2	6	639451	639456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581754
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13113	NC_015865	TTC	2	6	639509	639514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581754
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13115	NC_015865	T	6	6	639554	639559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_015865	CTA	2	6	639676	639681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581755
13117	NC_015865	GGAGA	2	10	639738	639747	40 %	0 %	60 %	0 %	341581755
13118	NC_015865	GAG	2	6	639928	639933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581755
13119	NC_015865	GGAA	2	8	639944	639951	50 %	0 %	50 %	0 %	341581755
13120	NC_015865	CAGC	2	8	639956	639963	25 %	0 %	25 %	50 %	341581755
13121	NC_015865	TCT	2	6	639988	639993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581755
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13124	NC_015865	GAA	2	6	640081	640086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_015865	TAA	2	6	640092	640097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_015865	GTG	2	6	640118	640123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_015865	CGA	2	6	640211	640216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581756
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13175	NC_015865	GGGA	2	8	642754	642761	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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13221	NC_015865	GCT	2	6	644765	644770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581760
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13225	NC_015865	GAGC	2	8	644959	644966	25 %	0 %	50 %	25 %	341581761
13226	NC_015865	GTC	2	6	645012	645017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581761
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13229	NC_015865	ATA	2	6	645045	645050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581761
13230	NC_015865	GAG	2	6	645120	645125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581761
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13232	NC_015865	TCA	2	6	645190	645195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581761
13233	NC_015865	TTC	2	6	645210	645215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581761
13234	NC_015865	CAAA	2	8	645264	645271	75 %	0 %	0 %	25 %	341581761
13235	NC_015865	AAC	2	6	645433	645438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581762
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13237	NC_015865	TCA	2	6	645569	645574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581762
13238	NC_015865	C	6	6	645695	645700	0 %	0 %	0 %	100 %	341581762
13239	NC_015865	TGACCG	2	12	645701	645712	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341581762
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13361	NC_015865	ATC	2	6	651930	651935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581769
13362	NC_015865	GTA	2	6	652067	652072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581769
13363	NC_015865	AT	3	6	652103	652108	50 %	50 %	0 %	0 %	341581769
13364	NC_015865	TC	3	6	652151	652156	0 %	50 %	0 %	50 %	341581769
13365	NC_015865	CGA	2	6	652222	652227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581769
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13371	NC_015865	GCCA	2	8	652488	652495	25 %	0 %	25 %	50 %	341581769
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13396	NC_015865	GTTG	2	8	653892	653899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13397	NC_015865	TGG	2	6	653924	653929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13399	NC_015865	TGG	2	6	653999	654004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13400	NC_015865	TTA	2	6	654032	654037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13401	NC_015865	TTA	2	6	654046	654051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13402	NC_015865	AGG	2	6	654101	654106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13480	NC_015865	TTC	2	6	657371	657376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581773
13481	NC_015865	CTTCTC	2	12	657475	657486	0 %	50 %	0 %	50 %	341581773
13482	NC_015865	AAC	2	6	657493	657498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581773
13483	NC_015865	GAT	2	6	657499	657504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581773
13484	NC_015865	AAC	2	6	657634	657639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581773
13485	NC_015865	ACC	2	6	657652	657657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581774
13486	NC_015865	CAC	2	6	657762	657767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581774
13487	NC_015865	CGC	2	6	657771	657776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581774
13488	NC_015865	AGC	2	6	657793	657798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581774
13489	NC_015865	C	6	6	657823	657828	0 %	0 %	0 %	100 %	341581774
13490	NC_015865	CCA	2	6	657863	657868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581774
13491	NC_015865	AGCTC	2	10	657872	657881	20 %	20 %	20 %	40 %	341581774
13492	NC_015865	GAG	2	6	657921	657926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581774
13493	NC_015865	CTC	2	6	657937	657942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581774
13494	NC_015865	CCA	2	6	657995	658000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581774
13495	NC_015865	TGC	2	6	658028	658033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581774
13496	NC_015865	CG	3	6	658061	658066	0 %	0 %	50 %	50 %	341581774
13497	NC_015865	CCA	2	6	658082	658087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581774
13498	NC_015865	CAG	2	6	658179	658184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581774
13499	NC_015865	AGA	2	6	658280	658285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581774
13500	NC_015865	AGG	2	6	658310	658315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581774

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