MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermodesulfatator indicus DSM 15286 chromosome

Total Repeats: 48871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015681	T	6	6	621652	621657	0 %	100 %	0 %	0 %	337285960
13002	NC_015681	TCC	2	6	621669	621674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285960
13003	NC_015681	AAT	2	6	621723	621728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285960
13004	NC_015681	CGG	2	6	621737	621742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285960
13005	NC_015681	GCG	2	6	621853	621858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285960
13006	NC_015681	CAT	2	6	621897	621902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285960
13007	NC_015681	GATT	2	8	621938	621945	25 %	50 %	25 %	0 %	337285960
13008	NC_015681	CTA	2	6	622109	622114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285960
13009	NC_015681	AACACC	2	12	622123	622134	50 %	0 %	0 %	50 %	337285960
13010	NC_015681	GAG	2	6	622245	622250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285960
13011	NC_015681	GCG	2	6	622324	622329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285960
13012	NC_015681	T	6	6	622348	622353	0 %	100 %	0 %	0 %	337285960
13013	NC_015681	CTC	2	6	622426	622431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285961
13014	NC_015681	T	6	6	622505	622510	0 %	100 %	0 %	0 %	337285961
13015	NC_015681	TCT	2	6	622527	622532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285961
13016	NC_015681	TCC	2	6	622565	622570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285961
13017	NC_015681	T	6	6	622672	622677	0 %	100 %	0 %	0 %	337285961
13018	NC_015681	AGA	2	6	622682	622687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285961
13019	NC_015681	TTC	3	9	622691	622699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285961
13020	NC_015681	GGA	2	6	622710	622715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285961
13021	NC_015681	TTAC	2	8	622716	622723	25 %	50 %	0 %	25 %	337285961
13022	NC_015681	GAT	2	6	622798	622803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285961
13023	NC_015681	CT	3	6	622808	622813	0 %	50 %	0 %	50 %	337285961
13024	NC_015681	AG	5	10	622890	622899	50 %	0 %	50 %	0 %	337285961
13025	NC_015681	CAA	2	6	622969	622974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285961
13026	NC_015681	CGC	2	6	623082	623087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285961
13027	NC_015681	A	6	6	623099	623104	100 %	0 %	0 %	0 %	337285961
13028	NC_015681	CTG	2	6	623116	623121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285961
13029	NC_015681	T	6	6	623159	623164	0 %	100 %	0 %	0 %	337285961
13030	NC_015681	AAGA	3	12	623169	623180	75 %	0 %	25 %	0 %	337285961
13031	NC_015681	GCT	2	6	623199	623204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285961
13032	NC_015681	TCT	2	6	623205	623210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285961
13033	NC_015681	CTT	2	6	623245	623250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285961
13034	NC_015681	TTTA	2	8	623347	623354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_015681	ATT	2	6	623364	623369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_015681	A	6	6	623389	623394	100 %	0 %	0 %	0 %	337285962
13037	NC_015681	TTG	2	6	623402	623407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337285962
13038	NC_015681	AAG	2	6	623457	623462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285962
13039	NC_015681	CCG	2	6	623496	623501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285962
13040	NC_015681	T	6	6	623521	623526	0 %	100 %	0 %	0 %	337285962
13041	NC_015681	GAA	2	6	623545	623550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285962
13042	NC_015681	CTC	2	6	623609	623614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285962
13043	NC_015681	TGA	2	6	623721	623726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285962
13044	NC_015681	GTA	2	6	623774	623779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285962
13045	NC_015681	AAT	2	6	623800	623805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285962
13046	NC_015681	ATA	2	6	623864	623869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285962
13047	NC_015681	T	6	6	623873	623878	0 %	100 %	0 %	0 %	337285962
13048	NC_015681	TCAA	2	8	623987	623994	50 %	25 %	0 %	25 %	337285962
13049	NC_015681	CGC	2	6	624012	624017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285962
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13051	NC_015681	CAA	2	6	624079	624084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285962
13052	NC_015681	GGA	2	6	624133	624138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285962
13053	NC_015681	AT	4	8	624265	624272	50 %	50 %	0 %	0 %	337285962
13054	NC_015681	GCCGAT	2	12	624280	624291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	337285962
13055	NC_015681	GCA	2	6	624301	624306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285962
13056	NC_015681	T	6	6	624310	624315	0 %	100 %	0 %	0 %	337285962
13057	NC_015681	AAT	2	6	624351	624356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285962
