MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermodesulfatator indicus DSM 15286 chromosome

Total Repeats: 48871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_015681	TTAAA	2	10	2254878	2254887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47502	NC_015681	CTG	2	6	2254930	2254935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47503	NC_015681	TCG	2	6	2254943	2254948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47504	NC_015681	CTA	2	6	2255015	2255020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47505	NC_015681	TAA	2	6	2255059	2255064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47506	NC_015681	CT	3	6	2255089	2255094	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47507	NC_015681	CTT	2	6	2255099	2255104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47508	NC_015681	TATC	2	8	2255165	2255172	25 %	50 %	0 %	25 %	337287516
47509	NC_015681	TTC	2	6	2255202	2255207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287516
47510	NC_015681	TGG	2	6	2255246	2255251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337287516
47511	NC_015681	TTC	2	6	2255358	2255363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287516
47512	NC_015681	GGC	3	9	2255426	2255434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337287516
47513	NC_015681	TTA	2	6	2255438	2255443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287516
47514	NC_015681	GTA	2	6	2255484	2255489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287516
47515	NC_015681	AGGCA	2	10	2255493	2255502	40 %	0 %	40 %	20 %	337287516
47516	NC_015681	A	6	6	2255502	2255507	100 %	0 %	0 %	0 %	337287516
47517	NC_015681	GAT	2	6	2255561	2255566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287516
47518	NC_015681	CAA	2	6	2255584	2255589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337287516
47519	NC_015681	GTAA	2	8	2255613	2255620	50 %	25 %	25 %	0 %	337287516
47520	NC_015681	ATT	2	6	2255638	2255643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287516
47521	NC_015681	CGG	2	6	2255669	2255674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337287516
47522	NC_015681	AAT	2	6	2255718	2255723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287516
47523	NC_015681	GGT	2	6	2255749	2255754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337287516
47524	NC_015681	CAC	2	6	2255883	2255888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337287516
47525	NC_015681	AGA	2	6	2255890	2255895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287516
47526	NC_015681	CAC	2	6	2255961	2255966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337287516
47527	NC_015681	CAT	2	6	2256006	2256011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287516
47528	NC_015681	T	6	6	2256092	2256097	0 %	100 %	0 %	0 %	337287516
47529	NC_015681	AAGGC	2	10	2256116	2256125	40 %	0 %	40 %	20 %	337287516
47530	NC_015681	TC	3	6	2256334	2256339	0 %	50 %	0 %	50 %	337287516
47531	NC_015681	T	6	6	2256422	2256427	0 %	100 %	0 %	0 %	337287516
47532	NC_015681	CTT	2	6	2256452	2256457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287516
47533	NC_015681	AGCC	2	8	2256471	2256478	25 %	0 %	25 %	50 %	337287516
47534	NC_015681	ATAG	2	8	2256521	2256528	50 %	25 %	25 %	0 %	337287516
47535	NC_015681	TAC	2	6	2256564	2256569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287516
47536	NC_015681	AAG	2	6	2256654	2256659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287516
47537	NC_015681	TTCT	2	8	2256665	2256672	0 %	75 %	0 %	25 %	337287516
47538	NC_015681	TCG	2	6	2256676	2256681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337287516
47539	NC_015681	GCT	2	6	2256694	2256699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337287516
47540	NC_015681	TG	3	6	2256772	2256777	0 %	50 %	50 %	0 %	337287516
47541	NC_015681	CAA	2	6	2256899	2256904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337287516
47542	NC_015681	CT	3	6	2256930	2256935	0 %	50 %	0 %	50 %	337287516
47543	NC_015681	T	6	6	2256969	2256974	0 %	100 %	0 %	0 %	337287516
47544	NC_015681	GCG	2	6	2257054	2257059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337287516
47545	NC_015681	CTT	2	6	2257148	2257153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287516
47546	NC_015681	T	6	6	2257152	2257157	0 %	100 %	0 %	0 %	337287516
47547	NC_015681	AC	3	6	2257229	2257234	50 %	0 %	0 %	50 %	337287516
47548	NC_015681	TTC	2	6	2257236	2257241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287516
47549	NC_015681	GTAAAG	2	12	2257243	2257254	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337287516
47550	NC_015681	TTC	2	6	2257260	2257265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287516
47551	NC_015681	CCG	2	6	2257303	2257308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337287516
47552	NC_015681	TTA	2	6	2257348	2257353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287516
47553	NC_015681	GAA	2	6	2257368	2257373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287516
47554	NC_015681	AAG	2	6	2257437	2257442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287516
47555	NC_015681	TTC	2	6	2257515	2257520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287516
47556	NC_015681	TTC	2	6	2257560	2257565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287516
47557	NC_015681	TTC	2	6	2257632	2257637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287516
47558	NC_015681	CGC	2	6	2257642	2257647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337287516
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47560	NC_015681	CTTT	2	8	2257688	2257695	0 %	75 %	0 %	25 %	337287516
47561	NC_015681	TGG	2	6	2257711	2257716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337287516
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47571	NC_015681	ATT	2	6	2258107	2258112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287516
47572	NC_015681	ACC	2	6	2258155	2258160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337287516
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47574	NC_015681	TTC	2	6	2258304	2258309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287516
47575	NC_015681	TAC	2	6	2258324	2258329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287516
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47578	NC_015681	ATCT	2	8	2258454	2258461	25 %	50 %	0 %	25 %	337287516
47579	NC_015681	A	6	6	2258572	2258577	100 %	0 %	0 %	0 %	337287516
47580	NC_015681	GAAG	2	8	2258635	2258642	50 %	0 %	50 %	0 %	337287516
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47583	NC_015681	T	6	6	2258955	2258960	0 %	100 %	0 %	0 %	337287516
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47585	NC_015681	CTT	2	6	2258993	2258998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287516
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47587	NC_015681	ACC	3	9	2259160	2259168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337287516
47588	NC_015681	TAT	2	6	2259196	2259201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47589	NC_015681	T	6	6	2259238	2259243	0 %	100 %	0 %	0 %	337287517
47590	NC_015681	TAA	2	6	2259312	2259317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287517
47591	NC_015681	TTC	2	6	2259370	2259375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287517
47592	NC_015681	CTT	2	6	2259483	2259488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287517
47593	NC_015681	ATA	2	6	2259536	2259541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287517
47594	NC_015681	CTT	2	6	2259552	2259557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287517
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47598	NC_015681	GCC	2	6	2259650	2259655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337287517
47599	NC_015681	T	6	6	2259672	2259677	0 %	100 %	0 %	0 %	337287517
47600	NC_015681	TCA	2	6	2259686	2259691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287517
47601	NC_015681	TC	3	6	2259702	2259707	0 %	50 %	0 %	50 %	337287517
47602	NC_015681	CTA	2	6	2259711	2259716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287517
47603	NC_015681	TAA	2	6	2259758	2259763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287517
47604	NC_015681	T	7	7	2259793	2259799	0 %	100 %	0 %	0 %	337287517
47605	NC_015681	CAT	2	6	2259843	2259848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287517
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47607	NC_015681	TAA	2	6	2260020	2260025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287517
47608	NC_015681	ATA	2	6	2260073	2260078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287517
47609	NC_015681	TAG	2	6	2260113	2260118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287517
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47611	NC_015681	CAAT	2	8	2260295	2260302	50 %	25 %	0 %	25 %	337287517
47612	NC_015681	TTC	2	6	2260324	2260329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287517
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47614	NC_015681	AAG	2	6	2260371	2260376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287517
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