MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermodesulfatator indicus DSM 15286 chromosome

Total Repeats: 48871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015681	CAAA	2	8	43	50	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015681	A	6	6	73	78	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015681	AAT	2	6	88	93	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015681	T	8	8	130	137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015681	T	6	6	158	163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015681	TTC	2	6	238	243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015681	G	6	6	246	251	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015681	CAAT	2	8	386	393	50 %	25 %	0 %	25 %	337285378
9	NC_015681	ATT	2	6	418	423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285378
10	NC_015681	GAA	2	6	435	440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285378
11	NC_015681	A	6	6	447	452	100 %	0 %	0 %	0 %	337285378
12	NC_015681	TTGAAT	2	12	466	477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337285378
13	NC_015681	AGT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285378
14	NC_015681	AGA	2	6	488	493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285378
15	NC_015681	TAA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285378
16	NC_015681	GAA	2	6	553	558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285378
17	NC_015681	GAA	2	6	582	587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285378
18	NC_015681	TAA	2	6	641	646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285378
19	NC_015681	TAT	2	6	662	667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285378
20	NC_015681	TCT	2	6	728	733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285378
21	NC_015681	A	6	6	734	739	100 %	0 %	0 %	0 %	337285378
22	NC_015681	GGT	2	6	750	755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285378
23	NC_015681	GAA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285378
24	NC_015681	CAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285378
25	NC_015681	ATG	2	6	943	948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285378
26	NC_015681	TCC	2	6	1055	1060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285378
27	NC_015681	ATC	2	6	1083	1088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285378
28	NC_015681	GAA	2	6	1125	1130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285378
29	NC_015681	CTC	2	6	1270	1275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285378
30	NC_015681	TCCCT	2	10	1279	1288	0 %	40 %	0 %	60 %	337285378
31	NC_015681	AGA	2	6	1340	1345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285378
32	NC_015681	A	7	7	1356	1362	100 %	0 %	0 %	0 %	337285378
33	NC_015681	GTC	2	6	1408	1413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285378
34	NC_015681	TAA	2	6	1454	1459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285378
35	NC_015681	A	6	6	1500	1505	100 %	0 %	0 %	0 %	337285378
36	NC_015681	GAA	2	6	1560	1565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285378
37	NC_015681	TCA	2	6	1585	1590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285378
38	NC_015681	GAA	2	6	1596	1601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285378
39	NC_015681	AAG	2	6	1640	1645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285378
40	NC_015681	TTC	2	6	1685	1690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285379
41	NC_015681	GAA	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285379
42	NC_015681	AGAA	2	8	1751	1758	75 %	0 %	25 %	0 %	337285379
43	NC_015681	ACT	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285379
44	NC_015681	G	6	6	1822	1827	0 %	0 %	100 %	0 %	337285379
45	NC_015681	GTA	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285379
46	NC_015681	AGA	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285379
47	NC_015681	TGG	2	6	1992	1997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285379
48	NC_015681	AGG	2	6	2016	2021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285379
49	NC_015681	GGT	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285379
50	NC_015681	AAT	2	6	2094	2099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285379
51	NC_015681	AGC	2	6	2265	2270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285379
52	NC_015681	GAT	2	6	2329	2334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285379
53	NC_015681	CTT	2	6	2392	2397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285379
54	NC_015681	A	6	6	2419	2424	100 %	0 %	0 %	0 %	337285379
55	NC_015681	AGA	3	9	2430	2438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285379
56	NC_015681	CTA	2	6	2440	2445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285379
57	NC_015681	A	6	6	2453	2458	100 %	0 %	0 %	0 %	337285379
58	NC_015681	A	6	6	2463	2468	100 %	0 %	0 %	0 %	337285379
59	NC_015681	AAGA	2	8	2504	2511	75 %	0 %	25 %	0 %	337285379
60	NC_015681	GC	3	6	2527	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	337285379
61	NC_015681	A	8	8	2553	2560	100 %	0 %	0 %	0 %	337285379
62	NC_015681	A	7	7	2717	2723	100 %	0 %	0 %	0 %	337285379
63	NC_015681	TAAA	2	8	2762	2769	75 %	25 %	0 %	0 %	337285379
64	NC_015681	A	6	6	2821	2826	100 %	0 %	0 %	0 %	337285379
65	NC_015681	T	6	6	2829	2834	0 %	100 %	0 %	0 %	337285379
66	NC_015681	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285379
67	NC_015681	AGA	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285379
