MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10123	NC_015714	TG	3	6	480271	480276	0 %	50 %	50 %	0 %	338706418
10124	NC_015714	TCC	2	6	480286	480291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706418
10125	NC_015714	TA	3	6	480409	480414	50 %	50 %	0 %	0 %	338706418
10126	NC_015714	A	6	6	480414	480419	100 %	0 %	0 %	0 %	338706418
10127	NC_015714	TTA	2	6	480431	480436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706418
10128	NC_015714	CG	3	6	480498	480503	0 %	0 %	50 %	50 %	338706418
10129	NC_015714	TC	3	6	480578	480583	0 %	50 %	0 %	50 %	338706418
10130	NC_015714	ATT	2	6	480625	480630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706418
10131	NC_015714	CTG	2	6	480647	480652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706418
10132	NC_015714	TCG	2	6	480673	480678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706418
10133	NC_015714	CGGAG	2	10	480709	480718	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10134	NC_015714	ACGC	2	8	480809	480816	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10135	NC_015714	TTTCT	2	10	480837	480846	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10136	NC_015714	TCCT	2	8	480906	480913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10137	NC_015714	C	6	6	480954	480959	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10138	NC_015714	C	6	6	480974	480979	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10139	NC_015714	TGCT	2	8	481024	481031	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10140	NC_015714	GT	4	8	481036	481043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10141	NC_015714	AGC	2	6	481150	481155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706419
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10144	NC_015714	CGC	2	6	481393	481398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706419
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10146	NC_015714	CTGC	2	8	481456	481463	0 %	25 %	25 %	50 %	338706419
10147	NC_015714	CG	3	6	481473	481478	0 %	0 %	50 %	50 %	338706419
10148	NC_015714	GA	3	6	481481	481486	50 %	0 %	50 %	0 %	338706419
10149	NC_015714	GGA	2	6	481487	481492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706419
10150	NC_015714	CG	3	6	481516	481521	0 %	0 %	50 %	50 %	338706419
10151	NC_015714	A	6	6	481544	481549	100 %	0 %	0 %	0 %	338706419
10152	NC_015714	TGAG	2	8	481551	481558	25 %	25 %	50 %	0 %	338706419
10153	NC_015714	TGA	2	6	481591	481596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706419
10154	NC_015714	AGC	2	6	481599	481604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706419
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10158	NC_015714	CTT	2	6	481822	481827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706420
10159	NC_015714	T	6	6	481896	481901	0 %	100 %	0 %	0 %	338706420
10160	NC_015714	GCA	2	6	481925	481930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706420
10161	NC_015714	ATCA	2	8	481975	481982	50 %	25 %	0 %	25 %	338706420
10162	NC_015714	TGT	2	6	481983	481988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706420
10163	NC_015714	GCG	2	6	482017	482022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706420
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10165	NC_015714	G	6	6	482167	482172	0 %	0 %	100 %	0 %	338706420
10166	NC_015714	GCC	2	6	482195	482200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706420
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10170	NC_015714	GC	3	6	482451	482456	0 %	0 %	50 %	50 %	338706420
10171	NC_015714	TTC	2	6	482459	482464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706420
10172	NC_015714	GTC	2	6	482500	482505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706420
10173	NC_015714	AGCAA	2	10	482667	482676	60 %	0 %	20 %	20 %	338706420
10174	NC_015714	TAC	2	6	482846	482851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706421
10175	NC_015714	GAAA	2	8	482858	482865	75 %	0 %	25 %	0 %	338706421
10176	NC_015714	TTC	2	6	482871	482876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706421
10177	NC_015714	GAGG	2	8	482889	482896	25 %	0 %	75 %	0 %	338706421
10178	NC_015714	GA	3	6	482902	482907	50 %	0 %	50 %	0 %	338706421
10179	NC_015714	GAAG	2	8	482910	482917	50 %	0 %	50 %	0 %	338706421
10180	NC_015714	CGTG	2	8	482950	482957	0 %	25 %	50 %	25 %	338706421
10181	NC_015714	TCT	2	6	482971	482976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706421
10182	NC_015714	GC	3	6	483028	483033	0 %	0 %	50 %	50 %	338706421
10183	NC_015714	GTG	2	6	483060	483065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706421
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10185	NC_015714	GA	4	8	483152	483159	50 %	0 %	50 %	0 %	338706421
10186	NC_015714	CG	3	6	483164	483169	0 %	0 %	50 %	50 %	338706421
10187	NC_015714	CAAG	2	8	483170	483177	50 %	0 %	25 %	25 %	338706421
10188	NC_015714	TGA	2	6	483208	483213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706421
10189	NC_015714	GGC	2	6	483273	483278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706421
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10191	NC_015714	AGGG	2	8	483364	483371	25 %	0 %	75 %	0 %	338706421
10192	NC_015714	GC	3	6	483487	483492	0 %	0 %	50 %	50 %	338706421
10193	NC_015714	AGCG	2	8	483512	483519	25 %	0 %	50 %	25 %	338706421
10194	NC_015714	AACA	2	8	483600	483607	75 %	0 %	0 %	25 %	338706421
