MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermodesulfatator indicus DSM 15286 chromosome

Total Repeats: 48871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48502	NC_015681	GCCTGA	2	12	2305301	2305312	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	337287556
48503	NC_015681	A	6	6	2305333	2305338	100 %	0 %	0 %	0 %	337287556
48504	NC_015681	TCC	2	6	2305385	2305390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48505	NC_015681	CAT	2	6	2305449	2305454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287557
48506	NC_015681	TGG	2	6	2305573	2305578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337287557
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48508	NC_015681	CAT	2	6	2305733	2305738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287557
48509	NC_015681	ATG	2	6	2305841	2305846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287557
48510	NC_015681	AGA	2	6	2305866	2305871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287557
48511	NC_015681	GCA	2	6	2305885	2305890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337287557
48512	NC_015681	GCA	2	6	2305906	2305911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337287557
48513	NC_015681	ACT	2	6	2305912	2305917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287557
48514	NC_015681	ATT	2	6	2305979	2305984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48515	NC_015681	AGG	2	6	2306086	2306091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48516	NC_015681	T	7	7	2306092	2306098	0 %	100 %	0 %	0 %	337287558
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48519	NC_015681	T	8	8	2306161	2306168	0 %	100 %	0 %	0 %	337287558
48520	NC_015681	CAA	2	6	2306208	2306213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337287558
48521	NC_015681	AAGCCA	2	12	2306224	2306235	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	337287558
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48531	NC_015681	T	6	6	2306727	2306732	0 %	100 %	0 %	0 %	337287558
48532	NC_015681	TAAA	2	8	2306746	2306753	75 %	25 %	0 %	0 %	337287558
48533	NC_015681	CTA	2	6	2306764	2306769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287558
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48536	NC_015681	GAG	2	6	2306916	2306921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337287558
48537	NC_015681	A	7	7	2306945	2306951	100 %	0 %	0 %	0 %	337287558
48538	NC_015681	AGAA	2	8	2307041	2307048	75 %	0 %	25 %	0 %	337287558
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48545	NC_015681	TAC	3	9	2307269	2307277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287558
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48858	NC_015681	AGA	2	6	2321780	2321785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287572
48859	NC_015681	GACC	2	8	2321878	2321885	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48860	NC_015681	CAG	2	6	2321888	2321893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48861	NC_015681	CAA	2	6	2321897	2321902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48862	NC_015681	TC	3	6	2321930	2321935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48863	NC_015681	TGG	2	6	2321948	2321953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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48865	NC_015681	AGCGA	2	10	2322038	2322047	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48866	NC_015681	CAG	2	6	2322126	2322131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48868	NC_015681	TAAA	2	8	2322185	2322192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48869	NC_015681	T	7	7	2322198	2322204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48870	NC_015681	A	6	6	2322206	2322211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48871	NC_015681	A	6	6	2322216	2322221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.