MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015865	AG	3	6	536263	536268	50 %	0 %	50 %	0 %	341581635
11002	NC_015865	CAT	2	6	536277	536282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581635
11003	NC_015865	TCG	2	6	536429	536434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581635
11004	NC_015865	TGA	2	6	536498	536503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581635
11005	NC_015865	CTT	2	6	536550	536555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581635
11006	NC_015865	ATG	2	6	536590	536595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581635
11007	NC_015865	AGG	2	6	536602	536607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581635
11008	NC_015865	CATC	2	8	536714	536721	25 %	25 %	0 %	50 %	341581635
11009	NC_015865	GACC	2	8	536865	536872	25 %	0 %	25 %	50 %	341581635
11010	NC_015865	CTT	2	6	536886	536891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581635
11011	NC_015865	GCG	2	6	536894	536899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581635
11012	NC_015865	TCC	2	6	536927	536932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581635
11013	NC_015865	CGC	2	6	536964	536969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581635
11014	NC_015865	ACC	2	6	536987	536992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581635
11015	NC_015865	CGT	2	6	537033	537038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581635
11016	NC_015865	AGG	2	6	537065	537070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581635
11017	NC_015865	CTC	2	6	537093	537098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581635
11018	NC_015865	ATA	2	6	537226	537231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581635
11019	NC_015865	GGC	2	6	537265	537270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581635
11020	NC_015865	CCG	2	6	537337	537342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581635
11021	NC_015865	CAA	2	6	537606	537611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581635
11022	NC_015865	CGG	2	6	537633	537638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581635
11023	NC_015865	ACT	2	6	537641	537646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581635
11024	NC_015865	GAG	2	6	537802	537807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581635
11025	NC_015865	GAA	2	6	537825	537830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581635
11026	NC_015865	GGA	2	6	537915	537920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581635
11027	NC_015865	CAGG	2	8	537936	537943	25 %	0 %	50 %	25 %	341581635
11028	NC_015865	TGC	2	6	537992	537997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581635
11029	NC_015865	G	6	6	538013	538018	0 %	0 %	100 %	0 %	341581635
11030	NC_015865	CTTCAT	2	12	538089	538100	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	341581636
11031	NC_015865	GA	3	6	538108	538113	50 %	0 %	50 %	0 %	341581636
11032	NC_015865	CTC	2	6	538183	538188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581636
11033	NC_015865	AAG	2	6	538192	538197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581636
11034	NC_015865	CTC	2	6	538267	538272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581636
11035	NC_015865	CCT	2	6	538335	538340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581636
11036	NC_015865	CGG	2	6	538397	538402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581636
11037	NC_015865	TGG	2	6	538430	538435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581636
11038	NC_015865	CAG	2	6	538519	538524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581636
11039	NC_015865	GCT	2	6	538554	538559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581636
11040	NC_015865	CAT	2	6	538620	538625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581636
11041	NC_015865	CGG	2	6	538634	538639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581636
11042	NC_015865	CGG	2	6	538668	538673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581636
11043	NC_015865	CGG	2	6	538752	538757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581636
11044	NC_015865	GCT	2	6	538776	538781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581636
11045	NC_015865	GGC	2	6	538854	538859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581636
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11050	NC_015865	GAA	2	6	539014	539019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581637
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11052	NC_015865	GCC	2	6	539068	539073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581637
11053	NC_015865	AAT	2	6	539110	539115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581637
11054	NC_015865	TCA	2	6	539151	539156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581637
11055	NC_015865	GTTAC	2	10	539160	539169	20 %	40 %	20 %	20 %	341581637
11056	NC_015865	GAT	2	6	539206	539211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581637
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11060	NC_015865	AG	3	6	539392	539397	50 %	0 %	50 %	0 %	341581637
11061	NC_015865	TAC	2	6	539441	539446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581637
11062	NC_015865	GAA	2	6	539449	539454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581637
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11065	NC_015865	GAG	2	6	539539	539544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581638