10195	NC_015714	G	6	6	483632	483637	0 %	0 %	100 %	0 %	338706421
10196	NC_015714	CTG	2	6	483640	483645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706421
10197	NC_015714	TG	3	6	483679	483684	0 %	50 %	50 %	0 %	338706421
10198	NC_015714	G	6	6	483696	483701	0 %	0 %	100 %	0 %	338706421
10199	NC_015714	CGT	2	6	483717	483722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706421
10200	NC_015714	TGA	2	6	483812	483817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706421
10201	NC_015714	CG	3	6	483915	483920	0 %	0 %	50 %	50 %	338706421
10202	NC_015714	CGTC	2	8	483931	483938	0 %	25 %	25 %	50 %	338706421
10203	NC_015714	CGTG	2	8	483939	483946	0 %	25 %	50 %	25 %	338706421
10204	NC_015714	CGG	2	6	483998	484003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706421
10205	NC_015714	GT	3	6	484017	484022	0 %	50 %	50 %	0 %	338706421
10206	NC_015714	GTGC	2	8	484048	484055	0 %	25 %	50 %	25 %	338706421
10207	NC_015714	CA	3	6	484088	484093	50 %	0 %	0 %	50 %	338706421
10208	NC_015714	CCT	2	6	484129	484134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10209	NC_015714	GGCG	2	8	484161	484168	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10210	NC_015714	CAG	2	6	484179	484184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10211	NC_015714	GTGCGC	2	12	484283	484294	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	338706422
10212	NC_015714	GT	3	6	484298	484303	0 %	50 %	50 %	0 %	338706422
10213	NC_015714	TGC	2	6	484325	484330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706422
10214	NC_015714	GCT	2	6	484335	484340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706422
10215	NC_015714	GC	3	6	484341	484346	0 %	0 %	50 %	50 %	338706422
10216	NC_015714	GAG	2	6	484360	484365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706422
10217	NC_015714	AG	4	8	484413	484420	50 %	0 %	50 %	0 %	338706422
10218	NC_015714	GCG	2	6	484473	484478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706422
10219	NC_015714	GCG	2	6	484678	484683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706422
10220	NC_015714	CGGG	2	8	484726	484733	0 %	0 %	75 %	25 %	338706422
10221	NC_015714	GC	3	6	484835	484840	0 %	0 %	50 %	50 %	338706422
10222	NC_015714	CG	3	6	484862	484867	0 %	0 %	50 %	50 %	338706422
10223	NC_015714	TGTA	2	8	484880	484887	25 %	50 %	25 %	0 %	338706422
10224	NC_015714	TG	3	6	484938	484943	0 %	50 %	50 %	0 %	338706422
10225	NC_015714	ACGTGC	2	12	484952	484963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	338706422
10226	NC_015714	CCG	2	6	485068	485073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706422
10227	NC_015714	GCTC	2	8	485130	485137	0 %	25 %	25 %	50 %	338706422
10228	NC_015714	GGAT	2	8	485145	485152	25 %	25 %	50 %	0 %	338706422
10229	NC_015714	GTGG	2	8	485289	485296	0 %	25 %	75 %	0 %	338706422
10230	NC_015714	A	6	6	485349	485354	100 %	0 %	0 %	0 %	338706422
10231	NC_015714	GAC	2	6	485358	485363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706422
10232	NC_015714	T	6	6	485413	485418	0 %	100 %	0 %	0 %	338706422
10233	NC_015714	GGCAGC	2	12	485442	485453	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338706422
10234	NC_015714	GCG	2	6	485469	485474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706422
10235	NC_015714	GGA	2	6	485546	485551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706422
10236	NC_015714	AGG	2	6	485558	485563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706422
10237	NC_015714	TCC	2	6	485610	485615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706422
10238	NC_015714	TGCG	2	8	485699	485706	0 %	25 %	50 %	25 %	338706422
10239	NC_015714	GAG	2	6	485764	485769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706422
10240	NC_015714	GCG	2	6	485863	485868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706422
10241	NC_015714	CAG	2	6	485908	485913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706422
10242	NC_015714	GGTGCG	2	12	485925	485936	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	338706422
10243	NC_015714	AGG	2	6	486026	486031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10244	NC_015714	TTTG	2	8	486126	486133	0 %	75 %	25 %	0 %	338706423
10245	NC_015714	GC	3	6	486239	486244	0 %	0 %	50 %	50 %	338706423
10246	NC_015714	GTG	4	12	486245	486256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706423
10247	NC_015714	TGC	2	6	486293	486298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706423
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10491	NC_015714	GCG	2	6	496415	496420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706433
10492	NC_015714	TGC	2	6	496458	496463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706433
10493	NC_015714	TTG	2	6	496527	496532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706433
10494	NC_015714	TGCGC	2	10	496543	496552	0 %	20 %	40 %	40 %	338706433
10495	NC_015714	CCT	2	6	496605	496610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706433
10496	NC_015714	A	7	7	496617	496623	100 %	0 %	0 %	0 %	338706433
10497	NC_015714	T	6	6	496772	496777	0 %	100 %	0 %	0 %	338706433
10498	NC_015714	GTT	2	6	496916	496921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706433
10499	NC_015714	T	6	6	496920	496925	0 %	100 %	0 %	0 %	338706433
10500	NC_015714	GC	3	6	496960	496965	0 %	0 %	50 %	50 %	338706433

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