MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga thermarum DSM 5069 chromosome

Total Repeats: 40243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015707	TAT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015707	GTTT	2	8	21	28	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015707	TCA	2	6	184	189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729813
4	NC_015707	A	6	6	204	209	100 %	0 %	0 %	0 %	338729813
5	NC_015707	ACG	2	6	307	312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338729813
6	NC_015707	A	6	6	324	329	100 %	0 %	0 %	0 %	338729813
7	NC_015707	ACA	2	6	394	399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729813
8	NC_015707	A	6	6	431	436	100 %	0 %	0 %	0 %	338729813
9	NC_015707	TTG	2	6	583	588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729813
10	NC_015707	AAAG	2	8	596	603	75 %	0 %	25 %	0 %	338729813
11	NC_015707	CTT	2	6	654	659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729813
12	NC_015707	GTT	2	6	704	709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729813
13	NC_015707	GTT	2	6	825	830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729813
14	NC_015707	GAG	2	6	852	857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338729813
15	NC_015707	GAGG	2	8	894	901	25 %	0 %	75 %	0 %	338729813
16	NC_015707	GAA	2	6	1063	1068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729813
17	NC_015707	GAA	2	6	1107	1112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729813
18	NC_015707	AGG	2	6	1149	1154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338729813
19	NC_015707	CAT	3	9	1160	1168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729813
20	NC_015707	A	6	6	1196	1201	100 %	0 %	0 %	0 %	338729813
21	NC_015707	CAA	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729813
22	NC_015707	CTT	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729813
23	NC_015707	TCA	2	6	1408	1413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729814
24	NC_015707	TTC	2	6	1415	1420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729814
25	NC_015707	CAAA	2	8	1447	1454	75 %	0 %	0 %	25 %	338729814
26	NC_015707	GCA	2	6	1510	1515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338729814
27	NC_015707	ATC	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729814
28	NC_015707	GCC	2	6	1766	1771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338729814
29	NC_015707	ACA	2	6	1929	1934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729814
30	NC_015707	TG	3	6	1948	1953	0 %	50 %	50 %	0 %	338729814
31	NC_015707	T	6	6	2041	2046	0 %	100 %	0 %	0 %	338729814
32	NC_015707	T	6	6	2087	2092	0 %	100 %	0 %	0 %	338729814
33	NC_015707	TTC	2	6	2165	2170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729814
34	NC_015707	GTT	2	6	2178	2183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729814
35	NC_015707	TTCTT	2	10	2261	2270	0 %	80 %	0 %	20 %	338729814
36	NC_015707	T	6	6	2382	2387	0 %	100 %	0 %	0 %	338729815
37	NC_015707	CAC	2	6	2401	2406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338729815
38	NC_015707	CCAT	2	8	2449	2456	25 %	25 %	0 %	50 %	338729815
39	NC_015707	TTTTC	2	10	2459	2468	0 %	80 %	0 %	20 %	338729815
40	NC_015707	AAG	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729815
41	NC_015707	TTC	3	9	2530	2538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729815
42	NC_015707	T	6	6	2545	2550	0 %	100 %	0 %	0 %	338729815
43	NC_015707	ACG	2	6	2564	2569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338729815
44	NC_015707	AC	3	6	2571	2576	50 %	0 %	0 %	50 %	338729815
45	NC_015707	T	6	6	2616	2621	0 %	100 %	0 %	0 %	338729815
46	NC_015707	C	6	6	2664	2669	0 %	0 %	0 %	100 %	338729815
47	NC_015707	AGTC	2	8	2671	2678	25 %	25 %	25 %	25 %	338729815
48	NC_015707	T	6	6	2700	2705	0 %	100 %	0 %	0 %	338729815
49	NC_015707	ACG	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338729815
50	NC_015707	TTTG	2	8	2775	2782	0 %	75 %	25 %	0 %	338729815
51	NC_015707	GTT	2	6	2799	2804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729815
52	NC_015707	CTT	2	6	2936	2941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729815
53	NC_015707	T	6	6	3084	3089	0 %	100 %	0 %	0 %	338729815
