MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 23885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015714	GGC	2	6	243844	243849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706215
5002	NC_015714	T	9	9	243909	243917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015714	CGT	2	6	243932	243937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_015714	TG	3	6	243938	243943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_015714	TG	3	6	244088	244093	0 %	50 %	50 %	0 %	338706216
5006	NC_015714	TCGGT	2	10	244135	244144	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5007	NC_015714	G	6	6	244154	244159	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_015714	AC	3	6	244186	244191	50 %	0 %	0 %	50 %	338706217
5009	NC_015714	TAC	2	6	244326	244331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706217
5010	NC_015714	TGA	2	6	244425	244430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706217
5011	NC_015714	CAAA	2	8	244461	244468	75 %	0 %	0 %	25 %	338706217
5012	NC_015714	TTG	2	6	244502	244507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706217
5013	NC_015714	CAA	2	6	244518	244523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706217
5014	NC_015714	ATC	2	6	244594	244599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706217
5015	NC_015714	GTG	2	6	244615	244620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706217
5016	NC_015714	GTT	2	6	244648	244653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706217
5017	NC_015714	T	6	6	244652	244657	0 %	100 %	0 %	0 %	338706217
5018	NC_015714	AAGG	2	8	244672	244679	50 %	0 %	50 %	0 %	338706217
5019	NC_015714	ATT	2	6	244702	244707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706217
5020	NC_015714	A	6	6	244747	244752	100 %	0 %	0 %	0 %	338706217
5021	NC_015714	TGCG	2	8	244808	244815	0 %	25 %	50 %	25 %	338706217
5022	NC_015714	ATC	2	6	244840	244845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706217
5023	NC_015714	GCT	2	6	244902	244907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706217
5024	NC_015714	GA	3	6	244982	244987	50 %	0 %	50 %	0 %	338706217
5025	NC_015714	ATCC	2	8	244990	244997	25 %	25 %	0 %	50 %	338706217
5026	NC_015714	GAT	2	6	245008	245013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706217
5027	NC_015714	CTG	2	6	245014	245019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706217
5028	NC_015714	TTA	2	6	245045	245050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706217
5029	NC_015714	TGTAT	2	10	245167	245176	20 %	60 %	20 %	0 %	338706217
5030	NC_015714	CGG	2	6	245216	245221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706217
5031	NC_015714	ACT	2	6	245320	245325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706217
5032	NC_015714	CGA	2	6	245343	245348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706217
5033	NC_015714	TCA	2	6	245372	245377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706217
5034	NC_015714	GAT	2	6	245404	245409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706217
5035	NC_015714	CGT	2	6	245428	245433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706217
5036	NC_015714	TTCG	2	8	245435	245442	0 %	50 %	25 %	25 %	338706217
5037	NC_015714	GGAAAC	2	12	245523	245534	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	338706217
5038	NC_015714	AC	3	6	245650	245655	50 %	0 %	0 %	50 %	338706217
5039	NC_015714	TGG	2	6	245682	245687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706217
5040	NC_015714	ACGC	2	8	245810	245817	25 %	0 %	25 %	50 %	338706217
5041	NC_015714	GTT	2	6	245869	245874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706217
5042	NC_015714	CTA	2	6	245916	245921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706217
5043	NC_015714	CGG	2	6	245939	245944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706217
5044	NC_015714	CGGA	2	8	245951	245958	25 %	0 %	50 %	25 %	338706217
5045	NC_015714	G	6	6	245993	245998	0 %	0 %	100 %	0 %	338706217
5046	NC_015714	TTTCTG	2	12	246059	246070	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	338706217
5047	NC_015714	TC	3	6	246073	246078	0 %	50 %	0 %	50 %	338706217
5048	NC_015714	ATG	3	9	246095	246103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706217
5049	NC_015714	CG	3	6	246170	246175	0 %	0 %	50 %	50 %	338706217
5050	NC_015714	AGA	2	6	246266	246271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706217
