MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015865	TATG	2	8	511634	511641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_015865	CGC	2	6	511711	511716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581607
10503	NC_015865	AGC	2	6	511797	511802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581607
10504	NC_015865	GTTCT	2	10	511842	511851	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10505	NC_015865	T	6	6	511856	511861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_015865	CTT	2	6	511874	511879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_015865	GAAAA	2	10	511902	511911	80 %	0 %	20 %	0 %	341581608
10508	NC_015865	AG	3	6	512064	512069	50 %	0 %	50 %	0 %	341581608
10509	NC_015865	TA	3	6	512193	512198	50 %	50 %	0 %	0 %	341581609
10510	NC_015865	ATC	2	6	512243	512248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581609
10511	NC_015865	AG	3	6	512298	512303	50 %	0 %	50 %	0 %	341581609
10512	NC_015865	AGC	2	6	512336	512341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581609
10513	NC_015865	TCCA	2	8	512468	512475	25 %	25 %	0 %	50 %	341581609
10514	NC_015865	TTCC	2	8	512488	512495	0 %	50 %	0 %	50 %	341581609
10515	NC_015865	ATCC	2	8	512660	512667	25 %	25 %	0 %	50 %	341581609
10516	NC_015865	T	7	7	512698	512704	0 %	100 %	0 %	0 %	341581609
10517	NC_015865	CCA	2	6	512713	512718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581609
10518	NC_015865	CGG	2	6	512774	512779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581609
10519	NC_015865	ATA	2	6	512795	512800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581609
10520	NC_015865	TC	3	6	512868	512873	0 %	50 %	0 %	50 %	341581609
10521	NC_015865	G	6	6	512917	512922	0 %	0 %	100 %	0 %	341581609
10522	NC_015865	TGA	2	6	512926	512931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581609
10523	NC_015865	CGG	2	6	513013	513018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581609
10524	NC_015865	ATT	2	6	513087	513092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581609
10525	NC_015865	CAG	3	9	513098	513106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581609
10526	NC_015865	AGC	3	9	513174	513182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581609
10527	NC_015865	TAA	2	6	513259	513264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581609
10528	NC_015865	CTG	2	6	513267	513272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581609
10529	NC_015865	AG	3	6	513283	513288	50 %	0 %	50 %	0 %	341581609
10530	NC_015865	CTG	2	6	513306	513311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581609
10531	NC_015865	ACC	2	6	513375	513380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581609
10532	NC_015865	GA	3	6	513395	513400	50 %	0 %	50 %	0 %	341581609
10533	NC_015865	AGC	2	6	513402	513407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581609
10534	NC_015865	CGC	2	6	513413	513418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581609
10535	NC_015865	ACG	2	6	513513	513518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581609
10536	NC_015865	AGGCC	2	10	513602	513611	20 %	0 %	40 %	40 %	341581609
10537	NC_015865	CAG	2	6	513731	513736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581609
10538	NC_015865	CAAGG	2	10	513812	513821	40 %	0 %	40 %	20 %	341581609
10539	NC_015865	GA	3	6	513822	513827	50 %	0 %	50 %	0 %	341581609
10540	NC_015865	ATA	2	6	513869	513874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581609
10541	NC_015865	GAA	2	6	513879	513884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581609
10542	NC_015865	AAGC	2	8	513958	513965	50 %	0 %	25 %	25 %	341581609
10543	NC_015865	GCTC	2	8	513997	514004	0 %	25 %	25 %	50 %	341581609
10544	NC_015865	CCA	2	6	514042	514047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581609
10545	NC_015865	GTA	3	9	514109	514117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581609
10546	NC_015865	GGA	2	6	514122	514127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581609
10547	NC_015865	AGGT	2	8	514188	514195	25 %	25 %	50 %	0 %	341581609
10548	NC_015865	CTGA	2	8	514226	514233	25 %	25 %	25 %	25 %	341581609
10549	NC_015865	CAATA	2	10	514247	514256	60 %	20 %	0 %	20 %	341581609
10550	NC_015865	TGT	2	6	514347	514352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581610
10551	NC_015865	TAA	2	6	514362	514367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581610
10552	NC_015865	TGT	2	6	514392	514397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581610
10553	NC_015865	GA	3	6	514498	514503	50 %	0 %	50 %	0 %	341581610
10554	NC_015865	ATA	2	6	514564	514569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581610
10555	NC_015865	T	7	7	514800	514806	0 %	100 %	0 %	0 %	341581610
10556	NC_015865	TC	3	6	514833	514838	0 %	50 %	0 %	50 %	341581610
10557	NC_015865	TAT	2	6	514839	514844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581610
10558	NC_015865	TAG	2	6	514968	514973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581610
10559	NC_015865	AGTAA	2	10	515062	515071	60 %	20 %	20 %	0 %	341581610
10560	NC_015865	CAC	2	6	515142	515147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581610
10561	NC_015865	CAG	2	6	515170	515175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581610
10562	NC_015865	TTA	2	6	515313	515318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581610
10563	NC_015865	TCT	2	6	515333	515338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581610
10564	NC_015865	T	6	6	515386	515391	0 %	100 %	0 %	0 %	341581610
10565	NC_015865	ATA	3	9	515395	515403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581610
10566	NC_015865	A	7	7	515411	515417	100 %	0 %	0 %	0 %	341581610
10567	NC_015865	ATC	2	6	515518	515523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581610
10568	NC_015865	ATAAC	2	10	515547	515556	60 %	20 %	0 %	20 %	341581610
10569	NC_015865	GAA	2	6	515610	515615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581610
10570	NC_015865	TAT	2	6	515652	515657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581610
10571	NC_015865	TC	3	6	515722	515727	0 %	50 %	0 %	50 %	341581610
10572	NC_015865	CTA	2	6	515817	515822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581610
10573	NC_015865	ACGTA	2	10	515853	515862	40 %	20 %	20 %	20 %	341581610
10574	NC_015865	TTA	2	6	515867	515872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581610
10575	NC_015865	ACC	2	6	515887	515892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10576	NC_015865	TTA	2	6	515958	515963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_015865	AAG	2	6	515987	515992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_015865	GAA	2	6	516051	516056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581611
