MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 41954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015865	CTA	2	6	219903	219908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581302
4502	NC_015865	CAA	2	6	219912	219917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581302
4503	NC_015865	CAT	2	6	219975	219980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581302
4504	NC_015865	GAT	2	6	219996	220001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581302
4505	NC_015865	GAG	2	6	220015	220020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581302
4506	NC_015865	GGC	2	6	220114	220119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581302
4507	NC_015865	GAA	2	6	220233	220238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581302
4508	NC_015865	TCA	2	6	220250	220255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581302
4509	NC_015865	AGG	2	6	220288	220293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581302
4510	NC_015865	GAG	2	6	220315	220320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581302
4511	NC_015865	ATA	2	6	220330	220335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581302
4512	NC_015865	CCA	2	6	220376	220381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581302
4513	NC_015865	CCG	2	6	220516	220521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581302
4514	NC_015865	AAG	2	6	220525	220530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581302
4515	NC_015865	GGC	2	6	220531	220536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581302
4516	NC_015865	CGG	2	6	220541	220546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581302
4517	NC_015865	GGA	2	6	220563	220568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581302
4518	NC_015865	AGC	2	6	220646	220651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581302
4519	NC_015865	CAA	2	6	220662	220667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581302
4520	NC_015865	TCG	2	6	220679	220684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581302
4521	NC_015865	GAA	2	6	220686	220691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581302
4522	NC_015865	AAC	2	6	220711	220716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581302
4523	NC_015865	GAC	3	9	220733	220741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581302
4524	NC_015865	TCG	2	6	220750	220755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581303
4525	NC_015865	GAC	2	6	220878	220883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581303
4526	NC_015865	AAG	3	9	220968	220976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581303
4527	NC_015865	CTT	2	6	221063	221068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581303
4528	NC_015865	GAA	2	6	221075	221080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581303
4529	NC_015865	TTC	2	6	221167	221172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581303
4530	NC_015865	TCC	2	6	221197	221202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581303
4531	NC_015865	AAC	2	6	221322	221327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581303
4532	NC_015865	GAA	2	6	221333	221338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581303
4533	NC_015865	AAC	2	6	221454	221459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581303
4534	NC_015865	CCTGGC	2	12	221477	221488	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	341581303
4535	NC_015865	CTA	2	6	221546	221551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581303
4536	NC_015865	CCTTC	2	10	221639	221648	0 %	40 %	0 %	60 %	341581303
4537	NC_015865	CGA	2	6	221651	221656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581303
4538	NC_015865	GCA	2	6	221680	221685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581303
4539	NC_015865	TCA	2	6	221692	221697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581303
4540	NC_015865	GAG	2	6	221729	221734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581303
4541	NC_015865	ACC	2	6	221758	221763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581303
4542	NC_015865	CTC	2	6	221778	221783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581303
4543	NC_015865	CGA	2	6	221840	221845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581303
4544	NC_015865	GAA	2	6	221861	221866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581303
4545	NC_015865	GAA	2	6	221909	221914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581303
4546	NC_015865	CTC	2	6	221964	221969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581303
4547	NC_015865	GC	3	6	222001	222006	0 %	0 %	50 %	50 %	341581304
4548	NC_015865	AAC	2	6	222007	222012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581304
4549	NC_015865	GAG	2	6	222049	222054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581304
4550	NC_015865	CGA	2	6	222083	222088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581304
4551	NC_015865	GCCC	2	8	222143	222150	0 %	0 %	25 %	75 %	341581304
4552	NC_015865	CGC	2	6	222183	222188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581304
4553	NC_015865	AACG	2	8	222253	222260	50 %	0 %	25 %	25 %	341581304
4554	NC_015865	CCT	2	6	222282	222287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581304
4555	NC_015865	CCT	2	6	222354	222359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581304
4556	NC_015865	CT	3	6	222405	222410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_015865	T	6	6	222418	222423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_015865	GGT	2	6	222461	222466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_015865	CAT	2	6	222656	222661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581305