5051	NC_015714	CCG	2	6	246284	246289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706217
5052	NC_015714	AGA	2	6	246308	246313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706217
5053	NC_015714	ACC	2	6	246362	246367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706217
5054	NC_015714	AGG	2	6	246539	246544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706217
5055	NC_015714	GAA	2	6	246645	246650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706217
5056	NC_015714	GTGC	2	8	246697	246704	0 %	25 %	50 %	25 %	338706217
5057	NC_015714	GAC	2	6	246750	246755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706217
5058	NC_015714	GCT	2	6	246768	246773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706217
5059	NC_015714	GAAG	2	8	246798	246805	50 %	0 %	50 %	0 %	338706217
5060	NC_015714	TTC	2	6	246813	246818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706217
5061	NC_015714	GGAG	2	8	246879	246886	25 %	0 %	75 %	0 %	338706217
5062	NC_015714	GGT	2	6	246912	246917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706217
5063	NC_015714	GC	3	6	246997	247002	0 %	0 %	50 %	50 %	338706217
5064	NC_015714	TCCT	2	8	247004	247011	0 %	50 %	0 %	50 %	338706217
5065	NC_015714	GAA	2	6	247012	247017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706217
5066	NC_015714	GAT	2	6	247033	247038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706217
5067	NC_015714	GCAG	2	8	247206	247213	25 %	0 %	50 %	25 %	338706217
5068	NC_015714	TGC	2	6	247238	247243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706217
5069	NC_015714	GACG	2	8	247246	247253	25 %	0 %	50 %	25 %	338706217
5070	NC_015714	ATT	2	6	247262	247267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706217
5071	NC_015714	GCA	2	6	247371	247376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706217
5072	NC_015714	CGGCG	2	10	247449	247458	0 %	0 %	60 %	40 %	338706217
5073	NC_015714	GAT	2	6	247492	247497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706217
5074	NC_015714	GAA	2	6	247666	247671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706217
5075	NC_015714	AATT	2	8	247812	247819	50 %	50 %	0 %	0 %	338706218
5076	NC_015714	T	6	6	247850	247855	0 %	100 %	0 %	0 %	338706218
5077	NC_015714	TAC	2	6	247872	247877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
5078	NC_015714	GGAATG	2	12	247881	247892	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338706218
5079	NC_015714	TAC	2	6	248029	248034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
5080	NC_015714	A	6	6	248145	248150	100 %	0 %	0 %	0 %	338706218
5081	NC_015714	GGC	2	6	248203	248208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706218
5082	NC_015714	CGG	2	6	248213	248218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706218
5083	NC_015714	ACCTTG	2	12	248255	248266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706218
5084	NC_015714	TTG	2	6	248273	248278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706218
5085	NC_015714	GAT	2	6	248295	248300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
5086	NC_015714	TGC	2	6	248330	248335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706218
5087	NC_015714	GAT	2	6	248388	248393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
5088	NC_015714	G	6	6	248449	248454	0 %	0 %	100 %	0 %	338706218
5089	NC_015714	ATC	2	6	248548	248553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
5090	NC_015714	TAT	2	6	248820	248825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706218
5091	NC_015714	GAAA	2	8	248841	248848	75 %	0 %	25 %	0 %	338706218
5092	NC_015714	TGG	2	6	249002	249007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706218
5093	NC_015714	TG	3	6	249036	249041	0 %	50 %	50 %	0 %	338706218
5094	NC_015714	GGC	2	6	249102	249107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706218
5095	NC_015714	TGT	2	6	249131	249136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706218
5096	NC_015714	TAT	2	6	249211	249216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706218
5097	NC_015714	CT	3	6	249231	249236	0 %	50 %	0 %	50 %	338706218
5098	NC_015714	GGA	2	6	249273	249278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706218
5099	NC_015714	ATG	2	6	249283	249288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
5100	NC_015714	ACT	2	6	249367	249372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
5101	NC_015714	TGA	2	6	249435	249440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
