MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_015714	TGA	2	6	709594	709599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706605
15003	NC_015714	CTG	2	6	709705	709710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706605
15004	NC_015714	TG	3	6	709781	709786	0 %	50 %	50 %	0 %	338706605
15005	NC_015714	CAC	2	6	709823	709828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706605
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15011	NC_015714	GCT	2	6	710019	710024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706605
15012	NC_015714	TCCG	2	8	710033	710040	0 %	25 %	25 %	50 %	338706605
15013	NC_015714	CG	3	6	710065	710070	0 %	0 %	50 %	50 %	338706605
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15016	NC_015714	TCA	2	6	710196	710201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706605
15017	NC_015714	GAAA	2	8	710208	710215	75 %	0 %	25 %	0 %	338706605
15018	NC_015714	GA	3	6	710221	710226	50 %	0 %	50 %	0 %	338706605
15019	NC_015714	CCG	2	6	710308	710313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706605
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15021	NC_015714	CGG	2	6	710367	710372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706605
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15041	NC_015714	CTG	2	6	711934	711939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706607
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15057	NC_015714	TGC	2	6	712674	712679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706608
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15121	NC_015714	GC	4	8	715870	715877	0 %	0 %	50 %	50 %	338706612
15122	NC_015714	GAG	2	6	715885	715890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706612
15123	NC_015714	AGA	2	6	715891	715896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706612
15124	NC_015714	TGG	2	6	715933	715938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706612
15125	NC_015714	TGCATT	2	12	716112	716123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338706612
15126	NC_015714	T	8	8	716165	716172	0 %	100 %	0 %	0 %	338706612
15127	NC_015714	TC	3	6	716301	716306	0 %	50 %	0 %	50 %	338706612
15128	NC_015714	GAC	2	6	716329	716334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706612
15129	NC_015714	AGCG	2	8	716358	716365	25 %	0 %	50 %	25 %	338706612
15130	NC_015714	ATC	2	6	716367	716372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706612
15131	NC_015714	GCT	2	6	716378	716383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706612
15132	NC_015714	TG	3	6	716474	716479	0 %	50 %	50 %	0 %	338706612
15133	NC_015714	TCC	2	6	716501	716506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706612
15134	NC_015714	TGA	2	6	716552	716557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706613
15135	NC_015714	CCG	2	6	716579	716584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706613
15136	NC_015714	TAA	2	6	716624	716629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706613
15137	NC_015714	TCA	2	6	716644	716649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706613
15138	NC_015714	TGT	2	6	716754	716759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706613
15139	NC_015714	A	6	6	716769	716774	100 %	0 %	0 %	0 %	338706613
15140	NC_015714	GT	3	6	716785	716790	0 %	50 %	50 %	0 %	338706613
15141	NC_015714	GCC	2	6	716839	716844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706613
15142	NC_015714	ACAGC	2	10	716912	716921	40 %	0 %	20 %	40 %	338706613
15143	NC_015714	TCCA	2	8	716932	716939	25 %	25 %	0 %	50 %	338706613
15144	NC_015714	CCTG	2	8	716980	716987	0 %	25 %	25 %	50 %	338706613
15145	NC_015714	CT	3	6	717011	717016	0 %	50 %	0 %	50 %	338706613
15146	NC_015714	TGC	2	6	717045	717050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706613
15147	NC_015714	TCC	2	6	717088	717093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706613
15148	NC_015714	TGAT	2	8	717199	717206	25 %	50 %	25 %	0 %	338706613
15149	NC_015714	CCA	2	6	717212	717217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706613
15150	NC_015714	CCA	2	6	717224	717229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706613
15151	NC_015714	GGC	2	6	717237	717242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706613
15152	NC_015714	GAA	2	6	717352	717357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706613
15153	NC_015714	CCCATC	2	12	717366	717377	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	338706613
15154	NC_015714	TTG	2	6	717400	717405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706613
15155	NC_015714	A	7	7	717423	717429	100 %	0 %	0 %	0 %	338706613
15156	NC_015714	CAC	2	6	717612	717617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706613
15157	NC_015714	GTT	2	6	717637	717642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706613
15158	NC_015714	CTCATC	2	12	717717	717728	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338706613
15159	NC_015714	TGA	3	9	717943	717951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706613
15160	NC_015714	ACAG	2	8	718018	718025	50 %	0 %	25 %	25 %	338706613
15161	NC_015714	GCCA	2	8	718031	718038	25 %	0 %	25 %	50 %	338706613
15162	NC_015714	TCC	2	6	718075	718080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706613
15163	NC_015714	GTCT	2	8	718146	718153	0 %	50 %	25 %	25 %	338706613
15164	NC_015714	GAG	2	6	718173	718178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706613
15165	NC_015714	CG	3	6	718192	718197	0 %	0 %	50 %	50 %	338706613
15166	NC_015714	CGAA	2	8	718274	718281	50 %	0 %	25 %	25 %	338706613
15167	NC_015714	GGC	2	6	718298	718303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706613
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15170	NC_015714	CCTC	2	8	718462	718469	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15171	NC_015714	AAGAC	2	10	718534	718543	60 %	0 %	20 %	20 %	338706614
15172	NC_015714	CTG	2	6	718593	718598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706614
15173	NC_015714	CG	3	6	718639	718644	0 %	0 %	50 %	50 %	338706614
15174	NC_015714	T	6	6	718678	718683	0 %	100 %	0 %	0 %	338706614
15175	NC_015714	AG	3	6	718715	718720	50 %	0 %	50 %	0 %	338706614
15176	NC_015714	CGA	2	6	718721	718726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706614
15177	NC_015714	CG	3	6	718749	718754	0 %	0 %	50 %	50 %	338706614
15178	NC_015714	AAG	2	6	718768	718773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706614
15179	NC_015714	GGA	2	6	718817	718822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706614
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15181	NC_015714	AC	3	6	718928	718933	50 %	0 %	0 %	50 %	338706614
15182	NC_015714	CAA	2	6	718958	718963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706614
15183	NC_015714	CAA	2	6	718976	718981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706614
