MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga thermarum DSM 5069 chromosome

Total Repeats: 40243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_015707	TCA	2	6	1524079	1524084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30002	NC_015707	CAG	2	6	1524182	1524187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30003	NC_015707	G	6	6	1524203	1524208	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30004	NC_015707	AT	3	6	1524212	1524217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30005	NC_015707	GGT	2	6	1524223	1524228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30006	NC_015707	GAA	2	6	1524234	1524239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731269
30007	NC_015707	TTA	2	6	1524253	1524258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731269
30008	NC_015707	GTG	2	6	1524259	1524264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731269
30009	NC_015707	TGCT	2	8	1524284	1524291	0 %	50 %	25 %	25 %	338731269
30010	NC_015707	ATG	2	6	1524298	1524303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731269
30011	NC_015707	GAA	2	6	1524367	1524372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731269
30012	NC_015707	AAAG	2	8	1524400	1524407	75 %	0 %	25 %	0 %	338731269
30013	NC_015707	GAAA	2	8	1524423	1524430	75 %	0 %	25 %	0 %	338731269
30014	NC_015707	A	6	6	1524436	1524441	100 %	0 %	0 %	0 %	338731269
30015	NC_015707	AGAA	2	8	1524530	1524537	75 %	0 %	25 %	0 %	338731269
30016	NC_015707	GAA	2	6	1524541	1524546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731269
30017	NC_015707	A	6	6	1524611	1524616	100 %	0 %	0 %	0 %	338731269
30018	NC_015707	AGC	2	6	1524636	1524641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731269
30019	NC_015707	A	6	6	1524644	1524649	100 %	0 %	0 %	0 %	338731269
30020	NC_015707	AAC	2	6	1524671	1524676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731269
30021	NC_015707	AAG	2	6	1524687	1524692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731269
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30023	NC_015707	GAA	2	6	1524769	1524774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731269
30024	NC_015707	A	6	6	1524786	1524791	100 %	0 %	0 %	0 %	338731269
30025	NC_015707	TGT	2	6	1524839	1524844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731270
30026	NC_015707	TCGTCA	2	12	1524852	1524863	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338731270
30027	NC_015707	CTT	3	9	1524886	1524894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731270
30028	NC_015707	TTC	2	6	1525067	1525072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731270
30029	NC_015707	TGG	2	6	1525211	1525216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731270
30030	NC_015707	T	6	6	1525239	1525244	0 %	100 %	0 %	0 %	338731270
30031	NC_015707	TTC	2	6	1525250	1525255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731270
30032	NC_015707	TCA	2	6	1525416	1525421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731270
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30034	NC_015707	TCT	2	6	1525562	1525567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731270
30035	NC_015707	AAG	2	6	1525568	1525573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731270
30036	NC_015707	TCA	2	6	1525584	1525589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731270
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30038	NC_015707	TCAAT	2	10	1525681	1525690	40 %	40 %	0 %	20 %	338731270
30039	NC_015707	TTC	2	6	1525760	1525765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731270
30040	NC_015707	TTTC	2	8	1525830	1525837	0 %	75 %	0 %	25 %	338731270
30041	NC_015707	TC	4	8	1525879	1525886	0 %	50 %	0 %	50 %	338731270
30042	NC_015707	CCT	2	6	1525897	1525902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30043	NC_015707	CAT	2	6	1525911	1525916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30044	NC_015707	GTT	2	6	1525925	1525930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30045	NC_015707	CAT	2	6	1525947	1525952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30046	NC_015707	ATA	2	6	1525956	1525961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30047	NC_015707	TTA	2	6	1526022	1526027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30048	NC_015707	TAAAA	2	10	1526071	1526080	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30049	NC_015707	A	6	6	1526077	1526082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30050	NC_015707	GTTT	2	8	1526099	1526106	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30051	NC_015707	AG	3	6	1526138	1526143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30052	NC_015707	ATA	2	6	1526255	1526260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731271
30053	NC_015707	TG	3	6	1526290	1526295	0 %	50 %	50 %	0 %	338731271
30054	NC_015707	TGA	2	6	1526317	1526322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731271
30055	NC_015707	TTGG	2	8	1526370	1526377	0 %	50 %	50 %	0 %	338731271
30056	NC_015707	CTT	2	6	1526426	1526431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731271
30057	NC_015707	CAC	2	6	1526435	1526440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731271
30058	NC_015707	AAAG	2	8	1526462	1526469	75 %	0 %	25 %	0 %	338731271
30059	NC_015707	AATT	2	8	1526499	1526506	50 %	50 %	0 %	0 %	338731271
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30064	NC_015707	TGG	2	6	1526725	1526730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731271
30065	NC_015707	TTGGG	2	10	1526775	1526784	0 %	40 %	60 %	0 %	338731271
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30069	NC_015707	CAA	2	6	1526842	1526847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731271
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30092	NC_015707	GAG	2	6	1527833	1527838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30093	NC_015707	GGAGT	2	10	1527870	1527879	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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30102	NC_015707	AT	3	6	1528175	1528180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30103	NC_015707	G	6	6	1528199	1528204	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30104	NC_015707	GTTT	2	8	1528298	1528305	0 %	75 %	25 %	0 %	338731274
30105	NC_015707	GA	3	6	1528313	1528318	50 %	0 %	50 %	0 %	338731274
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30108	NC_015707	TGAAC	2	10	1528451	1528460	40 %	20 %	20 %	20 %	338731274
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