MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015865	GAA	2	6	291981	291986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581365
6002	NC_015865	CCT	2	6	291987	291992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581365
6003	NC_015865	AGC	2	6	292058	292063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581365
6004	NC_015865	GCGA	2	8	292132	292139	25 %	0 %	50 %	25 %	341581365
6005	NC_015865	AGG	2	6	292162	292167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581365
6006	NC_015865	GCG	2	6	292333	292338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581365
6007	NC_015865	GTC	2	6	292378	292383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581365
6008	NC_015865	CGT	2	6	292442	292447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581366
6009	NC_015865	CGG	2	6	292454	292459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581366
6010	NC_015865	CGG	2	6	292480	292485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581366
6011	NC_015865	CGAA	2	8	292523	292530	50 %	0 %	25 %	25 %	341581366
6012	NC_015865	GAA	2	6	292533	292538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581366
6013	NC_015865	ACG	2	6	292567	292572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581366
6014	NC_015865	CCGGA	2	10	292606	292615	20 %	0 %	40 %	40 %	341581366
6015	NC_015865	ACGT	2	8	292674	292681	25 %	25 %	25 %	25 %	341581366
6016	NC_015865	GAA	2	6	292892	292897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581366
6017	NC_015865	CGG	3	9	292910	292918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581366
6018	NC_015865	TCG	2	6	292933	292938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581366
6019	NC_015865	CGT	2	6	292976	292981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581366
6020	NC_015865	GGA	2	6	292988	292993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581366
6021	NC_015865	TTC	2	6	292995	293000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581366
6022	NC_015865	CAG	2	6	293022	293027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581366
6023	NC_015865	GAG	2	6	293154	293159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581366
6024	NC_015865	AAG	2	6	293211	293216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581366
6025	NC_015865	TTC	2	6	293274	293279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581366
6026	NC_015865	GAC	2	6	293282	293287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581366
6027	NC_015865	GCC	2	6	293304	293309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581366
6028	NC_015865	GAC	2	6	293340	293345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581366
6029	NC_015865	GGCG	2	8	293393	293400	0 %	0 %	75 %	25 %	341581366
6030	NC_015865	GA	3	6	293484	293489	50 %	0 %	50 %	0 %	341581366
6031	NC_015865	GGT	2	6	293492	293497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581366
6032	NC_015865	CTG	2	6	293512	293517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581366
6033	NC_015865	CG	3	6	293526	293531	0 %	0 %	50 %	50 %	341581366
6034	NC_015865	GA	3	6	293557	293562	50 %	0 %	50 %	0 %	341581366
6035	NC_015865	GAA	2	6	293567	293572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581366
6036	NC_015865	GCCT	2	8	293758	293765	0 %	25 %	25 %	50 %	341581367
6037	NC_015865	GAG	2	6	293785	293790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581367
6038	NC_015865	ACG	2	6	293818	293823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581367
6039	NC_015865	TAC	2	6	294033	294038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581368
6040	NC_015865	GAC	2	6	294056	294061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581368
6041	NC_015865	GAG	2	6	294087	294092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581368
6042	NC_015865	CTGG	2	8	294145	294152	0 %	25 %	50 %	25 %	341581368
6043	NC_015865	GGC	2	6	294190	294195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581368
6044	NC_015865	CTT	2	6	294211	294216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581368
6045	NC_015865	ACCA	2	8	294246	294253	50 %	0 %	0 %	50 %	341581368
6046	NC_015865	CGT	2	6	294266	294271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581368
6047	NC_015865	GAC	2	6	294276	294281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581368
6048	NC_015865	TCT	2	6	294391	294396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581368
6049	NC_015865	AGCC	2	8	294425	294432	25 %	0 %	25 %	50 %	341581368
6050	NC_015865	TA	3	6	294447	294452	50 %	50 %	0 %	0 %	341581368
6051	NC_015865	CTC	2	6	294488	294493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581368
6052	NC_015865	ACA	2	6	294676	294681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581368
6053	NC_015865	CTC	2	6	294771	294776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581368
6054	NC_015865	TGG	2	6	294781	294786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581368
6055	NC_015865	CAG	2	6	294792	294797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581368
6056	NC_015865	TCG	2	6	294862	294867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581368
6057	NC_015865	GA	3	6	294880	294885	50 %	0 %	50 %	0 %	341581368
6058	NC_015865	CCT	2	6	294953	294958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581368
6059	NC_015865	AAT	2	6	294965	294970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581368
6060	NC_015865	GCT	2	6	294998	295003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581368