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11069	NC_015865	CGAG	2	8	539732	539739	25 %	0 %	50 %	25 %	341581638
11070	NC_015865	CTC	2	6	539752	539757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581638
11071	NC_015865	CGT	2	6	539766	539771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581638
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11091	NC_015865	AGGA	2	8	540875	540882	50 %	0 %	50 %	0 %	341581639
11092	NC_015865	AGG	2	6	540933	540938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581639
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11101	NC_015865	GAG	2	6	541351	541356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581640
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11104	NC_015865	GC	3	6	541658	541663	0 %	0 %	50 %	50 %	341581640
11105	NC_015865	ACT	2	6	541679	541684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581640
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11112	NC_015865	ACC	2	6	541835	541840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581640
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11115	NC_015865	CGG	2	6	541919	541924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581640
11116	NC_015865	AAAG	2	8	541947	541954	75 %	0 %	25 %	0 %	341581640
11117	NC_015865	GCCG	2	8	541965	541972	0 %	0 %	50 %	50 %	341581640
11118	NC_015865	GAAG	2	8	541977	541984	50 %	0 %	50 %	0 %	341581640
11119	NC_015865	GAG	2	6	542029	542034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581640
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11122	NC_015865	TCC	2	6	542107	542112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11123	NC_015865	CA	3	6	542139	542144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11124	NC_015865	GGAG	2	8	542151	542158	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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11155	NC_015865	TGT	2	6	543416	543421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11241	NC_015865	CGG	2	6	547672	547677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581646
11242	NC_015865	CTT	2	6	547778	547783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581646
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11337	NC_015865	TTC	3	9	552577	552585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11342	NC_015865	CAG	2	6	552787	552792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581652
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11351	NC_015865	AT	3	6	553089	553094	50 %	50 %	0 %	0 %	341581652
11352	NC_015865	CGG	2	6	553098	553103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581652
11353	NC_015865	GGC	2	6	553111	553116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581652
11354	NC_015865	GA	3	6	553157	553162	50 %	0 %	50 %	0 %	341581652
11355	NC_015865	GAG	2	6	553168	553173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581652
11356	NC_015865	GAA	2	6	553228	553233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581652
11357	NC_015865	CTC	2	6	553328	553333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581652
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11359	NC_015865	CGA	2	6	553447	553452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581653
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11479	NC_015865	CTC	2	6	559188	559193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581662
11480	NC_015865	TCT	2	6	559244	559249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581662
11481	NC_015865	GAC	2	6	559275	559280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581662
11482	NC_015865	TCCTC	2	10	559364	559373	0 %	40 %	0 %	60 %	341581662
11483	NC_015865	CCT	2	6	559395	559400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581662
11484	NC_015865	CCT	2	6	559406	559411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581662
11485	NC_015865	TCT	2	6	559424	559429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581662
11486	NC_015865	CGG	2	6	559436	559441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581662
11487	NC_015865	CGA	2	6	559541	559546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581662
11488	NC_015865	TGA	2	6	559580	559585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581662
11489	NC_015865	CGC	2	6	559602	559607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581662
11490	NC_015865	TCG	2	6	559666	559671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581662
11491	NC_015865	CTC	2	6	559717	559722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581662
11492	NC_015865	ACGGC	2	10	559810	559819	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11493	NC_015865	TCA	2	6	559863	559868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11494	NC_015865	TTC	2	6	559953	559958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581663
11495	NC_015865	ATG	2	6	559965	559970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581663
11496	NC_015865	CAG	2	6	560060	560065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581663
11497	NC_015865	ACG	2	6	560109	560114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581663
11498	NC_015865	CTTC	2	8	560140	560147	0 %	50 %	0 %	50 %	341581663
11499	NC_015865	GTC	2	6	560192	560197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581663
11500	NC_015865	CCTT	2	8	560257	560264	0 %	50 %	0 %	50 %	341581663

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