MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015581	ACCT	2	8	179954	179961	25 %	25 %	0 %	50 %	334143283
3502	NC_015581	ATC	2	6	180026	180031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143283
3503	NC_015581	ATAA	2	8	180209	180216	75 %	25 %	0 %	0 %	334143283
3504	NC_015581	ACG	2	6	180275	180280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143283
3505	NC_015581	TCACC	2	10	180283	180292	20 %	20 %	0 %	60 %	334143283
3506	NC_015581	AAGT	2	8	180336	180343	50 %	25 %	25 %	0 %	334143283
3507	NC_015581	AAAT	2	8	180344	180351	75 %	25 %	0 %	0 %	334143283
3508	NC_015581	CTG	2	6	180414	180419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143283
3509	NC_015581	AAT	2	6	180422	180427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143283
3510	NC_015581	TGT	2	6	180551	180556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143284
3511	NC_015581	GTT	2	6	180566	180571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143284
3512	NC_015581	T	6	6	180584	180589	0 %	100 %	0 %	0 %	334143284
3513	NC_015581	AAG	2	6	180687	180692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143284
3514	NC_015581	CAA	2	6	180708	180713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143284
3515	NC_015581	ACC	2	6	180714	180719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143284
3516	NC_015581	TGAA	2	8	180736	180743	50 %	25 %	25 %	0 %	334143284
3517	NC_015581	TTG	2	6	180753	180758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143284
3518	NC_015581	CAT	2	6	180776	180781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143284
3519	NC_015581	GTT	2	6	180998	181003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143284
3520	NC_015581	GCGTT	2	10	181033	181042	0 %	40 %	40 %	20 %	334143284
3521	NC_015581	CTT	2	6	181049	181054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143284
3522	NC_015581	ACCC	2	8	181061	181068	25 %	0 %	0 %	75 %	334143284
3523	NC_015581	CAACCA	2	12	181069	181080	50 %	0 %	0 %	50 %	334143284
3524	NC_015581	TTA	2	6	181138	181143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143284
3525	NC_015581	TAA	2	6	181338	181343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143284
3526	NC_015581	CTT	2	6	181358	181363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143284
3527	NC_015581	ATG	2	6	181389	181394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143284
3528	NC_015581	TGA	2	6	181457	181462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143284
3529	NC_015581	A	7	7	181469	181475	100 %	0 %	0 %	0 %	334143284
3530	NC_015581	AAT	2	6	181618	181623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143284
3531	NC_015581	ACT	2	6	181647	181652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143284
3532	NC_015581	CCA	2	6	181760	181765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143285
3533	NC_015581	A	7	7	181870	181876	100 %	0 %	0 %	0 %	334143285
3534	NC_015581	T	6	6	181879	181884	0 %	100 %	0 %	0 %	334143285
3535	NC_015581	TAA	2	6	181900	181905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143285
3536	NC_015581	TGTT	3	12	182009	182020	0 %	75 %	25 %	0 %	334143285
3537	NC_015581	TTG	2	6	182021	182026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143285
3538	NC_015581	CAA	2	6	182089	182094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143285
3539	NC_015581	TCA	2	6	182115	182120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143285
3540	NC_015581	GTGG	2	8	182167	182174	0 %	25 %	75 %	0 %	334143285
3541	NC_015581	T	7	7	182188	182194	0 %	100 %	0 %	0 %	334143285
3542	NC_015581	T	6	6	182325	182330	0 %	100 %	0 %	0 %	334143285
3543	NC_015581	GCC	2	6	182370	182375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143285
3544	NC_015581	TAA	2	6	182450	182455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143286
3545	NC_015581	CAT	2	6	182599	182604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143286
3546	NC_015581	TCA	2	6	182612	182617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143286
3547	NC_015581	GGT	2	6	182625	182630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143286
3548	NC_015581	TTG	2	6	182655	182660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143286
3549	NC_015581	TTGA	2	8	182767	182774	25 %	50 %	25 %	0 %	334143286
3550	NC_015581	AGT	2	6	182784	182789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143286
3551	NC_015581	TG	3	6	182836	182841	0 %	50 %	50 %	0 %	334143286
3552	NC_015581	TGA	2	6	182897	182902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143286
3553	NC_015581	AAC	2	6	182986	182991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143286
3554	NC_015581	CTGATC	2	12	182992	183003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	334143286
3555	NC_015581	AAT	2	6	183040	183045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143286
3556	NC_015581	CATTAA	2	12	183123	183134	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	334143286
3557	NC_015581	GTT	2	6	183145	183150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143286
3558	NC_015581	GAA	2	6	183151	183156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143286
3559	NC_015581	GGT	2	6	183306	183311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143286
3560	NC_015581	T	6	6	183319	183324	0 %	100 %	0 %	0 %	334143286
3561	NC_015581	GCTT	2	8	183326	183333	0 %	50 %	25 %	25 %	334143286
3562	NC_015581	A	6	6	183378	183383	100 %	0 %	0 %	0 %	334143286
