MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015581	GAT	2	6	156067	156072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143258
3002	NC_015581	CAAGC	2	10	156103	156112	40 %	0 %	20 %	40 %	334143258
3003	NC_015581	T	6	6	156178	156183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_015581	AAGC	2	8	156278	156285	50 %	0 %	25 %	25 %	334143259
3005	NC_015581	GCC	2	6	156351	156356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143259
3006	NC_015581	AC	3	6	156368	156373	50 %	0 %	0 %	50 %	334143259
3007	NC_015581	CAA	2	6	156423	156428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143259
3008	NC_015581	GCTC	2	8	156496	156503	0 %	25 %	25 %	50 %	334143259
3009	NC_015581	TCAG	2	8	156547	156554	25 %	25 %	25 %	25 %	334143259
3010	NC_015581	CAG	2	6	156561	156566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143259
3011	NC_015581	CAG	2	6	156657	156662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143259
3012	NC_015581	T	6	6	156744	156749	0 %	100 %	0 %	0 %	334143259
3013	NC_015581	AGCC	2	8	156876	156883	25 %	0 %	25 %	50 %	334143259
3014	NC_015581	GGGC	2	8	156884	156891	0 %	0 %	75 %	25 %	334143259
3015	NC_015581	AGC	2	6	156904	156909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143259
3016	NC_015581	T	6	6	156920	156925	0 %	100 %	0 %	0 %	334143259
3017	NC_015581	GCG	2	6	157065	157070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143259
3018	NC_015581	TGT	2	6	157170	157175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143259
3019	NC_015581	GTT	2	6	157193	157198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143259
3020	NC_015581	TGG	2	6	157264	157269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143259
3021	NC_015581	GGCT	2	8	157299	157306	0 %	25 %	50 %	25 %	334143259
3022	NC_015581	TGA	2	6	157330	157335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143259
3023	NC_015581	ATT	2	6	157423	157428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143259
3024	NC_015581	CAC	2	6	157451	157456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143259
3025	NC_015581	AATGC	2	10	157464	157473	40 %	20 %	20 %	20 %	334143259
3026	NC_015581	TTA	2	6	157525	157530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143259
3027	NC_015581	GTG	2	6	157535	157540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143259
3028	NC_015581	GCG	2	6	157563	157568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143259
3029	NC_015581	TTG	2	6	157651	157656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143259
3030	NC_015581	GGC	2	6	157667	157672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143259
3031	NC_015581	GC	3	6	157671	157676	0 %	0 %	50 %	50 %	334143259
3032	NC_015581	CAA	2	6	157686	157691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143259
3033	NC_015581	AGC	2	6	157708	157713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143259
3034	NC_015581	A	7	7	157791	157797	100 %	0 %	0 %	0 %	334143259
3035	NC_015581	CCA	2	6	157798	157803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143259
3036	NC_015581	ATC	2	6	157816	157821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143259
3037	NC_015581	GTTT	2	8	157831	157838	0 %	75 %	25 %	0 %	334143259
3038	NC_015581	A	6	6	157853	157858	100 %	0 %	0 %	0 %	334143260
3039	NC_015581	GT	3	6	157887	157892	0 %	50 %	50 %	0 %	334143260
3040	NC_015581	TG	3	6	157904	157909	0 %	50 %	50 %	0 %	334143260
3041	NC_015581	A	6	6	157913	157918	100 %	0 %	0 %	0 %	334143260
3042	NC_015581	CGG	2	6	157965	157970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143260
3043	NC_015581	TGG	3	9	158006	158014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143261
3044	NC_015581	AAC	2	6	158129	158134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143261
3045	NC_015581	AGC	2	6	158174	158179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143261
3046	NC_015581	AGTTG	2	10	158286	158295	20 %	40 %	40 %	0 %	334143261
3047	NC_015581	GCA	2	6	158322	158327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143261
3048	NC_015581	CTGG	2	8	158415	158422	0 %	25 %	50 %	25 %	334143261
3049	NC_015581	A	7	7	158430	158436	100 %	0 %	0 %	0 %	334143261
3050	NC_015581	A	6	6	158509	158514	100 %	0 %	0 %	0 %	334143261
3051	NC_015581	CGG	2	6	158520	158525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143261
3052	NC_015581	ATG	2	6	158537	158542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143261
3053	NC_015581	AGG	2	6	158624	158629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334143261
3054	NC_015581	TTGG	2	8	158684	158691	0 %	50 %	50 %	0 %	334143261
3055	NC_015581	GAC	2	6	158725	158730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143261
