MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015865	CCAAC	2	10	267088	267097	40 %	0 %	0 %	60 %	341581344
5502	NC_015865	CGC	2	6	267113	267118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581344
5503	NC_015865	TC	3	6	267119	267124	0 %	50 %	0 %	50 %	341581344
5504	NC_015865	TC	3	6	267138	267143	0 %	50 %	0 %	50 %	341581344
5505	NC_015865	G	6	6	267171	267176	0 %	0 %	100 %	0 %	341581344
5506	NC_015865	TGG	2	6	267223	267228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581344
5507	NC_015865	TTC	2	6	267231	267236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581344
5508	NC_015865	CGC	2	6	267296	267301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581344
5509	NC_015865	GAG	2	6	267311	267316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581344
5510	NC_015865	CTC	2	6	267348	267353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581344
5511	NC_015865	TCC	2	6	267568	267573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581344
5512	NC_015865	GGC	2	6	267587	267592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581344
5513	NC_015865	ATA	2	6	267708	267713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581344
5514	NC_015865	CTG	2	6	267750	267755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581344
5515	NC_015865	CGT	2	6	267779	267784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581344
5516	NC_015865	CCG	2	6	267802	267807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581344
5517	NC_015865	TGA	2	6	267861	267866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581344
5518	NC_015865	CCCT	2	8	267896	267903	0 %	25 %	0 %	75 %	341581345
5519	NC_015865	CT	3	6	268001	268006	0 %	50 %	0 %	50 %	341581345
5520	NC_015865	GGAA	2	8	268013	268020	50 %	0 %	50 %	0 %	341581345
5521	NC_015865	GTC	2	6	268094	268099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581345
5522	NC_015865	CCT	2	6	268140	268145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581345
5523	NC_015865	CCTT	2	8	268149	268156	0 %	50 %	0 %	50 %	341581345
5524	NC_015865	CGA	2	6	268197	268202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581345
5525	NC_015865	TAT	2	6	268207	268212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581345
5526	NC_015865	CTC	2	6	268213	268218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581345
5527	NC_015865	CCT	2	6	268269	268274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581345
5528	NC_015865	CGT	2	6	268392	268397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581345
5529	NC_015865	TCG	2	6	268412	268417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581345
5530	NC_015865	TTC	2	6	268459	268464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581345
5531	NC_015865	TCCA	2	8	268498	268505	25 %	25 %	0 %	50 %	341581345
5532	NC_015865	TCC	2	6	268514	268519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581346
5533	NC_015865	TC	3	6	268520	268525	0 %	50 %	0 %	50 %	341581346
5534	NC_015865	GTC	2	6	268561	268566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581346
5535	NC_015865	AGT	2	6	268584	268589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581346
5536	NC_015865	CGC	2	6	268608	268613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581346
5537	NC_015865	CCT	2	6	268620	268625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581346
5538	NC_015865	CAT	2	6	268651	268656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581346
5539	NC_015865	CCG	2	6	268658	268663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581346
5540	NC_015865	CTT	2	6	268675	268680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581346
5541	NC_015865	CTC	2	6	268786	268791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581346
5542	NC_015865	TCC	2	6	268892	268897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581346
5543	NC_015865	TC	3	6	268902	268907	0 %	50 %	0 %	50 %	341581346
5544	NC_015865	TCC	2	6	268921	268926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581346
5545	NC_015865	GCC	2	6	269020	269025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581346
5546	NC_015865	TCG	2	6	269084	269089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581346
5547	NC_015865	GAT	2	6	269248	269253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581346
5548	NC_015865	CCCTG	2	10	269260	269269	0 %	20 %	20 %	60 %	341581346
5549	NC_015865	ATC	2	6	269306	269311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581346
5550	NC_015865	TTCC	2	8	269320	269327	0 %	50 %	0 %	50 %	341581346
5551	NC_015865	GTTTC	2	10	269409	269418	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5552	NC_015865	TTA	2	6	269430	269435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_015865	TAA	2	6	269452	269457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_015865	GA	3	6	269459	269464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_015865	GGA	2	6	269506	269511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581347
5556	NC_015865	GA	3	6	269541	269546	50 %	0 %	50 %	0 %	341581347
5557	NC_015865	GCT	2	6	269559	269564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581347
5558	NC_015865	CGG	2	6	269615	269620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581347
5559	NC_015865	CTC	2	6	269767	269772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581347
5560	NC_015865	GAG	2	6	269785	269790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581347
5561	NC_015865	GGTCT	2	10	269815	269824	0 %	40 %	40 %	20 %	341581347
5562	NC_015865	GACGTT	2	12	269830	269841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341581347
5563	NC_015865	GCG	2	6	269888	269893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581347
5564	NC_015865	GAAG	2	8	269922	269929	50 %	0 %	50 %	0 %	341581347
5565	NC_015865	AGC	2	6	269966	269971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581347
5566	NC_015865	GATG	2	8	269984	269991	25 %	25 %	50 %	0 %	341581347
