MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015865	TA	3	6	243302	243307	50 %	50 %	0 %	0 %	341581322
5002	NC_015865	CCT	2	6	243344	243349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581322
5003	NC_015865	TC	4	8	243355	243362	0 %	50 %	0 %	50 %	341581322
5004	NC_015865	TAT	2	6	243381	243386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581322
5005	NC_015865	TCT	2	6	243481	243486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581322
5006	NC_015865	GTC	2	6	243504	243509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581322
5007	NC_015865	TTC	2	6	243540	243545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581322
5008	NC_015865	GAT	2	6	243607	243612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581322
5009	NC_015865	ACC	2	6	243624	243629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_015865	TCT	2	6	243662	243667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581323
5011	NC_015865	CTC	2	6	243684	243689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
5012	NC_015865	TCC	3	9	243733	243741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
5013	NC_015865	ACG	2	6	243811	243816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581323
5014	NC_015865	CTC	2	6	243876	243881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
5015	NC_015865	TGA	2	6	243938	243943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581323
5016	NC_015865	TTCT	2	8	243955	243962	0 %	75 %	0 %	25 %	341581323
5017	NC_015865	GC	3	6	244004	244009	0 %	0 %	50 %	50 %	341581323
5018	NC_015865	GAG	2	6	244035	244040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581323
5019	NC_015865	GTC	2	6	244059	244064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581323
5020	NC_015865	TCT	3	9	244085	244093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581323
5021	NC_015865	GCCCC	2	10	244096	244105	0 %	0 %	20 %	80 %	341581323
5022	NC_015865	GC	3	6	244112	244117	0 %	0 %	50 %	50 %	341581323
5023	NC_015865	CAT	2	6	244145	244150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581323
5024	NC_015865	GTT	2	6	244197	244202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581323
5025	NC_015865	CTC	2	6	244227	244232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
5026	NC_015865	CTT	2	6	244245	244250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581323
5027	NC_015865	TCGCC	2	10	244256	244265	0 %	20 %	20 %	60 %	341581323
5028	NC_015865	CCT	2	6	244328	244333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
5029	NC_015865	GGT	2	6	244422	244427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581323
5030	NC_015865	CCT	2	6	244436	244441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
5031	NC_015865	CTC	2	6	244475	244480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
5032	NC_015865	CCT	2	6	244547	244552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
5033	NC_015865	GAG	2	6	244581	244586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581323
5034	NC_015865	TGA	2	6	244589	244594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581323
5035	NC_015865	CCT	2	6	244619	244624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
5036	NC_015865	CTT	2	6	244824	244829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581323
5037	NC_015865	TCC	2	6	244883	244888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
5038	NC_015865	CGG	2	6	244949	244954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581323
5039	NC_015865	TCG	2	6	245017	245022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581323
5040	NC_015865	CAG	2	6	245040	245045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581323
5041	NC_015865	GAG	2	6	245046	245051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581323
5042	NC_015865	CTT	2	6	245094	245099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581323
5043	NC_015865	CTC	2	6	245115	245120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
5044	NC_015865	GGA	2	6	245198	245203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_015865	GAA	2	6	245235	245240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_015865	AAAGA	2	10	245243	245252	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_015865	TCC	2	6	245278	245283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
5048	NC_015865	TCG	2	6	245365	245370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
5049	NC_015865	GTC	2	6	245460	245465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
5050	NC_015865	CTG	2	6	245470	245475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
5051	NC_015865	CGA	2	6	245573	245578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581324
5052	NC_015865	GCG	2	6	245579	245584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581324
5053	NC_015865	CGT	2	6	245636	245641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
5054	NC_015865	CCA	2	6	245721	245726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581324
5055	NC_015865	GGT	2	6	245765	245770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581324
5056	NC_015865	CGT	2	6	245825	245830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
5057	NC_015865	GGCG	2	8	245832	245839	0 %	0 %	75 %	25 %	341581324
5058	NC_015865	GAG	2	6	245919	245924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581324
5059	NC_015865	CGG	2	6	245972	245977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581324
5060	NC_015865	TCC	2	6	246016	246021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
5061	NC_015865	GTC	2	6	246138	246143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
5062	NC_015865	CGC	2	6	246155	246160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581324
5063	NC_015865	CCA	2	6	246194	246199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581324
5064	NC_015865	TTG	2	6	246250	246255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581324
5065	NC_015865	CTTC	2	8	246270	246277	0 %	50 %	0 %	50 %	341581324
5066	NC_015865	CG	3	6	246279	246284	0 %	0 %	50 %	50 %	341581324
5067	NC_015865	CTC	2	6	246333	246338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
5068	NC_015865	CTT	2	6	246357	246362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581324
5069	NC_015865	GAA	2	6	246363	246368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581324
5070	NC_015865	TGG	2	6	246458	246463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581324
5071	NC_015865	GGT	2	6	246467	246472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581324
5072	NC_015865	GGCT	2	8	246521	246528	0 %	25 %	50 %	25 %	341581324
5073	NC_015865	CTT	2	6	246537	246542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581324
5074	NC_015865	CTT	2	6	246570	246575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581324
5075	NC_015865	TCC	2	6	246597	246602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
5076	NC_015865	GCCT	2	8	246610	246617	0 %	25 %	25 %	50 %	341581324
5077	NC_015865	TCG	2	6	246632	246637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
5078	NC_015865	TC	3	6	246651	246656	0 %	50 %	0 %	50 %	341581324
5079	NC_015865	CTC	2	6	246696	246701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
5080	NC_015865	GGT	2	6	246726	246731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581324
5081	NC_015865	CGG	2	6	246749	246754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581324
5082	NC_015865	TCG	2	6	246772	246777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
5083	NC_015865	TGA	3	9	246779	246787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581324
5084	NC_015865	TCG	2	6	246799	246804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
5085	NC_015865	GAT	2	6	246816	246821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581324
