MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_015865	AC	3	6	486679	486684	50 %	0 %	0 %	50 %	341581577
10003	NC_015865	ACC	2	6	486689	486694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581577
10004	NC_015865	GAA	2	6	486859	486864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581577
10005	NC_015865	AGG	2	6	486910	486915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581577
10006	NC_015865	TCAT	2	8	486924	486931	25 %	50 %	0 %	25 %	341581577
10007	NC_015865	GGA	2	6	486965	486970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581577
10008	NC_015865	CTC	2	6	487025	487030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581577
10009	NC_015865	ACG	2	6	487036	487041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581577
10010	NC_015865	G	6	6	487041	487046	0 %	0 %	100 %	0 %	341581577
10011	NC_015865	TCC	2	6	487071	487076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581577
10012	NC_015865	TCG	2	6	487098	487103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581577
10013	NC_015865	CT	3	6	487235	487240	0 %	50 %	0 %	50 %	341581577
10014	NC_015865	TAT	2	6	487301	487306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581577
10015	NC_015865	GTT	2	6	487415	487420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581577
10016	NC_015865	ATC	2	6	487508	487513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581577
10017	NC_015865	CAA	2	6	487573	487578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581577
10018	NC_015865	TCCT	2	8	487583	487590	0 %	50 %	0 %	50 %	341581577
10019	NC_015865	T	6	6	487730	487735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_015865	C	6	6	487799	487804	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10021	NC_015865	A	6	6	487955	487960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_015865	CAT	2	6	487988	487993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_015865	AAAAC	2	10	487997	488006	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10024	NC_015865	T	6	6	488048	488053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_015865	GGT	2	6	488118	488123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_015865	GAC	2	6	488248	488253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581578
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10028	NC_015865	GCC	2	6	488292	488297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581578
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10030	NC_015865	TTC	3	9	488305	488313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581578
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10034	NC_015865	CGA	2	6	488526	488531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581578
10035	NC_015865	GAC	2	6	488569	488574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581578
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10039	NC_015865	GCTCGA	2	12	488775	488786	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341581578
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10042	NC_015865	TCG	2	6	488960	488965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581578
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10058	NC_015865	CCT	2	6	489722	489727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581579
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10062	NC_015865	TCA	2	6	489931	489936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581579
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10237	NC_015865	CTTCG	2	10	498433	498442	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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10240	NC_015865	CTC	2	6	498549	498554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581589
10241	NC_015865	GGAG	2	8	498602	498609	25 %	0 %	75 %	0 %	341581589
10242	NC_015865	CCT	2	6	498644	498649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581589
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10273	NC_015865	G	6	6	500178	500183	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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10357	NC_015865	GCCT	2	8	504091	504098	0 %	25 %	25 %	50 %	341581598
10358	NC_015865	GAG	2	6	504107	504112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581598
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10361	NC_015865	TGA	2	6	504220	504225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581598
10362	NC_015865	TCC	2	6	504261	504266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581598
10363	NC_015865	TGG	2	6	504367	504372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581598
10364	NC_015865	ATG	2	6	504468	504473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581598
10365	NC_015865	CGA	2	6	504529	504534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581598
10366	NC_015865	TTC	2	6	504558	504563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581598
10367	NC_015865	CGA	2	6	504580	504585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581598
10368	NC_015865	CGGG	2	8	504685	504692	0 %	0 %	75 %	25 %	341581598
10369	NC_015865	TGG	2	6	504693	504698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581598
10370	NC_015865	CAA	2	6	504703	504708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581598
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10373	NC_015865	CGG	2	6	504892	504897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581598
10374	NC_015865	CT	3	6	505001	505006	0 %	50 %	0 %	50 %	341581598
10375	NC_015865	CAC	2	6	505021	505026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10376	NC_015865	AAG	3	9	505036	505044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10377	NC_015865	GTA	2	6	505122	505127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581599
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10380	NC_015865	TCT	2	6	505298	505303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581599
10381	NC_015865	CCTT	2	8	505378	505385	0 %	50 %	0 %	50 %	341581599
10382	NC_015865	AAC	2	6	505395	505400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581599
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10390	NC_015865	CTT	2	6	505698	505703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581600
10391	NC_015865	CTC	2	6	505798	505803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581600
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10396	NC_015865	CCGT	2	8	506209	506216	0 %	25 %	25 %	50 %	341581600
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10405	NC_015865	GCT	2	6	506692	506697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10424	NC_015865	C	6	6	507961	507966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10425	NC_015865	TAT	2	6	507982	507987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10427	NC_015865	GGT	2	6	508088	508093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10440	NC_015865	ACCGC	2	10	508827	508836	20 %	0 %	20 %	60 %	341581603
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10450	NC_015865	GAAG	2	8	509281	509288	50 %	0 %	50 %	0 %	341581604
10451	NC_015865	CGG	2	6	509348	509353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581604
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10455	NC_015865	GAG	2	6	509600	509605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581604
10456	NC_015865	GGAGGT	2	12	509639	509650	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	341581604
10457	NC_015865	GGA	2	6	509701	509706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10458	NC_015865	GTC	2	6	509755	509760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581605
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10464	NC_015865	TGAG	2	8	509933	509940	25 %	25 %	50 %	0 %	341581605
10465	NC_015865	GAG	2	6	510040	510045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581605
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10468	NC_015865	CCG	2	6	510104	510109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581605
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10472	NC_015865	CTC	2	6	510214	510219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581605
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10474	NC_015865	CGC	2	6	510438	510443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581605
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10478	NC_015865	TCC	2	6	510641	510646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581605
10479	NC_015865	GA	3	6	510751	510756	50 %	0 %	50 %	0 %	341581605
10480	NC_015865	TGGG	2	8	510814	510821	0 %	25 %	75 %	0 %	341581605
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10482	NC_015865	GAA	2	6	510903	510908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581605
10483	NC_015865	CTGGCG	2	12	510919	510930	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	341581605
10484	NC_015865	CTT	2	6	510995	511000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581606
10485	NC_015865	GTA	2	6	511028	511033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581606
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10487	NC_015865	GACCAC	2	12	511190	511201	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	341581606
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