MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermodesulfobacterium sp. OPB45 chromosome

Total Repeats: 43053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015682	AGG	2	6	499443	499448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_015682	ATTAA	2	10	499462	499471	60 %	40 %	0 %	0 %	337288055
13003	NC_015682	AAG	2	6	499473	499478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288055
13004	NC_015682	T	6	6	499482	499487	0 %	100 %	0 %	0 %	337288055
13005	NC_015682	AATT	2	8	499527	499534	50 %	50 %	0 %	0 %	337288055
13006	NC_015682	ACT	2	6	499588	499593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337288055
13007	NC_015682	TGTGG	2	10	499609	499618	0 %	40 %	60 %	0 %	337288055
13008	NC_015682	ATT	2	6	499627	499632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337288055
13009	NC_015682	GTA	2	6	499654	499659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337288055
13010	NC_015682	ATC	2	6	499679	499684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337288055
13011	NC_015682	TA	3	6	499766	499771	50 %	50 %	0 %	0 %	337288055
13012	NC_015682	GAA	2	6	499945	499950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288055
13013	NC_015682	TA	3	6	499993	499998	50 %	50 %	0 %	0 %	337288055
13014	NC_015682	ATC	2	6	500000	500005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337288055
13015	NC_015682	CAAT	2	8	500073	500080	50 %	25 %	0 %	25 %	337288055
13016	NC_015682	CTG	2	6	500129	500134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337288055
13017	NC_015682	ATC	2	6	500138	500143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337288055
13018	NC_015682	A	6	6	500173	500178	100 %	0 %	0 %	0 %	337288055
13019	NC_015682	TTGTGG	2	12	500195	500206	0 %	50 %	50 %	0 %	337288055
13020	NC_015682	GCA	2	6	500227	500232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337288055
13021	NC_015682	GGT	2	6	500284	500289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337288055
13022	NC_015682	TTAA	2	8	500290	500297	50 %	50 %	0 %	0 %	337288055
13023	NC_015682	ATT	2	6	500302	500307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337288055
13024	NC_015682	TAG	2	6	500363	500368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337288055
13025	NC_015682	GAAAA	2	10	500427	500436	80 %	0 %	20 %	0 %	337288055
13026	NC_015682	AAC	2	6	500445	500450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337288055
13027	NC_015682	TGA	2	6	500466	500471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337288055
13028	NC_015682	AAG	2	6	500485	500490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288055
13029	NC_015682	ATT	2	6	500540	500545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337288055
13030	NC_015682	ATT	2	6	500617	500622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337288055
13031	NC_015682	ATT	2	6	500719	500724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337288055
13032	NC_015682	CTT	3	9	500728	500736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337288055
13033	NC_015682	GGT	2	6	500755	500760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337288055
13034	NC_015682	CTT	2	6	500815	500820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337288055
13035	NC_015682	CTT	2	6	500858	500863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337288055
13036	NC_015682	GAA	2	6	500889	500894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288055
13037	NC_015682	TGG	2	6	500929	500934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337288055
13038	NC_015682	TGA	3	9	501033	501041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337288055
13039	NC_015682	TTC	2	6	501129	501134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337288055
13040	NC_015682	AAG	2	6	501247	501252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288055
13041	NC_015682	GCA	2	6	501283	501288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337288055
13042	NC_015682	GAAG	2	8	501301	501308	50 %	0 %	50 %	0 %	337288055
13043	NC_015682	GAA	2	6	501323	501328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288055
13044	NC_015682	CCT	2	6	501358	501363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337288055
13045	NC_015682	AAG	2	6	501431	501436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288055
13046	NC_015682	GAT	2	6	501607	501612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337288055
13047	NC_015682	AT	3	6	501637	501642	50 %	50 %	0 %	0 %	337288055
13048	NC_015682	AGA	2	6	501657	501662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288055
13049	NC_015682	ATG	2	6	501670	501675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337288055
13050	NC_015682	AGG	2	6	501679	501684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337288055
13051	NC_015682	AGA	2	6	501748	501753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288055
13052	NC_015682	TTA	2	6	501815	501820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337288055
13053	NC_015682	AAG	2	6	501838	501843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288055
13054	NC_015682	CCA	2	6	501874	501879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337288055
13055	NC_015682	AGG	2	6	501891	501896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337288055
13056	NC_015682	TAT	2	6	501909	501914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337288055
13057	NC_015682	TCT	2	6	502008	502013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337288055
13058	NC_015682	GCAATA	2	12	502288	502299	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337288055
13059	NC_015682	TGT	2	6	502347	502352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337288055
13060	NC_015682	ATGG	2	8	502370	502377	25 %	25 %	50 %	0 %	337288055
13061	NC_015682	GTG	2	6	502397	502402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337288055
