MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015865	CAT	2	6	342806	342811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581415
7002	NC_015865	TCC	2	6	342908	342913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581416
7003	NC_015865	TCC	2	6	342959	342964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581416
7004	NC_015865	GGC	2	6	343056	343061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581416
7005	NC_015865	TCC	2	6	343079	343084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581416
7006	NC_015865	TCG	2	6	343148	343153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581416
7007	NC_015865	CTC	2	6	343156	343161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581416
7008	NC_015865	AAG	2	6	343196	343201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581416
7009	NC_015865	GAA	2	6	343233	343238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581416
7010	NC_015865	GGA	2	6	343247	343252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581416
7011	NC_015865	TCC	2	6	343268	343273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581416
7012	NC_015865	CTC	2	6	343279	343284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581416
7013	NC_015865	CCA	2	6	343373	343378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581417
7014	NC_015865	GAA	2	6	343448	343453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581417
7015	NC_015865	CTC	2	6	343497	343502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581417
7016	NC_015865	GAG	2	6	343560	343565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581417
7017	NC_015865	AT	3	6	343591	343596	50 %	50 %	0 %	0 %	341581417
7018	NC_015865	TGTA	2	8	343633	343640	25 %	50 %	25 %	0 %	341581417
7019	NC_015865	TGG	2	6	343739	343744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581417
7020	NC_015865	TC	3	6	343761	343766	0 %	50 %	0 %	50 %	341581417
7021	NC_015865	CTTC	2	8	343796	343803	0 %	50 %	0 %	50 %	341581417
7022	NC_015865	GGA	2	6	343811	343816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581417
7023	NC_015865	CTC	2	6	343853	343858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581418
7024	NC_015865	AAG	2	6	343888	343893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581418
7025	NC_015865	TCC	2	6	344061	344066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581418
7026	NC_015865	CAC	2	6	344161	344166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581418
7027	NC_015865	GTC	2	6	344209	344214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581418
7028	NC_015865	TGA	2	6	344289	344294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581418
7029	NC_015865	TGAGCC	2	12	344325	344336	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341581418
7030	NC_015865	AT	3	6	344338	344343	50 %	50 %	0 %	0 %	341581418
7031	NC_015865	CGC	2	6	344346	344351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581418
7032	NC_015865	ACC	2	6	344372	344377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581418
7033	NC_015865	TGC	2	6	344405	344410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_015865	TAA	2	6	344513	344518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581419
7035	NC_015865	AG	3	6	344586	344591	50 %	0 %	50 %	0 %	341581419
7036	NC_015865	ATAGTC	2	12	344614	344625	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341581419
7037	NC_015865	AAC	2	6	344692	344697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581419
7038	NC_015865	GAT	2	6	344778	344783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581419
7039	NC_015865	GCT	2	6	344859	344864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581419
7040	NC_015865	CCA	2	6	344961	344966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581419
7041	NC_015865	GGACAG	2	12	345009	345020	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	341581419
7042	NC_015865	CGA	2	6	345072	345077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581419
7043	NC_015865	GCC	2	6	345091	345096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581419
7044	NC_015865	GGCGAT	2	12	345198	345209	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	341581419
7045	NC_015865	TTC	2	6	345311	345316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_015865	T	6	6	345431	345436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_015865	TTC	2	6	345450	345455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_015865	TCC	2	6	345497	345502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_015865	CTT	2	6	345516	345521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_015865	TG	3	6	345565	345570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_015865	CTT	2	6	345660	345665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_015865	G	6	6	345690	345695	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_015865	A	6	6	345755	345760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_015865	GAAA	2	8	345927	345934	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_015865	TTG	2	6	345949	345954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_015865	CCG	2	6	346001	346006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7057	NC_015865	G	6	6	346006	346011	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_015865	TAT	2	6	346096	346101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_015865	CTC	2	6	346138	346143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7060	NC_015865	CTTTC	2	10	346148	346157	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7061	NC_015865	CATGCT	2	12	346158	346169	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_015865	GGA	2	6	346218	346223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_015865	TTG	2	6	346235	346240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_015865	TCA	2	6	346267	346272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_015865	AGAGGG	2	12	346276	346287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_015865	TCG	2	6	346337	346342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_015865	GTTCA	2	10	346422	346431	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7068	NC_015865	CG	3	6	346488	346493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7069	NC_015865	CACTCC	2	12	346619	346630	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7070	NC_015865	CAC	2	6	346660	346665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7071	NC_015865	TCA	2	6	346671	346676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_015865	ATG	2	6	346700	346705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_015865	TTG	2	6	346715	346720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_015865	GTC	2	6	346728	346733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581420
7075	NC_015865	GAG	2	6	346797	346802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581420
7076	NC_015865	CGC	2	6	346803	346808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581420
7077	NC_015865	TTG	3	9	346846	346854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581420
7078	NC_015865	CAT	2	6	346896	346901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581420
7079	NC_015865	GCC	2	6	346905	346910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581421
7080	NC_015865	ATG	2	6	346923	346928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581421
7081	NC_015865	GAG	2	6	346979	346984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581421
7082	NC_015865	GGAAGA	2	12	346993	347004	50 %	0 %	50 %	0 %	341581421
7083	NC_015865	CGA	2	6	347011	347016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581421
7084	NC_015865	AT	3	6	347036	347041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_015865	TGT	2	6	347154	347159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581422
7086	NC_015865	CAGCT	2	10	347228	347237	20 %	20 %	20 %	40 %	341581422
