MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015865	CCT	2	6	317237	317242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581395
6502	NC_015865	GA	3	6	317274	317279	50 %	0 %	50 %	0 %	341581395
6503	NC_015865	AGG	2	6	317294	317299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581395
6504	NC_015865	CCTT	2	8	317431	317438	0 %	50 %	0 %	50 %	341581395
6505	NC_015865	GAA	2	6	317501	317506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581395
6506	NC_015865	CTT	2	6	317546	317551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581395
6507	NC_015865	GA	3	6	317586	317591	50 %	0 %	50 %	0 %	341581395
6508	NC_015865	GTTC	2	8	317645	317652	0 %	50 %	25 %	25 %	341581395
6509	NC_015865	GGA	2	6	317672	317677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581395
6510	NC_015865	GTGC	2	8	317729	317736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6511	NC_015865	AAT	2	6	317762	317767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_015865	ACA	2	6	317794	317799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_015865	TCC	2	6	317831	317836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581396
6514	NC_015865	TCC	2	6	317844	317849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581396
6515	NC_015865	ACA	3	9	318108	318116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581396
6516	NC_015865	GAACG	2	10	318283	318292	40 %	0 %	40 %	20 %	341581396
6517	NC_015865	TGC	2	6	318336	318341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581396
6518	NC_015865	ACA	2	6	318375	318380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581396
6519	NC_015865	GGT	2	6	318385	318390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581396
6520	NC_015865	GAA	2	6	318440	318445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581396
6521	NC_015865	GC	3	6	318450	318455	0 %	0 %	50 %	50 %	341581396
6522	NC_015865	TAC	2	6	318470	318475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581396
6523	NC_015865	GTC	2	6	318506	318511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581396
6524	NC_015865	TA	3	6	318539	318544	50 %	50 %	0 %	0 %	341581396
6525	NC_015865	GGAG	2	8	318562	318569	25 %	0 %	75 %	0 %	341581396
6526	NC_015865	GTGA	2	8	318611	318618	25 %	25 %	50 %	0 %	341581396
6527	NC_015865	AG	3	6	318688	318693	50 %	0 %	50 %	0 %	341581396
6528	NC_015865	CGCA	2	8	318701	318708	25 %	0 %	25 %	50 %	341581396
6529	NC_015865	C	6	6	318731	318736	0 %	0 %	0 %	100 %	341581396
6530	NC_015865	AG	3	6	318783	318788	50 %	0 %	50 %	0 %	341581396
6531	NC_015865	CCG	2	6	318885	318890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581396
6532	NC_015865	GGC	2	6	318983	318988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581396
6533	NC_015865	ATGG	2	8	319199	319206	25 %	25 %	50 %	0 %	341581396
6534	NC_015865	ATC	2	6	319287	319292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581396
6535	NC_015865	CAGG	2	8	319497	319504	25 %	0 %	50 %	25 %	341581396
6536	NC_015865	CCT	2	6	319549	319554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581396
6537	NC_015865	GTC	2	6	319622	319627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581396
6538	NC_015865	CGA	2	6	319732	319737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581396
6539	NC_015865	GTG	2	6	319802	319807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581396
6540	NC_015865	GCTCC	2	10	319851	319860	0 %	20 %	20 %	60 %	341581396
6541	NC_015865	TAC	2	6	319916	319921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581396
6542	NC_015865	TGGA	2	8	320079	320086	25 %	25 %	50 %	0 %	341581396
6543	NC_015865	CAT	2	6	320162	320167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581396
6544	NC_015865	ATA	2	6	320267	320272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581396
6545	NC_015865	TTC	2	6	320445	320450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581396
6546	NC_015865	CCA	2	6	320481	320486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581396
6547	NC_015865	GGAC	2	8	320619	320626	25 %	0 %	50 %	25 %	341581396
6548	NC_015865	G	6	6	320669	320674	0 %	0 %	100 %	0 %	341581396
6549	NC_015865	GCC	2	6	320755	320760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581396
6550	NC_015865	TCA	2	6	320784	320789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581396
6551	NC_015865	TGC	2	6	320790	320795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581396
6552	NC_015865	GGA	2	6	320824	320829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581396
6553	NC_015865	A	7	7	320876	320882	100 %	0 %	0 %	0 %	341581396
6554	NC_015865	GCC	2	6	320917	320922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581396
6555	NC_015865	GGCGAG	2	12	320930	320941	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	341581396
6556	NC_015865	TCG	2	6	320979	320984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581396
6557	NC_015865	G	6	6	321033	321038	0 %	0 %	100 %	0 %	341581396
6558	NC_015865	GA	3	6	321062	321067	50 %	0 %	50 %	0 %	341581396
6559	NC_015865	GAG	2	6	321107	321112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581396
6560	NC_015865	GGA	2	6	321187	321192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581396
6561	NC_015865	TGG	2	6	321330	321335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581396
6562	NC_015865	CT	3	6	321365	321370	0 %	50 %	0 %	50 %	341581397
6563	NC_015865	CCT	2	6	321422	321427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581397
6564	NC_015865	CTG	2	6	321471	321476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581397
