MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_015581	ACCA	2	8	1763718	1763725	50 %	0 %	0 %	50 %	334144597
33502	NC_015581	GGC	2	6	1763741	1763746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144597
33503	NC_015581	GCA	2	6	1763934	1763939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144597
33504	NC_015581	CTT	2	6	1763967	1763972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144597
33505	NC_015581	CGC	2	6	1763977	1763982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144597
33506	NC_015581	CAAC	2	8	1764007	1764014	50 %	0 %	0 %	50 %	334144597
33507	NC_015581	ACG	2	6	1764026	1764031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144597
33508	NC_015581	ACCG	2	8	1764078	1764085	25 %	0 %	25 %	50 %	334144597
33509	NC_015581	TCT	2	6	1764092	1764097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144597
33510	NC_015581	CAT	2	6	1764105	1764110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144597
33511	NC_015581	CAT	2	6	1764124	1764129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144597
33512	NC_015581	TAG	2	6	1764155	1764160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144597
33513	NC_015581	A	7	7	1764172	1764178	100 %	0 %	0 %	0 %	334144597
33514	NC_015581	TTGC	2	8	1764216	1764223	0 %	50 %	25 %	25 %	334144597
33515	NC_015581	AAAAC	2	10	1764282	1764291	80 %	0 %	0 %	20 %	334144597
33516	NC_015581	ATGA	2	8	1764354	1764361	50 %	25 %	25 %	0 %	334144598
33517	NC_015581	CAC	2	6	1764396	1764401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144598
33518	NC_015581	AAC	2	6	1764418	1764423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144598
33519	NC_015581	CAA	2	6	1764431	1764436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144598
33520	NC_015581	CACCCG	2	12	1764437	1764448	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	334144598
33521	NC_015581	AACT	2	8	1764546	1764553	50 %	25 %	0 %	25 %	334144598
33522	NC_015581	CTG	2	6	1764579	1764584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144598
33523	NC_015581	ACC	2	6	1764699	1764704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144598
33524	NC_015581	T	6	6	1764711	1764716	0 %	100 %	0 %	0 %	334144598
33525	NC_015581	TGA	3	9	1764828	1764836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33526	NC_015581	CAT	3	9	1764897	1764905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144599
33527	NC_015581	CTGT	2	8	1764908	1764915	0 %	50 %	25 %	25 %	334144599
33528	NC_015581	CGG	2	6	1764920	1764925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144599
33529	NC_015581	TGT	3	9	1765093	1765101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144599
33530	NC_015581	AACT	2	8	1765143	1765150	50 %	25 %	0 %	25 %	334144599
33531	NC_015581	ATG	2	6	1765165	1765170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144599
33532	NC_015581	CTTGC	2	10	1765244	1765253	0 %	40 %	20 %	40 %	334144599
33533	NC_015581	CGC	2	6	1765278	1765283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144599
33534	NC_015581	ATA	2	6	1765318	1765323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144599
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33538	NC_015581	TGT	2	6	1765639	1765644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144599
33539	NC_015581	GGC	2	6	1765716	1765721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144599
33540	NC_015581	CAAG	2	8	1765727	1765734	50 %	0 %	25 %	25 %	334144599
33541	NC_015581	CAA	2	6	1765755	1765760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144599
33542	NC_015581	CAC	2	6	1765820	1765825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144599
33543	NC_015581	CAT	2	6	1765862	1765867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144599
33544	NC_015581	GGTC	2	8	1766000	1766007	0 %	25 %	50 %	25 %	334144599
33545	NC_015581	TAA	2	6	1766032	1766037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33546	NC_015581	AAAT	2	8	1766039	1766046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33547	NC_015581	ACT	2	6	1766068	1766073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33548	NC_015581	GTC	2	6	1766129	1766134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144600
33549	NC_015581	ATGA	2	8	1766146	1766153	50 %	25 %	25 %	0 %	334144600
33550	NC_015581	GAT	2	6	1766173	1766178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144600
33551	NC_015581	GAA	2	6	1766338	1766343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144600
33552	NC_015581	GAT	2	6	1766446	1766451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144600
