MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015865	CTC	2	6	610440	610445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581721
12502	NC_015865	CTT	2	6	610449	610454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581721
12503	NC_015865	GAA	2	6	610505	610510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581722
12504	NC_015865	GAC	2	6	610541	610546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581722
12505	NC_015865	CGC	2	6	610555	610560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581722
12506	NC_015865	CGA	2	6	610567	610572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581722
12507	NC_015865	CGGTTC	2	12	610573	610584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581722
12508	NC_015865	GGA	2	6	610669	610674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581722
12509	NC_015865	CTC	3	9	610698	610706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581722
12510	NC_015865	CTT	2	6	610709	610714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581722
12511	NC_015865	CTTC	2	8	610733	610740	0 %	50 %	0 %	50 %	341581722
12512	NC_015865	TG	3	6	610747	610752	0 %	50 %	50 %	0 %	341581722
12513	NC_015865	CGG	2	6	610878	610883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_015865	TCA	2	6	610906	610911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581723
12515	NC_015865	CGCTTC	2	12	611073	611084	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	341581723
12516	NC_015865	CCT	2	6	611189	611194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581723
12517	NC_015865	CTC	2	6	611208	611213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581723
12518	NC_015865	CTTC	2	8	611270	611277	0 %	50 %	0 %	50 %	341581723
12519	NC_015865	TCG	2	6	611341	611346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581723
12520	NC_015865	T	6	6	611361	611366	0 %	100 %	0 %	0 %	341581723
12521	NC_015865	AACGTC	2	12	611415	611426	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341581723
12522	NC_015865	GAT	2	6	611487	611492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581723
12523	NC_015865	CTC	2	6	611505	611510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581723
12524	NC_015865	AGGG	2	8	611517	611524	25 %	0 %	75 %	0 %	341581723
12525	NC_015865	CGG	2	6	611714	611719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581723
12526	NC_015865	CTC	2	6	611733	611738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581723
12527	NC_015865	CCT	2	6	611765	611770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581723
12528	NC_015865	CGA	2	6	611786	611791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581723
12529	NC_015865	CCT	2	6	611822	611827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581723
12530	NC_015865	CTC	2	6	611961	611966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581723
12531	NC_015865	GAT	2	6	612107	612112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581724
12532	NC_015865	GCAG	2	8	612118	612125	25 %	0 %	50 %	25 %	341581724
12533	NC_015865	AAT	2	6	612128	612133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581724
12534	NC_015865	ACT	2	6	612154	612159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581724
12535	NC_015865	GGA	2	6	612221	612226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581724
12536	NC_015865	AGA	2	6	612241	612246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581724
12537	NC_015865	CTC	2	6	612270	612275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581724
12538	NC_015865	CCGG	2	8	612314	612321	0 %	0 %	50 %	50 %	341581724
12539	NC_015865	CGA	2	6	612411	612416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_015865	GGAG	2	8	612495	612502	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_015865	GCG	2	6	612637	612642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581725
12542	NC_015865	TGG	2	6	612688	612693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581725
12543	NC_015865	GCC	2	6	612726	612731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581725
12544	NC_015865	GAG	2	6	612738	612743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581725
12545	NC_015865	GAG	2	6	612753	612758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581725
12546	NC_015865	AAG	2	6	612768	612773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581725
12547	NC_015865	ATA	2	6	612795	612800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581725
12548	NC_015865	CGG	2	6	612806	612811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581725
12549	NC_015865	CCG	2	6	612865	612870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581725
12550	NC_015865	GCT	2	6	612926	612931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581725
12551	NC_015865	TGAG	2	8	612943	612950	25 %	25 %	50 %	0 %	341581725
12552	NC_015865	AAC	2	6	613005	613010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581725
12553	NC_015865	CGT	2	6	613022	613027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581725
12554	NC_015865	ACGGA	2	10	613036	613045	40 %	0 %	40 %	20 %	341581725
12555	NC_015865	AGC	2	6	613143	613148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581725
12556	NC_015865	TCCG	2	8	613173	613180	0 %	25 %	25 %	50 %	341581725
12557	NC_015865	CCG	2	6	613189	613194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581725
12558	NC_015865	AGG	2	6	613290	613295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581725
12559	NC_015865	GAC	2	6	613407	613412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581725
12560	NC_015865	GGA	2	6	613418	613423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581725
12561	NC_015865	CAT	2	6	613433	613438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581725
12562	NC_015865	ATA	2	6	613467	613472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581725
12563	NC_015865	TCG	2	6	613480	613485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581725
12564	NC_015865	TCGAT	2	10	613549	613558	20 %	40 %	20 %	20 %	341581725
