MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015865	GCC	2	6	560279	560284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581663
11502	NC_015865	TCC	2	6	560325	560330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581663
11503	NC_015865	CGC	2	6	560368	560373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581663
11504	NC_015865	ACG	2	6	560427	560432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581663
11505	NC_015865	CCT	2	6	560588	560593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581663
11506	NC_015865	C	6	6	560619	560624	0 %	0 %	0 %	100 %	341581663
11507	NC_015865	CTC	2	6	560739	560744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581664
11508	NC_015865	GTA	2	6	560783	560788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581664
11509	NC_015865	TCC	2	6	560928	560933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581664
11510	NC_015865	TCC	2	6	561052	561057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581665
11511	NC_015865	GAG	2	6	561081	561086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581665
11512	NC_015865	TCC	2	6	561118	561123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581665
11513	NC_015865	GAG	2	6	561154	561159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581665
11514	NC_015865	AGCC	2	8	561214	561221	25 %	0 %	25 %	50 %	341581665
11515	NC_015865	TCC	2	6	561265	561270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11516	NC_015865	TA	4	8	561326	561333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_015865	GCTC	2	8	561399	561406	0 %	25 %	25 %	50 %	341581666
11518	NC_015865	CCGT	2	8	561509	561516	0 %	25 %	25 %	50 %	341581666
11519	NC_015865	ATG	2	6	561530	561535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581666
11520	NC_015865	TCG	2	6	561548	561553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581666
11521	NC_015865	TCC	2	6	561590	561595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581666
11522	NC_015865	CT	3	6	561609	561614	0 %	50 %	0 %	50 %	341581666
11523	NC_015865	ACC	3	9	561629	561637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11524	NC_015865	TTAA	2	8	561645	561652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_015865	TCA	2	6	561692	561697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581667
11526	NC_015865	TCCC	2	8	561730	561737	0 %	25 %	0 %	75 %	341581667
11527	NC_015865	GTA	2	6	561825	561830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581667
11528	NC_015865	CGT	2	6	561851	561856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581667
11529	NC_015865	TCC	2	6	561883	561888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581667
11530	NC_015865	TCG	2	6	561919	561924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581667
11531	NC_015865	CTC	2	6	562017	562022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581667
11532	NC_015865	GTCAT	2	10	562117	562126	20 %	40 %	20 %	20 %	341581667
11533	NC_015865	CTC	2	6	562134	562139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581667
11534	NC_015865	TCG	2	6	562141	562146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581667
11535	NC_015865	TAT	2	6	562155	562160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581667
11536	NC_015865	GAA	2	6	562234	562239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_015865	CGA	2	6	562245	562250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_015865	G	6	6	562282	562287	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_015865	C	6	6	562302	562307	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11540	NC_015865	AAT	2	6	562339	562344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_015865	TGT	2	6	562401	562406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_015865	GTTT	2	8	562409	562416	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_015865	CGCA	2	8	562543	562550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11544	NC_015865	CGG	2	6	562652	562657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_015865	TGA	2	6	562679	562684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_015865	ACT	2	6	562790	562795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581668
11547	NC_015865	GGTT	2	8	562798	562805	0 %	50 %	50 %	0 %	341581668
11548	NC_015865	GCC	2	6	562856	562861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581668
11549	NC_015865	GAAGCA	2	12	562876	562887	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	341581668
11550	NC_015865	GGAA	2	8	562904	562911	50 %	0 %	50 %	0 %	341581668
11551	NC_015865	AGG	2	6	562919	562924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581668
11552	NC_015865	GCG	2	6	562956	562961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581668
11553	NC_015865	CGG	2	6	562972	562977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581668
11554	NC_015865	CCTTT	2	10	563044	563053	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11555	NC_015865	AGG	2	6	563112	563117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581669
11556	NC_015865	GCA	2	6	563166	563171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581669
11557	NC_015865	TTTCG	2	10	563228	563237	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11558	NC_015865	TGAG	2	8	563265	563272	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_015865	ATG	2	6	563277	563282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581670
11560	NC_015865	GAG	2	6	563309	563314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581670
11561	NC_015865	GAG	2	6	563318	563323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581670
11562	NC_015865	AGA	2	6	563380	563385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581670
