MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_015714	TGC	2	6	1089520	1089525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706952
23003	NC_015714	GTC	2	6	1089532	1089537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706952
23004	NC_015714	T	8	8	1089553	1089560	0 %	100 %	0 %	0 %	338706952
23005	NC_015714	CG	3	6	1089650	1089655	0 %	0 %	50 %	50 %	338706952
23006	NC_015714	ATCTGC	2	12	1089686	1089697	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706952
23007	NC_015714	TTG	2	6	1089757	1089762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706952
23008	NC_015714	GTT	2	6	1089803	1089808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706952
23009	NC_015714	CGG	2	6	1089829	1089834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706952
23010	NC_015714	TCA	2	6	1089893	1089898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706952
23011	NC_015714	ATA	2	6	1089899	1089904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706952
23012	NC_015714	ACGT	2	8	1089958	1089965	25 %	25 %	25 %	25 %	338706952
23013	NC_015714	TG	4	8	1089976	1089983	0 %	50 %	50 %	0 %	338706952
23014	NC_015714	TC	3	6	1090029	1090034	0 %	50 %	0 %	50 %	338706952
23015	NC_015714	CA	3	6	1090078	1090083	50 %	0 %	0 %	50 %	338706952
23016	NC_015714	CAC	2	6	1090296	1090301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23017	NC_015714	AT	3	6	1090349	1090354	50 %	50 %	0 %	0 %	338706953
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23019	NC_015714	CAT	2	6	1090454	1090459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706953
23020	NC_015714	CCAT	2	8	1090503	1090510	25 %	25 %	0 %	50 %	338706953
23021	NC_015714	T	7	7	1090549	1090555	0 %	100 %	0 %	0 %	338706953
23022	NC_015714	GGC	2	6	1090638	1090643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706953
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23030	NC_015714	GC	3	6	1091054	1091059	0 %	0 %	50 %	50 %	338706953
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23052	NC_015714	AGTA	2	8	1091960	1091967	50 %	25 %	25 %	0 %	338706953
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23058	NC_015714	CA	3	6	1092327	1092332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23059	NC_015714	CTG	2	6	1092356	1092361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706954
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23082	NC_015714	CGTA	2	8	1093359	1093366	25 %	25 %	25 %	25 %	338706955
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23091	NC_015714	TCA	2	6	1093905	1093910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706955
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23103	NC_015714	ACG	2	6	1094506	1094511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706955
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23105	NC_015714	ACTGCA	2	12	1094694	1094705	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706955
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23110	NC_015714	TGC	2	6	1094848	1094853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706955
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23113	NC_015714	TCAT	2	8	1095015	1095022	25 %	50 %	0 %	25 %	338706955
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23237	NC_015714	CT	3	6	1101197	1101202	0 %	50 %	0 %	50 %	338706961
23238	NC_015714	CCT	2	6	1101235	1101240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706961
23239	NC_015714	AGC	2	6	1101258	1101263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706961
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23242	NC_015714	CAT	2	6	1101389	1101394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706961
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23307	NC_015714	CTG	2	6	1105099	1105104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23311	NC_015714	CA	4	8	1105241	1105248	50 %	0 %	0 %	50 %	338706965
23312	NC_015714	TCC	2	6	1105369	1105374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706966
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23321	NC_015714	CG	4	8	1105540	1105547	0 %	0 %	50 %	50 %	338706966
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23326	NC_015714	TCA	2	6	1105720	1105725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706966
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23333	NC_015714	CG	3	6	1105899	1105904	0 %	0 %	50 %	50 %	338706966
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23335	NC_015714	GTC	2	6	1105956	1105961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706966
23336	NC_015714	GC	3	6	1105995	1106000	0 %	0 %	50 %	50 %	338706966
23337	NC_015714	TC	3	6	1106002	1106007	0 %	50 %	0 %	50 %	338706966
23338	NC_015714	ATCC	2	8	1106034	1106041	25 %	25 %	0 %	50 %	338706966
23339	NC_015714	GC	3	6	1106043	1106048	0 %	0 %	50 %	50 %	338706966
23340	NC_015714	A	6	6	1106089	1106094	100 %	0 %	0 %	0 %	338706966
23341	NC_015714	AGG	2	6	1106221	1106226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706966
23342	NC_015714	TGC	2	6	1106296	1106301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706966
23343	NC_015714	ATGA	2	8	1106376	1106383	50 %	25 %	25 %	0 %	338706966
23344	NC_015714	GTG	2	6	1106394	1106399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706966
23345	NC_015714	CAC	2	6	1106415	1106420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706966
23346	NC_015714	GTGTT	2	10	1106435	1106444	0 %	60 %	40 %	0 %	338706966
23347	NC_015714	CTG	2	6	1106479	1106484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706966
23348	NC_015714	TGG	2	6	1106509	1106514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706966
23349	NC_015714	AAC	2	6	1106622	1106627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706966
23350	NC_015714	AG	3	6	1106684	1106689	50 %	0 %	50 %	0 %	338706966
23351	NC_015714	CG	3	6	1106737	1106742	0 %	0 %	50 %	50 %	338706966
23352	NC_015714	AGGGGG	2	12	1106768	1106779	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
23353	NC_015714	CAA	2	6	1106861	1106866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706967
23354	NC_015714	GCT	2	6	1106921	1106926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706967
23355	NC_015714	AGC	2	6	1106946	1106951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706967
23356	NC_015714	CGA	2	6	1107035	1107040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706967
23357	NC_015714	CTG	2	6	1107098	1107103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706967
23358	NC_015714	CG	4	8	1107202	1107209	0 %	0 %	50 %	50 %	338706967
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23471	NC_015714	GCGA	2	8	1112740	1112747	25 %	0 %	50 %	25 %	338706972
23472	NC_015714	TTC	2	6	1112783	1112788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706972
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23474	NC_015714	GTA	2	6	1113010	1113015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706973
23475	NC_015714	CG	4	8	1113141	1113148	0 %	0 %	50 %	50 %	338706973
23476	NC_015714	GA	3	6	1113312	1113317	50 %	0 %	50 %	0 %	338706974
23477	NC_015714	CCG	2	6	1113337	1113342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706974
23478	NC_015714	GCA	2	6	1113349	1113354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706974
23479	NC_015714	AGA	2	6	1113418	1113423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706974
23480	NC_015714	CCG	2	6	1113431	1113436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706974
23481	NC_015714	AGC	2	6	1113445	1113450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706974
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23485	NC_015714	GAA	2	6	1113592	1113597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706975
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23500	NC_015714	CGCA	2	8	1114287	1114294	25 %	0 %	25 %	50 %	338706976

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