13058	NC_015681	GAA	2	6	624406	624411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285962
13059	NC_015681	T	6	6	624434	624439	0 %	100 %	0 %	0 %	337285962
13060	NC_015681	CTC	2	6	624452	624457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285962
13061	NC_015681	A	6	6	624464	624469	100 %	0 %	0 %	0 %	337285962
13062	NC_015681	A	6	6	624484	624489	100 %	0 %	0 %	0 %	337285962
13063	NC_015681	ACT	2	6	624618	624623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285962
13064	NC_015681	CTT	2	6	624640	624645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285962
13065	NC_015681	GAAA	2	8	624667	624674	75 %	0 %	25 %	0 %	337285962
13066	NC_015681	TGG	2	6	624819	624824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285962
13067	NC_015681	CTAACC	2	12	624940	624951	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
13068	NC_015681	CCG	2	6	624952	624957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13069	NC_015681	GGA	2	6	625011	625016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_015681	T	6	6	625038	625043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_015681	A	6	6	625061	625066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_015681	GAGG	2	8	625124	625131	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_015681	ACGC	2	8	625163	625170	25 %	0 %	25 %	50 %	337285963
13074	NC_015681	CA	3	6	625195	625200	50 %	0 %	0 %	50 %	337285963
13075	NC_015681	GAA	2	6	625206	625211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285963
13076	NC_015681	CCG	2	6	625235	625240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285963
13077	NC_015681	CGG	2	6	625250	625255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285963
13078	NC_015681	AATC	2	8	625316	625323	50 %	25 %	0 %	25 %	337285963
13079	NC_015681	CGT	2	6	625389	625394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285963
13080	NC_015681	CCT	2	6	625485	625490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285963
13081	NC_015681	AGA	2	6	625614	625619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285963
13082	NC_015681	TGG	2	6	625774	625779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285963
13083	NC_015681	TAT	2	6	625794	625799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285963
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13086	NC_015681	ACCG	2	8	626013	626020	25 %	0 %	25 %	50 %	337285963
13087	NC_015681	GGT	2	6	626099	626104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285963
13088	NC_015681	TGA	2	6	626165	626170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285963
13089	NC_015681	TTC	2	6	626262	626267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285963
13090	NC_015681	GAA	3	9	626271	626279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285963
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13092	NC_015681	T	6	6	626328	626333	0 %	100 %	0 %	0 %	337285963
13093	NC_015681	GGT	2	6	626438	626443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285963
13094	NC_015681	TGG	2	6	626455	626460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285963
13095	NC_015681	GAA	3	9	626469	626477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285963
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13099	NC_015681	CCGG	2	8	626627	626634	0 %	0 %	50 %	50 %	337285963
13100	NC_015681	GGT	2	6	626739	626744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285963
13101	NC_015681	TTATGC	2	12	626770	626781	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	337285963
13102	NC_015681	TGCT	2	8	626838	626845	0 %	50 %	25 %	25 %	337285963
13103	NC_015681	TGC	2	6	626896	626901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285963
13104	NC_015681	GAAA	2	8	626918	626925	75 %	0 %	25 %	0 %	337285963
13105	NC_015681	A	7	7	626923	626929	100 %	0 %	0 %	0 %	337285963
13106	NC_015681	T	6	6	626964	626969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_015681	GGCC	2	8	626985	626992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13108	NC_015681	AAAAG	2	10	626999	627008	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_015681	GTA	2	6	627015	627020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_015681	GGCC	2	8	627030	627037	0 %	0 %	50 %	50 %	337285964
13111	NC_015681	TTGG	2	8	627170	627177	0 %	50 %	50 %	0 %	337285964
13112	NC_015681	GAA	2	6	627211	627216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285964
13113	NC_015681	ATC	2	6	627220	627225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285964
13114	NC_015681	TTTC	2	8	627259	627266	0 %	75 %	0 %	25 %	337285964
13115	NC_015681	TTGA	2	8	627274	627281	25 %	50 %	25 %	0 %	337285964
13116	NC_015681	TAC	2	6	627289	627294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285964
13117	NC_015681	CT	3	6	627311	627316	0 %	50 %	0 %	50 %	337285964
13118	NC_015681	TCG	2	6	627378	627383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285964
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13120	NC_015681	T	6	6	627514	627519	0 %	100 %	0 %	0 %	337285964
13121	NC_015681	TCCCTT	2	12	627527	627538	0 %	50 %	0 %	50 %	337285964
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