MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermodesulfatator indicus DSM 15286 chromosome

Total Repeats: 48871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015681	ATG	3	9	262254	262262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285628
5502	NC_015681	GAA	3	9	262278	262286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285628
5503	NC_015681	AAG	2	6	262408	262413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285628
5504	NC_015681	ATC	3	9	262544	262552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285629
5505	NC_015681	A	6	6	262656	262661	100 %	0 %	0 %	0 %	337285629
5506	NC_015681	CCG	2	6	262738	262743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285629
5507	NC_015681	TTA	2	6	263055	263060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285629
5508	NC_015681	A	6	6	263068	263073	100 %	0 %	0 %	0 %	337285629
5509	NC_015681	CTTT	2	8	263087	263094	0 %	75 %	0 %	25 %	337285629
5510	NC_015681	TAA	2	6	263160	263165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285629
5511	NC_015681	GGC	2	6	263282	263287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285629
5512	NC_015681	TTA	2	6	263293	263298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285629
5513	NC_015681	CTTC	2	8	263312	263319	0 %	50 %	0 %	50 %	337285629
5514	NC_015681	GGC	2	6	263362	263367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285629
5515	NC_015681	TGTTA	2	10	263399	263408	20 %	60 %	20 %	0 %	337285629
5516	NC_015681	GAA	2	6	263438	263443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285629
5517	NC_015681	GTC	2	6	263495	263500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285629
5518	NC_015681	CAAG	2	8	263534	263541	50 %	0 %	25 %	25 %	337285629
5519	NC_015681	CCG	2	6	263548	263553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285629
5520	NC_015681	GCTT	2	8	263583	263590	0 %	50 %	25 %	25 %	337285629
5521	NC_015681	AGA	2	6	263596	263601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285629
5522	NC_015681	AGA	2	6	263617	263622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285629
5523	NC_015681	GCT	2	6	263646	263651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285629
5524	NC_015681	TG	3	6	263655	263660	0 %	50 %	50 %	0 %	337285629
5525	NC_015681	AGT	2	6	263689	263694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285629
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5527	NC_015681	ATCAC	2	10	263812	263821	40 %	20 %	0 %	40 %	337285630
5528	NC_015681	AGA	2	6	263837	263842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285630
5529	NC_015681	TTA	2	6	263879	263884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285630
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5531	NC_015681	AG	3	6	263918	263923	50 %	0 %	50 %	0 %	337285630
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5534	NC_015681	AAAC	2	8	264203	264210	75 %	0 %	0 %	25 %	337285630
5535	NC_015681	A	6	6	264225	264230	100 %	0 %	0 %	0 %	337285630
5536	NC_015681	CTA	2	6	264245	264250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285630
5537	NC_015681	CTG	2	6	264438	264443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285630
5538	NC_015681	GAAG	2	8	264464	264471	50 %	0 %	50 %	0 %	337285630
5539	NC_015681	AAG	2	6	264504	264509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285630
5540	NC_015681	A	7	7	264585	264591	100 %	0 %	0 %	0 %	337285630
5541	NC_015681	CTG	2	6	264642	264647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285630
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5544	NC_015681	A	7	7	264691	264697	100 %	0 %	0 %	0 %	337285630
5545	NC_015681	AAG	2	6	264736	264741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285630
5546	NC_015681	AAG	2	6	264868	264873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285630
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5551	NC_015681	CTTA	2	8	265222	265229	25 %	50 %	0 %	25 %	337285630
5552	NC_015681	CGC	2	6	265314	265319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285630
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5555	NC_015681	GGC	2	6	265455	265460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285631
5556	NC_015681	GCCCT	2	10	265501	265510	0 %	20 %	20 %	60 %	337285631
5557	NC_015681	CCA	2	6	265523	265528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285631
5558	NC_015681	AAAT	2	8	265539	265546	75 %	25 %	0 %	0 %	337285631
5559	NC_015681	AGC	2	6	265547	265552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285631
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5562	NC_015681	A	6	6	265716	265721	100 %	0 %	0 %	0 %	337285631
5563	NC_015681	ATT	2	6	265833	265838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285631
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5574	NC_015681	TGA	2	6	266339	266344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285631
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5580	NC_015681	A	7	7	266523	266529	100 %	0 %	0 %	0 %	337285631
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5591	NC_015681	GTA	2	6	266957	266962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285632
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5593	NC_015681	CTTT	2	8	267105	267112	0 %	75 %	0 %	25 %	337285632
5594	NC_015681	T	6	6	267150	267155	0 %	100 %	0 %	0 %	337285632
5595	NC_015681	TACCTC	2	12	267203	267214	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	337285632
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5601	NC_015681	GGC	2	6	267737	267742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285632
5602	NC_015681	GAAT	2	8	267807	267814	50 %	25 %	25 %	0 %	337285632
