MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_015581	CGC	2	6	1817843	1817848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144658
34502	NC_015581	AAT	2	6	1817964	1817969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144658
34503	NC_015581	CAT	2	6	1817987	1817992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144658
34504	NC_015581	ATG	2	6	1817997	1818002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144658
34505	NC_015581	AGC	2	6	1818007	1818012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144658
34506	NC_015581	CGT	2	6	1818027	1818032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144658
34507	NC_015581	CAAT	2	8	1818040	1818047	50 %	25 %	0 %	25 %	334144658
34508	NC_015581	TAA	2	6	1818070	1818075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34509	NC_015581	TTA	2	6	1818083	1818088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34510	NC_015581	CA	3	6	1818116	1818121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34511	NC_015581	ACCA	2	8	1818161	1818168	50 %	0 %	0 %	50 %	334144659
34512	NC_015581	ACC	2	6	1818236	1818241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144659
34513	NC_015581	GGC	2	6	1818301	1818306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144659
34514	NC_015581	TGGC	2	8	1818412	1818419	0 %	25 %	50 %	25 %	334144659
34515	NC_015581	GCA	2	6	1818455	1818460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144659
34516	NC_015581	CA	3	6	1818459	1818464	50 %	0 %	0 %	50 %	334144659
34517	NC_015581	AAAC	2	8	1818466	1818473	75 %	0 %	0 %	25 %	334144659
34518	NC_015581	CCG	2	6	1818508	1818513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144659
34519	NC_015581	GAC	2	6	1818545	1818550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144659
34520	NC_015581	TCC	2	6	1818569	1818574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144659
34521	NC_015581	CCA	2	6	1818579	1818584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144659
34522	NC_015581	TCA	2	6	1818627	1818632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144659
34523	NC_015581	CTTG	2	8	1818656	1818663	0 %	50 %	25 %	25 %	334144659
34524	NC_015581	CGC	3	9	1818760	1818768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144659
34525	NC_015581	ACTC	2	8	1818984	1818991	25 %	25 %	0 %	50 %	334144659
34526	NC_015581	CAT	2	6	1819098	1819103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144659
34527	NC_015581	CCG	2	6	1819104	1819109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144659
34528	NC_015581	ACC	2	6	1819174	1819179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144659
34529	NC_015581	ACC	2	6	1819276	1819281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144659
34530	NC_015581	TG	3	6	1819413	1819418	0 %	50 %	50 %	0 %	334144659
34531	NC_015581	GGC	2	6	1819432	1819437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144659
34532	NC_015581	CTG	2	6	1819501	1819506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144659
34533	NC_015581	ATC	3	9	1819561	1819569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144659
34534	NC_015581	ACAA	2	8	1819577	1819584	75 %	0 %	0 %	25 %	334144659
34535	NC_015581	ACC	2	6	1819594	1819599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144659
34536	NC_015581	AGCA	2	8	1819600	1819607	50 %	0 %	25 %	25 %	334144659
34537	NC_015581	CCA	2	6	1819653	1819658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144659
34538	NC_015581	TTG	2	6	1819762	1819767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144659
34539	NC_015581	TGT	2	6	1819772	1819777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144659
34540	NC_015581	CGT	2	6	1819847	1819852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144659
34541	NC_015581	CTT	2	6	1819857	1819862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144659
34542	NC_015581	TAA	2	6	1819872	1819877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144659
34543	NC_015581	ACC	2	6	1819883	1819888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144659
34544	NC_015581	TCA	2	6	1819910	1819915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144659
34545	NC_015581	TAA	2	6	1819930	1819935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144659
34546	NC_015581	CTG	2	6	1819995	1820000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144659
34547	NC_015581	GCC	2	6	1820066	1820071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144659
34548	NC_015581	ACC	2	6	1820171	1820176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144659
34549	NC_015581	CAT	2	6	1820274	1820279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144659
34550	NC_015581	CTA	2	6	1820341	1820346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34551	NC_015581	A	6	6	1820373	1820378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34552	NC_015581	T	9	9	1820392	1820400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34553	NC_015581	CT	3	6	1820442	1820447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34554	NC_015581	TTTAA	2	10	1820502	1820511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34555	NC_015581	AAATA	2	10	1820584	1820593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34556	NC_015581	ATA	3	9	1820591	1820599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34557	NC_015581	TTG	2	6	1820685	1820690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144660
34558	NC_015581	GAC	2	6	1820741	1820746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144660
34559	NC_015581	TTAAA	2	10	1820781	1820790	60 %	40 %	0 %	0 %	334144660
34560	NC_015581	TGA	2	6	1820794	1820799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144660
34561	NC_015581	ACC	2	6	1820812	1820817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144660
34562	NC_015581	GC	3	6	1820889	1820894	0 %	0 %	50 %	50 %	334144660
34563	NC_015581	CTT	2	6	1820917	1820922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144660
