MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015714	ACGC	2	8	194743	194750	25 %	0 %	25 %	50 %	338706152
4002	NC_015714	CTC	2	6	194752	194757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706152
4003	NC_015714	CCTG	2	8	194931	194938	0 %	25 %	25 %	50 %	338706152
4004	NC_015714	GTC	2	6	194945	194950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706152
4005	NC_015714	GCAG	2	8	194960	194967	25 %	0 %	50 %	25 %	338706152
4006	NC_015714	AGG	2	6	194978	194983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706152
4007	NC_015714	GTG	3	9	195011	195019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706152
4008	NC_015714	GAGAAA	2	12	195064	195075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706152
4009	NC_015714	CG	3	6	195079	195084	0 %	0 %	50 %	50 %	338706152
4010	NC_015714	GA	3	6	195094	195099	50 %	0 %	50 %	0 %	338706152
4011	NC_015714	GTA	2	6	195133	195138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706152
4012	NC_015714	GC	4	8	195176	195183	0 %	0 %	50 %	50 %	338706152
4013	NC_015714	CTC	2	6	195258	195263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706153
4014	NC_015714	TCT	2	6	195266	195271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706153
4015	NC_015714	AGC	2	6	195289	195294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706153
4016	NC_015714	TCG	2	6	195325	195330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706153
4017	NC_015714	GGC	2	6	195450	195455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706153
4018	NC_015714	TCG	3	9	195559	195567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706153
4019	NC_015714	GCT	2	6	195590	195595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706153
4020	NC_015714	GGA	2	6	195621	195626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706153
4021	NC_015714	CG	3	6	195785	195790	0 %	0 %	50 %	50 %	338706153
4022	NC_015714	GTC	2	6	195801	195806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706153
4023	NC_015714	CTC	2	6	195807	195812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706153
4024	NC_015714	CAC	2	6	195872	195877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706153
4025	NC_015714	TGA	2	6	195929	195934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706153
4026	NC_015714	TCGTC	2	10	195968	195977	0 %	40 %	20 %	40 %	338706153
4027	NC_015714	ATC	2	6	195981	195986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706153
4028	NC_015714	TTCC	2	8	196019	196026	0 %	50 %	0 %	50 %	338706153
4029	NC_015714	CTG	2	6	196117	196122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706153
4030	NC_015714	GAA	2	6	196273	196278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706153
4031	NC_015714	CGT	2	6	196331	196336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706153
4032	NC_015714	GTC	2	6	196356	196361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706153
4033	NC_015714	GTG	2	6	196369	196374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706153
4034	NC_015714	TGC	2	6	196400	196405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706153
4035	NC_015714	CG	3	6	196409	196414	0 %	0 %	50 %	50 %	338706153
4036	NC_015714	GGC	2	6	196420	196425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706153
4037	NC_015714	GTC	2	6	196470	196475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706153
4038	NC_015714	TCG	2	6	196504	196509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706153
4039	NC_015714	ACG	2	6	196511	196516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706153
4040	NC_015714	GCC	2	6	196555	196560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706153
4041	NC_015714	GGA	3	9	196566	196574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706153
4042	NC_015714	CGAG	2	8	196603	196610	25 %	0 %	50 %	25 %	338706153
4043	NC_015714	TCC	2	6	196618	196623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706153
4044	NC_015714	CAA	2	6	196634	196639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706153
4045	NC_015714	CCGCA	2	10	196695	196704	20 %	0 %	20 %	60 %	338706153
4046	NC_015714	CG	3	6	196709	196714	0 %	0 %	50 %	50 %	338706153
4047	NC_015714	CGG	2	6	196791	196796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706153
4048	NC_015714	CTG	2	6	196883	196888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706153
4049	NC_015714	T	6	6	196988	196993	0 %	100 %	0 %	0 %	338706153
4050	NC_015714	CAA	2	6	196994	196999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706153
4051	NC_015714	CG	3	6	197041	197046	0 %	0 %	50 %	50 %	338706153
4052	NC_015714	CCT	2	6	197081	197086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706153
4053	NC_015714	G	10	10	197090	197099	0 %	0 %	100 %	0 %	338706153
4054	NC_015714	GTA	2	6	197190	197195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706154
4055	NC_015714	G	6	6	197254	197259	0 %	0 %	100 %	0 %	338706154
4056	NC_015714	TG	3	6	197260	197265	0 %	50 %	50 %	0 %	338706154
4057	NC_015714	GGT	2	6	197348	197353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706154
4058	NC_015714	CG	3	6	197415	197420	0 %	0 %	50 %	50 %	338706154
4059	NC_015714	TTG	2	6	197497	197502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706154
4060	NC_015714	CTT	2	6	197555	197560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706154
4061	NC_015714	GTC	2	6	197562	197567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706154
4062	NC_015714	GCT	2	6	197576	197581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706154
4063	NC_015714	GC	3	6	197590	197595	0 %	0 %	50 %	50 %	338706154
