MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015714	A	7	7	546450	546456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_015714	CTA	2	6	546464	546469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_015714	TTG	3	9	546492	546500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706473
11504	NC_015714	CGT	2	6	546530	546535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706473
11505	NC_015714	TTG	2	6	546564	546569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706473
11506	NC_015714	TCA	2	6	546628	546633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706473
11507	NC_015714	TTG	2	6	546687	546692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706473
11508	NC_015714	TG	3	6	546726	546731	0 %	50 %	50 %	0 %	338706473
11509	NC_015714	GCC	2	6	546737	546742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706473
11510	NC_015714	GT	3	6	546803	546808	0 %	50 %	50 %	0 %	338706473
11511	NC_015714	TGCG	2	8	546867	546874	0 %	25 %	50 %	25 %	338706473
11512	NC_015714	CT	3	6	546989	546994	0 %	50 %	0 %	50 %	338706473
11513	NC_015714	CGT	2	6	547001	547006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706473
11514	NC_015714	TTG	2	6	547023	547028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706473
11515	NC_015714	GAG	2	6	547051	547056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706473
11516	NC_015714	A	8	8	547171	547178	100 %	0 %	0 %	0 %	338706473
11517	NC_015714	GGTA	2	8	547201	547208	25 %	25 %	50 %	0 %	338706473
11518	NC_015714	AGT	2	6	547256	547261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706473
11519	NC_015714	GT	3	6	547334	547339	0 %	50 %	50 %	0 %	338706473
11520	NC_015714	T	6	6	547390	547395	0 %	100 %	0 %	0 %	338706473
11521	NC_015714	ACC	2	6	547433	547438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706473
11522	NC_015714	TAA	2	6	547441	547446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706473
11523	NC_015714	GGA	2	6	547531	547536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706473
11524	NC_015714	TAT	2	6	547597	547602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706473
11525	NC_015714	CATA	2	8	547633	547640	50 %	25 %	0 %	25 %	338706473
11526	NC_015714	C	6	6	547692	547697	0 %	0 %	0 %	100 %	338706473
11527	NC_015714	CTT	2	6	547738	547743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706473
11528	NC_015714	TGC	2	6	547746	547751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706473
11529	NC_015714	GGA	2	6	547868	547873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706473
11530	NC_015714	CTG	2	6	548003	548008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706474
11531	NC_015714	GAA	2	6	548049	548054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706474
11532	NC_015714	A	6	6	548267	548272	100 %	0 %	0 %	0 %	338706474
11533	NC_015714	ACT	2	6	548324	548329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706474
11534	NC_015714	CTG	2	6	548335	548340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706474
11535	NC_015714	CG	3	6	548356	548361	0 %	0 %	50 %	50 %	338706474
11536	NC_015714	TTG	2	6	548411	548416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706474
11537	NC_015714	TTGC	2	8	548455	548462	0 %	50 %	25 %	25 %	338706474
11538	NC_015714	GGT	2	6	548466	548471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706474
11539	NC_015714	A	7	7	548478	548484	100 %	0 %	0 %	0 %	338706474
11540	NC_015714	AC	3	6	548488	548493	50 %	0 %	0 %	50 %	338706474
11541	NC_015714	A	7	7	548591	548597	100 %	0 %	0 %	0 %	338706474
11542	NC_015714	GAC	2	6	548673	548678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706474
11543	NC_015714	GA	3	6	548720	548725	50 %	0 %	50 %	0 %	338706474
11544	NC_015714	TCT	2	6	548758	548763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706474
11545	NC_015714	T	7	7	548782	548788	0 %	100 %	0 %	0 %	338706474