4560	NC_015865	CGA	2	6	222698	222703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581305
4561	NC_015865	GGAA	2	8	222720	222727	50 %	0 %	50 %	0 %	341581305
4562	NC_015865	GCT	2	6	222866	222871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581305
4563	NC_015865	TTC	2	6	222873	222878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581305
4564	NC_015865	CTC	2	6	222937	222942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581305
4565	NC_015865	TGG	2	6	223036	223041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581305
4566	NC_015865	GAA	2	6	223042	223047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581305
4567	NC_015865	CTA	2	6	223067	223072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581305
4568	NC_015865	C	6	6	223075	223080	0 %	0 %	0 %	100 %	341581305
4569	NC_015865	G	6	6	223202	223207	0 %	0 %	100 %	0 %	341581305
4570	NC_015865	TA	3	6	223268	223273	50 %	50 %	0 %	0 %	341581305
4571	NC_015865	GGACG	2	10	223380	223389	20 %	0 %	60 %	20 %	341581305
4572	NC_015865	GTG	2	6	223431	223436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581305
4573	NC_015865	GAC	2	6	223461	223466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581305
4574	NC_015865	CG	3	6	223500	223505	0 %	0 %	50 %	50 %	341581305
4575	NC_015865	TAC	3	9	223521	223529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581305
4576	NC_015865	GAG	2	6	223581	223586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581305
4577	NC_015865	GAG	2	6	223590	223595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581305
4578	NC_015865	GGA	2	6	223607	223612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581305
4579	NC_015865	GAG	2	6	223626	223631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581305
4580	NC_015865	CTC	2	6	223650	223655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581305
4581	NC_015865	CAGG	2	8	223664	223671	25 %	0 %	50 %	25 %	341581305
4582	NC_015865	CCA	2	6	223751	223756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581305
4583	NC_015865	CCGG	2	8	223790	223797	0 %	0 %	50 %	50 %	341581305
4584	NC_015865	CGT	2	6	223814	223819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581305
4585	NC_015865	ACG	2	6	223822	223827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581305
4586	NC_015865	TGG	2	6	223828	223833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581305
4587	NC_015865	CTCC	2	8	223874	223881	0 %	25 %	0 %	75 %	341581305
4588	NC_015865	AGG	3	9	223893	223901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581305
4589	NC_015865	GAA	2	6	223919	223924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581305
4590	NC_015865	AGG	2	6	223950	223955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581305
4591	NC_015865	GGAG	2	8	223987	223994	25 %	0 %	75 %	0 %	341581305
4592	NC_015865	GGAC	2	8	224084	224091	25 %	0 %	50 %	25 %	341581305
4593	NC_015865	CAT	2	6	224102	224107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581305
4594	NC_015865	CCA	2	6	224142	224147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581305
4595	NC_015865	CCG	2	6	224176	224181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581305
4596	NC_015865	GAG	2	6	224213	224218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581305
4597	NC_015865	CTG	2	6	224256	224261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581305
4598	NC_015865	CGG	2	6	224276	224281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581305
4599	NC_015865	CAT	2	6	224318	224323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581305
4600	NC_015865	AG	3	6	224324	224329	50 %	0 %	50 %	0 %	341581305
4601	NC_015865	CATCG	2	10	224375	224384	20 %	20 %	20 %	40 %	341581305
4602	NC_015865	GGA	3	9	224396	224404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581305
4603	NC_015865	GAC	2	6	224508	224513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581305
4604	NC_015865	TTC	2	6	224675	224680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581306
4605	NC_015865	TAC	2	6	224753	224758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581306
4606	NC_015865	GAGC	2	8	224797	224804	25 %	0 %	50 %	25 %	341581306
4607	NC_015865	TGA	2	6	224851	224856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581306
4608	NC_015865	TGA	2	6	224886	224891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581306
4609	NC_015865	CG	3	6	224950	224955	0 %	0 %	50 %	50 %	341581306
4610	NC_015865	GAGG	2	8	224960	224967	25 %	0 %	75 %	0 %	341581306
4611	NC_015865	CTG	2	6	225002	225007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581306
4612	NC_015865	GAG	2	6	225053	225058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581306
4613	NC_015865	TC	3	6	225088	225093	0 %	50 %	0 %	50 %	341581306
4614	NC_015865	AGG	2	6	225104	225109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581306
4615	NC_015865	GGC	2	6	225184	225189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581306
4616	NC_015865	GGT	2	6	225196	225201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581306
4617	NC_015865	GAC	2	6	225287	225292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581306
4618	NC_015865	GAT	2	6	225355	225360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581306
4619	NC_015865	GGAAGG	2	12	225476	225487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581306
4620	NC_015865	GCC	2	6	225508	225513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581306
4621	NC_015865	GGA	2	6	225529	225534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581306
4622	NC_015865	TGG	2	6	225665	225670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581306
