MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermotoga thermarum DSM 5069 chromosome

Total Repeats: 40243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015707	CAT	2	6	305846	305851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_015707	GTT	2	6	305859	305864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_015707	CAA	2	6	305953	305958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_015707	AGT	2	6	306056	306061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_015707	ATT	2	6	306073	306078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_015707	TAC	2	6	306080	306085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338730108
6007	NC_015707	ATCT	2	8	306105	306112	25 %	50 %	0 %	25 %	338730108
6008	NC_015707	A	6	6	306130	306135	100 %	0 %	0 %	0 %	338730108
6009	NC_015707	AGTTTT	2	12	306170	306181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338730108
6010	NC_015707	ATG	2	6	306200	306205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338730108
6011	NC_015707	A	7	7	306237	306243	100 %	0 %	0 %	0 %	338730108
6012	NC_015707	TCT	2	6	306266	306271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730108
6013	NC_015707	GAA	2	6	306300	306305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338730108
6014	NC_015707	AGG	2	6	306340	306345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338730108
6015	NC_015707	AAG	2	6	306373	306378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338730108
6016	NC_015707	ATT	3	9	306521	306529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338730108
6017	NC_015707	TTC	2	6	306763	306768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730108
6018	NC_015707	AGC	2	6	306779	306784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338730108
6019	NC_015707	GATT	2	8	306794	306801	25 %	50 %	25 %	0 %	338730108
6020	NC_015707	AGGTT	2	10	306959	306968	20 %	40 %	40 %	0 %	338730109
6021	NC_015707	TCT	2	6	307009	307014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730109
6022	NC_015707	GTCATC	2	12	307057	307068	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338730109
6023	NC_015707	CTT	2	6	307085	307090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730109
6024	NC_015707	GGTC	2	8	307229	307236	0 %	25 %	50 %	25 %	338730110
6025	NC_015707	TCT	2	6	307258	307263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730110
6026	NC_015707	GATT	2	8	307584	307591	25 %	50 %	25 %	0 %	338730110
6027	NC_015707	T	6	6	307590	307595	0 %	100 %	0 %	0 %	338730110
6028	NC_015707	AAT	2	6	307598	307603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338730110
6029	NC_015707	CAG	2	6	307616	307621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338730110
6030	NC_015707	CTT	2	6	307708	307713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730111
6031	NC_015707	T	6	6	307761	307766	0 %	100 %	0 %	0 %	338730111
6032	NC_015707	CTT	3	9	307796	307804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730111
6033	NC_015707	TTCA	2	8	307812	307819	25 %	50 %	0 %	25 %	338730111
6034	NC_015707	CAA	2	6	307830	307835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338730111
6035	NC_015707	GTT	2	6	307881	307886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730111
6036	NC_015707	AAG	2	6	307962	307967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338730111
6037	NC_015707	TTC	2	6	308040	308045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730111
6038	NC_015707	TTCT	2	8	308139	308146	0 %	75 %	0 %	25 %	338730111
6039	NC_015707	C	6	6	308199	308204	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6040	NC_015707	T	6	6	308265	308270	0 %	100 %	0 %	0 %	338730112
6041	NC_015707	ACC	2	6	308279	308284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338730112
6042	NC_015707	T	6	6	308312	308317	0 %	100 %	0 %	0 %	338730112
6043	NC_015707	CTT	3	9	308321	308329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730112
6044	NC_015707	GTT	2	6	308373	308378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730112
6045	NC_015707	TTG	2	6	308404	308409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730112
6046	NC_015707	TCG	2	6	308449	308454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730112
6047	NC_015707	TTC	2	6	308459	308464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730112
6048	NC_015707	CTT	2	6	308468	308473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730112
6049	NC_015707	ATA	2	6	308478	308483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338730112
6050	NC_015707	CAA	2	6	308484	308489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338730112
6051	NC_015707	TGA	2	6	308495	308500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338730112
6052	NC_015707	GGAT	2	8	308554	308561	25 %	25 %	50 %	0 %	338730112
6053	NC_015707	AG	3	6	308577	308582	50 %	0 %	50 %	0 %	338730112
6054	NC_015707	TCG	2	6	308719	308724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730112
6055	NC_015707	TCG	2	6	308840	308845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730112
6056	NC_015707	AAC	2	6	308847	308852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338730112
6057	NC_015707	TTA	2	6	308960	308965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_015707	ATC	2	6	308998	309003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_015707	GAA	2	6	309013	309018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_015707	A	7	7	309022	309028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_015707	GCC	2	6	309038	309043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_015707	CTC	2	6	309069	309074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_015707	TAG	2	6	309085	309090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_015707	TCT	2	6	309094	309099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_015707	AACC	2	8	309121	309128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_015707	TCT	2	6	309141	309146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_015707	CCA	2	6	309289	309294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_015707	AGGTGT	2	12	309300	309311	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_015707	ATA	2	6	309369	309374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015707	TG	3	6	309389	309394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_015707	TAT	2	6	309420	309425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_015707	TTC	2	6	309548	309553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_015707	TTC	2	6	309598	309603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_015707	TCA	2	6	309736	309741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_015707	ACA	2	6	309858	309863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_015707	AGG	2	6	309914	309919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_015707	AT	3	6	309954	309959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_015707	ATG	2	6	310005	310010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_015707	GGAT	2	8	310046	310053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_015707	AAGC	2	8	310058	310065	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6081	NC_015707	ATC	2	6	310344	310349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338730113
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6083	NC_015707	AT	3	6	310416	310421	50 %	50 %	0 %	0 %	338730113
6084	NC_015707	CAC	2	6	310476	310481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338730113
6085	NC_015707	TAC	2	6	310607	310612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338730113
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6088	NC_015707	CCAA	2	8	310712	310719	50 %	0 %	0 %	50 %	338730113
6089	NC_015707	CTG	2	6	310768	310773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730113
6090	NC_015707	ATT	2	6	310776	310781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338730113
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6092	NC_015707	AAC	2	6	310802	310807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338730113
6093	NC_015707	ACC	2	6	310887	310892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338730113
6094	NC_015707	ACCA	2	8	310894	310901	50 %	0 %	0 %	50 %	338730113
6095	NC_015707	GTT	2	6	310990	310995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730113
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6098	NC_015707	ACA	2	6	311143	311148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338730113
6099	NC_015707	CCT	2	6	311155	311160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_015707	A	6	6	311192	311197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_015707	TAG	2	6	311286	311291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_015707	TA	3	6	311292	311297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_015707	TTA	2	6	311367	311372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338730114
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6109	NC_015707	CGC	2	6	311730	311735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338730114
6110	NC_015707	GAG	2	6	311761	311766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338730114
6111	NC_015707	ATAG	2	8	312010	312017	50 %	25 %	25 %	0 %	338730114
6112	NC_015707	CAG	2	6	312085	312090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338730114
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6114	NC_015707	TTGCT	2	10	312151	312160	0 %	60 %	20 %	20 %	338730115
6115	NC_015707	TGC	2	6	312169	312174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338730115
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6117	NC_015707	CAA	2	6	312221	312226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338730115
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6121	NC_015707	TTG	2	6	312366	312371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730115
6122	NC_015707	CAT	2	6	312401	312406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338730115
6123	NC_015707	CTT	2	6	312473	312478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338730115
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6497	NC_015707	GTT	2	6	332040	332045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338730132
6498	NC_015707	GATAT	2	10	332110	332119	40 %	40 %	20 %	0 %	338730132
6499	NC_015707	TTA	2	6	332131	332136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338730132
6500	NC_015707	ATG	2	6	332137	332142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338730132

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