MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_015714	TCT	2	6	497018	497023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706433
10503	NC_015714	CGT	3	9	497109	497117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706433
10504	NC_015714	GTT	2	6	497214	497219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706434
10505	NC_015714	GT	3	6	497244	497249	0 %	50 %	50 %	0 %	338706434
10506	NC_015714	GAAC	2	8	497315	497322	50 %	0 %	25 %	25 %	338706434
10507	NC_015714	AGCA	2	8	497330	497337	50 %	0 %	25 %	25 %	338706434
10508	NC_015714	TG	3	6	497341	497346	0 %	50 %	50 %	0 %	338706434
10509	NC_015714	CTTT	2	8	497395	497402	0 %	75 %	0 %	25 %	338706434
10510	NC_015714	GCA	2	6	497461	497466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706434
10511	NC_015714	TGCAG	2	10	497469	497478	20 %	20 %	40 %	20 %	338706434
10512	NC_015714	CGA	2	6	497484	497489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706434
10513	NC_015714	GTG	2	6	497500	497505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706434
10514	NC_015714	GCA	2	6	497595	497600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706434
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10516	NC_015714	CGG	2	6	497673	497678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706434
10517	NC_015714	GT	3	6	497998	498003	0 %	50 %	50 %	0 %	338706434
10518	NC_015714	TGCAG	2	10	498023	498032	20 %	20 %	40 %	20 %	338706434
10519	NC_015714	CGT	2	6	498034	498039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706434
10520	NC_015714	GAA	2	6	498156	498161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706434
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10522	NC_015714	GTATG	2	10	498283	498292	20 %	40 %	40 %	0 %	338706434
10523	NC_015714	AGT	2	6	498298	498303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706434
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10534	NC_015714	TAG	2	6	498699	498704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706434
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10539	NC_015714	T	7	7	498938	498944	0 %	100 %	0 %	0 %	338706434
10540	NC_015714	GT	3	6	498949	498954	0 %	50 %	50 %	0 %	338706434
10541	NC_015714	AGC	2	6	498963	498968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706434
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10543	NC_015714	GCG	2	6	499008	499013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706434
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10545	NC_015714	AAG	2	6	499060	499065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706434
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10548	NC_015714	CCA	2	6	499219	499224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10549	NC_015714	AACA	2	8	499284	499291	75 %	0 %	0 %	25 %	338706435
10550	NC_015714	AAG	2	6	499307	499312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706435
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10558	NC_015714	A	6	6	499711	499716	100 %	0 %	0 %	0 %	338706435
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10590	NC_015714	ATT	2	6	501706	501711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706437
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10603	NC_015714	GGCG	2	8	502434	502441	0 %	0 %	75 %	25 %	338706437
10604	NC_015714	GCG	2	6	502445	502450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706437
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10610	NC_015714	GCT	2	6	502856	502861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706438
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10613	NC_015714	AAGGC	2	10	502982	502991	40 %	0 %	40 %	20 %	338706438
10614	NC_015714	GCA	2	6	503018	503023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706438
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10616	NC_015714	GTG	2	6	503087	503092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706438
10617	NC_015714	GACA	2	8	503104	503111	50 %	0 %	25 %	25 %	338706438
10618	NC_015714	ACACA	2	10	503234	503243	60 %	0 %	0 %	40 %	338706438
10619	NC_015714	T	7	7	503295	503301	0 %	100 %	0 %	0 %	338706438
10620	NC_015714	GC	3	6	503315	503320	0 %	0 %	50 %	50 %	338706438
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10866	NC_015714	CGA	2	6	515175	515180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706447
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10870	NC_015714	TCA	2	6	515379	515384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706447
10871	NC_015714	CTG	2	6	515440	515445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706447
10872	NC_015714	GCT	2	6	515451	515456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706447
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10874	NC_015714	CG	3	6	515474	515479	0 %	0 %	50 %	50 %	338706447
10875	NC_015714	GCC	2	6	515498	515503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706447
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10896	NC_015714	ATG	2	6	516158	516163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706447
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10900	NC_015714	GCA	2	6	516423	516428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706447
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10904	NC_015714	GCGT	2	8	516698	516705	0 %	25 %	50 %	25 %	338706448
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10926	NC_015714	GCACCG	2	12	517687	517698	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	338706448
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10931	NC_015714	TGA	2	6	517909	517914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706448
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10933	NC_015714	GGA	2	6	517941	517946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706448
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10971	NC_015714	G	6	6	519404	519409	0 %	0 %	100 %	0 %	338706449
10972	NC_015714	AGC	2	6	519477	519482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706449
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10974	NC_015714	CGT	2	6	519649	519654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706449
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10980	NC_015714	GAC	2	6	519953	519958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706449
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10982	NC_015714	ATC	2	6	520106	520111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706449
10983	NC_015714	TCC	2	6	520172	520177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706449
10984	NC_015714	TGA	2	6	520234	520239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706449
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