11546	NC_015714	A	7	7	548792	548798	100 %	0 %	0 %	0 %	338706474
11547	NC_015714	GC	3	6	548804	548809	0 %	0 %	50 %	50 %	338706474
11548	NC_015714	T	6	6	548964	548969	0 %	100 %	0 %	0 %	338706474
11549	NC_015714	TGC	2	6	549009	549014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706474
11550	NC_015714	TC	3	6	549037	549042	0 %	50 %	0 %	50 %	338706474
11551	NC_015714	GAT	2	6	549043	549048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706474
11552	NC_015714	ACTC	2	8	549217	549224	25 %	25 %	0 %	50 %	338706474
11553	NC_015714	A	10	10	549320	549329	100 %	0 %	0 %	0 %	338706474
11554	NC_015714	CTGT	2	8	549349	549356	0 %	50 %	25 %	25 %	338706474
11555	NC_015714	GAT	2	6	549358	549363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706474
11556	NC_015714	T	6	6	549373	549378	0 %	100 %	0 %	0 %	338706474
11557	NC_015714	GAAA	2	8	549429	549436	75 %	0 %	25 %	0 %	338706474
11558	NC_015714	TTC	2	6	549455	549460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706474
11559	NC_015714	GCT	2	6	549496	549501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706474
11560	NC_015714	CGG	2	6	549513	549518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706474
11561	NC_015714	CTT	2	6	549640	549645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706474
11562	NC_015714	GTA	2	6	549676	549681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706474
11563	NC_015714	GGA	2	6	549751	549756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706474
11564	NC_015714	TGT	2	6	549759	549764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706474
11565	NC_015714	CGC	2	6	549765	549770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706474
11566	NC_015714	GCAA	2	8	549798	549805	50 %	0 %	25 %	25 %	338706474
11567	NC_015714	ATTAC	2	10	549835	549844	40 %	40 %	0 %	20 %	338706474
11568	NC_015714	GAAATG	2	12	549869	549880	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338706474
11569	NC_015714	TGA	2	6	550031	550036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706474
11570	NC_015714	CTC	2	6	550130	550135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706474
11571	NC_015714	GT	3	6	550160	550165	0 %	50 %	50 %	0 %	338706474
11572	NC_015714	TTTC	2	8	550235	550242	0 %	75 %	0 %	25 %	338706474
11573	NC_015714	GGA	2	6	550252	550257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706474
11574	NC_015714	T	6	6	550305	550310	0 %	100 %	0 %	0 %	338706474
11575	NC_015714	TG	3	6	550335	550340	0 %	50 %	50 %	0 %	338706474
11576	NC_015714	GAA	2	6	550423	550428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706474
11577	NC_015714	T	8	8	550437	550444	0 %	100 %	0 %	0 %	338706474
11578	NC_015714	CTG	2	6	550445	550450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706474
11579	NC_015714	TCC	2	6	550452	550457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706474
11580	NC_015714	CT	3	6	550478	550483	0 %	50 %	0 %	50 %	338706474
11581	NC_015714	CT	3	6	550598	550603	0 %	50 %	0 %	50 %	338706474
11582	NC_015714	CTA	2	6	550619	550624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706474
11583	NC_015714	ATC	2	6	550645	550650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706474
11584	NC_015714	GTT	2	6	550663	550668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706474
11585	NC_015714	TGA	2	6	550700	550705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706474
11586	NC_015714	AACAT	2	10	550709	550718	60 %	20 %	0 %	20 %	338706474
11587	NC_015714	AGG	2	6	550764	550769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706474
11588	NC_015714	TTCT	2	8	550905	550912	0 %	75 %	0 %	25 %	338706475
11589	NC_015714	T	6	6	550912	550917	0 %	100 %	0 %	0 %	338706475
11590	NC_015714	ATT	3	9	550956	550964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706475
11591	NC_015714	TTTCCA	2	12	551086	551097	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338706475
