MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015714	TGC	2	6	615459	615464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706533
13002	NC_015714	GCA	2	6	615475	615480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706533
13003	NC_015714	TGC	2	6	615522	615527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706533
13004	NC_015714	TTC	2	6	615561	615566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706533
13005	NC_015714	GCA	2	6	615592	615597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706533
13006	NC_015714	TCA	2	6	615622	615627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706533
13007	NC_015714	GCT	2	6	615647	615652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706533
13008	NC_015714	GCTC	2	8	615718	615725	0 %	25 %	25 %	50 %	338706533
13009	NC_015714	CTC	2	6	615804	615809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706533
13010	NC_015714	CTG	2	6	615830	615835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706533
13011	NC_015714	ACGCAC	2	12	615860	615871	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	338706533
13012	NC_015714	CTG	2	6	615883	615888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706533
13013	NC_015714	AC	3	6	615966	615971	50 %	0 %	0 %	50 %	338706533
13014	NC_015714	GCG	2	6	615974	615979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706533
13015	NC_015714	CCA	2	6	615995	616000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706533
13016	NC_015714	GCA	2	6	616003	616008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706533
13017	NC_015714	CAA	2	6	616026	616031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706533
13018	NC_015714	CAC	2	6	616032	616037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706533
13019	NC_015714	CTGC	2	8	616045	616052	0 %	25 %	25 %	50 %	338706533
13020	NC_015714	GC	3	6	616116	616121	0 %	0 %	50 %	50 %	338706533
13021	NC_015714	AC	3	6	616122	616127	50 %	0 %	0 %	50 %	338706533
13022	NC_015714	A	7	7	616134	616140	100 %	0 %	0 %	0 %	338706533
13023	NC_015714	AGA	2	6	616194	616199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706533
13024	NC_015714	AAAG	2	8	616220	616227	75 %	0 %	25 %	0 %	338706533
13025	NC_015714	GAC	2	6	616242	616247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706533
13026	NC_015714	CCA	2	6	616256	616261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706533
13027	NC_015714	GC	3	6	616288	616293	0 %	0 %	50 %	50 %	338706533
13028	NC_015714	CA	3	6	616309	616314	50 %	0 %	0 %	50 %	338706533
13029	NC_015714	ACA	2	6	616328	616333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706533
13030	NC_015714	CG	3	6	616365	616370	0 %	0 %	50 %	50 %	338706533
13031	NC_015714	CAA	2	6	616419	616424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706533
13032	NC_015714	GGAA	2	8	616434	616441	50 %	0 %	50 %	0 %	338706533
13033	NC_015714	AC	3	6	616502	616507	50 %	0 %	0 %	50 %	338706533
13034	NC_015714	CTG	2	6	616518	616523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706533
13035	NC_015714	GCCCAG	2	12	616586	616597	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706533
13036	NC_015714	CGCC	2	8	616646	616653	0 %	0 %	25 %	75 %	338706533
13037	NC_015714	CAC	3	9	616752	616760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706533
13038	NC_015714	ATCT	2	8	616806	616813	25 %	50 %	0 %	25 %	338706533
13039	NC_015714	TC	3	6	616916	616921	0 %	50 %	0 %	50 %	338706533
13040	NC_015714	AC	3	6	616947	616952	50 %	0 %	0 %	50 %	338706533
13041	NC_015714	CAG	2	6	616958	616963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706533
13042	NC_015714	T	7	7	617063	617069	0 %	100 %	0 %	0 %	338706534
13043	NC_015714	ACG	2	6	617139	617144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706534
13044	NC_015714	ATT	2	6	617164	617169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706534
13045	NC_015714	GGCA	2	8	617193	617200	25 %	0 %	50 %	25 %	338706534
13046	NC_015714	CGC	2	6	617239	617244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706534
13047	NC_015714	CA	3	6	617293	617298	50 %	0 %	0 %	50 %	338706534
13048	NC_015714	CG	4	8	617322	617329	0 %	0 %	50 %	50 %	338706534
13049	NC_015714	TGC	2	6	617341	617346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706534
13050	NC_015714	GC	3	6	617366	617371	0 %	0 %	50 %	50 %	338706534
13051	NC_015714	CCAC	2	8	617375	617382	25 %	0 %	0 %	75 %	338706534
13052	NC_015714	A	7	7	617401	617407	100 %	0 %	0 %	0 %	338706534
13053	NC_015714	CA	3	6	617409	617414	50 %	0 %	0 %	50 %	338706534
13054	NC_015714	GGC	2	6	617461	617466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706534
13055	NC_015714	AGCG	2	8	617598	617605	25 %	0 %	50 %	25 %	338706534