5603	NC_015681	CTT	2	6	267820	267825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285632
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5607	NC_015681	GCCG	2	8	268094	268101	0 %	0 %	50 %	50 %	337285632
5608	NC_015681	T	6	6	268106	268111	0 %	100 %	0 %	0 %	337285632
5609	NC_015681	TCT	2	6	268152	268157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285632
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5611	NC_015681	GCA	2	6	268427	268432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285632
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5622	NC_015681	TCA	2	6	269178	269183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285632
5623	NC_015681	GAG	2	6	269256	269261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285632
5624	NC_015681	GAC	2	6	269288	269293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285632
5625	NC_015681	TC	3	6	269356	269361	0 %	50 %	0 %	50 %	337285632
5626	NC_015681	GGC	2	6	269375	269380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285632
5627	NC_015681	CGGT	2	8	269403	269410	0 %	25 %	50 %	25 %	337285632
5628	NC_015681	GAT	2	6	269486	269491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285632
5629	NC_015681	TCT	2	6	269556	269561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285632
5630	NC_015681	ATC	2	6	269562	269567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285632
5631	NC_015681	TCT	2	6	269610	269615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285632
5632	NC_015681	TTC	2	6	269618	269623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285632
5633	NC_015681	GCCAC	2	10	269634	269643	20 %	0 %	20 %	60 %	337285632
5634	NC_015681	GGCC	2	8	269666	269673	0 %	0 %	50 %	50 %	337285632
5635	NC_015681	T	6	6	269695	269700	0 %	100 %	0 %	0 %	337285632
5636	NC_015681	CG	3	6	269705	269710	0 %	0 %	50 %	50 %	337285632
5637	NC_015681	GGT	2	6	269726	269731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285632
5638	NC_015681	ATC	2	6	269832	269837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285632
5639	NC_015681	CGC	2	6	269860	269865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285632
5640	NC_015681	CTT	2	6	269938	269943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285632
5641	NC_015681	CCA	2	6	269956	269961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285632
5642	NC_015681	ATA	2	6	270015	270020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285632
5643	NC_015681	CTT	2	6	270061	270066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285632
5644	NC_015681	TCC	2	6	270182	270187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285633
5645	NC_015681	T	6	6	270301	270306	0 %	100 %	0 %	0 %	337285633
5646	NC_015681	TGG	2	6	270442	270447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285633
5647	NC_015681	CT	3	6	270488	270493	0 %	50 %	0 %	50 %	337285633
5648	NC_015681	T	6	6	270511	270516	0 %	100 %	0 %	0 %	337285633
5649	NC_015681	CTT	2	6	270546	270551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285633
5650	NC_015681	ACT	2	6	270614	270619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285633
5651	NC_015681	TGG	2	6	270652	270657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285633
5652	NC_015681	TTCT	2	8	270658	270665	0 %	75 %	0 %	25 %	337285633
5653	NC_015681	CAT	2	6	270753	270758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285633
5654	NC_015681	AGT	2	6	270805	270810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285633
5655	NC_015681	CCA	2	6	270855	270860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285633
5656	NC_015681	AATT	2	8	270922	270929	50 %	50 %	0 %	0 %	337285633
5657	NC_015681	T	6	6	270928	270933	0 %	100 %	0 %	0 %	337285633
5658	NC_015681	TCT	2	6	270941	270946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285633
5659	NC_015681	AAGA	2	8	270994	271001	75 %	0 %	25 %	0 %	337285633
5660	NC_015681	TC	3	6	271038	271043	0 %	50 %	0 %	50 %	337285633
5661	NC_015681	CTT	2	6	271044	271049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285633
5662	NC_015681	ATC	2	6	271138	271143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285633
5663	NC_015681	TCT	2	6	271223	271228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285633
5664	NC_015681	TTC	2	6	271241	271246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285633
5665	NC_015681	TTC	2	6	271276	271281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285633
5666	NC_015681	T	6	6	271297	271302	0 %	100 %	0 %	0 %	337285633
5667	NC_015681	TAA	2	6	271313	271318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285633
5668	NC_015681	T	6	6	271319	271324	0 %	100 %	0 %	0 %	337285633
5669	NC_015681	TAA	2	6	271379	271384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285633
5670	NC_015681	GTTTT	2	10	271401	271410	0 %	80 %	20 %	0 %	337285633
5671	NC_015681	ATTT	2	8	271456	271463	25 %	75 %	0 %	0 %	337285633
5672	NC_015681	CTT	2	6	271467	271472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285633
5673	NC_015681	CAA	2	6	271563	271568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285633
5674	NC_015681	GTTT	2	8	271696	271703	0 %	75 %	25 %	0 %	337285633
5675	NC_015681	TGG	2	6	271743	271748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285633
5676	NC_015681	GCAACT	2	12	271824	271835	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	337285633
5677	NC_015681	T	6	6	271835	271840	0 %	100 %	0 %	0 %	337285633
5678	NC_015681	TCA	2	6	271847	271852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285633
5679	NC_015681	T	7	7	271958	271964	0 %	100 %	0 %	0 %	337285633
5680	NC_015681	A	6	6	271992	271997	100 %	0 %	0 %	0 %	337285633
