MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermodesulfatator indicus DSM 15286 chromosome

Total Repeats: 48871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_015681	ATG	2	6	2280111	2280116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287532
48003	NC_015681	AAC	2	6	2280120	2280125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337287532
48004	NC_015681	TTA	2	6	2280133	2280138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287532
48005	NC_015681	AAT	2	6	2280165	2280170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287532
48006	NC_015681	T	7	7	2280282	2280288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48007	NC_015681	A	6	6	2280329	2280334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48008	NC_015681	TA	3	6	2280360	2280365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48009	NC_015681	ATCA	2	8	2280368	2280375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48010	NC_015681	T	7	7	2280442	2280448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48011	NC_015681	TTTAGT	2	12	2280488	2280499	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48012	NC_015681	TA	3	6	2280501	2280506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48013	NC_015681	A	6	6	2280548	2280553	100 %	0 %	0 %	0 %	337287533
48014	NC_015681	TAC	2	6	2280568	2280573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287533
48015	NC_015681	AGA	2	6	2280575	2280580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287533
48016	NC_015681	CTG	2	6	2280621	2280626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337287533
48017	NC_015681	AAGCCA	2	12	2280657	2280668	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	337287533
48018	NC_015681	ATGGCC	2	12	2280679	2280690	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	337287533
48019	NC_015681	CAG	2	6	2280717	2280722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337287533
48020	NC_015681	GGT	2	6	2280758	2280763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337287533
48021	NC_015681	GTA	2	6	2280767	2280772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287533
48022	NC_015681	GTA	2	6	2280774	2280779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287533
48023	NC_015681	T	6	6	2280780	2280785	0 %	100 %	0 %	0 %	337287533
48024	NC_015681	A	6	6	2280797	2280802	100 %	0 %	0 %	0 %	337287533
48025	NC_015681	AGG	2	6	2280805	2280810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337287533
48026	NC_015681	GTGGC	2	10	2280855	2280864	0 %	20 %	60 %	20 %	337287533
48027	NC_015681	ATTTT	2	10	2280915	2280924	20 %	80 %	0 %	0 %	337287533
48028	NC_015681	AAT	2	6	2280973	2280978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287533
48029	NC_015681	A	7	7	2281040	2281046	100 %	0 %	0 %	0 %	337287533
48030	NC_015681	AGA	2	6	2281136	2281141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287533
48031	NC_015681	ATC	2	6	2281176	2281181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287533
48032	NC_015681	GTA	2	6	2281184	2281189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287533
48033	NC_015681	CTA	2	6	2281190	2281195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287533
48034	NC_015681	AGCC	2	8	2281400	2281407	25 %	0 %	25 %	50 %	337287534
48035	NC_015681	TTA	2	6	2281408	2281413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287534
48036	NC_015681	A	6	6	2281486	2281491	100 %	0 %	0 %	0 %	337287534
48037	NC_015681	CCTG	2	8	2281567	2281574	0 %	25 %	25 %	50 %	337287534
48038	NC_015681	A	7	7	2281627	2281633	100 %	0 %	0 %	0 %	337287534
48039	NC_015681	A	6	6	2281693	2281698	100 %	0 %	0 %	0 %	337287534
48040	NC_015681	A	6	6	2281707	2281712	100 %	0 %	0 %	0 %	337287534
48041	NC_015681	AG	3	6	2281882	2281887	50 %	0 %	50 %	0 %	337287534
48042	NC_015681	T	7	7	2281945	2281951	0 %	100 %	0 %	0 %	337287534
48043	NC_015681	AGGG	2	8	2282036	2282043	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48044	NC_015681	CCCCT	2	10	2282050	2282059	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
48045	NC_015681	GAA	2	6	2282084	2282089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287535
48046	NC_015681	GACGTA	2	12	2282104	2282115	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	337287535
48047	NC_015681	TAA	2	6	2282158	2282163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287535
48048	NC_015681	TCA	2	6	2282188	2282193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287535
48049	NC_015681	TCT	2	6	2282205	2282210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287535
48050	NC_015681	GGT	2	6	2282246	2282251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337287535
48051	NC_015681	CTC	2	6	2282267	2282272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337287535
48052	NC_015681	TGG	2	6	2282273	2282278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337287535
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48054	NC_015681	AGC	2	6	2282357	2282362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337287535
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48056	NC_015681	ACC	2	6	2282579	2282584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337287535
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48070	NC_015681	CTT	2	6	2283463	2283468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287535
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48072	NC_015681	T	7	7	2283498	2283504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48073	NC_015681	TCA	2	6	2283575	2283580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287536
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48084	NC_015681	A	6	6	2283816	2283821	100 %	0 %	0 %	0 %	337287536
48085	NC_015681	TC	3	6	2283909	2283914	0 %	50 %	0 %	50 %	337287536
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48090	NC_015681	GA	3	6	2284105	2284110	50 %	0 %	50 %	0 %	337287536
48091	NC_015681	TTA	2	6	2284133	2284138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287536
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48097	NC_015681	A	6	6	2284271	2284276	100 %	0 %	0 %	0 %	337287536
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48102	NC_015681	TCT	2	6	2284462	2284467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287536
48103	NC_015681	GAT	2	6	2284491	2284496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287536
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48105	NC_015681	A	7	7	2284634	2284640	100 %	0 %	0 %	0 %	337287536
48106	NC_015681	CTT	2	6	2284644	2284649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287536
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48108	NC_015681	TTCC	2	8	2284681	2284688	0 %	50 %	0 %	50 %	337287536
48109	NC_015681	GA	3	6	2284798	2284803	50 %	0 %	50 %	0 %	337287536
48110	NC_015681	TAAC	2	8	2284854	2284861	50 %	25 %	0 %	25 %	337287536
48111	NC_015681	A	7	7	2284870	2284876	100 %	0 %	0 %	0 %	337287536
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48114	NC_015681	GAC	2	6	2285043	2285048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337287536
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48116	NC_015681	T	7	7	2285077	2285083	0 %	100 %	0 %	0 %	337287536
48117	NC_015681	GAA	2	6	2285094	2285099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287536
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48119	NC_015681	CT	3	6	2285296	2285301	0 %	50 %	0 %	50 %	337287536
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48134	NC_015681	T	6	6	2285716	2285721	0 %	100 %	0 %	0 %	337287536
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48236	NC_015681	AAGG	2	8	2290883	2290890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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