13056	NC_015714	GT	3	6	617620	617625	0 %	50 %	50 %	0 %	338706534
13057	NC_015714	GCA	2	6	617657	617662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706534
13058	NC_015714	AGTCC	2	10	617672	617681	20 %	20 %	20 %	40 %	338706534
13059	NC_015714	AGC	2	6	617688	617693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706534
13060	NC_015714	TCC	3	9	617725	617733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706534
13061	NC_015714	GC	3	6	617756	617761	0 %	0 %	50 %	50 %	338706534
13062	NC_015714	GA	3	6	617827	617832	50 %	0 %	50 %	0 %	338706534
13063	NC_015714	CA	3	6	617884	617889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13064	NC_015714	GCA	2	6	617910	617915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706535
13065	NC_015714	CGGG	2	8	617942	617949	0 %	0 %	75 %	25 %	338706535
13066	NC_015714	CCA	2	6	617971	617976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706535
13067	NC_015714	GC	3	6	618105	618110	0 %	0 %	50 %	50 %	338706535
13068	NC_015714	CAA	2	6	618137	618142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706535
13069	NC_015714	AG	3	6	618206	618211	50 %	0 %	50 %	0 %	338706535
13070	NC_015714	CACC	2	8	618220	618227	25 %	0 %	0 %	75 %	338706535
13071	NC_015714	TCA	2	6	618387	618392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706535
13072	NC_015714	ACC	2	6	618435	618440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706535
13073	NC_015714	AC	3	6	618502	618507	50 %	0 %	0 %	50 %	338706535
13074	NC_015714	ACG	2	6	618532	618537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706535
13075	NC_015714	ACAA	2	8	618538	618545	75 %	0 %	0 %	25 %	338706535
13076	NC_015714	CCG	2	6	618556	618561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706535
13077	NC_015714	CTT	2	6	618564	618569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13078	NC_015714	CGGTTG	2	12	618577	618588	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	338706536
13079	NC_015714	CTCA	2	8	618640	618647	25 %	25 %	0 %	50 %	338706536
13080	NC_015714	GCC	2	6	618683	618688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706536
13081	NC_015714	AGG	2	6	618708	618713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706536
13082	NC_015714	ATC	2	6	618721	618726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706536
13083	NC_015714	ACG	2	6	618740	618745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706536
13084	NC_015714	GC	3	6	618810	618815	0 %	0 %	50 %	50 %	338706536
13085	NC_015714	CCG	2	6	618957	618962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706536
13086	NC_015714	GCA	2	6	619014	619019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706536
13087	NC_015714	ACA	2	6	619047	619052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706536
13088	NC_015714	CGGT	2	8	619089	619096	0 %	25 %	50 %	25 %	338706536
13089	NC_015714	AGG	2	6	619097	619102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706536
13090	NC_015714	AAAGG	2	10	619105	619114	60 %	0 %	40 %	0 %	338706536
13091	NC_015714	TCA	2	6	619224	619229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706536
13092	NC_015714	CGC	2	6	619354	619359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706536
13093	NC_015714	CGCA	2	8	619375	619382	25 %	0 %	25 %	50 %	338706536
13094	NC_015714	GCT	2	6	619395	619400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706536
13095	NC_015714	TTC	2	6	619412	619417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706536
13096	NC_015714	CACG	2	8	619491	619498	25 %	0 %	25 %	50 %	338706536
13097	NC_015714	GCA	2	6	619544	619549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706536
13098	NC_015714	AC	3	6	619553	619558	50 %	0 %	0 %	50 %	338706536
13099	NC_015714	CAGA	2	8	619574	619581	50 %	0 %	25 %	25 %	338706536
13100	NC_015714	GC	3	6	619608	619613	0 %	0 %	50 %	50 %	338706536
13101	NC_015714	AC	3	6	619741	619746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13102	NC_015714	CGCA	2	8	619784	619791	25 %	0 %	25 %	50 %	338706537
13103	NC_015714	AACCT	2	10	619809	619818	40 %	20 %	0 %	40 %	338706537
13104	NC_015714	AG	3	6	619853	619858	50 %	0 %	50 %	0 %	338706537
13105	NC_015714	GCA	2	6	619929	619934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706537
13106	NC_015714	TCCGCG	2	12	619947	619958	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	338706537
13107	NC_015714	GAAG	2	8	620017	620024	50 %	0 %	50 %	0 %	338706537
13108	NC_015714	GTA	2	6	620075	620080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706537
13109	NC_015714	CCA	2	6	620156	620161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706537
13110	NC_015714	CAG	2	6	620167	620172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706537