5567	NC_015865	GGT	2	6	270016	270021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_015865	GAG	3	9	270190	270198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581348
5569	NC_015865	CTT	2	6	270234	270239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581348
5570	NC_015865	TGT	2	6	270324	270329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581348
5571	NC_015865	CTG	2	6	270565	270570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581348
5572	NC_015865	TCGG	2	8	270586	270593	0 %	25 %	50 %	25 %	341581348
5573	NC_015865	GAA	2	6	270603	270608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581348
5574	NC_015865	AGG	2	6	270638	270643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581348
5575	NC_015865	AGA	2	6	270665	270670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581348
5576	NC_015865	TCA	2	6	270674	270679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581348
5577	NC_015865	GGC	2	6	270681	270686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581348
5578	NC_015865	CGG	2	6	270705	270710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581348
5579	NC_015865	GAG	2	6	270754	270759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581348
5580	NC_015865	GTC	2	6	270760	270765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581348
5581	NC_015865	GGGAG	2	10	270845	270854	20 %	0 %	80 %	0 %	341581348
5582	NC_015865	GAG	2	6	270865	270870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581348
5583	NC_015865	CAACGA	2	12	270897	270908	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	341581348
5584	NC_015865	CTT	2	6	270918	270923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581348
5585	NC_015865	GGAG	2	8	270945	270952	25 %	0 %	75 %	0 %	341581348
5586	NC_015865	GAGG	2	8	271066	271073	25 %	0 %	75 %	0 %	341581349
5587	NC_015865	TTCC	2	8	271187	271194	0 %	50 %	0 %	50 %	341581349
5588	NC_015865	GAA	2	6	271214	271219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581349
5589	NC_015865	CGT	2	6	271220	271225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581349
5590	NC_015865	GAC	2	6	271233	271238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581349
5591	NC_015865	TGGG	2	8	271298	271305	0 %	25 %	75 %	0 %	341581349
5592	NC_015865	CTA	2	6	271325	271330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581349
5593	NC_015865	CTCGG	2	10	271332	271341	0 %	20 %	40 %	40 %	341581349
5594	NC_015865	CCAAGG	2	12	271342	271353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581349
5595	NC_015865	TCA	2	6	271363	271368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581349
5596	NC_015865	AAT	2	6	271431	271436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_015865	AGG	2	6	271451	271456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_015865	GAC	2	6	271554	271559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581350
5599	NC_015865	GGA	2	6	271686	271691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581350
5600	NC_015865	AGG	2	6	271711	271716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581350
5601	NC_015865	GAG	2	6	271809	271814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581350
5602	NC_015865	ACG	2	6	271852	271857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581350
5603	NC_015865	TGA	2	6	271859	271864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581350
5604	NC_015865	ACC	2	6	271978	271983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581350
5605	NC_015865	AGGG	2	8	272025	272032	25 %	0 %	75 %	0 %	341581350
5606	NC_015865	CGA	2	6	272033	272038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581350
5607	NC_015865	GAG	2	6	272073	272078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581350
5608	NC_015865	AGA	2	6	272079	272084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581350
5609	NC_015865	GAG	2	6	272100	272105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581350
5610	NC_015865	GAGGAC	2	12	272112	272123	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	341581350
5611	NC_015865	CTA	2	6	272157	272162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581350
5612	NC_015865	CCGCT	2	10	272163	272172	0 %	20 %	20 %	60 %	341581350
5613	NC_015865	GGA	2	6	272174	272179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581350
5614	NC_015865	GAAG	2	8	272276	272283	50 %	0 %	50 %	0 %	341581350
5615	NC_015865	GAA	2	6	272300	272305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581350
5616	NC_015865	AAG	2	6	272472	272477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581350
5617	NC_015865	CGCTC	2	10	272516	272525	0 %	20 %	20 %	60 %	341581350
5618	NC_015865	TCG	2	6	272575	272580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581350
5619	NC_015865	ATGA	2	8	272661	272668	50 %	25 %	25 %	0 %	341581350
5620	NC_015865	CTC	2	6	272679	272684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581350
5621	NC_015865	GAC	2	6	272702	272707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581350
5622	NC_015865	GAG	2	6	272763	272768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581350
5623	NC_015865	GGA	2	6	272788	272793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581350
5624	NC_015865	GAA	2	6	272816	272821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581350
5625	NC_015865	AG	3	6	272884	272889	50 %	0 %	50 %	0 %	341581350
5626	NC_015865	CAA	2	6	272966	272971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581350
5627	NC_015865	TCG	2	6	272977	272982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581350
5628	NC_015865	CG	3	6	273013	273018	0 %	0 %	50 %	50 %	341581350
5629	NC_015865	GAG	2	6	273042	273047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581350
5630	NC_015865	CG	4	8	273050	273057	0 %	0 %	50 %	50 %	341581350
5631	NC_015865	GAGG	2	8	273069	273076	25 %	0 %	75 %	0 %	341581350
5632	NC_015865	TCG	2	6	273079	273084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581350
5633	NC_015865	CGT	2	6	273182	273187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581350