10579	NC_015865	ATAAA	2	10	516059	516068	80 %	20 %	0 %	0 %	341581611
10580	NC_015865	A	6	6	516066	516071	100 %	0 %	0 %	0 %	341581611
10581	NC_015865	TGA	2	6	516093	516098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581611
10582	NC_015865	AAG	2	6	516124	516129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581611
10583	NC_015865	CGA	2	6	516156	516161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581611
10584	NC_015865	CTG	2	6	516190	516195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581611
10585	NC_015865	TGG	2	6	516206	516211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581611
10586	NC_015865	TGT	2	6	516228	516233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581611
10587	NC_015865	CAGAAA	2	12	516279	516290	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	341581611
10588	NC_015865	CT	3	6	516319	516324	0 %	50 %	0 %	50 %	341581611
10589	NC_015865	CGA	2	6	516381	516386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581611
10590	NC_015865	CAT	2	6	516616	516621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10591	NC_015865	TAA	2	6	516643	516648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_015865	CGTT	2	8	516652	516659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10593	NC_015865	ACT	2	6	516663	516668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10594	NC_015865	CAT	2	6	516722	516727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581612
10595	NC_015865	TGG	2	6	516730	516735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581612
10596	NC_015865	TGG	2	6	516856	516861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581612
10597	NC_015865	ATA	2	6	516897	516902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581612
10598	NC_015865	TTCCC	2	10	516923	516932	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10599	NC_015865	AAG	2	6	517055	517060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581613
10600	NC_015865	GAG	2	6	517064	517069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581613
10601	NC_015865	CCGG	2	8	517118	517125	0 %	0 %	50 %	50 %	341581613
10602	NC_015865	GCA	2	6	517147	517152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581613
10603	NC_015865	GAGG	2	8	517156	517163	25 %	0 %	75 %	0 %	341581613
10604	NC_015865	GCA	2	6	517237	517242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581613
10605	NC_015865	TCG	2	6	517287	517292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581613
10606	NC_015865	AGG	2	6	517308	517313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581613
10607	NC_015865	CCG	2	6	517346	517351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581613
10608	NC_015865	TCA	2	6	517392	517397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581613
10609	NC_015865	GGA	2	6	517408	517413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581613
10610	NC_015865	GAA	2	6	517456	517461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581613
10611	NC_015865	CCA	2	6	517467	517472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581613
10612	NC_015865	GGT	2	6	517547	517552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581613
10613	NC_015865	CAA	2	6	517627	517632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581613
10614	NC_015865	TCC	2	6	517638	517643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581613
10615	NC_015865	CTC	2	6	517646	517651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581613
10616	NC_015865	CAT	3	9	517672	517680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581613
10617	NC_015865	GGC	2	6	517682	517687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581613
10618	NC_015865	GACC	2	8	517692	517699	25 %	0 %	25 %	50 %	341581613
10619	NC_015865	AGG	2	6	517701	517706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581613
10620	NC_015865	CCA	2	6	517729	517734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581613
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10622	NC_015865	CGT	2	6	517759	517764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581613
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10742	NC_015865	GGT	2	6	523161	523166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581617
10743	NC_015865	ATC	2	6	523185	523190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581618
10744	NC_015865	ATC	2	6	523194	523199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581618
10745	NC_015865	GT	3	6	523417	523422	0 %	50 %	50 %	0 %	341581618
10746	NC_015865	TC	3	6	523463	523468	0 %	50 %	0 %	50 %	341581618
10747	NC_015865	AGG	2	6	523516	523521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581618
10748	NC_015865	TG	3	6	523610	523615	0 %	50 %	50 %	0 %	341581618
10749	NC_015865	TGG	3	9	523723	523731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581618
10750	NC_015865	TCGATA	2	12	523797	523808	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341581618
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10980	NC_015865	GGA	2	6	535199	535204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581634
10981	NC_015865	CTT	2	6	535216	535221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581634
10982	NC_015865	GCTC	2	8	535248	535255	0 %	25 %	25 %	50 %	341581634
10983	NC_015865	GTC	2	6	535442	535447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581634
10984	NC_015865	GGCC	2	8	535450	535457	0 %	0 %	50 %	50 %	341581634
10985	NC_015865	GCT	2	6	535474	535479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581634
10986	NC_015865	GCT	2	6	535522	535527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581634
10987	NC_015865	ATA	2	6	535529	535534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581634
10988	NC_015865	TCG	2	6	535554	535559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581634
10989	NC_015865	GCG	2	6	535665	535670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581634
10990	NC_015865	CCT	2	6	535717	535722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581634
10991	NC_015865	AGA	2	6	535794	535799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581634
10992	NC_015865	GCC	2	6	535838	535843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581634
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10994	NC_015865	CGC	2	6	535894	535899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581634
10995	NC_015865	GCC	2	6	535922	535927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581634
10996	NC_015865	CGT	2	6	535948	535953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581634
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