MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga thermarum DSM 5069 chromosome

Total Repeats: 40243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_015707	GAT	2	6	1218372	1218377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731002
24002	NC_015707	ATC	2	6	1218415	1218420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731002
24003	NC_015707	ACAAA	2	10	1218422	1218431	80 %	0 %	0 %	20 %	338731002
24004	NC_015707	GT	3	6	1218518	1218523	0 %	50 %	50 %	0 %	338731002
24005	NC_015707	TGA	2	6	1218524	1218529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731002
24006	NC_015707	GCA	2	6	1218541	1218546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731002
24007	NC_015707	CGG	2	6	1218549	1218554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338731002
24008	NC_015707	TGG	2	6	1218603	1218608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731002
24009	NC_015707	GAT	2	6	1218633	1218638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731002
24010	NC_015707	ACC	2	6	1218748	1218753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731002
24011	NC_015707	CCA	2	6	1218826	1218831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731002
24012	NC_015707	T	6	6	1218879	1218884	0 %	100 %	0 %	0 %	338731003
24013	NC_015707	TCCT	2	8	1218910	1218917	0 %	50 %	0 %	50 %	338731003
24014	NC_015707	CTT	2	6	1218977	1218982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731003
24015	NC_015707	CTT	2	6	1219053	1219058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731003
24016	NC_015707	GTT	2	6	1219105	1219110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731003
24017	NC_015707	T	6	6	1219109	1219114	0 %	100 %	0 %	0 %	338731003
24018	NC_015707	AAT	2	6	1219123	1219128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731003
24019	NC_015707	TTC	2	6	1219129	1219134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731003
24020	NC_015707	TCT	2	6	1219166	1219171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731003
24021	NC_015707	TCT	2	6	1219229	1219234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731003
24022	NC_015707	T	7	7	1219274	1219280	0 %	100 %	0 %	0 %	338731003
24023	NC_015707	TTC	2	6	1219315	1219320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731003
24024	NC_015707	TCA	2	6	1219329	1219334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731003
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24026	NC_015707	CTT	2	6	1219374	1219379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731003
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24028	NC_015707	TCT	2	6	1219511	1219516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731003
24029	NC_015707	CCT	2	6	1219604	1219609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731003
24030	NC_015707	TGCA	2	8	1219714	1219721	25 %	25 %	25 %	25 %	338731003
24031	NC_015707	CCA	2	6	1219776	1219781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731003
24032	NC_015707	TA	3	6	1219787	1219792	50 %	50 %	0 %	0 %	338731003
24033	NC_015707	TTGT	2	8	1219861	1219868	0 %	75 %	25 %	0 %	338731003
24034	NC_015707	TCC	3	9	1219972	1219980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731003
24035	NC_015707	AAC	2	6	1219990	1219995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731003
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24037	NC_015707	GTT	2	6	1220163	1220168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731003
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24039	NC_015707	ATC	2	6	1220417	1220422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731003
24040	NC_015707	CTTT	2	8	1220472	1220479	0 %	75 %	0 %	25 %	338731003
24041	NC_015707	CTA	2	6	1220490	1220495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731003
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24046	NC_015707	TTTC	2	8	1220729	1220736	0 %	75 %	0 %	25 %	338731003
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24050	NC_015707	TTCATC	2	12	1220857	1220868	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338731003
24051	NC_015707	ACC	2	6	1220959	1220964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731004
24052	NC_015707	TCT	2	6	1221007	1221012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731004
24053	NC_015707	CGAG	2	8	1221089	1221096	25 %	0 %	50 %	25 %	338731004
24054	NC_015707	CTT	2	6	1221129	1221134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731004
24055	NC_015707	TTC	3	9	1221211	1221219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731004
24056	NC_015707	T	6	6	1221220	1221225	0 %	100 %	0 %	0 %	338731004
24057	NC_015707	CAA	2	6	1221306	1221311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731004
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24059	NC_015707	CT	3	6	1221386	1221391	0 %	50 %	0 %	50 %	338731004
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24063	NC_015707	T	6	6	1221618	1221623	0 %	100 %	0 %	0 %	338731004
24064	NC_015707	TC	3	6	1221628	1221633	0 %	50 %	0 %	50 %	338731004
24065	NC_015707	TCC	2	6	1221650	1221655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731004
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24089	NC_015707	TCA	2	6	1222947	1222952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731004
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24099	NC_015707	TGATC	2	10	1223548	1223557	20 %	40 %	20 %	20 %	338731005
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24101	NC_015707	A	6	6	1223632	1223637	100 %	0 %	0 %	0 %	338731005
24102	NC_015707	TC	4	8	1223790	1223797	0 %	50 %	0 %	50 %	338731005
24103	NC_015707	T	6	6	1223816	1223821	0 %	100 %	0 %	0 %	338731005
24104	NC_015707	GC	3	6	1223861	1223866	0 %	0 %	50 %	50 %	338731005
24105	NC_015707	TGT	2	6	1223869	1223874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731005
