MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015865	GTA	2	6	24624	24629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581109
502	NC_015865	CCA	2	6	24632	24637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581109
503	NC_015865	CTC	2	6	24672	24677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581109
504	NC_015865	TTC	2	6	24722	24727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581109
505	NC_015865	TCC	2	6	24743	24748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581109
506	NC_015865	CGG	2	6	24758	24763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581109
507	NC_015865	CAT	2	6	24906	24911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581109
508	NC_015865	CTC	2	6	24975	24980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581109
509	NC_015865	CTG	2	6	25036	25041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581109
510	NC_015865	TTC	2	6	25077	25082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581109
511	NC_015865	TGG	2	6	25088	25093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581109
512	NC_015865	TCA	2	6	25094	25099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581109
513	NC_015865	GTC	2	6	25102	25107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581109
514	NC_015865	CTTC	2	8	25136	25143	0 %	50 %	0 %	50 %	341581109
515	NC_015865	CCA	2	6	25160	25165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581109
516	NC_015865	GGA	2	6	25178	25183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581109
517	NC_015865	CTC	2	6	25185	25190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581109
518	NC_015865	CTTC	2	8	25208	25215	0 %	50 %	0 %	50 %	341581109
519	NC_015865	CGT	2	6	25244	25249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581109
520	NC_015865	AGG	2	6	25306	25311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581109
521	NC_015865	CGA	2	6	25316	25321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581109
522	NC_015865	TGA	2	6	25332	25337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581109
523	NC_015865	AGA	2	6	25373	25378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581109
524	NC_015865	GTCC	2	8	25398	25405	0 %	25 %	25 %	50 %	341581109
525	NC_015865	CGG	2	6	25475	25480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581109
526	NC_015865	GAG	2	6	25554	25559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581109
527	NC_015865	GGT	2	6	25583	25588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581109
528	NC_015865	CGCT	2	8	25619	25626	0 %	25 %	25 %	50 %	341581109
529	NC_015865	CCT	2	6	25814	25819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581109
530	NC_015865	TCT	2	6	25838	25843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581109
531	NC_015865	GGC	2	6	25866	25871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581109
532	NC_015865	CTC	2	6	25888	25893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581109
533	NC_015865	TCC	2	6	26011	26016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581109
534	NC_015865	TGC	2	6	26020	26025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581109
535	NC_015865	TTC	2	6	26050	26055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581109
536	NC_015865	AGCG	2	8	26184	26191	25 %	0 %	50 %	25 %	341581109
537	NC_015865	GGC	2	6	26233	26238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581109
538	NC_015865	TGG	2	6	26244	26249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581109
539	NC_015865	GATG	2	8	26283	26290	25 %	25 %	50 %	0 %	341581109
540	NC_015865	GAG	2	6	26361	26366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581109
541	NC_015865	ACC	2	6	26515	26520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581109
542	NC_015865	CCA	2	6	26555	26560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581109
543	NC_015865	GAG	2	6	26667	26672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581109
544	NC_015865	ATT	2	6	26713	26718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581109
545	NC_015865	CGT	2	6	26720	26725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581109
546	NC_015865	CCGC	2	8	26794	26801	0 %	0 %	25 %	75 %	341581109
547	NC_015865	ATC	2	6	26806	26811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581109
548	NC_015865	TTG	2	6	26833	26838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581109
549	NC_015865	CCTTCA	2	12	26870	26881	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	341581109
550	NC_015865	C	6	6	26900	26905	0 %	0 %	0 %	100 %	341581109
551	NC_015865	CGT	2	6	27002	27007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581109
552	NC_015865	TCCAC	2	10	27062	27071	20 %	20 %	0 %	60 %	341581109
553	NC_015865	CCT	2	6	27127	27132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581109
554	NC_015865	ATG	2	6	27136	27141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581109
555	NC_015865	CGA	2	6	27194	27199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581109
556	NC_015865	ACCAC	2	10	27206	27215	40 %	0 %	0 %	60 %	341581109
557	NC_015865	AT	3	6	27289	27294	50 %	50 %	0 %	0 %	341581109
558	NC_015865	GCC	3	9	27352	27360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581109
559	NC_015865	AGG	2	6	27379	27384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581109
560	NC_015865	TGC	2	6	27426	27431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581109
561	NC_015865	CAC	3	9	27443	27451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581110
562	NC_015865	TCC	2	6	27507	27512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581110
563	NC_015865	TTCT	2	8	27544	27551	0 %	75 %	0 %	25 %	341581110
564	NC_015865	ATG	2	6	27660	27665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581110