13062	NC_015682	A	6	6	502485	502490	100 %	0 %	0 %	0 %	337288055
13063	NC_015682	A	6	6	502510	502515	100 %	0 %	0 %	0 %	337288056
13064	NC_015682	GAA	2	6	502519	502524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288056
13065	NC_015682	CTT	2	6	502530	502535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337288056
13066	NC_015682	CAG	2	6	502603	502608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337288056
13067	NC_015682	A	6	6	502609	502614	100 %	0 %	0 %	0 %	337288056
13068	NC_015682	TCC	2	6	502640	502645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337288056
13069	NC_015682	TAA	2	6	502667	502672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337288056
13070	NC_015682	ATAG	2	8	502923	502930	50 %	25 %	25 %	0 %	337288056
13071	NC_015682	ATT	2	6	503040	503045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337288056
13072	NC_015682	AGG	2	6	503063	503068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337288056
13073	NC_015682	TTA	2	6	503105	503110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337288056
13074	NC_015682	GTT	2	6	503145	503150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337288056
13075	NC_015682	TTG	2	6	503176	503181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337288056
13076	NC_015682	TAA	2	6	503198	503203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337288056
13077	NC_015682	AAAG	2	8	503255	503262	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_015682	GGA	2	6	503265	503270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_015682	CTTT	2	8	503276	503283	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13080	NC_015682	T	6	6	503281	503286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_015682	TAA	2	6	503296	503301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_015682	AAT	2	6	503344	503349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337288057
13083	NC_015682	AGA	2	6	503362	503367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288057
13084	NC_015682	A	6	6	503433	503438	100 %	0 %	0 %	0 %	337288057
13085	NC_015682	AAT	2	6	503459	503464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337288057
13086	NC_015682	ATT	2	6	503477	503482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337288057
13087	NC_015682	TTC	2	6	503491	503496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337288057
13088	NC_015682	T	6	6	503527	503532	0 %	100 %	0 %	0 %	337288057
13089	NC_015682	GAA	3	9	503606	503614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288057
13090	NC_015682	AGA	2	6	503623	503628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288057
13091	NC_015682	TC	3	6	503650	503655	0 %	50 %	0 %	50 %	337288057
13092	NC_015682	T	7	7	503662	503668	0 %	100 %	0 %	0 %	337288057
13093	NC_015682	AAAGAA	2	12	503689	503700	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	337288057
13094	NC_015682	GATA	2	8	503758	503765	50 %	25 %	25 %	0 %	337288057
13095	NC_015682	GAA	3	9	503807	503815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288057
13096	NC_015682	TGA	2	6	503878	503883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337288057
13097	NC_015682	ATA	2	6	503984	503989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337288057
13098	NC_015682	AAGA	2	8	504015	504022	75 %	0 %	25 %	0 %	337288057
13099	NC_015682	TA	3	6	504026	504031	50 %	50 %	0 %	0 %	337288057
13100	NC_015682	GTT	2	6	504065	504070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337288057
13101	NC_015682	GAA	2	6	504081	504086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288058
13102	NC_015682	GTT	2	6	504100	504105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337288058
13103	NC_015682	AAGGT	2	10	504151	504160	40 %	20 %	40 %	0 %	337288058
13104	NC_015682	CAG	2	6	504212	504217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337288058
13105	NC_015682	TCT	2	6	504238	504243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337288058
13106	NC_015682	TCAT	2	8	504252	504259	25 %	50 %	0 %	25 %	337288058
13107	NC_015682	ATGG	2	8	504265	504272	25 %	25 %	50 %	0 %	337288058
13108	NC_015682	AT	3	6	504429	504434	50 %	50 %	0 %	0 %	337288058
13109	NC_015682	TCC	2	6	504453	504458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337288058
13110	NC_015682	ATG	2	6	504464	504469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337288058
13111	NC_015682	TTG	2	6	504491	504496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337288058
13112	NC_015682	TAAAAG	2	12	504572	504583	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337288058
13113	NC_015682	A	6	6	504589	504594	100 %	0 %	0 %	0 %	337288058
13114	NC_015682	AAT	2	6	504606	504611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337288058
13115	NC_015682	GAA	2	6	504649	504654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288058
13116	NC_015682	ACC	2	6	504666	504671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337288058
13117	NC_015682	TTC	2	6	504690	504695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337288058
13118	NC_015682	GGA	2	6	504724	504729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337288058
13119	NC_015682	AT	3	6	504739	504744	50 %	50 %	0 %	0 %	337288058
13120	NC_015682	AGA	2	6	504774	504779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337288058
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13496	NC_015682	AGAAA	2	10	518841	518850	80 %	0 %	20 %	0 %	337288069
13497	NC_015682	GCAC	2	8	518903	518910	25 %	0 %	25 %	50 %	337288069
13498	NC_015682	A	7	7	518921	518927	100 %	0 %	0 %	0 %	337288069
13499	NC_015682	ACTAA	2	10	518936	518945	60 %	20 %	0 %	20 %	337288069
13500	NC_015682	TAA	2	6	519009	519014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337288069

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