3563	NC_015581	T	6	6	183386	183391	0 %	100 %	0 %	0 %	334143286
3564	NC_015581	GTT	2	6	183415	183420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143286
3565	NC_015581	T	6	6	183568	183573	0 %	100 %	0 %	0 %	334143286
3566	NC_015581	CAT	2	6	183576	183581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143286
3567	NC_015581	GC	3	6	183616	183621	0 %	0 %	50 %	50 %	334143286
3568	NC_015581	AAT	2	6	183697	183702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143286
3569	NC_015581	TAAT	2	8	183748	183755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_015581	AGGA	2	8	183788	183795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_015581	TTA	2	6	183957	183962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143287
3572	NC_015581	GGC	2	6	184004	184009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143287
3573	NC_015581	TGA	2	6	184010	184015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143287
3574	NC_015581	ATT	2	6	184153	184158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143287
3575	NC_015581	TGC	2	6	184177	184182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143287
3576	NC_015581	ATT	2	6	184192	184197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143287
3577	NC_015581	GGT	2	6	184269	184274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143287
3578	NC_015581	TAAT	2	8	184297	184304	50 %	50 %	0 %	0 %	334143287
3579	NC_015581	ATT	2	6	184356	184361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143287
3580	NC_015581	A	6	6	184466	184471	100 %	0 %	0 %	0 %	334143287
3581	NC_015581	AAGA	2	8	184581	184588	75 %	0 %	25 %	0 %	334143287
3582	NC_015581	GAT	2	6	184646	184651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143288
3583	NC_015581	GGC	2	6	184729	184734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143288
3584	NC_015581	GCT	2	6	184807	184812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143288
3585	NC_015581	ATT	2	6	184816	184821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143288
3586	NC_015581	TGA	2	6	184975	184980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143288
3587	NC_015581	GTAT	2	8	185026	185033	25 %	50 %	25 %	0 %	334143288
3588	NC_015581	A	7	7	185077	185083	100 %	0 %	0 %	0 %	334143288
3589	NC_015581	GGCCT	2	10	185134	185143	0 %	20 %	40 %	40 %	334143289
3590	NC_015581	TATT	2	8	185170	185177	25 %	75 %	0 %	0 %	334143289
3591	NC_015581	TAT	2	6	185186	185191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143289
3592	NC_015581	TTG	2	6	185231	185236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143289
3593	NC_015581	TTG	2	6	185270	185275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143289
3594	NC_015581	ATC	2	6	185289	185294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143289
3595	NC_015581	ATT	2	6	185310	185315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143289
3596	NC_015581	TGT	2	6	185340	185345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143289
3597	NC_015581	GGA	2	6	185476	185481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143289
3598	NC_015581	CAT	2	6	185486	185491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143289
3599	NC_015581	TTG	2	6	185591	185596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143289
3600	NC_015581	TGG	2	6	185616	185621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143289
3601	NC_015581	GTT	2	6	185635	185640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143289
3602	NC_015581	CTT	2	6	185709	185714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143289
3603	NC_015581	ATGT	2	8	185729	185736	25 %	50 %	25 %	0 %	334143289
3604	NC_015581	G	6	6	185739	185744	0 %	0 %	100 %	0 %	334143289
3605	NC_015581	GTC	2	6	185754	185759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143289
3606	NC_015581	T	7	7	185776	185782	0 %	100 %	0 %	0 %	334143289
3607	NC_015581	GCCA	2	8	185803	185810	25 %	0 %	25 %	50 %	334143289
3608	NC_015581	TATT	2	8	185814	185821	25 %	75 %	0 %	0 %	334143289
3609	NC_015581	TTGT	2	8	185822	185829	0 %	75 %	25 %	0 %	334143289
3610	NC_015581	ACTTAG	2	12	185838	185849	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	334143289
3611	NC_015581	T	7	7	185878	185884	0 %	100 %	0 %	0 %	334143289
3612	NC_015581	GT	3	6	185892	185897	0 %	50 %	50 %	0 %	334143289
3613	NC_015581	GTTTGG	2	12	185909	185920	0 %	50 %	50 %	0 %	334143289
3614	NC_015581	GCTT	2	8	185972	185979	0 %	50 %	25 %	25 %	334143289
3615	NC_015581	TG	3	6	185986	185991	0 %	50 %	50 %	0 %	334143289
3616	NC_015581	AGC	2	6	186120	186125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143289
3617	NC_015581	GCTG	2	8	186224	186231	0 %	25 %	50 %	25 %	334143289
3618	NC_015581	GAT	2	6	186259	186264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143289
3619	NC_015581	TTTG	2	8	186319	186326	0 %	75 %	25 %	0 %	334143289
3620	NC_015581	TCG	2	6	186331	186336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143289
3621	NC_015581	AAAC	2	8	186430	186437	75 %	0 %	0 %	25 %	334143290
3622	NC_015581	CAAGC	2	10	186490	186499	40 %	0 %	20 %	40 %	334143290
3623	NC_015581	TGC	2	6	186580	186585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143290
3624	NC_015581	CAG	2	6	186595	186600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143290
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3713	NC_015581	TTTA	2	8	191259	191266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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