MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermodesulfatator indicus DSM 15286 chromosome

Total Repeats: 48871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_015681	CTG	2	6	191365	191370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285563
4003	NC_015681	ATT	2	6	191376	191381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285563
4004	NC_015681	ATT	2	6	191469	191474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285563
4005	NC_015681	CCA	2	6	191503	191508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285563
4006	NC_015681	TGCT	2	8	191536	191543	0 %	50 %	25 %	25 %	337285563
4007	NC_015681	TGC	2	6	191552	191557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285563
4008	NC_015681	CTG	2	6	191581	191586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285563
4009	NC_015681	GAA	2	6	191595	191600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285563
4010	NC_015681	GAA	3	9	191613	191621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285563
4011	NC_015681	AGT	2	6	191633	191638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285563
4012	NC_015681	AGA	2	6	191639	191644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285563
4013	NC_015681	TAG	3	9	191650	191658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285563
4014	NC_015681	G	6	6	191714	191719	0 %	0 %	100 %	0 %	337285563
4015	NC_015681	CTT	2	6	191724	191729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285563
4016	NC_015681	TCA	2	6	191839	191844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285563
4017	NC_015681	A	6	6	191913	191918	100 %	0 %	0 %	0 %	337285563
4018	NC_015681	A	6	6	191985	191990	100 %	0 %	0 %	0 %	337285563
4019	NC_015681	GTA	2	6	192018	192023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285563
4020	NC_015681	AGA	2	6	192149	192154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285563
4021	NC_015681	TTC	2	6	192193	192198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285563
4022	NC_015681	CTT	2	6	192234	192239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285563
4023	NC_015681	AGA	2	6	192392	192397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285563
4024	NC_015681	TCGTA	2	10	192467	192476	20 %	40 %	20 %	20 %	337285563
4025	NC_015681	GGC	2	6	192491	192496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285563
4026	NC_015681	TGA	2	6	192666	192671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285563
4027	NC_015681	CCA	2	6	192756	192761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285564
4028	NC_015681	GA	3	6	192769	192774	50 %	0 %	50 %	0 %	337285564
4029	NC_015681	GAA	2	6	192824	192829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285564
4030	NC_015681	AAG	2	6	192831	192836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285564
4031	NC_015681	CTT	2	6	192843	192848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285564
4032	NC_015681	T	6	6	192868	192873	0 %	100 %	0 %	0 %	337285564
4033	NC_015681	GAAA	2	8	192877	192884	75 %	0 %	25 %	0 %	337285564
4034	NC_015681	CTT	2	6	192888	192893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285564
4035	NC_015681	GAT	2	6	192901	192906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285564
4036	NC_015681	TATT	2	8	192954	192961	25 %	75 %	0 %	0 %	337285564
4037	NC_015681	TAA	2	6	192984	192989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285564
4038	NC_015681	CTT	2	6	192992	192997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285564
4039	NC_015681	ATGGTA	2	12	193005	193016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285564
4040	NC_015681	ATT	2	6	193024	193029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285564
4041	NC_015681	T	6	6	193094	193099	0 %	100 %	0 %	0 %	337285564
4042	NC_015681	ACC	2	6	193124	193129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285564
4043	NC_015681	TGC	2	6	193144	193149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285564
4044	NC_015681	T	6	6	193375	193380	0 %	100 %	0 %	0 %	337285564
4045	NC_015681	AG	3	6	193501	193506	50 %	0 %	50 %	0 %	337285564
4046	NC_015681	AGG	2	6	193516	193521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285564
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4049	NC_015681	GGA	2	6	193654	193659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285564
4050	NC_015681	GAAA	2	8	193782	193789	75 %	0 %	25 %	0 %	337285565
4051	NC_015681	CTGG	2	8	193878	193885	0 %	25 %	50 %	25 %	337285565
4052	NC_015681	GAA	2	6	193899	193904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285565
4053	NC_015681	GAT	2	6	193991	193996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285565