54	NC_015707	GA	3	6	3109	3114	50 %	0 %	50 %	0 %	338729815
55	NC_015707	CAA	2	6	3126	3131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729815
56	NC_015707	T	6	6	3214	3219	0 %	100 %	0 %	0 %	338729815
57	NC_015707	ATCG	2	8	3235	3242	25 %	25 %	25 %	25 %	338729815
58	NC_015707	TGAAA	2	10	3365	3374	60 %	20 %	20 %	0 %	338729816
59	NC_015707	GTA	2	6	3434	3439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338729816
60	NC_015707	CAT	2	6	3511	3516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729816
61	NC_015707	TTTC	2	8	3522	3529	0 %	75 %	0 %	25 %	338729816
62	NC_015707	AAG	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729816
63	NC_015707	CAA	2	6	3731	3736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729816
64	NC_015707	TTCAC	2	10	3759	3768	20 %	40 %	0 %	40 %	338729816
65	NC_015707	GCT	2	6	3828	3833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338729816
66	NC_015707	TGC	2	6	3848	3853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338729816
67	NC_015707	T	6	6	3857	3862	0 %	100 %	0 %	0 %	338729816
68	NC_015707	ATG	2	6	3930	3935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338729816
69	NC_015707	T	6	6	3961	3966	0 %	100 %	0 %	0 %	338729816
70	NC_015707	TTC	2	6	4013	4018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729816
71	NC_015707	T	6	6	4043	4048	0 %	100 %	0 %	0 %	338729816
72	NC_015707	GTT	2	6	4142	4147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729816
73	NC_015707	AAT	2	6	4186	4191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338729816
74	NC_015707	CT	3	6	4245	4250	0 %	50 %	0 %	50 %	338729816
75	NC_015707	TCAAGT	2	12	4305	4316	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338729816
76	NC_015707	CAAA	2	8	4339	4346	75 %	0 %	0 %	25 %	338729816
77	NC_015707	CCCT	2	8	4377	4384	0 %	25 %	0 %	75 %	338729816
78	NC_015707	CCT	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338729817
79	NC_015707	AAG	2	6	4461	4466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729817
80	NC_015707	CCG	2	6	4508	4513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338729817
81	NC_015707	ACA	2	6	4550	4555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729817
82	NC_015707	TGC	2	6	4569	4574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338729817
83	NC_015707	TGG	2	6	4676	4681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338729817
84	NC_015707	CTC	2	6	4725	4730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338729817
85	NC_015707	TGT	2	6	4856	4861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729817
86	NC_015707	ACA	2	6	4963	4968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729817
87	NC_015707	GGCA	2	8	5002	5009	25 %	0 %	50 %	25 %	338729817
88	NC_015707	AAGG	2	8	5050	5057	50 %	0 %	50 %	0 %	338729817
89	NC_015707	TCA	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729817
90	NC_015707	AGC	2	6	5130	5135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338729817
91	NC_015707	T	6	6	5167	5172	0 %	100 %	0 %	0 %	338729817
92	NC_015707	CAA	2	6	5292	5297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729817
93	NC_015707	GAAG	2	8	5452	5459	50 %	0 %	50 %	0 %	338729817
94	NC_015707	AAC	2	6	5493	5498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729817
95	NC_015707	TATTCC	2	12	5538	5549	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338729817
96	NC_015707	AAGCA	2	10	5550	5559	60 %	0 %	20 %	20 %	338729817
97	NC_015707	AAC	2	6	5565	5570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729817
98	NC_015707	TGA	2	6	5630	5635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338729817
99	NC_015707	TTGTC	2	10	5690	5699	0 %	60 %	20 %	20 %	338729817
100	NC_015707	TCC	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338729817
101	NC_015707	GTT	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729817
102	NC_015707	T	6	6	5805	5810	0 %	100 %	0 %	0 %	338729817
103	NC_015707	AAC	2	6	5844	5849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729817
104	NC_015707	GA	3	6	5882	5887	50 %	0 %	50 %	0 %	338729817
105	NC_015707	A	6	6	5890	5895	100 %	0 %	0 %	0 %	338729817
106	NC_015707	TTTC	2	8	5918	5925	0 %	75 %	0 %	25 %	338729817