3056	NC_015581	TTA	2	6	158809	158814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143261
3057	NC_015581	GCT	2	6	158835	158840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143261
3058	NC_015581	GCC	3	9	158860	158868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143261
3059	NC_015581	AGCA	2	8	158870	158877	50 %	0 %	25 %	25 %	334143261
3060	NC_015581	CAA	2	6	158881	158886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143261
3061	NC_015581	CAG	2	6	159010	159015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143261
3062	NC_015581	CTG	2	6	159142	159147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143261
3063	NC_015581	AAG	2	6	159347	159352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334143261
3064	NC_015581	CAG	2	6	159361	159366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143261
3065	NC_015581	ACC	2	6	159379	159384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143261
3066	NC_015581	A	6	6	159500	159505	100 %	0 %	0 %	0 %	334143261
3067	NC_015581	ATT	2	6	159642	159647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_015581	TGA	2	6	159693	159698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_015581	T	6	6	159780	159785	0 %	100 %	0 %	0 %	334143262
3070	NC_015581	TGT	2	6	159933	159938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143262
3071	NC_015581	T	7	7	159984	159990	0 %	100 %	0 %	0 %	334143262
3072	NC_015581	TTGT	2	8	160002	160009	0 %	75 %	25 %	0 %	334143262
3073	NC_015581	ATG	2	6	160031	160036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143262
3074	NC_015581	GC	3	6	160045	160050	0 %	0 %	50 %	50 %	334143262
3075	NC_015581	GGGTGC	2	12	160057	160068	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	334143262
3076	NC_015581	GT	3	6	160092	160097	0 %	50 %	50 %	0 %	334143262
3077	NC_015581	T	6	6	160224	160229	0 %	100 %	0 %	0 %	334143262
3078	NC_015581	AAC	2	6	160296	160301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143262
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3080	NC_015581	CATT	2	8	160431	160438	25 %	50 %	0 %	25 %	334143262
3081	NC_015581	GA	3	6	160441	160446	50 %	0 %	50 %	0 %	334143262
3082	NC_015581	GGT	2	6	160451	160456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143262
3083	NC_015581	ATT	2	6	160529	160534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143262
3084	NC_015581	GAT	2	6	160561	160566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143262
3085	NC_015581	TTG	2	6	160569	160574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143262
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3087	NC_015581	TGT	2	6	160638	160643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143262
3088	NC_015581	TTGTT	2	10	160644	160653	0 %	80 %	20 %	0 %	334143262
3089	NC_015581	ATT	3	9	160654	160662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143262
3090	NC_015581	A	6	6	160730	160735	100 %	0 %	0 %	0 %	334143262
3091	NC_015581	CGGT	2	8	160794	160801	0 %	25 %	50 %	25 %	334143262
3092	NC_015581	TTC	2	6	160808	160813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334143262
3093	NC_015581	CTTATT	2	12	160834	160845	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	334143262
3094	NC_015581	ATT	2	6	160862	160867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143262
3095	NC_015581	GCA	2	6	160880	160885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143262
3096	NC_015581	CGT	2	6	160956	160961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143262
3097	NC_015581	ATG	2	6	160983	160988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143262
3098	NC_015581	GT	3	6	160989	160994	0 %	50 %	50 %	0 %	334143262
3099	NC_015581	CGT	2	6	161002	161007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143262
3100	NC_015581	AAC	2	6	161019	161024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143262
3101	NC_015581	AAGC	2	8	161084	161091	50 %	0 %	25 %	25 %	334143262
3102	NC_015581	TAG	2	6	161137	161142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143263
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3104	NC_015581	GAAC	2	8	161256	161263	50 %	0 %	25 %	25 %	334143263
3105	NC_015581	CAA	2	6	161310	161315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334143263
3106	NC_015581	GTG	2	6	161428	161433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143263
3107	NC_015581	GGT	2	6	161454	161459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334143263
3108	NC_015581	GTCA	2	8	161473	161480	25 %	25 %	25 %	25 %	334143263
3109	NC_015581	TGC	2	6	161534	161539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143263
3110	NC_015581	GCT	2	6	161556	161561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143263