15184	NC_015714	CCTGC	2	10	718994	719003	0 %	20 %	20 %	60 %	338706614
15185	NC_015714	A	6	6	719093	719098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15186	NC_015714	CTG	2	6	719144	719149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15187	NC_015714	CGGC	2	8	719160	719167	0 %	0 %	50 %	50 %	338706615
15188	NC_015714	CTT	2	6	719204	719209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706615
15189	NC_015714	CG	3	6	719218	719223	0 %	0 %	50 %	50 %	338706615
15190	NC_015714	TGG	2	6	719263	719268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706615
15191	NC_015714	CGTA	2	8	719418	719425	25 %	25 %	25 %	25 %	338706615
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15194	NC_015714	TTC	2	6	719622	719627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706615
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15199	NC_015714	GC	3	6	719972	719977	0 %	0 %	50 %	50 %	338706615
15200	NC_015714	GAA	2	6	719982	719987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706615
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15202	NC_015714	GTT	2	6	720053	720058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706615
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15205	NC_015714	TGG	2	6	720437	720442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706616
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15211	NC_015714	CTGG	2	8	720726	720733	0 %	25 %	50 %	25 %	338706616
15212	NC_015714	GGT	2	6	720751	720756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706616
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15216	NC_015714	GAA	2	6	720909	720914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706616
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15218	NC_015714	GC	3	6	720968	720973	0 %	0 %	50 %	50 %	338706616
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15225	NC_015714	AGG	2	6	721198	721203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706617
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15230	NC_015714	GTGG	2	8	721529	721536	0 %	25 %	75 %	0 %	338706617
15231	NC_015714	GGA	2	6	721574	721579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706617
15232	NC_015714	C	6	6	721655	721660	0 %	0 %	0 %	100 %	338706617
15233	NC_015714	GGA	2	6	721675	721680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706617
15234	NC_015714	AGA	2	6	721693	721698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706617
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15237	NC_015714	GGT	2	6	721805	721810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706617
15238	NC_015714	ACG	2	6	721822	721827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706617
15239	NC_015714	CG	3	6	721834	721839	0 %	0 %	50 %	50 %	338706617
15240	NC_015714	TGA	2	6	721844	721849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706617
15241	NC_015714	CCGGGC	2	12	721894	721905	0 %	0 %	50 %	50 %	338706618
15242	NC_015714	AGG	3	9	721946	721954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706618
15243	NC_015714	CGG	2	6	721970	721975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706618
15244	NC_015714	TTCC	2	8	721976	721983	0 %	50 %	0 %	50 %	338706618
15245	NC_015714	TCC	2	6	722032	722037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706618
15246	NC_015714	GCA	2	6	722096	722101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706618
15247	NC_015714	TTG	2	6	722148	722153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706618
15248	NC_015714	TTC	2	6	722159	722164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706618
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15250	NC_015714	CTT	2	6	722207	722212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706618
15251	NC_015714	GTC	2	6	722234	722239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706618
15252	NC_015714	TGA	2	6	722245	722250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706618
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15254	NC_015714	GA	3	6	722276	722281	50 %	0 %	50 %	0 %	338706618
15255	NC_015714	GAA	2	6	722336	722341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706618
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15258	NC_015714	ACC	2	6	722430	722435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706618
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15262	NC_015714	CGTCC	2	10	722513	722522	0 %	20 %	20 %	60 %	338706618
15263	NC_015714	GAC	2	6	722528	722533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706618
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15268	NC_015714	ACC	2	6	722728	722733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706619
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15272	NC_015714	CAC	2	6	722913	722918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706619
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15291	NC_015714	A	6	6	724088	724093	100 %	0 %	0 %	0 %	338706620
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15303	NC_015714	ATAC	2	8	724803	724810	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15323	NC_015714	CCAG	2	8	725773	725780	25 %	0 %	25 %	50 %	338706622
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15330	NC_015714	TCA	2	6	726121	726126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706622
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15333	NC_015714	TTC	2	6	726195	726200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706622
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15345	NC_015714	TTTTC	2	10	726845	726854	0 %	80 %	0 %	20 %	338706622
15346	NC_015714	TTTC	2	8	726873	726880	0 %	75 %	0 %	25 %	338706622
15347	NC_015714	TATTT	2	10	727015	727024	20 %	80 %	0 %	0 %	338706622
15348	NC_015714	AT	3	6	727048	727053	50 %	50 %	0 %	0 %	338706622
15349	NC_015714	AATG	2	8	727059	727066	50 %	25 %	25 %	0 %	338706622
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15353	NC_015714	CGT	2	6	727270	727275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706622
15354	NC_015714	CTG	2	6	727451	727456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706622
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15356	NC_015714	T	6	6	727566	727571	0 %	100 %	0 %	0 %	338706622
15357	NC_015714	ATC	2	6	727587	727592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706622
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15361	NC_015714	CGCA	2	8	727725	727732	25 %	0 %	25 %	50 %	338706622
15362	NC_015714	CTT	2	6	727745	727750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706622
15363	NC_015714	CAAAA	2	10	727760	727769	80 %	0 %	0 %	20 %	338706622
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15490	NC_015714	CA	3	6	733581	733586	50 %	0 %	0 %	50 %	338706626
15491	NC_015714	GCT	2	6	733587	733592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706626
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