5681	NC_015681	ATA	3	9	272006	272014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285633
5682	NC_015681	A	7	7	272059	272065	100 %	0 %	0 %	0 %	337285633
5683	NC_015681	TCC	2	6	272078	272083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5684	NC_015681	GCC	2	6	272156	272161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285634
5685	NC_015681	AATT	2	8	272175	272182	50 %	50 %	0 %	0 %	337285634
5686	NC_015681	TAA	2	6	272213	272218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285634
5687	NC_015681	ATAACT	2	12	272227	272238	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	337285634
5688	NC_015681	TAA	2	6	272265	272270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285634
5689	NC_015681	TTC	2	6	272304	272309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285634
5690	NC_015681	AGA	2	6	272313	272318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285634
5691	NC_015681	ATC	2	6	272343	272348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285634
5692	NC_015681	CT	3	6	272376	272381	0 %	50 %	0 %	50 %	337285634
5693	NC_015681	TAT	2	6	272394	272399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285634
5694	NC_015681	ATC	2	6	272424	272429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285634
5695	NC_015681	GAC	2	6	272439	272444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337285634
5696	NC_015681	AGT	2	6	272451	272456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285634
5697	NC_015681	ATC	2	6	272505	272510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285634
5698	NC_015681	TGG	2	6	272542	272547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285634
5699	NC_015681	GATCAA	2	12	272549	272560	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337285634
5700	NC_015681	CAA	2	6	272590	272595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285634
5701	NC_015681	AGA	2	6	272596	272601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285634
5702	NC_015681	CTT	2	6	272603	272608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285634
5703	NC_015681	CTTT	2	8	272656	272663	0 %	75 %	0 %	25 %	337285634
5704	NC_015681	AAG	2	6	272687	272692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285634
5705	NC_015681	ATC	2	6	272700	272705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285634
5706	NC_015681	CCT	2	6	272789	272794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285634
5707	NC_015681	TC	3	6	272806	272811	0 %	50 %	0 %	50 %	337285634
5708	NC_015681	TAC	2	6	272865	272870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285634
5709	NC_015681	CTT	2	6	272879	272884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285634
5710	NC_015681	T	6	6	272912	272917	0 %	100 %	0 %	0 %	337285634
5711	NC_015681	A	8	8	272973	272980	100 %	0 %	0 %	0 %	337285634
5712	NC_015681	TTC	2	6	273018	273023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285634
5713	NC_015681	T	6	6	273071	273076	0 %	100 %	0 %	0 %	337285634
5714	NC_015681	ATCA	2	8	273109	273116	50 %	25 %	0 %	25 %	337285635
5715	NC_015681	TCA	2	6	273128	273133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285635
5716	NC_015681	T	7	7	273145	273151	0 %	100 %	0 %	0 %	337285635
5717	NC_015681	TTGTTT	2	12	273210	273221	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	337285635
5718	NC_015681	GAA	2	6	273246	273251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285635
5719	NC_015681	CTT	2	6	273252	273257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285635
5720	NC_015681	T	6	6	273321	273326	0 %	100 %	0 %	0 %	337285635
5721	NC_015681	CTT	2	6	273351	273356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285635
5722	NC_015681	CTT	2	6	273384	273389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285635
5723	NC_015681	CTT	2	6	273408	273413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285635
5724	NC_015681	CGT	2	6	273414	273419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285635
5725	NC_015681	CCTTTA	2	12	273437	273448	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	337285635
5726	NC_015681	TTTC	2	8	273453	273460	0 %	75 %	0 %	25 %	337285635
5727	NC_015681	TCT	2	6	273488	273493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285635
5728	NC_015681	CCCTTT	2	12	273526	273537	0 %	50 %	0 %	50 %	337285635
5729	NC_015681	C	6	6	273559	273564	0 %	0 %	0 %	100 %	337285635
5730	NC_015681	T	6	6	273568	273573	0 %	100 %	0 %	0 %	337285635
5731	NC_015681	T	6	6	273616	273621	0 %	100 %	0 %	0 %	337285635
5732	NC_015681	AGT	2	6	273622	273627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285635
5733	NC_015681	GA	3	6	273650	273655	50 %	0 %	50 %	0 %	337285635
5734	NC_015681	T	6	6	273658	273663	0 %	100 %	0 %	0 %	337285635
5735	NC_015681	AAT	2	6	273691	273696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285635
5736	NC_015681	CAC	2	6	273817	273822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285635
5737	NC_015681	AAAT	2	8	273856	273863	75 %	25 %	0 %	0 %	337285635
5738	NC_015681	AGAA	2	8	273909	273916	75 %	0 %	25 %	0 %	337285635
5739	NC_015681	AC	4	8	274018	274025	50 %	0 %	0 %	50 %	337285635
5740	NC_015681	ATT	2	6	274123	274128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285635
5741	NC_015681	GCCA	2	8	274147	274154	25 %	0 %	25 %	50 %	337285635
5742	NC_015681	AT	3	6	274261	274266	50 %	50 %	0 %	0 %	337285635
5743	NC_015681	TCC	2	6	274298	274303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337285635
5744	NC_015681	GAATAT	2	12	274308	274319	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337285635
5745	NC_015681	T	6	6	274321	274326	0 %	100 %	0 %	0 %	337285635
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