MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

< Previous12...3233343536373839404142...4748Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_015714	GGC	2	6	852904	852909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18003	NC_015714	ATC	2	6	852949	852954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706742
18004	NC_015714	TC	3	6	852977	852982	0 %	50 %	0 %	50 %	338706742
18005	NC_015714	AC	3	6	852996	853001	50 %	0 %	0 %	50 %	338706742
18006	NC_015714	GTCC	2	8	853008	853015	0 %	25 %	25 %	50 %	338706742
18007	NC_015714	AGA	2	6	853016	853021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706742
18008	NC_015714	TTCA	2	8	853159	853166	25 %	50 %	0 %	25 %	338706742
18009	NC_015714	ACC	2	6	853192	853197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706742
18010	NC_015714	GGC	2	6	853233	853238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706742
18011	NC_015714	AGA	2	6	853257	853262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706742
18012	NC_015714	TC	3	6	853286	853291	0 %	50 %	0 %	50 %	338706742
18013	NC_015714	GCCA	2	8	853318	853325	25 %	0 %	25 %	50 %	338706742
18014	NC_015714	CG	3	6	853365	853370	0 %	0 %	50 %	50 %	338706742
18015	NC_015714	TAA	2	6	853575	853580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706742
18016	NC_015714	GC	3	6	853584	853589	0 %	0 %	50 %	50 %	338706742
18017	NC_015714	AGC	2	6	853662	853667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706742
18018	NC_015714	TGG	2	6	853706	853711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706742
18019	NC_015714	TTC	2	6	853807	853812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18020	NC_015714	GC	3	6	853837	853842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18021	NC_015714	TCT	2	6	853850	853855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18022	NC_015714	A	6	6	853909	853914	100 %	0 %	0 %	0 %	338706743
18023	NC_015714	CTC	2	6	854068	854073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706743
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18025	NC_015714	GCTC	2	8	854136	854143	0 %	25 %	25 %	50 %	338706743
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18029	NC_015714	CGC	3	9	854184	854192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706743
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18031	NC_015714	GCT	2	6	854322	854327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706743
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18033	NC_015714	CAT	2	6	854361	854366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706743
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18036	NC_015714	CG	3	6	854426	854431	0 %	0 %	50 %	50 %	338706743
18037	NC_015714	GAT	2	6	854602	854607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706743
18038	NC_015714	TGC	2	6	854627	854632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706743
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18041	NC_015714	TAC	2	6	854758	854763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706743
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18044	NC_015714	CAT	3	9	854836	854844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706743
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18051	NC_015714	TACC	2	8	854948	854955	25 %	25 %	0 %	50 %	338706743
18052	NC_015714	CTTC	2	8	854956	854963	0 %	50 %	0 %	50 %	338706743
18053	NC_015714	A	6	6	854977	854982	100 %	0 %	0 %	0 %	338706743
18054	NC_015714	CACAA	2	10	855040	855049	60 %	0 %	0 %	40 %	338706743
18055	NC_015714	AC	3	6	855091	855096	50 %	0 %	0 %	50 %	338706743
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18058	NC_015714	TTC	2	6	855256	855261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706743
18059	NC_015714	CTGCGC	2	12	855319	855330	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706743
18060	NC_015714	GC	5	10	855327	855336	0 %	0 %	50 %	50 %	338706743
18061	NC_015714	AGA	2	6	855348	855353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706743
18062	NC_015714	CAG	2	6	855424	855429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706743
18063	NC_015714	ATC	2	6	855469	855474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706743
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18067	NC_015714	TG	3	6	855744	855749	0 %	50 %	50 %	0 %	338706744
18068	NC_015714	GC	4	8	855758	855765	0 %	0 %	50 %	50 %	338706744
18069	NC_015714	T	6	6	855866	855871	0 %	100 %	0 %	0 %	338706744
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18073	NC_015714	TGC	2	6	856154	856159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706744
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18076	NC_015714	G	6	6	856308	856313	0 %	0 %	100 %	0 %	338706744
18077	NC_015714	CGCA	2	8	856608	856615	25 %	0 %	25 %	50 %	338706744
18078	NC_015714	CTCA	2	8	856696	856703	25 %	25 %	0 %	50 %	338706744
18079	NC_015714	A	6	6	856717	856722	100 %	0 %	0 %	0 %	338706744
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18081	NC_015714	GCGCT	2	10	856807	856816	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18082	NC_015714	CGCA	2	8	856855	856862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18083	NC_015714	CA	5	10	856868	856877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18087	NC_015714	AAC	2	6	856916	856921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18088	NC_015714	AC	3	6	856920	856925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18089	NC_015714	CACG	2	8	856966	856973	25 %	0 %	25 %	50 %	338706745