11592	NC_015714	TGA	2	6	551099	551104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706475
11593	NC_015714	ACA	2	6	551146	551151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706475
11594	NC_015714	ATT	2	6	551270	551275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706475
11595	NC_015714	CTTAC	2	10	551289	551298	20 %	40 %	0 %	40 %	338706475
11596	NC_015714	AAGC	2	8	551373	551380	50 %	0 %	25 %	25 %	338706475
11597	NC_015714	AT	3	6	551437	551442	50 %	50 %	0 %	0 %	338706475
11598	NC_015714	TGC	2	6	551446	551451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706475
11599	NC_015714	AAT	2	6	551454	551459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706475
11600	NC_015714	GTT	2	6	551496	551501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706475
11601	NC_015714	TTCA	2	8	551589	551596	25 %	50 %	0 %	25 %	338706475
11602	NC_015714	GAC	2	6	551597	551602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706475
11603	NC_015714	ACCC	2	8	551638	551645	25 %	0 %	0 %	75 %	338706475
11604	NC_015714	AGG	3	9	551671	551679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706475
11605	NC_015714	CTTT	2	8	551746	551753	0 %	75 %	0 %	25 %	338706475
11606	NC_015714	CTAT	2	8	551842	551849	25 %	50 %	0 %	25 %	338706475
11607	NC_015714	ACC	2	6	551853	551858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706475
11608	NC_015714	CTAT	2	8	551882	551889	25 %	50 %	0 %	25 %	338706475
11609	NC_015714	TTA	2	6	551912	551917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706475
11610	NC_015714	TGTA	2	8	551953	551960	25 %	50 %	25 %	0 %	338706475
11611	NC_015714	ATGTGC	2	12	551962	551973	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706475
11612	NC_015714	T	7	7	551991	551997	0 %	100 %	0 %	0 %	338706475
11613	NC_015714	T	6	6	552005	552010	0 %	100 %	0 %	0 %	338706475
11614	NC_015714	AG	3	6	552066	552071	50 %	0 %	50 %	0 %	338706475
11615	NC_015714	AGC	2	6	552090	552095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706475
11616	NC_015714	A	10	10	552217	552226	100 %	0 %	0 %	0 %	338706475
11617	NC_015714	CTT	2	6	552245	552250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706475
11618	NC_015714	TC	3	6	552304	552309	0 %	50 %	0 %	50 %	338706475
11619	NC_015714	TG	3	6	552311	552316	0 %	50 %	50 %	0 %	338706475
11620	NC_015714	CAA	2	6	552333	552338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706475
11621	NC_015714	GAA	2	6	552339	552344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706475
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11623	NC_015714	T	7	7	552476	552482	0 %	100 %	0 %	0 %	338706475
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11983	NC_015714	CG	4	8	569543	569550	0 %	0 %	50 %	50 %	338706489
11984	NC_015714	GATAG	2	10	569559	569568	40 %	20 %	40 %	0 %	338706489
11985	NC_015714	AG	3	6	569592	569597	50 %	0 %	50 %	0 %	338706489
11986	NC_015714	AGGC	2	8	569698	569705	25 %	0 %	50 %	25 %	338706489
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11990	NC_015714	C	7	7	569920	569926	0 %	0 %	0 %	100 %	338706490
11991	NC_015714	TG	3	6	569928	569933	0 %	50 %	50 %	0 %	338706490
11992	NC_015714	CG	3	6	569934	569939	0 %	0 %	50 %	50 %	338706490
11993	NC_015714	GCA	2	6	569940	569945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706490
11994	NC_015714	CA	4	8	569944	569951	50 %	0 %	0 %	50 %	338706490
11995	NC_015714	CGTA	2	8	570019	570026	25 %	25 %	25 %	25 %	338706490
11996	NC_015714	TACG	2	8	570034	570041	25 %	25 %	25 %	25 %	338706490
11997	NC_015714	GCA	3	9	570094	570102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706490
11998	NC_015714	CTG	2	6	570194	570199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706490
11999	NC_015714	CA	3	6	570223	570228	50 %	0 %	0 %	50 %	338706490
12000	NC_015714	TCT	2	6	570246	570251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706490

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