MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_015581	ATTA	2	8	1845134	1845141	50 %	50 %	0 %	0 %	334144685
35002	NC_015581	TGC	2	6	1845144	1845149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144685
35003	NC_015581	AAC	2	6	1845150	1845155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144685
35004	NC_015581	AAC	2	6	1845230	1845235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144685
35005	NC_015581	TTA	2	6	1845268	1845273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35006	NC_015581	TAA	2	6	1845303	1845308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35007	NC_015581	AT	4	8	1845309	1845316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35008	NC_015581	A	7	7	1845333	1845339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35009	NC_015581	CTT	2	6	1845353	1845358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35010	NC_015581	T	6	6	1845393	1845398	0 %	100 %	0 %	0 %	334144686
35011	NC_015581	TCA	2	6	1845542	1845547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144686
35012	NC_015581	CGAA	2	8	1845556	1845563	50 %	0 %	25 %	25 %	334144686
35013	NC_015581	ACA	2	6	1845587	1845592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144686
35014	NC_015581	TAA	2	6	1845626	1845631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144686
35015	NC_015581	TCA	2	6	1845641	1845646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144686
35016	NC_015581	TCA	2	6	1845854	1845859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144687
35017	NC_015581	CAT	2	6	1845894	1845899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144687
35018	NC_015581	A	6	6	1846007	1846012	100 %	0 %	0 %	0 %	334144687
35019	NC_015581	ACGTGC	2	12	1846024	1846035	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334144687
35020	NC_015581	TCT	3	9	1846049	1846057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144687
35021	NC_015581	ATG	2	6	1846085	1846090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144687
35022	NC_015581	CAA	2	6	1846158	1846163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144687
35023	NC_015581	TAC	2	6	1846246	1846251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144687
35024	NC_015581	GTC	2	6	1846300	1846305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144687
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35028	NC_015581	GAA	2	6	1846516	1846521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144687
35029	NC_015581	TGG	2	6	1846567	1846572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144687
35030	NC_015581	TCAT	2	8	1846574	1846581	25 %	50 %	0 %	25 %	334144687
35031	NC_015581	TTCA	2	8	1846621	1846628	25 %	50 %	0 %	25 %	334144687
35032	NC_015581	CAT	2	6	1846726	1846731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144687
35033	NC_015581	CAC	2	6	1846755	1846760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144687
35034	NC_015581	TGA	2	6	1847029	1847034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144687
35035	NC_015581	AAC	2	6	1847053	1847058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144687
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35038	NC_015581	CAT	2	6	1847118	1847123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144687
35039	NC_015581	GCA	2	6	1847138	1847143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144687
35040	NC_015581	T	7	7	1847212	1847218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35041	NC_015581	TTA	2	6	1847295	1847300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144688
35042	NC_015581	GC	3	6	1847366	1847371	0 %	0 %	50 %	50 %	334144688
35043	NC_015581	CTT	2	6	1847452	1847457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144688
35044	NC_015581	ATC	2	6	1847501	1847506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144688
35045	NC_015581	GCT	2	6	1847533	1847538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144688
35046	NC_015581	TTGAT	2	10	1847573	1847582	20 %	60 %	20 %	0 %	334144688
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35049	NC_015581	CAA	2	6	1847692	1847697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144688
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35051	NC_015581	T	6	6	1847732	1847737	0 %	100 %	0 %	0 %	334144688
35052	NC_015581	AAT	2	6	1847741	1847746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144688
35053	NC_015581	ACC	2	6	1847825	1847830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144688
35054	NC_015581	AAC	2	6	1847852	1847857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144688
35055	NC_015581	ATG	2	6	1847912	1847917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144688
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35058	NC_015581	TAC	2	6	1848082	1848087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144688
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35084	NC_015581	ATC	2	6	1849182	1849187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144689
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35089	NC_015581	ACA	2	6	1849431	1849436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144689
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35091	NC_015581	TACAT	2	10	1849506	1849515	40 %	40 %	0 %	20 %	334144689
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35099	NC_015581	T	6	6	1849834	1849839	0 %	100 %	0 %	0 %	334144690
35100	NC_015581	TCG	2	6	1849842	1849847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144690
35101	NC_015581	TCT	2	6	1849890	1849895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144690
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35106	NC_015581	CTT	2	6	1850320	1850325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144691
35107	NC_015581	CT	3	6	1850336	1850341	0 %	50 %	0 %	50 %	334144691
35108	NC_015581	GGC	2	6	1850375	1850380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144691
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35110	NC_015581	CTG	2	6	1850404	1850409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144691
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35113	NC_015581	AGTTCA	2	12	1850523	1850534	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	334144691
35114	NC_015581	TCT	2	6	1850586	1850591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144691
35115	NC_015581	ATA	2	6	1850713	1850718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35116	NC_015581	TGC	2	6	1850752	1850757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144692
35117	NC_015581	TTGCA	2	10	1850758	1850767	20 %	40 %	20 %	20 %	334144692
35118	NC_015581	GAT	2	6	1850812	1850817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144692
35119	NC_015581	CTG	3	9	1850952	1850960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144692
35120	NC_015581	GGC	2	6	1850989	1850994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144692
35121	NC_015581	ATC	2	6	1851008	1851013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144692
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35123	NC_015581	AGTTAA	2	12	1851054	1851065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35124	NC_015581	A	6	6	1851064	1851069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35125	NC_015581	GAG	2	6	1851104	1851109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35126	NC_015581	CTT	2	6	1851123	1851128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35127	NC_015581	TCG	2	6	1851151	1851156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144693
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35133	NC_015581	GTA	2	6	1851541	1851546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144693
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35140	NC_015581	TA	3	6	1851921	1851926	50 %	50 %	0 %	0 %	334144693
35141	NC_015581	TCT	2	6	1851960	1851965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35146	NC_015581	AT	3	6	1852122	1852127	50 %	50 %	0 %	0 %	334144694
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35227	NC_015581	ACCA	2	8	1856002	1856009	50 %	0 %	0 %	50 %	334144699
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35231	NC_015581	CGTT	2	8	1856243	1856250	0 %	50 %	25 %	25 %	334144699
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