MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_015714	AACG	2	8	805071	805078	50 %	0 %	25 %	25 %	338706698
17003	NC_015714	GTA	2	6	805178	805183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706698
17004	NC_015714	GGAC	2	8	805266	805273	25 %	0 %	50 %	25 %	338706698
17005	NC_015714	CAA	2	6	805300	805305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706698
17006	NC_015714	C	7	7	805325	805331	0 %	0 %	0 %	100 %	338706698
17007	NC_015714	AGAA	2	8	805337	805344	75 %	0 %	25 %	0 %	338706698
17008	NC_015714	CACGC	2	10	805438	805447	20 %	0 %	20 %	60 %	338706698
17009	NC_015714	CCG	2	6	805486	805491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706698
17010	NC_015714	AAT	2	6	805505	805510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706698
17011	NC_015714	C	7	7	805511	805517	0 %	0 %	0 %	100 %	338706698
17012	NC_015714	CCA	2	6	805618	805623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706698
17013	NC_015714	AGC	2	6	805644	805649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706698
17014	NC_015714	CTTCG	2	10	805673	805682	0 %	40 %	20 %	40 %	338706698
17015	NC_015714	TC	3	6	805744	805749	0 %	50 %	0 %	50 %	338706698
17016	NC_015714	TCC	2	6	805758	805763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706698
17017	NC_015714	TCG	2	6	805842	805847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706698
17018	NC_015714	TCT	2	6	805879	805884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706698
17019	NC_015714	TCC	2	6	805989	805994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706698
17020	NC_015714	CAG	2	6	806003	806008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706698
17021	NC_015714	CTT	2	6	806029	806034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706698
17022	NC_015714	CAT	2	6	806050	806055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706698
17023	NC_015714	TCC	2	6	806123	806128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706698
17024	NC_015714	A	7	7	806133	806139	100 %	0 %	0 %	0 %	338706698
17025	NC_015714	GAA	2	6	806240	806245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706698
17026	NC_015714	ACC	2	6	806364	806369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706698
17027	NC_015714	GAG	2	6	806372	806377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706698
17028	NC_015714	GA	3	6	806479	806484	50 %	0 %	50 %	0 %	338706698
17029	NC_015714	GAC	2	6	806548	806553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706698
17030	NC_015714	AATG	2	8	806614	806621	50 %	25 %	25 %	0 %	338706698
17031	NC_015714	CCT	2	6	806713	806718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706699
17032	NC_015714	AG	3	6	806729	806734	50 %	0 %	50 %	0 %	338706699
17033	NC_015714	AG	3	6	806812	806817	50 %	0 %	50 %	0 %	338706699
17034	NC_015714	GAA	2	6	806865	806870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706699
17035	NC_015714	CG	3	6	806877	806882	0 %	0 %	50 %	50 %	338706699
17036	NC_015714	ATA	2	6	806895	806900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706699
17037	NC_015714	AAC	2	6	806931	806936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706699
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17039	NC_015714	CG	3	6	807006	807011	0 %	0 %	50 %	50 %	338706699
17040	NC_015714	CTT	2	6	807086	807091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706699
17041	NC_015714	TCA	2	6	807237	807242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706699
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17043	NC_015714	TTC	2	6	807327	807332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706699
17044	NC_015714	TGA	2	6	807363	807368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706699
17045	NC_015714	CCTT	2	8	807439	807446	0 %	50 %	0 %	50 %	338706699
17046	NC_015714	AGC	2	6	807540	807545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706699
17047	NC_015714	TTC	2	6	807570	807575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706699
17048	NC_015714	TTC	3	9	807636	807644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706699
17049	NC_015714	CAC	2	6	807677	807682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706699
17050	NC_015714	TGA	2	6	807695	807700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17051	NC_015714	TCTA	2	8	807755	807762	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17052	NC_015714	GCAC	2	8	807997	808004	25 %	0 %	25 %	50 %	338706700
17053	NC_015714	ACG	3	9	808011	808019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706700
17054	NC_015714	CTT	2	6	808110	808115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706700
17055	NC_015714	CTC	2	6	808224	808229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706700
17056	NC_015714	CATA	2	8	808262	808269	50 %	25 %	0 %	25 %	338706700
17057	NC_015714	CTTC	2	8	808299	808306	0 %	50 %	0 %	50 %	338706700
17058	NC_015714	CAG	2	6	808361	808366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706700
17059	NC_015714	CTT	2	6	808443	808448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706700
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17061	NC_015714	TCA	2	6	808477	808482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706700
17062	NC_015714	GCA	2	6	808538	808543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706700
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17066	NC_015714	TCA	2	6	808684	808689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706700
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17068	NC_015714	T	7	7	808829	808835	0 %	100 %	0 %	0 %	338706700
17069	NC_015714	GC	3	6	808885	808890	0 %	0 %	50 %	50 %	338706700
17070	NC_015714	TCG	2	6	808963	808968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706700
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17085	NC_015714	TTGT	2	8	809665	809672	0 %	75 %	25 %	0 %	338706700
17086	NC_015714	CCT	2	6	809696	809701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706700
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17091	NC_015714	T	6	6	809916	809921	0 %	100 %	0 %	0 %	338706701
17092	NC_015714	A	6	6	809985	809990	100 %	0 %	0 %	0 %	338706701
17093	NC_015714	TGCA	2	8	810034	810041	25 %	25 %	25 %	25 %	338706702
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17101	NC_015714	GTTA	2	8	810380	810387	25 %	50 %	25 %	0 %	338706702
17102	NC_015714	ACG	2	6	810400	810405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706702
17103	NC_015714	CACGG	2	10	810539	810548	20 %	0 %	40 %	40 %	338706702
17104	NC_015714	GCA	2	6	810559	810564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706702
17105	NC_015714	CTC	2	6	810598	810603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706702
17106	NC_015714	AG	4	8	810609	810616	50 %	0 %	50 %	0 %	338706702
17107	NC_015714	GTT	2	6	810716	810721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706703
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17109	NC_015714	CTG	2	6	810820	810825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706703
17110	NC_015714	CG	3	6	810839	810844	0 %	0 %	50 %	50 %	338706703
17111	NC_015714	CCG	2	6	810850	810855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706703
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17117	NC_015714	CTG	2	6	811107	811112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706703
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17119	NC_015714	GC	3	6	811183	811188	0 %	0 %	50 %	50 %	338706703
17120	NC_015714	AC	4	8	811189	811196	50 %	0 %	0 %	50 %	338706703
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17122	NC_015714	GCA	2	6	811327	811332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706703
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