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24107	NC_015707	AAG	2	6	1223924	1223929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731005
24108	NC_015707	TCA	2	6	1223991	1223996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731005
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24111	NC_015707	TTCT	2	8	1224190	1224197	0 %	75 %	0 %	25 %	338731005
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24115	NC_015707	TCTTT	2	10	1224403	1224412	0 %	80 %	0 %	20 %	338731005
24116	NC_015707	AAG	2	6	1224510	1224515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731006
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24118	NC_015707	TCC	3	9	1224601	1224609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731006
24119	NC_015707	CAT	2	6	1224640	1224645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731006
24120	NC_015707	TCT	2	6	1224770	1224775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731006
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24123	NC_015707	TC	3	6	1224986	1224991	0 %	50 %	0 %	50 %	338731006
24124	NC_015707	ATT	2	6	1225004	1225009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731006
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24159	NC_015707	CTT	2	6	1226950	1226955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731007
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24165	NC_015707	CCT	2	6	1227228	1227233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24194	NC_015707	GT	3	6	1228601	1228606	0 %	50 %	50 %	0 %	338731009
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24217	NC_015707	GCTT	2	8	1229606	1229613	0 %	50 %	25 %	25 %	338731010
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24219	NC_015707	CTTT	2	8	1229748	1229755	0 %	75 %	0 %	25 %	338731010
24220	NC_015707	TC	3	6	1229846	1229851	0 %	50 %	0 %	50 %	338731010
24221	NC_015707	AGA	2	6	1229930	1229935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731010
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24223	NC_015707	T	6	6	1229992	1229997	0 %	100 %	0 %	0 %	338731010
24224	NC_015707	AAC	2	6	1230029	1230034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731010
24225	NC_015707	GT	3	6	1230064	1230069	0 %	50 %	50 %	0 %	338731010
24226	NC_015707	AAATC	2	10	1230108	1230117	60 %	20 %	0 %	20 %	338731010
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24230	NC_015707	T	6	6	1230516	1230521	0 %	100 %	0 %	0 %	338731010
24231	NC_015707	AG	3	6	1230523	1230528	50 %	0 %	50 %	0 %	338731010
24232	NC_015707	TCC	2	6	1230562	1230567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731010
24233	NC_015707	TCC	2	6	1230598	1230603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731010
24234	NC_015707	GTC	2	6	1230614	1230619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731010
24235	NC_015707	TCA	2	6	1230755	1230760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731010
24236	NC_015707	TGT	2	6	1230765	1230770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731010
24237	NC_015707	ATT	2	6	1230773	1230778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731010
24238	NC_015707	GAT	2	6	1230789	1230794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731010
24239	NC_015707	CCT	2	6	1230905	1230910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731011
24240	NC_015707	T	7	7	1230967	1230973	0 %	100 %	0 %	0 %	338731011
24241	NC_015707	TCA	2	6	1231005	1231010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731011
24242	NC_015707	CAAA	2	8	1231078	1231085	75 %	0 %	0 %	25 %	338731011
24243	NC_015707	TCC	2	6	1231086	1231091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731011
24244	NC_015707	GCT	2	6	1231120	1231125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731011
24245	NC_015707	TCA	2	6	1231174	1231179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731011
24246	NC_015707	GTT	2	6	1231230	1231235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731012
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24248	NC_015707	GAA	2	6	1231419	1231424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731012
24249	NC_015707	AAG	2	6	1231558	1231563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731012
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24252	NC_015707	TTCA	2	8	1231789	1231796	25 %	50 %	0 %	25 %	338731012
24253	NC_015707	AAGG	2	8	1231943	1231950	50 %	0 %	50 %	0 %	338731012
24254	NC_015707	GGAAA	2	10	1231960	1231969	60 %	0 %	40 %	0 %	338731012
24255	NC_015707	TTCA	2	8	1231978	1231985	25 %	50 %	0 %	25 %	338731012
24256	NC_015707	CAA	2	6	1232005	1232010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731013
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24263	NC_015707	TC	3	6	1232425	1232430	0 %	50 %	0 %	50 %	338731013
24264	NC_015707	ACG	2	6	1232442	1232447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731013
24265	NC_015707	TCA	2	6	1232479	1232484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731013
24266	NC_015707	TTGA	2	8	1232630	1232637	25 %	50 %	25 %	0 %	338731013
24267	NC_015707	TCA	2	6	1232751	1232756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731013
24268	NC_015707	GCTT	2	8	1232773	1232780	0 %	50 %	25 %	25 %	338731013
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24272	NC_015707	GTAA	2	8	1232947	1232954	50 %	25 %	25 %	0 %	338731013
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24300	NC_015707	ACA	2	6	1234026	1234031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731015
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24302	NC_015707	GGTT	2	8	1234168	1234175	0 %	50 %	50 %	0 %	338731015
24303	NC_015707	AAC	2	6	1234204	1234209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731015
