MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_015581	AAC	2	6	1790156	1790161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144626
34003	NC_015581	TATT	2	8	1790171	1790178	25 %	75 %	0 %	0 %	334144626
34004	NC_015581	TCT	2	6	1790179	1790184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144626
34005	NC_015581	TTGC	2	8	1790192	1790199	0 %	50 %	25 %	25 %	334144626
34006	NC_015581	ACT	2	6	1790253	1790258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144626
34007	NC_015581	CGC	2	6	1790337	1790342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144626
34008	NC_015581	GGCT	2	8	1790352	1790359	0 %	25 %	50 %	25 %	334144626
34009	NC_015581	TGG	2	6	1790461	1790466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144626
34010	NC_015581	TTA	2	6	1790545	1790550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144626
34011	NC_015581	GGT	2	6	1790596	1790601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144626
34012	NC_015581	ATT	2	6	1790634	1790639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144626
34013	NC_015581	A	7	7	1790652	1790658	100 %	0 %	0 %	0 %	334144626
34014	NC_015581	TCA	2	6	1790733	1790738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144626
34015	NC_015581	T	6	6	1790743	1790748	0 %	100 %	0 %	0 %	334144626
34016	NC_015581	T	6	6	1790827	1790832	0 %	100 %	0 %	0 %	334144626
34017	NC_015581	GAT	2	6	1790857	1790862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144626
34018	NC_015581	T	6	6	1790909	1790914	0 %	100 %	0 %	0 %	334144626
34019	NC_015581	TGA	2	6	1790955	1790960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144626
34020	NC_015581	TGG	2	6	1790973	1790978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144626
34021	NC_015581	TGGA	2	8	1791059	1791066	25 %	25 %	50 %	0 %	334144626
34022	NC_015581	GGCT	2	8	1791085	1791092	0 %	25 %	50 %	25 %	334144626
34023	NC_015581	GAT	2	6	1791163	1791168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144626
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34026	NC_015581	TTA	2	6	1791243	1791248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144626
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34028	NC_015581	AAT	2	6	1791319	1791324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144626
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34030	NC_015581	TGA	2	6	1791384	1791389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144626
34031	NC_015581	GAC	2	6	1791409	1791414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144626
34032	NC_015581	TTGG	2	8	1791417	1791424	0 %	50 %	50 %	0 %	334144626
34033	NC_015581	T	6	6	1791463	1791468	0 %	100 %	0 %	0 %	334144626
34034	NC_015581	TAT	2	6	1791564	1791569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144626
34035	NC_015581	A	7	7	1791735	1791741	100 %	0 %	0 %	0 %	334144627
34036	NC_015581	A	6	6	1791802	1791807	100 %	0 %	0 %	0 %	334144627
34037	NC_015581	CATC	2	8	1791888	1791895	25 %	25 %	0 %	50 %	334144627
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34039	NC_015581	CAT	2	6	1791973	1791978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144627
34040	NC_015581	TAC	2	6	1791995	1792000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144627
34041	NC_015581	GC	3	6	1792200	1792205	0 %	0 %	50 %	50 %	334144627
34042	NC_015581	TTA	2	6	1792213	1792218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144627
34043	NC_015581	TGCG	2	8	1792250	1792257	0 %	25 %	50 %	25 %	334144627
34044	NC_015581	CTAGC	2	10	1792301	1792310	20 %	20 %	20 %	40 %	334144627
34045	NC_015581	TGGC	2	8	1792341	1792348	0 %	25 %	50 %	25 %	334144627
34046	NC_015581	CAA	2	6	1792445	1792450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144628
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34048	NC_015581	TTA	2	6	1792546	1792551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144628
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34051	NC_015581	AATG	2	8	1792645	1792652	50 %	25 %	25 %	0 %	334144628
34052	NC_015581	AAG	2	6	1792662	1792667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144628
34053	NC_015581	TGA	2	6	1792680	1792685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144628
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34055	NC_015581	T	6	6	1792829	1792834	0 %	100 %	0 %	0 %	334144628
34056	NC_015581	TCAC	2	8	1792856	1792863	25 %	25 %	0 %	50 %	334144628
34057	NC_015581	AGC	2	6	1792899	1792904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144628
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34060	NC_015581	GAA	2	6	1793042	1793047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144628
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34064	NC_015581	TGCAA	2	10	1793086	1793095	40 %	20 %	20 %	20 %	334144628