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18096	NC_015714	CGTGC	2	10	857291	857300	0 %	20 %	40 %	40 %	338706745
18097	NC_015714	TTCCA	2	10	857319	857328	20 %	40 %	0 %	40 %	338706745
18098	NC_015714	GCT	2	6	857340	857345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706745
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18101	NC_015714	GC	3	6	857521	857526	0 %	0 %	50 %	50 %	338706745
18102	NC_015714	GC	3	6	857541	857546	0 %	0 %	50 %	50 %	338706745
18103	NC_015714	CCT	2	6	857581	857586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706745
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18106	NC_015714	CAA	2	6	857731	857736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706745
18107	NC_015714	CCTG	2	8	857751	857758	0 %	25 %	25 %	50 %	338706745
18108	NC_015714	GCA	2	6	857769	857774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706745
18109	NC_015714	TCA	2	6	857784	857789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706745
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18113	NC_015714	CAG	3	9	857860	857868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706745
18114	NC_015714	CG	3	6	857938	857943	0 %	0 %	50 %	50 %	338706745
18115	NC_015714	CA	3	6	857968	857973	50 %	0 %	0 %	50 %	338706745
18116	NC_015714	ACTGT	2	10	858032	858041	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18117	NC_015714	CAG	2	6	858042	858047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18118	NC_015714	A	9	9	858050	858058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18119	NC_015714	GAA	2	6	858087	858092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706746
18120	NC_015714	AGCGC	2	10	858096	858105	20 %	0 %	40 %	40 %	338706746
18121	NC_015714	CTC	2	6	858140	858145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706746
18122	NC_015714	TG	3	6	858256	858261	0 %	50 %	50 %	0 %	338706746
18123	NC_015714	CG	3	6	858283	858288	0 %	0 %	50 %	50 %	338706746
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18250	NC_015714	TCG	2	6	864318	864323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706750
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18284	NC_015714	GC	3	6	866044	866049	0 %	0 %	50 %	50 %	338706752
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18287	NC_015714	CTTT	2	8	866156	866163	0 %	75 %	0 %	25 %	338706752
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18289	NC_015714	TAG	2	6	866206	866211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706752
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18292	NC_015714	CGT	2	6	866413	866418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706752
18293	NC_015714	ACT	2	6	866423	866428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706752
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18305	NC_015714	GGTATC	2	12	866994	867005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706752
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18308	NC_015714	CGG	2	6	867122	867127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706752
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18312	NC_015714	AGT	2	6	867282	867287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18314	NC_015714	GTG	2	6	867422	867427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706753
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18336	NC_015714	CTC	2	6	868508	868513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18337	NC_015714	GCT	2	6	868522	868527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706754
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18358	NC_015714	GCGCC	2	10	869358	869367	0 %	0 %	40 %	60 %	338706754
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18366	NC_015714	TGCG	2	8	869657	869664	0 %	25 %	50 %	25 %	338706754
18367	NC_015714	GAA	2	6	869671	869676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706754
18368	NC_015714	CG	3	6	869746	869751	0 %	0 %	50 %	50 %	338706754
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18489	NC_015714	A	6	6	876211	876216	100 %	0 %	0 %	0 %	338706762
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18491	NC_015714	A	7	7	876327	876333	100 %	0 %	0 %	0 %	338706763
18492	NC_015714	GTA	2	6	876344	876349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706763
18493	NC_015714	TTC	2	6	876350	876355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706763
18494	NC_015714	TGCG	2	8	876464	876471	0 %	25 %	50 %	25 %	338706763
18495	NC_015714	CTC	2	6	876605	876610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706763
18496	NC_015714	AAC	2	6	876693	876698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706763
18497	NC_015714	CACAC	2	10	876748	876757	40 %	0 %	0 %	60 %	338706763
18498	NC_015714	GC	3	6	876777	876782	0 %	0 %	50 %	50 %	338706763
18499	NC_015714	CAG	2	6	876835	876840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706763
18500	NC_015714	CG	3	6	876849	876854	0 %	0 %	50 %	50 %	338706763

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