6565	NC_015865	TCC	2	6	321481	321486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581397
6566	NC_015865	TCC	2	6	321574	321579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581397
6567	NC_015865	CGC	2	6	321629	321634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581397
6568	NC_015865	CGG	2	6	321790	321795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581397
6569	NC_015865	GGT	2	6	321800	321805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581397
6570	NC_015865	GA	3	6	321861	321866	50 %	0 %	50 %	0 %	341581397
6571	NC_015865	CGC	2	6	321869	321874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581397
6572	NC_015865	CTG	2	6	321993	321998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581397
6573	NC_015865	ACC	2	6	322018	322023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581397
6574	NC_015865	GCG	2	6	322029	322034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581397
6575	NC_015865	GAG	2	6	322101	322106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581397
6576	NC_015865	GGA	2	6	322130	322135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581397
6577	NC_015865	AAG	2	6	322152	322157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581397
6578	NC_015865	CTA	2	6	322181	322186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581397
6579	NC_015865	GAG	3	9	322251	322259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581397
6580	NC_015865	GCTG	2	8	322282	322289	0 %	25 %	50 %	25 %	341581397
6581	NC_015865	AGAGGG	2	12	322297	322308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581397
6582	NC_015865	G	6	6	322370	322375	0 %	0 %	100 %	0 %	341581397
6583	NC_015865	TGA	2	6	322411	322416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581398
6584	NC_015865	GTC	2	6	322418	322423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581398
6585	NC_015865	GTT	2	6	322427	322432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581398
6586	NC_015865	GAG	2	6	322454	322459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581398
6587	NC_015865	GGC	2	6	322477	322482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581398
6588	NC_015865	GTTCA	2	10	322586	322595	20 %	40 %	20 %	20 %	341581398
6589	NC_015865	CTG	2	6	322604	322609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581398
6590	NC_015865	CCA	2	6	322721	322726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581398
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6593	NC_015865	TCC	2	6	322884	322889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581398
6594	NC_015865	CAAGG	2	10	322942	322951	40 %	0 %	40 %	20 %	341581398
6595	NC_015865	GAC	2	6	322967	322972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581398
6596	NC_015865	CGTT	2	8	323028	323035	0 %	50 %	25 %	25 %	341581398
6597	NC_015865	ACG	2	6	323055	323060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581398
6598	NC_015865	GCT	2	6	323149	323154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581398
6599	NC_015865	ATG	2	6	323177	323182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581398
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6601	NC_015865	GAT	2	6	323207	323212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581398
6602	NC_015865	GTC	2	6	323297	323302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581398
6603	NC_015865	GGC	2	6	323305	323310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581398
6604	NC_015865	GGTTCC	2	12	323320	323331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581398
6605	NC_015865	GAG	2	6	323348	323353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581398
6606	NC_015865	TCT	2	6	323414	323419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581399
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6609	NC_015865	GCGT	2	8	323561	323568	0 %	25 %	50 %	25 %	341581399
6610	NC_015865	GTG	2	6	323596	323601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581399
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6612	NC_015865	TGG	2	6	323633	323638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581399
6613	NC_015865	TGG	3	9	323681	323689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581399
6614	NC_015865	AGTACG	2	12	323690	323701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341581399
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6617	NC_015865	ACCT	2	8	323809	323816	25 %	25 %	0 %	50 %	341581399
6618	NC_015865	TGC	2	6	323822	323827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581399
6619	NC_015865	CG	3	6	323828	323833	0 %	0 %	50 %	50 %	341581399
6620	NC_015865	CG	3	6	323950	323955	0 %	0 %	50 %	50 %	341581399
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6622	NC_015865	A	7	7	324037	324043	100 %	0 %	0 %	0 %	341581399
6623	NC_015865	TCA	2	6	324053	324058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581399
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6988	NC_015865	CGA	2	6	342239	342244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581415
6989	NC_015865	CTG	2	6	342249	342254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581415
6990	NC_015865	CAA	2	6	342305	342310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581415
6991	NC_015865	CGG	2	6	342319	342324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581415
6992	NC_015865	GAA	2	6	342359	342364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581415
6993	NC_015865	TA	3	6	342372	342377	50 %	50 %	0 %	0 %	341581415
6994	NC_015865	GTC	2	6	342378	342383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581415
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