MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga thermarum DSM 5069 chromosome

Total Repeats: 40243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015707	TGT	2	6	25026	25031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729834
502	NC_015707	TTC	2	6	25067	25072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729834
503	NC_015707	TTC	2	6	25090	25095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729834
504	NC_015707	CAA	2	6	25173	25178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729834
505	NC_015707	GAAA	2	8	25203	25210	75 %	0 %	25 %	0 %	338729834
506	NC_015707	GTT	2	6	25243	25248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729834
507	NC_015707	GA	3	6	25270	25275	50 %	0 %	50 %	0 %	338729834
508	NC_015707	CAAC	2	8	25483	25490	50 %	0 %	0 %	50 %	338729834
509	NC_015707	TGA	2	6	25536	25541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338729834
510	NC_015707	AGAA	2	8	25608	25615	75 %	0 %	25 %	0 %	338729834
511	NC_015707	AGA	2	6	25620	25625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729834
512	NC_015707	TGG	2	6	25632	25637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338729834
513	NC_015707	CTTC	2	8	25666	25673	0 %	50 %	0 %	50 %	338729834
514	NC_015707	CAA	2	6	25674	25679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729834
515	NC_015707	GAA	2	6	25702	25707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729834
516	NC_015707	GAA	2	6	25728	25733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729834
517	NC_015707	CTT	2	6	25744	25749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729834
518	NC_015707	AG	3	6	25769	25774	50 %	0 %	50 %	0 %	338729834
519	NC_015707	AAG	2	6	25778	25783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729834
520	NC_015707	GTT	2	6	25791	25796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729834
521	NC_015707	AGA	2	6	25807	25812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729834
522	NC_015707	CTTG	2	8	25824	25831	0 %	50 %	25 %	25 %	338729834
523	NC_015707	AT	4	8	25866	25873	50 %	50 %	0 %	0 %	338729834
524	NC_015707	TGGT	2	8	25934	25941	0 %	50 %	50 %	0 %	338729834
525	NC_015707	AACC	2	8	25990	25997	50 %	0 %	0 %	50 %	338729834
526	NC_015707	TAC	2	6	26044	26049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729834
527	NC_015707	ATT	2	6	26054	26059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338729834
528	NC_015707	TCC	2	6	26082	26087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338729834
529	NC_015707	AT	3	6	26215	26220	50 %	50 %	0 %	0 %	338729834
530	NC_015707	AAT	2	6	26339	26344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338729834
531	NC_015707	AGG	2	6	26396	26401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015707	ATC	2	6	26405	26410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015707	ATG	2	6	26455	26460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338729835
534	NC_015707	TCA	2	6	26462	26467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729835
535	NC_015707	AAT	2	6	26472	26477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338729835
536	NC_015707	TAA	2	6	26486	26491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338729835
537	NC_015707	GAT	2	6	26553	26558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338729835
538	NC_015707	GAGAA	2	10	26568	26577	60 %	0 %	40 %	0 %	338729835
539	NC_015707	A	6	6	26622	26627	100 %	0 %	0 %	0 %	338729835
540	NC_015707	ATA	2	6	26629	26634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338729835
541	NC_015707	TGATT	2	10	26682	26691	20 %	60 %	20 %	0 %	338729835
542	NC_015707	GGTTG	2	10	26699	26708	0 %	40 %	60 %	0 %	338729835
543	NC_015707	ATT	2	6	26734	26739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338729835
544	NC_015707	ATA	2	6	26770	26775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338729835
545	NC_015707	TGG	2	6	26892	26897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338729835
546	NC_015707	GGT	2	6	26908	26913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338729835
547	NC_015707	AAT	2	6	26991	26996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338729835
548	NC_015707	TGT	2	6	26997	27002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729835
549	NC_015707	TGG	2	6	27015	27020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338729835
550	NC_015707	TGA	2	6	27023	27028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338729835
551	NC_015707	GAA	2	6	27100	27105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729835
552	NC_015707	GGT	2	6	27108	27113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338729835
553	NC_015707	AAT	2	6	27195	27200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338729835
554	NC_015707	ATT	2	6	27208	27213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338729835
555	NC_015707	CTT	2	6	27237	27242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729835
556	NC_015707	CTT	2	6	27325	27330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729835
557	NC_015707	GCT	2	6	27348	27353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338729835
558	NC_015707	CCA	2	6	27547	27552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338729836
559	NC_015707	T	6	6	27682	27687	0 %	100 %	0 %	0 %	338729836
560	NC_015707	GTG	2	6	27692	27697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338729836
561	NC_015707	GAT	2	6	27771	27776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338729836
562	NC_015707	TGG	2	6	27831	27836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338729836