33553	NC_015581	TAC	2	6	1766540	1766545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144600
33554	NC_015581	AGGAC	2	10	1766577	1766586	40 %	0 %	40 %	20 %	334144600
33555	NC_015581	GTT	2	6	1766670	1766675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144601
33556	NC_015581	GACC	2	8	1766694	1766701	25 %	0 %	25 %	50 %	334144601
33557	NC_015581	TAG	2	6	1766842	1766847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144601
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33559	NC_015581	CCA	2	6	1766868	1766873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144601
33560	NC_015581	GTT	2	6	1766899	1766904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144601
33561	NC_015581	TGC	2	6	1766966	1766971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144601
33562	NC_015581	TGA	2	6	1767065	1767070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144601
33563	NC_015581	GAT	2	6	1767168	1767173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144601
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33565	NC_015581	GAG	2	6	1767240	1767245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144601
33566	NC_015581	CTG	2	6	1767318	1767323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144601
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33569	NC_015581	A	7	7	1767458	1767464	100 %	0 %	0 %	0 %	334144601
33570	NC_015581	CTG	2	6	1767501	1767506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144601
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33573	NC_015581	GACT	2	8	1767681	1767688	25 %	25 %	25 %	25 %	334144602
33574	NC_015581	TGCT	2	8	1767701	1767708	0 %	50 %	25 %	25 %	334144602
33575	NC_015581	GC	3	6	1767721	1767726	0 %	0 %	50 %	50 %	334144602
33576	NC_015581	AAGATG	2	12	1767729	1767740	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	334144602
33577	NC_015581	A	7	7	1767838	1767844	100 %	0 %	0 %	0 %	334144602
33578	NC_015581	CGC	2	6	1767878	1767883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144602
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33582	NC_015581	CCCA	2	8	1768052	1768059	25 %	0 %	0 %	75 %	334144602
33583	NC_015581	ACG	2	6	1768112	1768117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144602
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33585	NC_015581	CAA	2	6	1768220	1768225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144602
33586	NC_015581	GCC	2	6	1768226	1768231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144602
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33588	NC_015581	ACC	2	6	1768295	1768300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144602
33589	NC_015581	GCC	2	6	1768418	1768423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144602
33590	NC_015581	TGG	2	6	1768445	1768450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144602
33591	NC_015581	TTA	2	6	1768475	1768480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144602
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33598	NC_015581	GATT	2	8	1769087	1769094	25 %	50 %	25 %	0 %	334144603
33599	NC_015581	GCAATG	2	12	1769152	1769163	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	334144603
33600	NC_015581	TTG	2	6	1769226	1769231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144603
33601	NC_015581	GGACT	2	10	1769253	1769262	20 %	20 %	40 %	20 %	334144603
33602	NC_015581	CAA	2	6	1769412	1769417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144604
33603	NC_015581	T	6	6	1769418	1769423	0 %	100 %	0 %	0 %	334144604
33604	NC_015581	TTAT	2	8	1769486	1769493	25 %	75 %	0 %	0 %	334144604
33605	NC_015581	TTA	2	6	1769519	1769524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144604
33606	NC_015581	CTTGC	2	10	1769526	1769535	0 %	40 %	20 %	40 %	334144604
33607	NC_015581	CAA	2	6	1769604	1769609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144604
33608	NC_015581	GGCGA	2	10	1769614	1769623	20 %	0 %	60 %	20 %	334144604
33609	NC_015581	TAT	2	6	1769684	1769689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144604
33610	NC_015581	ATTTT	3	15	1769691	1769705	20 %	80 %	0 %	0 %	334144604
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33612	NC_015581	CG	3	6	1769812	1769817	0 %	0 %	50 %	50 %	334144604
33613	NC_015581	GAG	2	6	1769844	1769849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334144604
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33615	NC_015581	AAT	2	6	1770066	1770071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144604
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