11563	NC_015865	GAG	2	6	563583	563588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581670
11564	NC_015865	TTG	2	6	563596	563601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581670
11565	NC_015865	ACC	2	6	563604	563609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581670
11566	NC_015865	CGG	2	6	563666	563671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581670
11567	NC_015865	GCTC	2	8	563695	563702	0 %	25 %	25 %	50 %	341581670
11568	NC_015865	ACA	2	6	563722	563727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581670
11569	NC_015865	GGA	2	6	563846	563851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581670
11570	NC_015865	GAG	2	6	563930	563935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581671
11571	NC_015865	GGA	2	6	563991	563996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581671
11572	NC_015865	TCC	2	6	564009	564014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581671
11573	NC_015865	TAA	2	6	564030	564035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581671
11574	NC_015865	GAC	2	6	564136	564141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_015865	TA	3	6	564180	564185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_015865	GGA	2	6	564310	564315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581672
11577	NC_015865	CCT	2	6	564330	564335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581672
11578	NC_015865	TCC	2	6	564368	564373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581672
11579	NC_015865	AGG	2	6	564396	564401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581672
11580	NC_015865	CTC	2	6	564466	564471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581672
11581	NC_015865	GCG	2	6	564571	564576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581672
11582	NC_015865	GGA	2	6	564612	564617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581672
11583	NC_015865	ATT	2	6	564720	564725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581672
11584	NC_015865	CGC	2	6	564729	564734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581672
11585	NC_015865	TCG	2	6	564770	564775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581672
11586	NC_015865	CAA	2	6	564816	564821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581672
11587	NC_015865	ATA	2	6	564928	564933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581672
11588	NC_015865	G	6	6	564966	564971	0 %	0 %	100 %	0 %	341581672
11589	NC_015865	CTT	2	6	565019	565024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_015865	C	7	7	565030	565036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11591	NC_015865	ATTACG	2	12	565052	565063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11592	NC_015865	GT	4	8	565067	565074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_015865	CAG	3	9	565130	565138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581673
11594	NC_015865	CAG	2	6	565154	565159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581673
11595	NC_015865	AAG	2	6	565193	565198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581673
11596	NC_015865	CAAGGC	2	12	565276	565287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581673
11597	NC_015865	GAG	2	6	565292	565297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581673
11598	NC_015865	GAA	2	6	565354	565359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581673
11599	NC_015865	CAC	2	6	565384	565389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581673
11600	NC_015865	CTCTT	2	10	565428	565437	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11601	NC_015865	GGT	2	6	565446	565451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_015865	GAG	2	6	565513	565518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581674
11603	NC_015865	CGA	2	6	565629	565634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581674
11604	NC_015865	GA	3	6	565696	565701	50 %	0 %	50 %	0 %	341581674
11605	NC_015865	GAG	2	6	565720	565725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581674
11606	NC_015865	GA	3	6	565741	565746	50 %	0 %	50 %	0 %	341581674
11607	NC_015865	GCT	2	6	565857	565862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581675
11608	NC_015865	ATA	2	6	565882	565887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581675
11609	NC_015865	GTG	2	6	565996	566001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581675
11610	NC_015865	GAG	2	6	566053	566058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581675
11611	NC_015865	GGGA	2	8	566108	566115	25 %	0 %	75 %	0 %	341581675
11612	NC_015865	CTG	2	6	566147	566152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581676
11613	NC_015865	GCC	2	6	566177	566182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581676
11614	NC_015865	GA	3	6	566195	566200	50 %	0 %	50 %	0 %	341581676
11615	NC_015865	CTC	2	6	566261	566266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581676
11616	NC_015865	CAG	2	6	566386	566391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581676
11617	NC_015865	GAA	3	9	566429	566437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581676
11618	NC_015865	GGA	2	6	566494	566499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581676
11619	NC_015865	ATGAA	2	10	566501	566510	60 %	20 %	20 %	0 %	341581676
11620	NC_015865	CTTC	2	8	566532	566539	0 %	50 %	0 %	50 %	341581677
11621	NC_015865	CCA	2	6	566574	566579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581677
11622	NC_015865	CTCGG	2	10	566599	566608	0 %	20 %	40 %	40 %	341581677
11623	NC_015865	AATC	2	8	566633	566640	50 %	25 %	0 %	25 %	341581677
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