MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga thermarum DSM 5069 chromosome

Total Repeats: 40243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_015707	A	6	6	641202	641207	100 %	0 %	0 %	0 %	338730426
12503	NC_015707	ATT	2	6	641221	641226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338730426
12504	NC_015707	TGG	2	6	641310	641315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338730426
12505	NC_015707	TTG	2	6	641365	641370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730426
12506	NC_015707	CCAA	2	8	641435	641442	50 %	0 %	0 %	50 %	338730426
12507	NC_015707	A	6	6	641459	641464	100 %	0 %	0 %	0 %	338730426
12508	NC_015707	CAA	2	6	641484	641489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338730426
12509	NC_015707	TGA	2	6	641497	641502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338730426
12510	NC_015707	AAG	3	9	641512	641520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338730426
12511	NC_015707	GTT	2	6	641539	641544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730426
12512	NC_015707	TTC	2	6	641571	641576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730426
12513	NC_015707	GTA	2	6	641623	641628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338730426
12514	NC_015707	AGG	2	6	641657	641662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338730426
12515	NC_015707	TTA	2	6	641708	641713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338730426
12516	NC_015707	AC	3	6	641716	641721	50 %	0 %	0 %	50 %	338730426
12517	NC_015707	CAAC	2	8	641827	641834	50 %	0 %	0 %	50 %	338730426
12518	NC_015707	AGC	2	6	641998	642003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338730427
12519	NC_015707	TTG	2	6	642037	642042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730427
12520	NC_015707	AGT	2	6	642086	642091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338730427
12521	NC_015707	ATT	2	6	642112	642117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338730427
12522	NC_015707	T	6	6	642138	642143	0 %	100 %	0 %	0 %	338730427
12523	NC_015707	TTC	2	6	642185	642190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730427
12524	NC_015707	GAAA	2	8	642196	642203	75 %	0 %	25 %	0 %	338730427
12525	NC_015707	GTT	2	6	642261	642266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730427
12526	NC_015707	TAG	2	6	642382	642387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338730427
12527	NC_015707	AAAG	2	8	642450	642457	75 %	0 %	25 %	0 %	338730427
12528	NC_015707	TAT	2	6	642546	642551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338730427
12529	NC_015707	T	6	6	642649	642654	0 %	100 %	0 %	0 %	338730428
12530	NC_015707	AC	3	6	642683	642688	50 %	0 %	0 %	50 %	338730428
12531	NC_015707	AGA	2	6	642736	642741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338730428
12532	NC_015707	TAA	2	6	642769	642774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338730428
12533	NC_015707	CTG	2	6	642781	642786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730428
12534	NC_015707	TCT	2	6	642877	642882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730428
12535	NC_015707	ACC	2	6	643023	643028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338730428
12536	NC_015707	T	7	7	643038	643044	0 %	100 %	0 %	0 %	338730428
12537	NC_015707	CGA	2	6	643090	643095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338730428
12538	NC_015707	ATT	2	6	643128	643133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338730428
12539	NC_015707	T	7	7	643141	643147	0 %	100 %	0 %	0 %	338730428
12540	NC_015707	C	6	6	643165	643170	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12541	NC_015707	T	6	6	643171	643176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_015707	TGA	2	6	643194	643199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_015707	GCT	2	6	643224	643229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730429
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12545	NC_015707	TGG	2	6	643427	643432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338730429
12546	NC_015707	ACT	2	6	643449	643454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338730429
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12548	NC_015707	TGA	2	6	643544	643549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338730429
12549	NC_015707	CGG	3	9	643585	643593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338730429
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12553	NC_015707	AT	3	6	643907	643912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_015707	AGG	2	6	643951	643956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12556	NC_015707	TGT	2	6	644006	644011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730430
12557	NC_015707	GACCG	2	10	644063	644072	20 %	0 %	40 %	40 %	338730430
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12565	NC_015707	A	6	6	644448	644453	100 %	0 %	0 %	0 %	338730430
12566	NC_015707	CGT	2	6	644486	644491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730430
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12569	NC_015707	CAAG	2	8	644667	644674	50 %	0 %	25 %	25 %	338730430
12570	NC_015707	T	6	6	644696	644701	0 %	100 %	0 %	0 %	338730430
12571	NC_015707	GGA	2	6	644742	644747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338730430
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12580	NC_015707	CTG	2	6	645031	645036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730430
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12584	NC_015707	CTT	2	6	645389	645394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730431
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12589	NC_015707	TTG	3	9	645621	645629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730431
12590	NC_015707	GA	3	6	645703	645708	50 %	0 %	50 %	0 %	338730431
12591	NC_015707	ACG	2	6	645716	645721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338730431
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12593	NC_015707	TGC	2	6	645871	645876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730431
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12597	NC_015707	AACC	2	8	646029	646036	50 %	0 %	0 %	50 %	338730431
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12600	NC_015707	TGG	2	6	646427	646432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338730432
12601	NC_015707	TA	3	6	646447	646452	50 %	50 %	0 %	0 %	338730432
12602	NC_015707	AAT	2	6	646527	646532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338730432
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12617	NC_015707	CGAA	2	8	647359	647366	50 %	0 %	25 %	25 %	338730433
12618	NC_015707	GTT	2	6	647404	647409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730433
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12620	NC_015707	TG	3	6	647486	647491	0 %	50 %	50 %	0 %	338730433
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