24304	NC_015707	CTT	2	6	1234218	1234223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731015
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24308	NC_015707	ACTATG	2	12	1234409	1234420	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	338731015
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24313	NC_015707	AAC	2	6	1234696	1234701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731015
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24315	NC_015707	TTG	2	6	1234736	1234741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731016
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24318	NC_015707	TCT	2	6	1234840	1234845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731016
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24320	NC_015707	T	6	6	1235010	1235015	0 %	100 %	0 %	0 %	338731016
24321	NC_015707	AGC	2	6	1235026	1235031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731016
24322	NC_015707	GTT	2	6	1235188	1235193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731016
24323	NC_015707	TGCC	2	8	1235288	1235295	0 %	25 %	25 %	50 %	338731016
24324	NC_015707	GAT	2	6	1235310	1235315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731016
24325	NC_015707	CAT	2	6	1235451	1235456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731016
24326	NC_015707	AAG	2	6	1235458	1235463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731016
24327	NC_015707	TCC	2	6	1235469	1235474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731017
24328	NC_015707	T	7	7	1235562	1235568	0 %	100 %	0 %	0 %	338731017
24329	NC_015707	CT	3	6	1235580	1235585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24330	NC_015707	ACC	2	6	1235606	1235611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24331	NC_015707	AATT	2	8	1235614	1235621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24332	NC_015707	TATAC	2	10	1235655	1235664	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24333	NC_015707	T	6	6	1235699	1235704	0 %	100 %	0 %	0 %	338731018
24334	NC_015707	A	6	6	1235724	1235729	100 %	0 %	0 %	0 %	338731018
24335	NC_015707	TTG	2	6	1235805	1235810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731018
24336	NC_015707	GAA	2	6	1235814	1235819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731018
24337	NC_015707	GAG	2	6	1235850	1235855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731018
24338	NC_015707	AGG	2	6	1235932	1235937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731018
24339	NC_015707	AAAT	2	8	1235938	1235945	75 %	25 %	0 %	0 %	338731018
24340	NC_015707	CTT	2	6	1236012	1236017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731018
24341	NC_015707	AGAA	2	8	1236046	1236053	75 %	0 %	25 %	0 %	338731018
24342	NC_015707	AGA	2	6	1236087	1236092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731018
24343	NC_015707	TCC	3	9	1236170	1236178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731018
24344	NC_015707	TA	3	6	1236240	1236245	50 %	50 %	0 %	0 %	338731018
24345	NC_015707	GTT	2	6	1236260	1236265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731018
24346	NC_015707	CAAA	2	8	1236274	1236281	75 %	0 %	0 %	25 %	338731018
24347	NC_015707	GAA	2	6	1236357	1236362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731018
24348	NC_015707	TAA	2	6	1236443	1236448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731019
24349	NC_015707	CAAG	3	12	1236456	1236467	50 %	0 %	25 %	25 %	338731019
24350	NC_015707	CAA	2	6	1236480	1236485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731019
24351	NC_015707	GCTT	3	12	1236490	1236501	0 %	50 %	25 %	25 %	338731019
24352	NC_015707	GTT	2	6	1236574	1236579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731019
24353	NC_015707	GCT	2	6	1236679	1236684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731019
24354	NC_015707	ATA	2	6	1236772	1236777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731019
24355	NC_015707	AAG	2	6	1236872	1236877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731019
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24469	NC_015707	TA	3	6	1242425	1242430	50 %	50 %	0 %	0 %	338731023
24470	NC_015707	GACA	2	8	1242442	1242449	50 %	0 %	25 %	25 %	338731023
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24472	NC_015707	ATC	2	6	1242594	1242599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731023
24473	NC_015707	GAA	2	6	1242645	1242650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731023
24474	NC_015707	TGA	2	6	1242680	1242685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731023
24475	NC_015707	ATC	2	6	1242686	1242691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731023
24476	NC_015707	GGA	2	6	1242723	1242728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731023
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24478	NC_015707	TGG	2	6	1242822	1242827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731024
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24480	NC_015707	GGC	2	6	1242876	1242881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338731024
24481	NC_015707	TGG	2	6	1242911	1242916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731024
24482	NC_015707	TGC	2	6	1243142	1243147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731024
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24484	NC_015707	AG	3	6	1243285	1243290	50 %	0 %	50 %	0 %	338731024
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24488	NC_015707	A	6	6	1243390	1243395	100 %	0 %	0 %	0 %	338731024
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24493	NC_015707	TGC	2	6	1243731	1243736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731024
24494	NC_015707	GAA	2	6	1243764	1243769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731024
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