4623	NC_015865	AGT	2	6	225686	225691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581306
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4643	NC_015865	ACC	2	6	226817	226822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4741	NC_015865	ATC	2	6	230777	230782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581312
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4744	NC_015865	CAG	2	6	230888	230893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581312
4745	NC_015865	CCGG	2	8	230939	230946	0 %	0 %	50 %	50 %	341581312
4746	NC_015865	TCG	2	6	230952	230957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581312
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4749	NC_015865	CCT	2	6	231175	231180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581312
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4751	NC_015865	TCG	2	6	231267	231272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581312
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4767	NC_015865	TCTTG	2	10	232107	232116	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4768	NC_015865	TAT	2	6	232208	232213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4769	NC_015865	TA	3	6	232304	232309	50 %	50 %	0 %	0 %	341581313
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4776	NC_015865	TC	3	6	232583	232588	0 %	50 %	0 %	50 %	341581313
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4795	NC_015865	GGAAA	2	10	233544	233553	60 %	0 %	40 %	0 %	341581313
4796	NC_015865	CGG	2	6	233705	233710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4803	NC_015865	CGC	2	6	234122	234127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581314
4804	NC_015865	TCG	3	9	234133	234141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581314
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4829	NC_015865	AGG	2	6	235124	235129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4832	NC_015865	CGA	2	6	235367	235372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581315
4833	NC_015865	ATCGAG	2	12	235422	235433	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341581315
4834	NC_015865	TAGCC	2	10	235469	235478	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4835	NC_015865	CCA	2	6	235516	235521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4836	NC_015865	CCA	2	6	235545	235550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4838	NC_015865	TTCAA	2	10	235619	235628	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4839	NC_015865	GTT	2	6	235778	235783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4840	NC_015865	CT	3	6	235799	235804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4841	NC_015865	CT	3	6	235825	235830	0 %	50 %	0 %	50 %	341581316
4842	NC_015865	CT	3	6	235873	235878	0 %	50 %	0 %	50 %	341581316
4843	NC_015865	ATA	2	6	235909	235914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581316
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4853	NC_015865	CTT	2	6	236316	236321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581316
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4856	NC_015865	TCA	2	6	236364	236369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581316
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4862	NC_015865	TCA	2	6	236791	236796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581317
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4864	NC_015865	CTGA	2	8	236905	236912	25 %	25 %	25 %	25 %	341581317
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4973	NC_015865	AAT	2	6	242163	242168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581322
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4975	NC_015865	T	6	6	242244	242249	0 %	100 %	0 %	0 %	341581322
4976	NC_015865	CCCAT	2	10	242300	242309	20 %	20 %	0 %	60 %	341581322
4977	NC_015865	AAGA	2	8	242358	242365	75 %	0 %	25 %	0 %	341581322
4978	NC_015865	GT	3	6	242458	242463	0 %	50 %	50 %	0 %	341581322
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4982	NC_015865	A	7	7	242601	242607	100 %	0 %	0 %	0 %	341581322
4983	NC_015865	TAA	2	6	242631	242636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581322
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4985	NC_015865	ATCTCT	2	12	242719	242730	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	341581322
4986	NC_015865	GA	3	6	242759	242764	50 %	0 %	50 %	0 %	341581322
4987	NC_015865	TGG	2	6	242826	242831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581322
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4989	NC_015865	CAA	2	6	242852	242857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581322
4990	NC_015865	TGT	2	6	242891	242896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581322
4991	NC_015865	TTC	2	6	242952	242957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581322
4992	NC_015865	AAG	2	6	242958	242963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581322
4993	NC_015865	T	7	7	242965	242971	0 %	100 %	0 %	0 %	341581322
4994	NC_015865	AGA	2	6	242996	243001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581322
4995	NC_015865	CCA	2	6	243071	243076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581322
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4997	NC_015865	TTC	2	6	243201	243206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581322
4998	NC_015865	T	6	6	243225	243230	0 %	100 %	0 %	0 %	341581322
4999	NC_015865	T	6	6	243261	243266	0 %	100 %	0 %	0 %	341581322
5000	NC_015865	CCA	2	6	243267	243272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581322

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