34564	NC_015581	AC	3	6	1820940	1820945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34565	NC_015581	T	7	7	1820968	1820974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34566	NC_015581	A	7	7	1821068	1821074	100 %	0 %	0 %	0 %	334144661
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34569	NC_015581	A	7	7	1821435	1821441	100 %	0 %	0 %	0 %	334144661
34570	NC_015581	CTC	2	6	1821523	1821528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144661
34571	NC_015581	CAAT	2	8	1821627	1821634	50 %	25 %	0 %	25 %	334144661
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34573	NC_015581	GGTGA	2	10	1821723	1821732	20 %	20 %	60 %	0 %	334144661
34574	NC_015581	ACA	2	6	1821871	1821876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144661
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34582	NC_015581	A	6	6	1822306	1822311	100 %	0 %	0 %	0 %	334144661
34583	NC_015581	GCAA	2	8	1822575	1822582	50 %	0 %	25 %	25 %	334144662
34584	NC_015581	TCG	2	6	1822639	1822644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144662
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34586	NC_015581	T	7	7	1822698	1822704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34587	NC_015581	CAC	2	6	1822710	1822715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34588	NC_015581	TTC	2	6	1822866	1822871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144663
34589	NC_015581	GAT	2	6	1822912	1822917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144663
34590	NC_015581	CGC	2	6	1823050	1823055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144663
34591	NC_015581	GGCTTA	2	12	1823096	1823107	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	334144663
34592	NC_015581	A	6	6	1823168	1823173	100 %	0 %	0 %	0 %	334144663
34593	NC_015581	TGA	2	6	1823211	1823216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144663
34594	NC_015581	ATG	2	6	1823348	1823353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144663
34595	NC_015581	TCA	2	6	1823374	1823379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144663
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34598	NC_015581	ACC	2	6	1823654	1823659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144663
34599	NC_015581	CGT	2	6	1823675	1823680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144663
34600	NC_015581	CCAGC	2	10	1823736	1823745	20 %	0 %	20 %	60 %	334144663
34601	NC_015581	GAA	2	6	1823756	1823761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144663
34602	NC_015581	GTG	2	6	1823873	1823878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144663
34603	NC_015581	TAGG	2	8	1823923	1823930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34604	NC_015581	ACC	2	6	1823939	1823944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34605	NC_015581	ACCT	2	8	1823947	1823954	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34606	NC_015581	ACA	2	6	1823961	1823966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34607	NC_015581	TAAA	2	8	1824014	1824021	75 %	25 %	0 %	0 %	334144664
34608	NC_015581	TTC	2	6	1824033	1824038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144664
34609	NC_015581	GC	3	6	1824051	1824056	0 %	0 %	50 %	50 %	334144664
34610	NC_015581	CTG	2	6	1824102	1824107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144664
34611	NC_015581	CTT	2	6	1824128	1824133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144664
34612	NC_015581	CCAT	2	8	1824193	1824200	25 %	25 %	0 %	50 %	334144664
34613	NC_015581	AC	3	6	1824217	1824222	50 %	0 %	0 %	50 %	334144664
34614	NC_015581	TCAA	2	8	1824289	1824296	50 %	25 %	0 %	25 %	334144665
34615	NC_015581	TGC	2	6	1824369	1824374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144665
34616	NC_015581	CAT	2	6	1824465	1824470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144665
34617	NC_015581	ACC	2	6	1824597	1824602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144665
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34619	NC_015581	CAG	2	6	1824667	1824672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144665
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34733	NC_015581	A	6	6	1830196	1830201	100 %	0 %	0 %	0 %	334144669
34734	NC_015581	GAA	2	6	1830243	1830248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144669
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34977	NC_015581	ACC	2	6	1843772	1843777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144684
34978	NC_015581	TAA	2	6	1843811	1843816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144684
34979	NC_015581	TTG	2	6	1843838	1843843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144684
34980	NC_015581	CCT	2	6	1843857	1843862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144685
34981	NC_015581	T	7	7	1843878	1843884	0 %	100 %	0 %	0 %	334144685
34982	NC_015581	GTT	2	6	1843921	1843926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144685
34983	NC_015581	TTTA	2	8	1844075	1844082	25 %	75 %	0 %	0 %	334144685
34984	NC_015581	CAC	2	6	1844345	1844350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144685
34985	NC_015581	T	7	7	1844351	1844357	0 %	100 %	0 %	0 %	334144685
34986	NC_015581	AC	3	6	1844359	1844364	50 %	0 %	0 %	50 %	334144685
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34988	NC_015581	GCTG	3	12	1844594	1844605	0 %	25 %	50 %	25 %	334144685
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34991	NC_015581	TTGC	2	8	1844714	1844721	0 %	50 %	25 %	25 %	334144685
34992	NC_015581	TTG	2	6	1844765	1844770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144685
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34996	NC_015581	ATC	3	9	1844966	1844974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144685
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34999	NC_015581	TCT	2	6	1845066	1845071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144685
35000	NC_015581	TGA	2	6	1845084	1845089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144685

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