13111	NC_015714	TCA	2	6	620217	620222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706537
13112	NC_015714	GTA	2	6	620225	620230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706537
13113	NC_015714	TCA	2	6	620254	620259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706537
13114	NC_015714	TGC	2	6	620398	620403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706537
13115	NC_015714	TCC	2	6	620478	620483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706537
13116	NC_015714	CG	3	6	620609	620614	0 %	0 %	50 %	50 %	338706537
13117	NC_015714	GCAC	2	8	620694	620701	25 %	0 %	25 %	50 %	338706537
13118	NC_015714	CTT	2	6	620738	620743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706537
13119	NC_015714	CTG	2	6	620751	620756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706537
13120	NC_015714	GA	3	6	620775	620780	50 %	0 %	50 %	0 %	338706537
13121	NC_015714	CG	3	6	620888	620893	0 %	0 %	50 %	50 %	338706537
13122	NC_015714	AGT	2	6	620953	620958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706537
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13125	NC_015714	AGT	2	6	621048	621053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706537
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13128	NC_015714	TCCT	2	8	621155	621162	0 %	50 %	0 %	50 %	338706538
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13142	NC_015714	GC	4	8	621976	621983	0 %	0 %	50 %	50 %	338706539
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13184	NC_015714	TACC	2	8	624006	624013	25 %	25 %	0 %	50 %	338706540
13185	NC_015714	TAG	2	6	624089	624094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706540
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13231	NC_015714	CGC	2	6	626285	626290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706542
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13233	NC_015714	CTG	2	6	626443	626448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706542
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13239	NC_015714	G	6	6	626585	626590	0 %	0 %	100 %	0 %	338706542
13240	NC_015714	CTG	2	6	626599	626604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706542
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13242	NC_015714	CCA	2	6	626782	626787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706542
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13245	NC_015714	CAT	2	6	626897	626902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706542
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13277	NC_015714	GTAC	2	8	628257	628264	25 %	25 %	25 %	25 %	338706544
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13334	NC_015714	GTTATT	2	12	630722	630733	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338706546
13335	NC_015714	TAG	2	6	630754	630759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706546
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13348	NC_015714	AC	3	6	631734	631739	50 %	0 %	0 %	50 %	338706547
13349	NC_015714	GCT	2	6	631775	631780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706547
13350	NC_015714	CAGCA	2	10	631846	631855	40 %	0 %	20 %	40 %	338706547
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13353	NC_015714	GA	3	6	632044	632049	50 %	0 %	50 %	0 %	338706547
13354	NC_015714	TCC	2	6	632088	632093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706547
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13356	NC_015714	TCT	2	6	632108	632113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706547
13357	NC_015714	TAC	2	6	632157	632162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706547
13358	NC_015714	GAG	2	6	632234	632239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706547
13359	NC_015714	CTT	2	6	632263	632268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706547
13360	NC_015714	GTC	3	9	632336	632344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706547
13361	NC_015714	GT	3	6	632413	632418	0 %	50 %	50 %	0 %	338706547
13362	NC_015714	AGC	2	6	632487	632492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706547
13363	NC_015714	TGA	2	6	632557	632562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706547
13364	NC_015714	TAC	2	6	632564	632569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706547
13365	NC_015714	GC	3	6	632590	632595	0 %	0 %	50 %	50 %	338706547
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13479	NC_015714	AGCCAT	2	12	638287	638298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706551
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13482	NC_015714	T	6	6	638481	638486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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