MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga thermarum DSM 5069 chromosome

Total Repeats: 40243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_015707	TTC	2	6	509235	509240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730302
10003	NC_015707	GCTG	2	8	509261	509268	0 %	25 %	50 %	25 %	338730302
10004	NC_015707	AAT	2	6	509294	509299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338730302
10005	NC_015707	TCG	2	6	509422	509427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730302
10006	NC_015707	AAC	2	6	509565	509570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338730302
10007	NC_015707	TCG	2	6	509599	509604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730302
10008	NC_015707	GA	3	6	509625	509630	50 %	0 %	50 %	0 %	338730302
10009	NC_015707	GCC	2	6	509639	509644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338730302
10010	NC_015707	CAG	2	6	509742	509747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338730302
10011	NC_015707	CTTT	2	8	509793	509800	0 %	75 %	0 %	25 %	338730302
10012	NC_015707	TTG	2	6	509824	509829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730302
10013	NC_015707	GAA	2	6	509847	509852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338730302
10014	NC_015707	ATA	2	6	509937	509942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338730302
10015	NC_015707	GCT	2	6	509958	509963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730302
10016	NC_015707	AAC	2	6	509969	509974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338730302
10017	NC_015707	CAA	2	6	510121	510126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338730302
10018	NC_015707	GTT	2	6	510404	510409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730303
10019	NC_015707	GTT	2	6	510425	510430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730303
10020	NC_015707	TCT	2	6	510495	510500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730303
10021	NC_015707	AGA	2	6	510571	510576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338730303
10022	NC_015707	TCA	2	6	510590	510595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338730303
10023	NC_015707	GAAGA	2	10	510645	510654	60 %	0 %	40 %	0 %	338730303
10024	NC_015707	AAGG	2	8	510725	510732	50 %	0 %	50 %	0 %	338730303
10025	NC_015707	ACA	2	6	510773	510778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338730303
10026	NC_015707	AAAC	2	8	510906	510913	75 %	0 %	0 %	25 %	338730303
10027	NC_015707	GAA	2	6	510973	510978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338730303
10028	NC_015707	AGT	2	6	510997	511002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338730303
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10030	NC_015707	TCG	2	6	511101	511106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730303
10031	NC_015707	GTG	2	6	511107	511112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338730303
10032	NC_015707	AATGG	2	10	511169	511178	40 %	20 %	40 %	0 %	338730303
10033	NC_015707	GATA	2	8	511255	511262	50 %	25 %	25 %	0 %	338730303
10034	NC_015707	CGA	2	6	511348	511353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338730303
10035	NC_015707	AT	3	6	511426	511431	50 %	50 %	0 %	0 %	338730303
10036	NC_015707	TCT	2	6	511449	511454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730303
10037	NC_015707	GCT	2	6	511493	511498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_015707	TCA	2	6	511515	511520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338730304
10039	NC_015707	T	6	6	511535	511540	0 %	100 %	0 %	0 %	338730304
10040	NC_015707	ATT	2	6	511558	511563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338730304
10041	NC_015707	GTA	2	6	511587	511592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338730304
10042	NC_015707	CAA	2	6	511763	511768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338730304
10043	NC_015707	AGC	2	6	511788	511793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338730304
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10046	NC_015707	ATG	2	6	511929	511934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338730304
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10050	NC_015707	ATG	2	6	512071	512076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338730304
10051	NC_015707	TTG	2	6	512158	512163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730304
10052	NC_015707	GTG	2	6	512168	512173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338730304
10053	NC_015707	CAGA	2	8	512216	512223	50 %	0 %	25 %	25 %	338730304
10054	NC_015707	CCA	2	6	512241	512246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338730304
10055	NC_015707	GAAG	2	8	512318	512325	50 %	0 %	50 %	0 %	338730304
10056	NC_015707	A	6	6	512335	512340	100 %	0 %	0 %	0 %	338730304
10057	NC_015707	CAA	2	6	512458	512463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338730304
10058	NC_015707	T	6	6	512616	512621	0 %	100 %	0 %	0 %	338730304
10059	NC_015707	TCG	2	6	512632	512637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730304
10060	NC_015707	GAA	2	6	512660	512665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338730304
10061	NC_015707	A	7	7	512734	512740	100 %	0 %	0 %	0 %	338730304
10062	NC_015707	TA	3	6	512761	512766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_015707	TCAC	2	8	512788	512795	25 %	25 %	0 %	50 %	338730305
10064	NC_015707	ATT	2	6	512798	512803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338730305
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10071	NC_015707	CTTT	2	8	513113	513120	0 %	75 %	0 %	25 %	338730305
10072	NC_015707	AAGT	2	8	513133	513140	50 %	25 %	25 %	0 %	338730305
10073	NC_015707	CT	3	6	513157	513162	0 %	50 %	0 %	50 %	338730305
10074	NC_015707	CTCAC	2	10	513211	513220	20 %	20 %	0 %	60 %	338730306
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10088	NC_015707	GCAATG	2	12	513981	513992	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338730306
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10090	NC_015707	CAT	2	6	514039	514044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338730306
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10092	NC_015707	TCT	2	6	514190	514195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_015707	AAGT	2	8	514198	514205	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_015707	ATT	2	6	514206	514211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_015707	TCT	2	6	514223	514228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_015707	AGG	2	6	514234	514239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_015707	TTCAT	2	10	514253	514262	20 %	60 %	0 %	20 %	338730307
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10100	NC_015707	GTC	2	6	514414	514419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730307
10101	NC_015707	GTT	2	6	514423	514428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730307
10102	NC_015707	TGAA	2	8	514562	514569	50 %	25 %	25 %	0 %	338730307
10103	NC_015707	AAG	2	6	514597	514602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338730307
10104	NC_015707	A	6	6	514695	514700	100 %	0 %	0 %	0 %	338730307
10105	NC_015707	GAAAAA	2	12	514866	514877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338730307
10106	NC_015707	ATC	2	6	514896	514901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338730307
10107	NC_015707	TTTG	2	8	514928	514935	0 %	75 %	25 %	0 %	338730307
10108	NC_015707	GA	3	6	514971	514976	50 %	0 %	50 %	0 %	338730307
10109	NC_015707	ATT	2	6	515003	515008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338730307
10110	NC_015707	AATTG	2	10	515034	515043	40 %	40 %	20 %	0 %	338730307
10111	NC_015707	AAAG	2	8	515124	515131	75 %	0 %	25 %	0 %	338730307
10112	NC_015707	GAG	2	6	515155	515160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338730307
10113	NC_015707	GTT	2	6	515222	515227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730307
10114	NC_015707	TG	3	6	515229	515234	0 %	50 %	50 %	0 %	338730307
10115	NC_015707	TTTA	2	8	515281	515288	25 %	75 %	0 %	0 %	338730307
10116	NC_015707	GGAA	2	8	515311	515318	50 %	0 %	50 %	0 %	338730308
10117	NC_015707	GTT	2	6	515349	515354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730308
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10119	NC_015707	GTT	2	6	515479	515484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730308
10120	NC_015707	CGA	2	6	515574	515579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338730308
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10122	NC_015707	ACC	2	6	515719	515724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338730308
10123	NC_015707	AGA	2	6	515734	515739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338730308
10124	NC_015707	CAT	2	6	515856	515861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338730308
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10237	NC_015707	CT	3	6	522022	522027	0 %	50 %	0 %	50 %	338730312
10238	NC_015707	TGC	2	6	522041	522046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730312
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10241	NC_015707	TTTGTT	2	12	522322	522333	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	338730312
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