12565	NC_015865	GC	3	6	613562	613567	0 %	0 %	50 %	50 %	341581725
12566	NC_015865	GGA	2	6	613571	613576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581725
12567	NC_015865	AGG	2	6	613647	613652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581725
12568	NC_015865	CGA	2	6	613736	613741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581725
12569	NC_015865	GAAG	2	8	613745	613752	50 %	0 %	50 %	0 %	341581725
12570	NC_015865	GAT	2	6	613760	613765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581725
12571	NC_015865	GA	3	6	613783	613788	50 %	0 %	50 %	0 %	341581725
12572	NC_015865	CAA	2	6	613876	613881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581726
12573	NC_015865	AGG	2	6	613943	613948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581726
12574	NC_015865	GAG	2	6	613997	614002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581726
12575	NC_015865	AG	3	6	614025	614030	50 %	0 %	50 %	0 %	341581726
12576	NC_015865	GAACT	2	10	614086	614095	40 %	20 %	20 %	20 %	341581727
12577	NC_015865	CCT	2	6	614120	614125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581727
12578	NC_015865	TTGC	2	8	614166	614173	0 %	50 %	25 %	25 %	341581727
12579	NC_015865	TGA	2	6	614270	614275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581727
12580	NC_015865	CGA	2	6	614318	614323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581727
12581	NC_015865	A	6	6	614361	614366	100 %	0 %	0 %	0 %	341581727
12582	NC_015865	TAT	2	6	614412	614417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581727
12583	NC_015865	TGA	2	6	614441	614446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581727
12584	NC_015865	GAG	2	6	614501	614506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
12585	NC_015865	CGA	2	6	614587	614592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581728
12586	NC_015865	CGA	2	6	614625	614630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581728
12587	NC_015865	GCC	2	6	614657	614662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581728
12588	NC_015865	GAG	2	6	614666	614671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
12589	NC_015865	AAG	2	6	614675	614680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581728
12590	NC_015865	GAG	2	6	614738	614743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
12591	NC_015865	GAG	2	6	614762	614767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
12592	NC_015865	CCT	2	6	614797	614802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581728
12593	NC_015865	ATA	2	6	614888	614893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581728
12594	NC_015865	CGA	2	6	614940	614945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581728
12595	NC_015865	GAG	2	6	614954	614959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
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12597	NC_015865	GA	3	6	614985	614990	50 %	0 %	50 %	0 %	341581728
12598	NC_015865	AGG	2	6	614991	614996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
12599	NC_015865	TGG	2	6	615030	615035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581728
12600	NC_015865	CAC	2	6	615043	615048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581728
12601	NC_015865	ACC	2	6	615060	615065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581728
12602	NC_015865	GTC	2	6	615080	615085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581728
12603	NC_015865	CCA	2	6	615114	615119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581728
12604	NC_015865	CAGG	2	8	615148	615155	25 %	0 %	50 %	25 %	341581728
12605	NC_015865	GGGGC	2	10	615174	615183	0 %	0 %	80 %	20 %	341581728
12606	NC_015865	TCA	2	6	615228	615233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581728
12607	NC_015865	AG	3	6	615247	615252	50 %	0 %	50 %	0 %	341581728
12608	NC_015865	GAG	2	6	615278	615283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
12609	NC_015865	GGA	2	6	615319	615324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
12610	NC_015865	ACG	2	6	615330	615335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581728
12611	NC_015865	AAG	2	6	615386	615391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581728
12612	NC_015865	AAG	2	6	615494	615499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581728
12613	NC_015865	GA	3	6	615591	615596	50 %	0 %	50 %	0 %	341581728
12614	NC_015865	TCG	2	6	615612	615617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581728
12615	NC_015865	GAG	3	9	615623	615631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
12616	NC_015865	GAA	2	6	615637	615642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581728
12617	NC_015865	GC	3	6	615664	615669	0 %	0 %	50 %	50 %	341581728
12618	NC_015865	GAGG	2	8	615670	615677	25 %	0 %	75 %	0 %	341581728
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12620	NC_015865	AGG	2	6	615704	615709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
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12861	NC_015865	TCG	2	6	627099	627104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581739
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12914	NC_015865	GGTA	2	8	629546	629553	25 %	25 %	50 %	0 %	341581741
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12918	NC_015865	TAT	2	6	629826	629831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12967	NC_015865	GGA	2	6	632328	632333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581745
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12980	NC_015865	GAG	2	6	632891	632896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581746
12981	NC_015865	ATT	3	9	632916	632924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581746
12982	NC_015865	CGA	2	6	632926	632931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581746
12983	NC_015865	GGA	2	6	633016	633021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581746
12984	NC_015865	GAC	2	6	633068	633073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581746
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