7087	NC_015865	A	6	6	347300	347305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_015865	AGA	2	6	347350	347355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581423
7089	NC_015865	TCG	2	6	347376	347381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581423
7090	NC_015865	GGC	2	6	347385	347390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581423
7091	NC_015865	CTT	2	6	347414	347419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581423
7092	NC_015865	GGTCG	2	10	347480	347489	0 %	20 %	60 %	20 %	341581423
7093	NC_015865	CTC	2	6	347516	347521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581423
7094	NC_015865	CTT	2	6	347525	347530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581423
7095	NC_015865	GCA	2	6	347536	347541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581423
7096	NC_015865	CGA	2	6	347590	347595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581423
7097	NC_015865	ACG	3	9	347628	347636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581423
7098	NC_015865	GC	3	6	347703	347708	0 %	0 %	50 %	50 %	341581423
7099	NC_015865	TCG	2	6	347796	347801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581423
7100	NC_015865	TCC	2	6	347829	347834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581423
7101	NC_015865	TGA	2	6	347854	347859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581423
7102	NC_015865	CATC	2	8	347887	347894	25 %	25 %	0 %	50 %	341581423
7103	NC_015865	TGG	2	6	347901	347906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581423
7104	NC_015865	AGA	2	6	347911	347916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581423
7105	NC_015865	GTC	2	6	347918	347923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581423
7106	NC_015865	AGT	2	6	347944	347949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581423
7107	NC_015865	GAA	2	6	348001	348006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581423
7108	NC_015865	TTC	2	6	348033	348038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581423
7109	NC_015865	TCC	2	6	348045	348050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581423
7110	NC_015865	CTT	2	6	348056	348061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581423
7111	NC_015865	CGA	2	6	348085	348090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581423
7112	NC_015865	CGT	2	6	348142	348147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581423
7113	NC_015865	CGA	2	6	348154	348159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581423
7114	NC_015865	CGT	2	6	348211	348216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581423
7115	NC_015865	TGA	2	6	348232	348237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581423
7116	NC_015865	GTC	3	9	348287	348295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581423
7117	NC_015865	CCG	2	6	348324	348329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581423
7118	NC_015865	TCG	2	6	348390	348395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581423
7119	NC_015865	TC	3	6	348409	348414	0 %	50 %	0 %	50 %	341581423
7120	NC_015865	GGAC	2	8	348427	348434	25 %	0 %	50 %	25 %	341581423
7121	NC_015865	GAG	2	6	348476	348481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581423
7122	NC_015865	GGGTC	2	10	348524	348533	0 %	20 %	60 %	20 %	341581423
7123	NC_015865	CAA	2	6	348610	348615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_015865	AT	3	6	348644	348649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7239	NC_015865	GA	3	6	353721	353726	50 %	0 %	50 %	0 %	341581430
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7246	NC_015865	CAG	2	6	354127	354132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581431
7247	NC_015865	ACG	2	6	354194	354199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581431
7248	NC_015865	TGA	2	6	354255	354260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581431
7249	NC_015865	TCT	2	6	354270	354275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581431
7250	NC_015865	CCAT	2	8	354308	354315	25 %	25 %	0 %	50 %	341581431
7251	NC_015865	AGG	2	6	354329	354334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581431
7252	NC_015865	CAG	2	6	354407	354412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581432
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7255	NC_015865	ACC	2	6	354474	354479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581432
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7259	NC_015865	TCG	2	6	354549	354554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581432
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7263	NC_015865	TGA	2	6	354724	354729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581432
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7266	NC_015865	CT	3	6	354861	354866	0 %	50 %	0 %	50 %	341581432
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7274	NC_015865	CGT	2	6	355033	355038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581432
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7279	NC_015865	CGT	2	6	355186	355191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581432
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7289	NC_015865	GTT	2	6	355504	355509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7290	NC_015865	AGG	2	6	355510	355515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7350	NC_015865	GAG	2	6	358830	358835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581436
7351	NC_015865	GCC	2	6	358866	358871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7352	NC_015865	GAG	2	6	358987	358992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581437
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7354	NC_015865	AGG	2	6	359098	359103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581437
7355	NC_015865	CTC	2	6	359125	359130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581437
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7357	NC_015865	ACG	2	6	359360	359365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581437
7358	NC_015865	TC	3	6	359397	359402	0 %	50 %	0 %	50 %	341581437
7359	NC_015865	AGC	2	6	359416	359421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581437
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7361	NC_015865	ATCC	2	8	359526	359533	25 %	25 %	0 %	50 %	341581437
7362	NC_015865	GGC	2	6	359574	359579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581437
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7365	NC_015865	GAG	2	6	359620	359625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581437
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7367	NC_015865	GCGAT	2	10	359663	359672	20 %	20 %	40 %	20 %	341581437
7368	NC_015865	CTC	2	6	359680	359685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581437
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7371	NC_015865	CCT	2	6	359742	359747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581437
7372	NC_015865	CCCTT	2	10	359801	359810	0 %	40 %	0 %	60 %	341581437
7373	NC_015865	CTG	2	6	359818	359823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581437
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7400	NC_015865	ATC	2	6	361263	361268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581438
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7485	NC_015865	CTT	3	9	365115	365123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581444
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7489	NC_015865	TAT	2	6	365461	365466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581444
7490	NC_015865	CT	3	6	365584	365589	0 %	50 %	0 %	50 %	341581444
7491	NC_015865	TCGT	2	8	365760	365767	0 %	50 %	25 %	25 %	341581445
7492	NC_015865	TGA	2	6	365850	365855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581445
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7494	NC_015865	CT	3	6	365898	365903	0 %	50 %	0 %	50 %	341581445
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