68	NC_015681	T	6	6	2924	2929	0 %	100 %	0 %	0 %	337285379
69	NC_015681	TA	3	6	2954	2959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015681	ATTTTT	2	12	3020	3031	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	337285380
71	NC_015681	TGA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285380
72	NC_015681	A	7	7	3087	3093	100 %	0 %	0 %	0 %	337285380
73	NC_015681	G	6	6	3268	3273	0 %	0 %	100 %	0 %	337285380
74	NC_015681	TCCC	2	8	3286	3293	0 %	25 %	0 %	75 %	337285380
75	NC_015681	T	6	6	3356	3361	0 %	100 %	0 %	0 %	337285380
76	NC_015681	GATC	2	8	3365	3372	25 %	25 %	25 %	25 %	337285380
77	NC_015681	AT	3	6	3551	3556	50 %	50 %	0 %	0 %	337285380
78	NC_015681	TTG	2	6	3580	3585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337285380
79	NC_015681	A	6	6	3716	3721	100 %	0 %	0 %	0 %	337285380
80	NC_015681	TA	3	6	3726	3731	50 %	50 %	0 %	0 %	337285380
81	NC_015681	TGA	2	6	3782	3787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285380
82	NC_015681	TCA	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285380
83	NC_015681	GC	3	6	3804	3809	0 %	0 %	50 %	50 %	337285380
84	NC_015681	ACTT	2	8	3828	3835	25 %	50 %	0 %	25 %	337285380
85	NC_015681	TAA	2	6	3874	3879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285380
86	NC_015681	TATT	2	8	3921	3928	25 %	75 %	0 %	0 %	337285380
87	NC_015681	ACAA	2	8	3955	3962	75 %	0 %	0 %	25 %	337285380
88	NC_015681	CAG	2	6	3987	3992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285380
89	NC_015681	TGA	2	6	4025	4030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285380
90	NC_015681	TAA	2	6	4060	4065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285380
91	NC_015681	TAAA	2	8	4069	4076	75 %	25 %	0 %	0 %	337285380
92	NC_015681	AGAT	2	8	4078	4085	50 %	25 %	25 %	0 %	337285380
93	NC_015681	AATT	2	8	4103	4110	50 %	50 %	0 %	0 %	337285380
94	NC_015681	ATC	2	6	4111	4116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285380
95	NC_015681	ATTTTT	2	12	4126	4137	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	337285380
96	NC_015681	TATACC	2	12	4188	4199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285380
97	NC_015681	CTATA	2	10	4221	4230	40 %	40 %	0 %	20 %	337285380
98	NC_015681	CTA	2	6	4303	4308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285380
99	NC_015681	A	6	6	4308	4313	100 %	0 %	0 %	0 %	337285380
100	NC_015681	AT	3	6	4319	4324	50 %	50 %	0 %	0 %	337285380
101	NC_015681	AAAAAG	2	12	4359	4370	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	337285380
102	NC_015681	TAT	2	6	4398	4403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285380
103	NC_015681	A	6	6	4423	4428	100 %	0 %	0 %	0 %	337285380
104	NC_015681	CAAT	2	8	4456	4463	50 %	25 %	0 %	25 %	337285380
105	NC_015681	AT	3	6	4522	4527	50 %	50 %	0 %	0 %	337285380
106	NC_015681	ACT	2	6	4581	4586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285380
107	NC_015681	AGAAA	2	10	4590	4599	80 %	0 %	20 %	0 %	337285380
108	NC_015681	A	6	6	4597	4602	100 %	0 %	0 %	0 %	337285380
109	NC_015681	A	7	7	4646	4652	100 %	0 %	0 %	0 %	337285380
110	NC_015681	AGA	2	6	4691	4696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285380
111	NC_015681	T	6	6	4720	4725	0 %	100 %	0 %	0 %	337285380
112	NC_015681	A	6	6	4758	4763	100 %	0 %	0 %	0 %	337285380
113	NC_015681	AGTA	2	8	4769	4776	50 %	25 %	25 %	0 %	337285380
114	NC_015681	A	7	7	4807	4813	100 %	0 %	0 %	0 %	337285380
115	NC_015681	A	8	8	4873	4880	100 %	0 %	0 %	0 %	337285380
116	NC_015681	AAT	3	9	4906	4914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285381
117	NC_015681	A	6	6	4924	4929	100 %	0 %	0 %	0 %	337285381
118	NC_015681	ATA	2	6	4943	4948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285381
119	NC_015681	ATT	2	6	4949	4954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285381
120	NC_015681	TCA	2	6	4955	4960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285381
121	NC_015681	A	8	8	5014	5021	100 %	0 %	0 %	0 %	337285381
122	NC_015681	GAT	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285381
123	NC_015681	A	7	7	5117	5123	100 %	0 %	0 %	0 %	337285381
124	NC_015681	A	6	6	5131	5136	100 %	0 %	0 %	0 %	337285381
125	NC_015681	A	7	7	5141	5147	100 %	0 %	0 %	0 %	337285381
126	NC_015681	T	6	6	5153	5158	0 %	100 %	0 %	0 %	337285381
127	NC_015681	CTG	2	6	5163	5168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285381
128	NC_015681	TAA	2	6	5200	5205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285381
129	NC_015681	A	7	7	5219	5225	100 %	0 %	0 %	0 %	337285381
130	NC_015681	T	6	6	5235	5240	0 %	100 %	0 %	0 %	337285381
131	NC_015681	A	8	8	5254	5261	100 %	0 %	0 %	0 %	337285381
132	NC_015681	ATT	2	6	5300	5305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285381
133	NC_015681	ATC	2	6	5323	5328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285381
134	NC_015681	TTTAT	2	10	5329	5338	20 %	80 %	0 %	0 %	337285381
135	NC_015681	CAAA	2	8	5397	5404	75 %	0 %	0 %	25 %	337285381
136	NC_015681	AGA	2	6	5425	5430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285381
137	NC_015681	AT	3	6	5448	5453	50 %	50 %	0 %	0 %	337285381
138	NC_015681	GAT	2	6	5458	5463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285381
139	NC_015681	TGA	2	6	5467	5472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285381
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156	NC_015681	A	6	6	5970	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	337285382
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