5634	NC_015865	GCG	2	6	273199	273204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581350
5635	NC_015865	GAAG	2	8	273233	273240	50 %	0 %	50 %	0 %	341581350
5636	NC_015865	ACGGCT	2	12	273379	273390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341581350
5637	NC_015865	AGG	2	6	273394	273399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581350
5638	NC_015865	GAA	2	6	273414	273419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581350
5639	NC_015865	GTC	2	6	273531	273536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581350
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5641	NC_015865	GTC	3	9	273591	273599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581350
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5644	NC_015865	CAGA	2	8	273726	273733	50 %	0 %	25 %	25 %	341581350
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5653	NC_015865	TGA	2	6	274129	274134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581350
5654	NC_015865	CGC	2	6	274142	274147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581350
5655	NC_015865	CTC	2	6	274185	274190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581350
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5657	NC_015865	CGT	2	6	274271	274276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581350
5658	NC_015865	CGT	2	6	274280	274285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581350
5659	NC_015865	CCA	2	6	274286	274291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581350
5660	NC_015865	A	6	6	274393	274398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5661	NC_015865	CAG	2	6	274469	274474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581351
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5663	NC_015865	GTA	2	6	274523	274528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581351
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5666	NC_015865	CGG	2	6	274661	274666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581351
5667	NC_015865	CCA	2	6	274699	274704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581351
5668	NC_015865	GAG	2	6	274856	274861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581351
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5682	NC_015865	GCT	2	6	275407	275412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581352
5683	NC_015865	CGGTTA	2	12	275472	275483	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341581352
5684	NC_015865	CTGG	2	8	275536	275543	0 %	25 %	50 %	25 %	341581352
5685	NC_015865	GTG	2	6	275690	275695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581352
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5688	NC_015865	TTCCC	2	10	275799	275808	0 %	40 %	0 %	60 %	341581352
5689	NC_015865	TGA	3	9	275811	275819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581352
5690	NC_015865	TAC	2	6	275842	275847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581352
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5694	NC_015865	CTG	2	6	276048	276053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581352
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5702	NC_015865	TCG	2	6	276299	276304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581352
5703	NC_015865	CCGT	2	8	276494	276501	0 %	25 %	25 %	50 %	341581352
5704	NC_015865	CTG	2	6	276535	276540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581352
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5707	NC_015865	CCTCGA	2	12	276759	276770	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341581352
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5710	NC_015865	CGT	2	6	276981	276986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581352
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5720	NC_015865	ACC	2	6	277439	277444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581352
5721	NC_015865	TCCC	2	8	277465	277472	0 %	25 %	0 %	75 %	341581353
5722	NC_015865	GGA	2	6	277484	277489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581353
5723	NC_015865	TCC	2	6	277495	277500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581353
5724	NC_015865	TTC	2	6	277509	277514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581353
5725	NC_015865	TAT	2	6	277758	277763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581353
5726	NC_015865	CTC	2	6	277782	277787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581353
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5728	NC_015865	TGA	2	6	277847	277852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581353
5729	NC_015865	TCG	2	6	277892	277897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581353
5730	NC_015865	TCG	2	6	277900	277905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581353
5731	NC_015865	GACC	2	8	278009	278016	25 %	0 %	25 %	50 %	341581353
5732	NC_015865	TTCTCC	2	12	278041	278052	0 %	50 %	0 %	50 %	341581353
5733	NC_015865	GAA	2	6	278079	278084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581353
5734	NC_015865	TGA	2	6	278503	278508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581354
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5737	NC_015865	AT	3	6	278733	278738	50 %	50 %	0 %	0 %	341581354
5738	NC_015865	CTG	2	6	278840	278845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581354
5739	NC_015865	GAG	2	6	279004	279009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581355
5740	NC_015865	GAA	2	6	279019	279024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581355
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5742	NC_015865	AGT	2	6	279057	279062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581355
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5988	NC_015865	GAT	2	6	291078	291083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581365
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5991	NC_015865	TCG	2	6	291443	291448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581365
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