5102	NC_015714	AATT	2	8	249455	249462	50 %	50 %	0 %	0 %	338706218
5103	NC_015714	CTT	2	6	249546	249551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706218
5104	NC_015714	GAC	2	6	249571	249576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706218
5105	NC_015714	ATC	2	6	249577	249582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
5106	NC_015714	G	6	6	249655	249660	0 %	0 %	100 %	0 %	338706218
5107	NC_015714	CGT	2	6	249690	249695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706218
5108	NC_015714	GAG	2	6	249718	249723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706218
5109	NC_015714	ATG	2	6	249736	249741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
5110	NC_015714	GGAT	2	8	249762	249769	25 %	25 %	50 %	0 %	338706218
5111	NC_015714	ATG	2	6	249784	249789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
5112	NC_015714	GC	3	6	249802	249807	0 %	0 %	50 %	50 %	338706218
5113	NC_015714	ATC	2	6	249874	249879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
5114	NC_015714	T	6	6	249928	249933	0 %	100 %	0 %	0 %	338706218
5115	NC_015714	CGT	2	6	250006	250011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706218
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5117	NC_015714	GAG	2	6	250045	250050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706218
5118	NC_015714	CG	3	6	250081	250086	0 %	0 %	50 %	50 %	338706218
5119	NC_015714	ATT	2	6	250105	250110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706218
5120	NC_015714	CTG	2	6	250180	250185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706218
5121	NC_015714	CGA	2	6	250206	250211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706218
5122	NC_015714	GAA	2	6	250231	250236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706218
5123	NC_015714	GAG	2	6	250289	250294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706218
5124	NC_015714	TG	5	10	250295	250304	0 %	50 %	50 %	0 %	338706218
5125	NC_015714	CAA	2	6	250329	250334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706218
5126	NC_015714	TAC	2	6	250443	250448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
5127	NC_015714	GGA	2	6	250518	250523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706218
5128	NC_015714	T	6	6	250558	250563	0 %	100 %	0 %	0 %	338706218
5129	NC_015714	CG	4	8	250621	250628	0 %	0 %	50 %	50 %	338706218
5130	NC_015714	ACCAC	2	10	250652	250661	40 %	0 %	0 %	60 %	338706218
5131	NC_015714	ATCG	2	8	250708	250715	25 %	25 %	25 %	25 %	338706218
5132	NC_015714	GTA	2	6	250771	250776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
5133	NC_015714	GCC	2	6	250797	250802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706218
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5136	NC_015714	ACG	2	6	250948	250953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706218
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5138	NC_015714	TAC	2	6	251023	251028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706218
5139	NC_015714	GC	3	6	251041	251046	0 %	0 %	50 %	50 %	338706218
5140	NC_015714	GAA	2	6	251056	251061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706218
5141	NC_015714	GC	3	6	251063	251068	0 %	0 %	50 %	50 %	338706218
5142	NC_015714	G	6	6	251134	251139	0 %	0 %	100 %	0 %	338706218
5143	NC_015714	ATT	2	6	251157	251162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706218
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5147	NC_015714	GGCG	2	8	251340	251347	0 %	0 %	75 %	25 %	338706218
5148	NC_015714	TG	3	6	251354	251359	0 %	50 %	50 %	0 %	338706218
5149	NC_015714	TGA	2	6	251423	251428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
5150	NC_015714	TCAA	2	8	251464	251471	50 %	25 %	0 %	25 %	338706218
5151	NC_015714	GTG	2	6	251491	251496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706218
5152	NC_015714	G	6	6	251611	251616	0 %	0 %	100 %	0 %	338706218
5153	NC_015714	GC	3	6	251629	251634	0 %	0 %	50 %	50 %	338706218
5154	NC_015714	GGC	2	6	251658	251663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706218
5155	NC_015714	GCG	2	6	251728	251733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706218
5156	NC_015714	TGA	2	6	251748	251753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706218
5157	NC_015714	TG	3	6	251756	251761	0 %	50 %	50 %	0 %	338706218
5158	NC_015714	GCG	2	6	251814	251819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706218
5159	NC_015714	GGA	2	6	251874	251879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706218