34065	NC_015581	ATT	2	6	1793132	1793137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144628
34066	NC_015581	GAT	2	6	1793153	1793158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144628
34067	NC_015581	TAG	2	6	1793276	1793281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144628
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34069	NC_015581	T	7	7	1793320	1793326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34070	NC_015581	CGA	2	6	1793354	1793359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144629
34071	NC_015581	TGA	3	9	1793361	1793369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144629
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34085	NC_015581	GTAA	2	8	1794246	1794253	50 %	25 %	25 %	0 %	334144630
34086	NC_015581	TGA	2	6	1794299	1794304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144630
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34089	NC_015581	TCCA	2	8	1794413	1794420	25 %	25 %	0 %	50 %	334144630
34090	NC_015581	CA	4	8	1794419	1794426	50 %	0 %	0 %	50 %	334144630
34091	NC_015581	TAAG	2	8	1794637	1794644	50 %	25 %	25 %	0 %	334144631
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34099	NC_015581	A	6	6	1794901	1794906	100 %	0 %	0 %	0 %	334144631
34100	NC_015581	ATC	2	6	1794947	1794952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144631
34101	NC_015581	ACC	2	6	1795022	1795027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144631
34102	NC_015581	CAT	2	6	1795064	1795069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144631
34103	NC_015581	GCA	2	6	1795158	1795163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144631
34104	NC_015581	TTG	2	6	1795247	1795252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144631
34105	NC_015581	CAT	2	6	1795284	1795289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144632
34106	NC_015581	ATGA	2	8	1795292	1795299	50 %	25 %	25 %	0 %	334144632
34107	NC_015581	TGA	3	9	1795297	1795305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144632
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34109	NC_015581	AC	3	6	1795400	1795405	50 %	0 %	0 %	50 %	334144632
34110	NC_015581	TTA	2	6	1795420	1795425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144632
34111	NC_015581	CTT	2	6	1795431	1795436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144632
34112	NC_015581	ATG	2	6	1795453	1795458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144632
34113	NC_015581	GCT	2	6	1795466	1795471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144632
34114	NC_015581	AAT	2	6	1795497	1795502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144632
34115	NC_015581	TCA	2	6	1795555	1795560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144632
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34117	NC_015581	GAC	2	6	1795694	1795699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144632
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34233	NC_015581	ATC	2	6	1802375	1802380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144643
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34348	NC_015581	TGCT	2	8	1808723	1808730	0 %	50 %	25 %	25 %	334144649
34349	NC_015581	ACC	2	6	1808810	1808815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144649
34350	NC_015581	CTG	2	6	1808896	1808901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144649
34351	NC_015581	CAA	2	6	1809084	1809089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34352	NC_015581	A	7	7	1809138	1809144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34353	NC_015581	TAA	2	6	1809152	1809157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34354	NC_015581	A	9	9	1809156	1809164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34355	NC_015581	A	6	6	1809168	1809173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34362	NC_015581	T	7	7	1809548	1809554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34363	NC_015581	AT	3	6	1809566	1809571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34463	NC_015581	GCG	2	6	1815647	1815652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144656
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34472	NC_015581	GCT	2	6	1816149	1816154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144657
34473	NC_015581	TAA	2	6	1816188	1816193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144657
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34479	NC_015581	TAA	2	6	1816669	1816674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144657
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34498	NC_015581	A	6	6	1817791	1817796	100 %	0 %	0 %	0 %	334144658
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34500	NC_015581	ATG	2	6	1817829	1817834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144658

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