6061	NC_015865	TCG	2	6	295015	295020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581368
6062	NC_015865	ACT	2	6	295024	295029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581368
6063	NC_015865	CTC	2	6	295137	295142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581368
6064	NC_015865	AAGG	2	8	295160	295167	50 %	0 %	50 %	0 %	341581368
6065	NC_015865	CAT	2	6	295172	295177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581368
6066	NC_015865	GCC	2	6	295224	295229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581368
6067	NC_015865	AGGGA	2	10	295402	295411	40 %	0 %	60 %	0 %	341581368
6068	NC_015865	TGG	2	6	295438	295443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581368
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6070	NC_015865	GCT	2	6	295514	295519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581368
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6072	NC_015865	CTC	2	6	295813	295818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581369
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6074	NC_015865	A	6	6	295834	295839	100 %	0 %	0 %	0 %	341581369
6075	NC_015865	CGA	2	6	295971	295976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581369
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6077	NC_015865	GAG	2	6	296037	296042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581369
6078	NC_015865	TCA	2	6	296048	296053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581369
6079	NC_015865	AGGC	2	8	296082	296089	25 %	0 %	50 %	25 %	341581369
6080	NC_015865	CGG	2	6	296103	296108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581369
6081	NC_015865	GAA	2	6	296123	296128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581369
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6086	NC_015865	GAACG	2	10	296253	296262	40 %	0 %	40 %	20 %	341581369
6087	NC_015865	GAG	2	6	296272	296277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581369
6088	NC_015865	CGAC	2	8	296321	296328	25 %	0 %	25 %	50 %	341581369
6089	NC_015865	C	6	6	296414	296419	0 %	0 %	0 %	100 %	341581369
6090	NC_015865	CGG	2	6	296484	296489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581369
6091	NC_015865	GGAA	2	8	296510	296517	50 %	0 %	50 %	0 %	341581369
6092	NC_015865	AGG	2	6	296575	296580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581369
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6094	NC_015865	GA	3	6	296716	296721	50 %	0 %	50 %	0 %	341581369
6095	NC_015865	ACC	2	6	296783	296788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581369
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6101	NC_015865	CCAG	2	8	297053	297060	25 %	0 %	25 %	50 %	341581371
6102	NC_015865	CTTC	2	8	297077	297084	0 %	50 %	0 %	50 %	341581371
6103	NC_015865	CTT	2	6	297093	297098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581371
6104	NC_015865	CT	3	6	297183	297188	0 %	50 %	0 %	50 %	341581371
6105	NC_015865	CAA	2	6	297215	297220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581371
6106	NC_015865	CTTT	2	8	297228	297235	0 %	75 %	0 %	25 %	341581371
6107	NC_015865	TCC	2	6	297275	297280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581371
6108	NC_015865	CTC	2	6	297423	297428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581371
6109	NC_015865	TGAG	2	8	297431	297438	25 %	25 %	50 %	0 %	341581371
6110	NC_015865	GTA	2	6	297489	297494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581371
6111	NC_015865	ACT	2	6	297541	297546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581371
6112	NC_015865	CGT	2	6	297627	297632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581371
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6118	NC_015865	CCTGA	2	10	297774	297783	20 %	20 %	20 %	40 %	341581371
6119	NC_015865	CGTC	2	8	297803	297810	0 %	25 %	25 %	50 %	341581371
6120	NC_015865	GAA	2	6	297852	297857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581371
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6122	NC_015865	TCT	2	6	298048	298053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581371
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6183	NC_015865	GTC	2	6	300971	300976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6232	NC_015865	CTC	2	6	303396	303401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581376
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6237	NC_015865	TG	3	6	303873	303878	0 %	50 %	50 %	0 %	341581376
6238	NC_015865	GGA	2	6	303923	303928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581376
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6240	NC_015865	TGC	2	6	304124	304129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581376
6241	NC_015865	CGT	2	6	304139	304144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581376
6242	NC_015865	AAT	2	6	304146	304151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581376
6243	NC_015865	TAAA	2	8	304196	304203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_015865	CCT	2	6	304296	304301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581377
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6246	NC_015865	CTT	2	6	304440	304445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581377
6247	NC_015865	ATGCG	2	10	304454	304463	20 %	20 %	40 %	20 %	341581377
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6366	NC_015865	CTT	2	6	310670	310675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581384
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