5086	NC_015865	GCC	2	6	246888	246893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581324
5087	NC_015865	ATC	2	6	246973	246978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581324
5088	NC_015865	TCG	2	6	247018	247023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
5089	NC_015865	CGC	2	6	247049	247054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581324
5090	NC_015865	CTC	2	6	247074	247079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
5091	NC_015865	CCT	2	6	247100	247105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
5092	NC_015865	GGA	2	6	247191	247196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_015865	GTTAA	2	10	247235	247244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_015865	ACC	2	6	247257	247262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_015865	AGA	2	6	247402	247407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_015865	CTT	2	6	247417	247422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581325
5097	NC_015865	ACG	3	9	247439	247447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581325
5098	NC_015865	TGA	2	6	247473	247478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581325
5099	NC_015865	CT	3	6	247513	247518	0 %	50 %	0 %	50 %	341581325
5100	NC_015865	CTC	2	6	247546	247551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581325
5101	NC_015865	GAC	2	6	247645	247650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581325
5102	NC_015865	TGT	2	6	247707	247712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581325
5103	NC_015865	TCCTG	2	10	247722	247731	0 %	40 %	20 %	40 %	341581325
5104	NC_015865	CCA	2	6	247860	247865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581325
5105	NC_015865	CACCGT	2	12	247978	247989	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341581325
5106	NC_015865	CGC	2	6	248031	248036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581325
5107	NC_015865	CCTG	2	8	248121	248128	0 %	25 %	25 %	50 %	341581325
5108	NC_015865	AACT	2	8	248182	248189	50 %	25 %	0 %	25 %	341581325
5109	NC_015865	CAG	2	6	248264	248269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_015865	GAG	2	6	248312	248317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_015865	ACG	2	6	248336	248341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_015865	TCC	2	6	248358	248363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_015865	GAG	2	6	248374	248379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015865	GAA	2	6	248387	248392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581326
5115	NC_015865	AGT	2	6	248399	248404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581326
5116	NC_015865	CAG	2	6	248461	248466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581326
5117	NC_015865	TGA	2	6	248496	248501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581326
5118	NC_015865	AGGCC	2	10	248502	248511	20 %	0 %	40 %	40 %	341581326
5119	NC_015865	AACGG	2	10	248549	248558	40 %	0 %	40 %	20 %	341581326
5120	NC_015865	AGA	2	6	248613	248618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581326
5121	NC_015865	CCA	2	6	248632	248637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581326
5122	NC_015865	AGC	2	6	248643	248648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581326
5123	NC_015865	AAGAGG	2	12	248690	248701	50 %	0 %	50 %	0 %	341581326
5124	NC_015865	CTT	2	6	248739	248744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_015865	GAC	2	6	248792	248797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_015865	TGA	2	6	248817	248822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5128	NC_015865	ATG	2	6	248907	248912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581327
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5154	NC_015865	TGGA	2	8	250456	250463	25 %	25 %	50 %	0 %	341581328
5155	NC_015865	ACC	2	6	250514	250519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5163	NC_015865	CCT	2	6	250820	250825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5231	NC_015865	GT	3	6	254522	254527	0 %	50 %	50 %	0 %	341581332
5232	NC_015865	CGAAGT	2	12	254532	254543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341581332
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5235	NC_015865	TCT	2	6	254676	254681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581333
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5240	NC_015865	GAC	2	6	254874	254879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581333
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5242	NC_015865	ACC	2	6	254914	254919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581333
5243	NC_015865	CGA	2	6	254930	254935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581333
5244	NC_015865	CCA	2	6	254960	254965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581333
5245	NC_015865	CCCA	2	8	255063	255070	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5246	NC_015865	TA	3	6	255093	255098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5343	NC_015865	CTTTT	2	10	259191	259200	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5344	NC_015865	T	6	6	259222	259227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5345	NC_015865	TGTT	2	8	259252	259259	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5347	NC_015865	TTTA	2	8	259320	259327	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5348	NC_015865	GGT	2	6	259350	259355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5349	NC_015865	G	6	6	259365	259370	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5350	NC_015865	GGA	2	6	259374	259379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5351	NC_015865	A	6	6	259390	259395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5352	NC_015865	GTA	3	9	259411	259419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581338
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5355	NC_015865	GGC	2	6	259556	259561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581338
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5411	NC_015865	GGCCG	2	10	262435	262444	0 %	0 %	60 %	40 %	341581339
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5479	NC_015865	ATA	2	6	265771	265776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581342
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5483	NC_015865	CTC	2	6	266074	266079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581342
5484	NC_015865	GCG	2	6	266156	266161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5485	NC_015865	TAT	2	6	266286	266291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5486	NC_015865	ATC	2	6	266339	266344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5488	NC_015865	TCT	2	6	266462	266467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581343
5489	NC_015865	TCC	2	6	266482	266487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581343
5490	NC_015865	GAA	2	6	266493	266498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581343
5491	NC_015865	TG	3	6	266569	266574	0 %	50 %	50 %	0 %	341581343
5492	NC_015865	TGG	2	6	266605	266610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581343
5493	NC_015865	ATA	2	6	266628	266633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581343
5494	NC_015865	C	7	7	266677	266683	0 %	0 %	0 %	100 %	341581343
5495	NC_015865	T	7	7	266744	266750	0 %	100 %	0 %	0 %	341581343
5496	NC_015865	C	6	6	266871	266876	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5497	NC_015865	CAC	2	6	266926	266931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5498	NC_015865	CCA	2	6	266945	266950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5499	NC_015865	GCG	2	6	267011	267016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581344
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