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5161	NC_015714	TG	3	6	252011	252016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5162	NC_015714	T	7	7	252041	252047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5163	NC_015714	CAA	2	6	252071	252076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706219
5164	NC_015714	T	6	6	252110	252115	0 %	100 %	0 %	0 %	338706219
5165	NC_015714	GT	3	6	252163	252168	0 %	50 %	50 %	0 %	338706219
5166	NC_015714	TGA	2	6	252176	252181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706219
5167	NC_015714	A	6	6	252192	252197	100 %	0 %	0 %	0 %	338706219
5168	NC_015714	TCTGC	2	10	252205	252214	0 %	40 %	20 %	40 %	338706219
5169	NC_015714	G	6	6	252362	252367	0 %	0 %	100 %	0 %	338706219
5170	NC_015714	GTG	2	6	252385	252390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706219
5171	NC_015714	GAG	2	6	252452	252457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5172	NC_015714	CCG	2	6	252496	252501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706220
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5174	NC_015714	GTG	2	6	252523	252528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706220
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5189	NC_015714	TGCAG	2	10	253286	253295	20 %	20 %	40 %	20 %	338706221
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5216	NC_015714	GCA	2	6	254623	254628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706221
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5221	NC_015714	CTT	2	6	254928	254933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706221
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5226	NC_015714	CG	3	6	255229	255234	0 %	0 %	50 %	50 %	338706221
5227	NC_015714	GAGG	2	8	255245	255252	25 %	0 %	75 %	0 %	338706221
5228	NC_015714	CG	3	6	255258	255263	0 %	0 %	50 %	50 %	338706221
5229	NC_015714	GAT	2	6	255272	255277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706221
5230	NC_015714	GCT	2	6	255319	255324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706221
5231	NC_015714	T	6	6	255386	255391	0 %	100 %	0 %	0 %	338706221
5232	NC_015714	GAT	2	6	255461	255466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706221
5233	NC_015714	TTG	2	6	255501	255506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706221
5234	NC_015714	AGT	2	6	255577	255582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706221
5235	NC_015714	GGT	2	6	255596	255601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706221
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5237	NC_015714	AGA	2	6	255647	255652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706221
5238	NC_015714	TG	4	8	255705	255712	0 %	50 %	50 %	0 %	338706221
5239	NC_015714	GTG	2	6	255734	255739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706221
5240	NC_015714	TGA	2	6	255745	255750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706221
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5242	NC_015714	GTA	2	6	255836	255841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706221
5243	NC_015714	AT	3	6	255926	255931	50 %	50 %	0 %	0 %	338706221
5244	NC_015714	GCATG	2	10	256027	256036	20 %	20 %	40 %	20 %	338706221
5245	NC_015714	AGTGT	2	10	256082	256091	20 %	40 %	40 %	0 %	338706221
5246	NC_015714	CT	3	6	256106	256111	0 %	50 %	0 %	50 %	338706221
5247	NC_015714	ACA	2	6	256208	256213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706221
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5249	NC_015714	ATC	2	6	256358	256363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706221
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5252	NC_015714	T	8	8	256427	256434	0 %	100 %	0 %	0 %	338706222
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5363	NC_015714	GGT	2	6	261439	261444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5367	NC_015714	G	6	6	261613	261618	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5372	NC_015714	GAG	2	6	261755	261760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5497	NC_015714	GTG	2	6	267755	267760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706231
5498	NC_015714	CCCG	2	8	267803	267810	0 %	0 %	25 %	75 %	338706231
5499	NC_015714	GTTC	2	8	267876	267883	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5500	NC_015714	GCAC	2	8	267915	267922	25 %	0 %	25 %	50 %	338706232

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