107	NC_015707	CTT	2	6	6054	6059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729818
108	NC_015707	TTG	2	6	6189	6194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729818
109	NC_015707	ATG	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338729818
110	NC_015707	GAA	2	6	6314	6319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729818
111	NC_015707	ACC	2	6	6336	6341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338729818
112	NC_015707	GTT	2	6	6428	6433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729818
113	NC_015707	TA	3	6	6469	6474	50 %	50 %	0 %	0 %	338729819
114	NC_015707	T	6	6	6507	6512	0 %	100 %	0 %	0 %	338729819
115	NC_015707	GCA	2	6	6542	6547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338729819
116	NC_015707	ACA	2	6	6675	6680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729819
117	NC_015707	GCC	2	6	6703	6708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338729819
118	NC_015707	T	6	6	6726	6731	0 %	100 %	0 %	0 %	338729819
119	NC_015707	GAA	2	6	6734	6739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729819
120	NC_015707	ATC	2	6	6842	6847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729819
121	NC_015707	A	6	6	6869	6874	100 %	0 %	0 %	0 %	338729819
122	NC_015707	A	6	6	6932	6937	100 %	0 %	0 %	0 %	338729819
123	NC_015707	CTTTC	2	10	6973	6982	0 %	60 %	0 %	40 %	338729819
124	NC_015707	TTAG	2	8	7064	7071	25 %	50 %	25 %	0 %	338729819
125	NC_015707	GCT	2	6	7133	7138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338729819
126	NC_015707	ACA	2	6	7142	7147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729819
127	NC_015707	TCC	2	6	7177	7182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338729820
128	NC_015707	TTTTG	2	10	7277	7286	0 %	80 %	20 %	0 %	338729820
129	NC_015707	AGATA	2	10	7291	7300	60 %	20 %	20 %	0 %	338729820
130	NC_015707	GTT	2	6	7463	7468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729820
131	NC_015707	CTT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729820
132	NC_015707	T	6	6	7491	7496	0 %	100 %	0 %	0 %	338729820
133	NC_015707	CTA	2	6	7523	7528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729820
134	NC_015707	TGT	2	6	7631	7636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729820
135	NC_015707	TAA	2	6	7699	7704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338729820
136	NC_015707	CTA	2	6	7730	7735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729820
137	NC_015707	AAG	2	6	7800	7805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729820
138	NC_015707	CAT	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729820
139	NC_015707	TGGA	2	8	7959	7966	25 %	25 %	50 %	0 %	338729820
140	NC_015707	TTCTT	2	10	7969	7978	0 %	80 %	0 %	20 %	338729820
141	NC_015707	T	6	6	8091	8096	0 %	100 %	0 %	0 %	338729820
142	NC_015707	TCT	2	6	8104	8109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729820
143	NC_015707	ATT	2	6	8152	8157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338729820
144	NC_015707	GTG	2	6	8173	8178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338729820
145	NC_015707	ACT	2	6	8185	8190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729820
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150	NC_015707	TCT	2	6	8515	8520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729821
151	NC_015707	TTAG	2	8	8524	8531	25 %	50 %	25 %	0 %	338729821
152	NC_015707	TTC	2	6	8721	8726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729821
153	NC_015707	ATTTCT	2	12	8896	8907	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338729821
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165	NC_015707	TCTTT	2	10	9434	9443	0 %	80 %	0 %	20 %	338729821
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179	NC_015707	CTTGAT	2	12	9966	9977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338729821
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269	NC_015707	CTT	2	6	14207	14212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729826
270	NC_015707	AGA	2	6	14226	14231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729826
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