565	NC_015865	CCT	2	6	27680	27685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581110
566	NC_015865	GAGT	2	8	27731	27738	25 %	25 %	50 %	0 %	341581110
567	NC_015865	GAT	2	6	27755	27760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581110
568	NC_015865	CTG	2	6	27786	27791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581110
569	NC_015865	GTC	2	6	27846	27851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581110
570	NC_015865	TTCC	2	8	27856	27863	0 %	50 %	0 %	50 %	341581110
571	NC_015865	CT	3	6	27864	27869	0 %	50 %	0 %	50 %	341581110
572	NC_015865	GTT	2	6	28097	28102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581110
573	NC_015865	GAA	2	6	28141	28146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581110
574	NC_015865	CCTC	2	8	28191	28198	0 %	25 %	0 %	75 %	341581111
575	NC_015865	GGA	2	6	28209	28214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581111
576	NC_015865	CAT	2	6	28264	28269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581111
577	NC_015865	CTC	2	6	28300	28305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581111
578	NC_015865	TGA	2	6	28347	28352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581111
579	NC_015865	TGAGC	2	10	28368	28377	20 %	20 %	40 %	20 %	341581111
580	NC_015865	AGG	2	6	28382	28387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581111
581	NC_015865	GTC	2	6	28448	28453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581111
582	NC_015865	TCT	2	6	28473	28478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581111
583	NC_015865	TC	3	6	28501	28506	0 %	50 %	0 %	50 %	341581111
584	NC_015865	CTT	2	6	28516	28521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581111
585	NC_015865	GGA	2	6	28539	28544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581111
586	NC_015865	CTC	2	6	28546	28551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581111
587	NC_015865	TTCT	2	8	28570	28577	0 %	75 %	0 %	25 %	341581111
588	NC_015865	CGT	2	6	28605	28610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581111
589	NC_015865	CGG	2	6	28639	28644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581111
590	NC_015865	CGG	2	6	28686	28691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581111
591	NC_015865	AGC	2	6	28724	28729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581111
592	NC_015865	GTCC	2	8	28759	28766	0 %	25 %	25 %	50 %	341581111
593	NC_015865	TCG	3	9	28790	28798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581111
594	NC_015865	GCG	2	6	28811	28816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581111
595	NC_015865	TGT	2	6	28837	28842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581111
596	NC_015865	TGCT	2	8	28955	28962	0 %	50 %	25 %	25 %	341581111
597	NC_015865	TGA	2	6	28995	29000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581111
598	NC_015865	TCC	2	6	29015	29020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581111
599	NC_015865	TGA	2	6	29052	29057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581111
600	NC_015865	CAA	2	6	29082	29087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581111
601	NC_015865	TCG	2	6	29114	29119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581111
602	NC_015865	CCT	2	6	29175	29180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581111
603	NC_015865	GAA	2	6	29185	29190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581111
604	NC_015865	TCC	2	6	29250	29255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581111
605	NC_015865	GCC	2	6	29278	29283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581111
606	NC_015865	GAG	2	6	29317	29322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581111
607	NC_015865	G	7	7	29326	29332	0 %	0 %	100 %	0 %	341581111
608	NC_015865	TGG	2	6	29350	29355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581111
609	NC_015865	CTG	2	6	29432	29437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581111
610	NC_015865	ACA	2	6	29453	29458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581111
611	NC_015865	ACC	2	6	29503	29508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_015865	GA	3	6	29522	29527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015865	GGGT	2	8	29561	29568	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015865	TGTCT	2	10	29602	29611	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
615	NC_015865	CAA	2	6	29614	29619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015865	AACA	2	8	29683	29690	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
617	NC_015865	CCG	2	6	29859	29864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_015865	GCG	2	6	29931	29936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015865	CTC	2	6	30009	30014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581112
620	NC_015865	TCCT	2	8	30040	30047	0 %	50 %	0 %	50 %	341581112
621	NC_015865	CCT	2	6	30077	30082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581112
622	NC_015865	GGAAG	2	10	30137	30146	40 %	0 %	60 %	0 %	341581112
623	NC_015865	CCT	2	6	30200	30205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581112
624	NC_015865	CCT	2	6	30240	30245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581112
625	NC_015865	CTC	2	6	30252	30257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581112
626	NC_015865	CGC	2	6	30411	30416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581112
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628	NC_015865	TGG	2	6	30608	30613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581112
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883	NC_015865	CG	3	6	43586	43591	0 %	0 %	50 %	50 %	341581121
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