3111	NC_015581	AGC	2	6	161620	161625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143263
3112	NC_015581	CAG	2	6	161626	161631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143263
3113	NC_015581	TGA	3	9	161666	161674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143263
3114	NC_015581	TTG	2	6	161763	161768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143264
3115	NC_015581	GCGA	2	8	161774	161781	25 %	0 %	50 %	25 %	334143264
3116	NC_015581	GCA	2	6	161791	161796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143264
3117	NC_015581	GCTTG	2	10	161810	161819	0 %	40 %	40 %	20 %	334143264
3118	NC_015581	AAT	2	6	161865	161870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334143264
3119	NC_015581	GGC	2	6	161928	161933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143264
3120	NC_015581	TTG	2	6	161949	161954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143264
3121	NC_015581	GGTAG	2	10	161971	161980	20 %	20 %	60 %	0 %	334143264
3122	NC_015581	ATC	2	6	161997	162002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143264
3123	NC_015581	GCC	2	6	162022	162027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334143264
3124	NC_015581	CAT	2	6	162050	162055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143264
3125	NC_015581	GAC	2	6	162083	162088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143264
3126	NC_015581	T	6	6	162119	162124	0 %	100 %	0 %	0 %	334143264
3127	NC_015581	GCG	2	6	162148	162153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143264
3128	NC_015581	GCA	2	6	162239	162244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143264
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3130	NC_015581	ATT	2	6	162289	162294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334143264
3131	NC_015581	CAT	2	6	162315	162320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143264
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3133	NC_015581	CCAA	2	8	162349	162356	50 %	0 %	0 %	50 %	334143264
3134	NC_015581	ACG	2	6	162402	162407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334143264
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3136	NC_015581	TCA	2	6	162430	162435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143264
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3138	NC_015581	GAT	2	6	162485	162490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143264
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3143	NC_015581	GTC	2	6	162645	162650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143264
3144	NC_015581	TTA	2	6	162727	162732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_015581	T	7	7	162743	162749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_015581	GC	3	6	162820	162825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3147	NC_015581	ATT	2	6	162850	162855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_015581	TA	3	6	162877	162882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_015581	TAT	2	6	162896	162901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3152	NC_015581	TGC	2	6	163155	163160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334143265
3153	NC_015581	A	6	6	163186	163191	100 %	0 %	0 %	0 %	334143265
3154	NC_015581	ATC	2	6	163198	163203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143265
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3156	NC_015581	ATT	2	6	163301	163306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_015581	AGTTA	2	10	163332	163341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3165	NC_015581	ATG	2	6	163694	163699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3201	NC_015581	AGTC	2	8	165379	165386	25 %	25 %	25 %	25 %	334143268
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3233	NC_015581	GAT	2	6	167108	167113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143269
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3237	NC_015581	TCTGAA	2	12	167246	167257	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	334143269
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3241	NC_015581	ACC	2	6	167347	167352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334143270
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3245	NC_015581	TTG	2	6	167665	167670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334143270
3246	NC_015581	GCG	2	6	167678	167683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334143270
3247	NC_015581	TCA	2	6	167708	167713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334143270
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3250	NC_015581	GTA	2	6	167917	167922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334143270
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