4064	NC_015714	GCT	2	6	197632	197637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706155
4065	NC_015714	GA	3	6	197775	197780	50 %	0 %	50 %	0 %	338706155
4066	NC_015714	TGC	2	6	197891	197896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706155
4067	NC_015714	CTG	2	6	197933	197938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706155
4068	NC_015714	CGGCA	2	10	198001	198010	20 %	0 %	40 %	40 %	338706155
4069	NC_015714	GCC	2	6	198012	198017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706155
4070	NC_015714	GCG	2	6	198154	198159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706155
4071	NC_015714	TCCC	2	8	198199	198206	0 %	25 %	0 %	75 %	338706155
4072	NC_015714	CTC	2	6	198252	198257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706156
4073	NC_015714	GTT	2	6	198336	198341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706156
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4076	NC_015714	TCCTCT	2	12	198556	198567	0 %	50 %	0 %	50 %	338706156
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4078	NC_015714	GC	3	6	198622	198627	0 %	0 %	50 %	50 %	338706156
4079	NC_015714	GC	3	6	198723	198728	0 %	0 %	50 %	50 %	338706156
4080	NC_015714	CGC	2	6	198827	198832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706156
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4082	NC_015714	CT	3	6	198885	198890	0 %	50 %	0 %	50 %	338706156
4083	NC_015714	GAAA	2	8	198927	198934	75 %	0 %	25 %	0 %	338706156
4084	NC_015714	CGT	2	6	198941	198946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706156
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4086	NC_015714	TG	3	6	198960	198965	0 %	50 %	50 %	0 %	338706156
4087	NC_015714	GAG	2	6	199007	199012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706156
4088	NC_015714	GAA	2	6	199060	199065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706156
4089	NC_015714	GTG	2	6	199090	199095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706157
4090	NC_015714	GC	4	8	199149	199156	0 %	0 %	50 %	50 %	338706157
4091	NC_015714	CTT	2	6	199168	199173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706157
4092	NC_015714	GC	3	6	199273	199278	0 %	0 %	50 %	50 %	338706157
4093	NC_015714	ATCCG	2	10	199310	199319	20 %	20 %	20 %	40 %	338706157
4094	NC_015714	AGGAA	2	10	199411	199420	60 %	0 %	40 %	0 %	338706157
4095	NC_015714	CG	3	6	199429	199434	0 %	0 %	50 %	50 %	338706157
4096	NC_015714	A	6	6	199502	199507	100 %	0 %	0 %	0 %	338706157
4097	NC_015714	GGGA	2	8	199622	199629	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_015714	GGCGC	2	10	199671	199680	0 %	0 %	60 %	40 %	338706158
4099	NC_015714	CTT	2	6	199725	199730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706158
4100	NC_015714	G	6	6	199862	199867	0 %	0 %	100 %	0 %	338706158
4101	NC_015714	CTC	2	6	199883	199888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706158
4102	NC_015714	GTG	2	6	200014	200019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706158
4103	NC_015714	ACG	2	6	200123	200128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706158
4104	NC_015714	GTA	2	6	200279	200284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706158
4105	NC_015714	GT	3	6	200346	200351	0 %	50 %	50 %	0 %	338706158
4106	NC_015714	GTGC	2	8	200368	200375	0 %	25 %	50 %	25 %	338706159
4107	NC_015714	TCT	2	6	200404	200409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706159
4108	NC_015714	TCA	2	6	200508	200513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706159
4109	NC_015714	ATCG	2	8	200530	200537	25 %	25 %	25 %	25 %	338706159
4110	NC_015714	GCT	2	6	200538	200543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706159
4111	NC_015714	TCG	2	6	200643	200648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706159
4112	NC_015714	CGCGC	2	10	200665	200674	0 %	0 %	40 %	60 %	338706159
4113	NC_015714	TG	3	6	200738	200743	0 %	50 %	50 %	0 %	338706159
4114	NC_015714	TGA	2	6	200796	200801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706159
4115	NC_015714	TGCG	2	8	200807	200814	0 %	25 %	50 %	25 %	338706159
4116	NC_015714	CGT	2	6	200818	200823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706159
4117	NC_015714	CTG	2	6	200831	200836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706159
4118	NC_015714	TGA	2	6	200861	200866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706159
4119	NC_015714	GC	3	6	200875	200880	0 %	0 %	50 %	50 %	338706159
4120	NC_015714	CAG	2	6	200906	200911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706159
4121	NC_015714	TG	3	6	201011	201016	0 %	50 %	50 %	0 %	338706159
4122	NC_015714	GTGC	2	8	201085	201092	0 %	25 %	50 %	25 %	338706159
4123	NC_015714	GCG	2	6	201133	201138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706159
4124	NC_015714	GC	3	6	201146	201151	0 %	0 %	50 %	50 %	338706159
4125	NC_015714	ACA	2	6	201152	201157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706159
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4142	NC_015714	TGCG	2	8	201886	201893	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4495	NC_015714	AGA	2	6	220162	220167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706193
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4497	NC_015714	GTGTTT	2	12	220238	220249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706193
4498	NC_015714	GC	3	6	220332	220337	0 %	0 %	50 %	50 %	338706193
4499	NC_015714	GCA	2	6	220369	220374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706193
4500	NC_015714	CCGG	2	8	220385	220392	0 %	0 %	50 %	50 %	338706193

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