MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_015714	GAT	2	6	451244	451249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706392
9502	NC_015714	GTC	2	6	451254	451259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706392
9503	NC_015714	GAA	2	6	451263	451268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706392
9504	NC_015714	GGA	2	6	451280	451285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706392
9505	NC_015714	GCA	2	6	451331	451336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706392
9506	NC_015714	CG	3	6	451448	451453	0 %	0 %	50 %	50 %	338706392
9507	NC_015714	GAAA	2	8	451529	451536	75 %	0 %	25 %	0 %	338706392
9508	NC_015714	CGA	2	6	451567	451572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706392
9509	NC_015714	TCA	2	6	451663	451668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706393
9510	NC_015714	ATT	2	6	451858	451863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706393
9511	NC_015714	GGT	2	6	451905	451910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706393
9512	NC_015714	AGGG	2	8	451925	451932	25 %	0 %	75 %	0 %	338706393
9513	NC_015714	CGG	2	6	451940	451945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706393
9514	NC_015714	CG	3	6	451976	451981	0 %	0 %	50 %	50 %	338706393
9515	NC_015714	TGAT	2	8	452008	452015	25 %	50 %	25 %	0 %	338706393
9516	NC_015714	GTT	2	6	452031	452036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706393
9517	NC_015714	T	6	6	452053	452058	0 %	100 %	0 %	0 %	338706393
9518	NC_015714	CTG	2	6	452085	452090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706393
9519	NC_015714	TGCAA	2	10	452099	452108	40 %	20 %	20 %	20 %	338706393
9520	NC_015714	CAGC	2	8	452420	452427	25 %	0 %	25 %	50 %	338706393
9521	NC_015714	TGA	2	6	452459	452464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706393
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9523	NC_015714	GAT	2	6	452508	452513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706393
9524	NC_015714	GAA	2	6	452570	452575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706393
9525	NC_015714	ATC	2	6	452644	452649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706393
9526	NC_015714	GC	3	6	452650	452655	0 %	0 %	50 %	50 %	338706393
9527	NC_015714	ATA	2	6	452662	452667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706393
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9529	NC_015714	TGATT	2	10	452882	452891	20 %	60 %	20 %	0 %	338706393
9530	NC_015714	GTG	2	6	452914	452919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9531	NC_015714	AGC	2	6	453015	453020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706394
9532	NC_015714	GC	4	8	453050	453057	0 %	0 %	50 %	50 %	338706394
9533	NC_015714	CAG	2	6	453101	453106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706394
9534	NC_015714	T	6	6	453117	453122	0 %	100 %	0 %	0 %	338706394
9535	NC_015714	GT	3	6	453132	453137	0 %	50 %	50 %	0 %	338706394
9536	NC_015714	CG	3	6	453142	453147	0 %	0 %	50 %	50 %	338706394
9537	NC_015714	TCC	2	6	453235	453240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706394
9538	NC_015714	GTGG	2	8	453265	453272	0 %	25 %	75 %	0 %	338706394
9539	NC_015714	CGA	2	6	453331	453336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706394
9540	NC_015714	GCAT	2	8	453422	453429	25 %	25 %	25 %	25 %	338706394
9541	NC_015714	CAG	2	6	453458	453463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706394
9542	NC_015714	TGC	2	6	453466	453471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706394
9543	NC_015714	AGT	2	6	453472	453477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706394
9544	NC_015714	AAG	2	6	453494	453499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706394
9545	NC_015714	GCGTT	2	10	453607	453616	0 %	40 %	40 %	20 %	338706395
9546	NC_015714	TGTGCA	2	12	453627	453638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338706395
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9549	NC_015714	CAGGT	2	10	453767	453776	20 %	20 %	40 %	20 %	338706395
9550	NC_015714	AGC	2	6	453783	453788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706395
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9552	NC_015714	G	6	6	453887	453892	0 %	0 %	100 %	0 %	338706395
9553	NC_015714	CGG	2	6	453902	453907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706395
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9555	NC_015714	TCG	2	6	454011	454016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706395
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9557	NC_015714	GCC	2	6	454062	454067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706395
9558	NC_015714	GC	5	10	454084	454093	0 %	0 %	50 %	50 %	338706395
9559	NC_015714	GAG	2	6	454150	454155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706395
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9564	NC_015714	CCTG	2	8	454338	454345	0 %	25 %	25 %	50 %	338706395
9565	NC_015714	GTGC	2	8	454354	454361	0 %	25 %	50 %	25 %	338706395
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9578	NC_015714	TTCT	2	8	454837	454844	0 %	75 %	0 %	25 %	338706395
9579	NC_015714	TCG	2	6	454877	454882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706395
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9589	NC_015714	GGCTT	2	10	455509	455518	0 %	40 %	40 %	20 %	338706396
9590	NC_015714	GGCAG	2	10	455520	455529	20 %	0 %	60 %	20 %	338706396
9591	NC_015714	AAT	2	6	455563	455568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706396
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9596	NC_015714	GGGC	2	8	455737	455744	0 %	0 %	75 %	25 %	338706396
9597	NC_015714	TG	3	6	455816	455821	0 %	50 %	50 %	0 %	338706396
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9601	NC_015714	GCGT	2	8	455972	455979	0 %	25 %	50 %	25 %	338706397
9602	NC_015714	GTT	2	6	455982	455987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706397
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9604	NC_015714	TC	3	6	456076	456081	0 %	50 %	0 %	50 %	338706397
9605	NC_015714	TCC	2	6	456097	456102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706397
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9607	NC_015714	GC	3	6	456222	456227	0 %	0 %	50 %	50 %	338706397
9608	NC_015714	GGC	2	6	456261	456266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706397
9609	NC_015714	CGG	2	6	456326	456331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706397
9610	NC_015714	TC	3	6	456394	456399	0 %	50 %	0 %	50 %	338706397
9611	NC_015714	CCTG	2	8	456438	456445	0 %	25 %	25 %	50 %	338706397
9612	NC_015714	TAC	2	6	456465	456470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706397
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9615	NC_015714	TCC	2	6	456615	456620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706397
9616	NC_015714	TC	3	6	456679	456684	0 %	50 %	0 %	50 %	338706397
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9622	NC_015714	TGG	2	6	456956	456961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706398
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9999	NC_015714	T	8	8	473376	473383	0 %	100 %	0 %	0 %	338706414
10000	NC_015714	GTC	2	6	473429	473434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706414

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