MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermodesulfatator indicus DSM 15286 chromosome

Total Repeats: 48871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_015681	T	6	6	549126	549131	0 %	100 %	0 %	0 %	337285893
11503	NC_015681	TGA	2	6	549157	549162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285893
11504	NC_015681	TTGG	2	8	549201	549208	0 %	50 %	50 %	0 %	337285893
11505	NC_015681	AAAT	2	8	549268	549275	75 %	25 %	0 %	0 %	337285893
11506	NC_015681	CAG	2	6	549365	549370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285893
11507	NC_015681	CAG	2	6	549419	549424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285893
11508	NC_015681	AG	3	6	549439	549444	50 %	0 %	50 %	0 %	337285893
11509	NC_015681	TAA	2	6	549497	549502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285893
11510	NC_015681	TCA	2	6	549667	549672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285893
11511	NC_015681	CGG	2	6	549702	549707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285893
11512	NC_015681	T	6	6	549742	549747	0 %	100 %	0 %	0 %	337285893
11513	NC_015681	CT	3	6	549774	549779	0 %	50 %	0 %	50 %	337285894
11514	NC_015681	TCA	2	6	549831	549836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285894
11515	NC_015681	TTC	3	9	549872	549880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285894
11516	NC_015681	AGA	2	6	549944	549949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285894
11517	NC_015681	GTC	2	6	550010	550015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285894
11518	NC_015681	T	6	6	550066	550071	0 %	100 %	0 %	0 %	337285894
11519	NC_015681	ACTTT	2	10	550139	550148	20 %	60 %	0 %	20 %	337285895
11520	NC_015681	TAA	2	6	550338	550343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285895
11521	NC_015681	CTT	2	6	550350	550355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285895
11522	NC_015681	GTA	2	6	550411	550416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285895
11523	NC_015681	CAT	2	6	550419	550424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285895
11524	NC_015681	CCTTC	2	10	550524	550533	0 %	40 %	0 %	60 %	337285895
11525	NC_015681	TAA	2	6	550604	550609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285895
11526	NC_015681	GCC	2	6	550610	550615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285895
11527	NC_015681	T	7	7	550644	550650	0 %	100 %	0 %	0 %	337285895
11528	NC_015681	TTC	2	6	550666	550671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285895
11529	NC_015681	CTT	2	6	550686	550691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285895
11530	NC_015681	CTT	2	6	550707	550712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285895
11531	NC_015681	TTC	2	6	550735	550740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285895
11532	NC_015681	TAG	2	6	550752	550757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285895
11533	NC_015681	ATATCC	2	12	550766	550777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285895
11534	NC_015681	AGT	2	6	550788	550793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285895
11535	NC_015681	CTA	2	6	550965	550970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285895
11536	NC_015681	GCTG	2	8	550985	550992	0 %	25 %	50 %	25 %	337285895
11537	NC_015681	GCC	2	6	551002	551007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285895
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11539	NC_015681	GCC	2	6	551054	551059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285895
11540	NC_015681	GAA	2	6	551069	551074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285895
11541	NC_015681	TGGG	2	8	551108	551115	0 %	25 %	75 %	0 %	337285895
11542	NC_015681	AGA	2	6	551137	551142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285895
11543	NC_015681	TCA	2	6	551156	551161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285895
11544	NC_015681	TTA	2	6	551208	551213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285895
11545	NC_015681	GGT	2	6	551263	551268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285895
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11548	NC_015681	CTT	2	6	551422	551427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285895
11549	NC_015681	CAAG	2	8	551439	551446	50 %	0 %	25 %	25 %	337285895
11550	NC_015681	GCT	2	6	551496	551501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285895
11551	NC_015681	CCATT	2	10	551521	551530	20 %	40 %	0 %	40 %	337285895
11552	NC_015681	CCT	2	6	551537	551542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285896
11553	NC_015681	CAC	2	6	551559	551564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285896
11554	NC_015681	A	6	6	551565	551570	100 %	0 %	0 %	0 %	337285896
11555	NC_015681	CAGC	2	8	551732	551739	25 %	0 %	25 %	50 %	337285896
11556	NC_015681	TTC	3	9	551760	551768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285896
11557	NC_015681	CTT	3	9	551807	551815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285896
11558	NC_015681	GCC	2	6	551832	551837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11559	NC_015681	TAC	2	6	551865	551870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285897
11560	NC_015681	C	6	6	551978	551983	0 %	0 %	0 %	100 %	337285897
11561	NC_015681	CTT	2	6	551999	552004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285897
11562	NC_015681	GGC	2	6	552108	552113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285897
11563	NC_015681	GC	3	6	552112	552117	0 %	0 %	50 %	50 %	337285897
11564	NC_015681	A	7	7	552329	552335	100 %	0 %	0 %	0 %	337285897
11565	NC_015681	CTT	2	6	552344	552349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285897
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11568	NC_015681	TGG	2	6	552485	552490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285897
11569	NC_015681	CAT	2	6	552611	552616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285897
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11571	NC_015681	T	6	6	552722	552727	0 %	100 %	0 %	0 %	337285897
11572	NC_015681	CTT	3	9	552812	552820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285897
11573	NC_015681	CAAG	2	8	552821	552828	50 %	0 %	25 %	25 %	337285897
11574	NC_015681	TGA	2	6	552908	552913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285897
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11578	NC_015681	AGTAA	2	10	553081	553090	60 %	20 %	20 %	0 %	337285897
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11580	NC_015681	TAAA	2	8	553322	553329	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_015681	AGG	2	6	553336	553341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_015681	GA	3	6	553421	553426	50 %	0 %	50 %	0 %	337285898
11583	NC_015681	AG	3	6	553428	553433	50 %	0 %	50 %	0 %	337285898
11584	NC_015681	TGA	2	6	553580	553585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285898
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11588	NC_015681	T	6	6	553992	553997	0 %	100 %	0 %	0 %	337285898
11589	NC_015681	GAA	3	9	554034	554042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285898
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11592	NC_015681	CAA	2	6	554247	554252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285899
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11594	NC_015681	A	6	6	554268	554273	100 %	0 %	0 %	0 %	337285899
11595	NC_015681	CACC	2	8	554305	554312	25 %	0 %	0 %	75 %	337285899
11596	NC_015681	CCA	2	6	554378	554383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285899
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11601	NC_015681	AAAC	2	8	554621	554628	75 %	0 %	0 %	25 %	337285899
11602	NC_015681	AGC	2	6	554668	554673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285899
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11604	NC_015681	A	6	6	554842	554847	100 %	0 %	0 %	0 %	337285899
11605	NC_015681	A	6	6	554884	554889	100 %	0 %	0 %	0 %	337285899
11606	NC_015681	T	6	6	554927	554932	0 %	100 %	0 %	0 %	337285899
11607	NC_015681	CTT	2	6	554990	554995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285899
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11611	NC_015681	CTT	3	9	555086	555094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285900
11612	NC_015681	TTTTC	2	10	555143	555152	0 %	80 %	0 %	20 %	337285900
11613	NC_015681	TGG	2	6	555159	555164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285900
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11617	NC_015681	A	6	6	555307	555312	100 %	0 %	0 %	0 %	337285900
11618	NC_015681	T	7	7	555325	555331	0 %	100 %	0 %	0 %	337285900
11619	NC_015681	GTA	2	6	555358	555363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285900
11620	NC_015681	CTAG	2	8	555385	555392	25 %	25 %	25 %	25 %	337285900
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