563	NC_015707	GTG	2	6	27880	27885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338729836
564	NC_015707	TAC	2	6	27916	27921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729836
565	NC_015707	GGT	2	6	27922	27927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338729836
566	NC_015707	CGC	2	6	28016	28021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338729836
567	NC_015707	GGAT	2	8	28075	28082	25 %	25 %	50 %	0 %	338729836
568	NC_015707	AG	3	6	28123	28128	50 %	0 %	50 %	0 %	338729836
569	NC_015707	T	6	6	28275	28280	0 %	100 %	0 %	0 %	338729836
570	NC_015707	TTG	2	6	28418	28423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729836
571	NC_015707	GA	3	6	28434	28439	50 %	0 %	50 %	0 %	338729836
572	NC_015707	AG	3	6	28561	28566	50 %	0 %	50 %	0 %	338729837
573	NC_015707	GAA	2	6	28710	28715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729837
574	NC_015707	CAAA	2	8	28796	28803	75 %	0 %	0 %	25 %	338729837
575	NC_015707	A	6	6	28875	28880	100 %	0 %	0 %	0 %	338729837
576	NC_015707	TGA	2	6	28910	28915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338729837
577	NC_015707	GGT	2	6	28935	28940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338729837
578	NC_015707	ATAGCA	2	12	28959	28970	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	338729837
579	NC_015707	CGA	2	6	29000	29005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338729837
580	NC_015707	CTG	2	6	29052	29057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338729837
581	NC_015707	ACA	2	6	29077	29082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338729837
582	NC_015707	GTT	2	6	29115	29120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729837
583	NC_015707	GTT	2	6	29264	29269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729837
584	NC_015707	AAG	2	6	29361	29366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729837
585	NC_015707	ACC	2	6	29372	29377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338729837
586	NC_015707	GCAG	2	8	29421	29428	25 %	0 %	50 %	25 %	338729837
587	NC_015707	AGG	2	6	29488	29493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338729838
588	NC_015707	T	7	7	29496	29502	0 %	100 %	0 %	0 %	338729838
589	NC_015707	AGAT	2	8	29535	29542	50 %	25 %	25 %	0 %	338729838
590	NC_015707	GTT	2	6	29564	29569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729838
591	NC_015707	GAA	2	6	29610	29615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729838
592	NC_015707	CAAAGA	2	12	29659	29670	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	338729838
593	NC_015707	A	6	6	29678	29683	100 %	0 %	0 %	0 %	338729838
594	NC_015707	A	6	6	29689	29694	100 %	0 %	0 %	0 %	338729838
595	NC_015707	GAA	2	6	29712	29717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338729838
596	NC_015707	ATC	2	6	29726	29731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729838
597	NC_015707	TAG	2	6	29781	29786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338729838
598	NC_015707	A	6	6	29822	29827	100 %	0 %	0 %	0 %	338729838
599	NC_015707	TTGA	2	8	29852	29859	25 %	50 %	25 %	0 %	338729838
600	NC_015707	CGA	2	6	29977	29982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338729838
601	NC_015707	ACTT	2	8	30027	30034	25 %	50 %	0 %	25 %	338729838
602	NC_015707	GA	3	6	30043	30048	50 %	0 %	50 %	0 %	338729838
603	NC_015707	CA	3	6	30078	30083	50 %	0 %	0 %	50 %	338729838
604	NC_015707	CGT	2	6	30139	30144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338729838
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606	NC_015707	ACC	2	6	30271	30276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338729838
607	NC_015707	TCC	2	6	30289	30294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338729838
608	NC_015707	TTG	2	6	30363	30368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729838
609	NC_015707	CGA	2	6	30370	30375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338729838
610	NC_015707	GTT	2	6	30596	30601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729839
611	NC_015707	TTTC	2	8	30671	30678	0 %	75 %	0 %	25 %	338729839
612	NC_015707	AG	3	6	30693	30698	50 %	0 %	50 %	0 %	338729839
613	NC_015707	CTT	2	6	30716	30721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729839
614	NC_015707	CA	3	6	30725	30730	50 %	0 %	0 %	50 %	338729839
615	NC_015707	CTT	2	6	30782	30787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338729839
616	NC_015707	AGC	2	6	30816	30821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338729839
617	NC_015707	TGGT	2	8	31011	31018	0 %	50 %	50 %	0 %	338729839
618	NC_015707	GAT	2	6	31025	31030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338729839
619	NC_015707	TAC	2	6	31040	31045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338729839
620	NC_015707	GGA	2	6	31049	31054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338729839
621	NC_015707	GTT	2	6	31153	31158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338729839
622	NC_015707	TGGA	2	8	31201	31208	25 %	25 %	50 %	0 %	338729839
623	NC_015707	GGT	2	6	31223	31228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338729839
624	NC_015707	AAT	2	6	31363	31368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338729839
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626	NC_015707	GGA	2	6	31403	31408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338729839
627	NC_015707	AGAA	2	8	31452	31459	75 %	0 %	25 %	0 %	338729840
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