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4055	NC_015681	GCT	2	6	194055	194060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285565
4056	NC_015681	TACTT	2	10	194077	194086	20 %	60 %	0 %	20 %	337285565
4057	NC_015681	TTAA	2	8	194157	194164	50 %	50 %	0 %	0 %	337285565
4058	NC_015681	ATT	2	6	194369	194374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285565
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4060	NC_015681	GGCT	2	8	194628	194635	0 %	25 %	50 %	25 %	337285566
4061	NC_015681	CCA	2	6	194645	194650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285566
4062	NC_015681	G	6	6	194766	194771	0 %	0 %	100 %	0 %	337285566
4063	NC_015681	TGA	2	6	194779	194784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285566
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4065	NC_015681	CTG	2	6	194880	194885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285566
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4070	NC_015681	GAA	2	6	195011	195016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285566
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4072	NC_015681	TCT	2	6	195091	195096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285566
4073	NC_015681	AT	3	6	195103	195108	50 %	50 %	0 %	0 %	337285566
4074	NC_015681	TGA	2	6	195109	195114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285566
4075	NC_015681	GAAAAA	2	12	195122	195133	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	337285566
4076	NC_015681	TAC	2	6	195152	195157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285566
4077	NC_015681	GA	3	6	195172	195177	50 %	0 %	50 %	0 %	337285566
4078	NC_015681	T	6	6	195281	195286	0 %	100 %	0 %	0 %	337285566
4079	NC_015681	GAA	2	6	195287	195292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285566
4080	NC_015681	AGG	2	6	195343	195348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_015681	GAT	2	6	195387	195392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285567
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4088	NC_015681	AT	3	6	195671	195676	50 %	50 %	0 %	0 %	337285567
4089	NC_015681	A	7	7	195717	195723	100 %	0 %	0 %	0 %	337285567
4090	NC_015681	GAA	2	6	195740	195745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285568
4091	NC_015681	TAG	2	6	195804	195809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285568
4092	NC_015681	AAG	2	6	195828	195833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285568
4093	NC_015681	AGA	2	6	195856	195861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285568
4094	NC_015681	AGA	2	6	195877	195882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285568
4095	NC_015681	A	7	7	195886	195892	100 %	0 %	0 %	0 %	337285568
4096	NC_015681	TCT	2	6	195931	195936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285568
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4100	NC_015681	GACGAG	2	12	196001	196012	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	337285568
4101	NC_015681	GAA	3	9	196034	196042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285568
4102	NC_015681	T	6	6	196124	196129	0 %	100 %	0 %	0 %	337285568
4103	NC_015681	A	7	7	196199	196205	100 %	0 %	0 %	0 %	337285568
4104	NC_015681	TCC	2	6	196229	196234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285568
4105	NC_015681	CTC	2	6	196262	196267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285568
4106	NC_015681	A	6	6	196270	196275	100 %	0 %	0 %	0 %	337285568
4107	NC_015681	AAC	2	6	196297	196302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285568
4108	NC_015681	AAACG	2	10	196373	196382	60 %	0 %	20 %	20 %	337285568
4109	NC_015681	ACT	2	6	196384	196389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285568
4110	NC_015681	TATG	2	8	196433	196440	25 %	50 %	25 %	0 %	337285568
4111	NC_015681	GAA	2	6	196457	196462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285568
4112	NC_015681	ATT	2	6	196485	196490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285568
4113	NC_015681	A	7	7	196499	196505	100 %	0 %	0 %	0 %	337285568
4114	NC_015681	GTA	2	6	196514	196519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285568
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4116	NC_015681	TGA	2	6	196567	196572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285569
4117	NC_015681	T	6	6	196584	196589	0 %	100 %	0 %	0 %	337285569
4118	NC_015681	A	6	6	196647	196652	100 %	0 %	0 %	0 %	337285569
4119	NC_015681	A	8	8	196661	196668	100 %	0 %	0 %	0 %	337285569
4120	NC_015681	GAA	2	6	196676	196681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285569
4121	NC_015681	AAGA	2	8	196682	196689	75 %	0 %	25 %	0 %	337285569
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