MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalimicrobium cyclicum ALM1 chromosome

Total Repeats: 36691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33104	NC_015581	GAA	2	6	1742628	1742633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33105	NC_015581	ATC	2	6	1742635	1742640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33109	NC_015581	TTC	2	6	1742938	1742943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33110	NC_015581	A	6	6	1743030	1743035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33111	NC_015581	CAT	2	6	1743218	1743223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33113	NC_015581	ACCAG	2	10	1743327	1743336	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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33243	NC_015581	GCGT	2	8	1750265	1750272	0 %	25 %	50 %	25 %	334144585
33244	NC_015581	CAGA	2	8	1750307	1750314	50 %	0 %	25 %	25 %	334144586
33245	NC_015581	TTA	2	6	1750348	1750353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144586
33246	NC_015581	AAT	2	6	1750370	1750375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144586
33247	NC_015581	A	6	6	1750401	1750406	100 %	0 %	0 %	0 %	334144586
33248	NC_015581	GAT	2	6	1750442	1750447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144586
33249	NC_015581	A	7	7	1750482	1750488	100 %	0 %	0 %	0 %	334144586
33250	NC_015581	CCAA	2	8	1750530	1750537	50 %	0 %	0 %	50 %	334144586
33251	NC_015581	ATC	2	6	1750551	1750556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144586
33252	NC_015581	AAT	2	6	1750730	1750735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144586
33253	NC_015581	CTG	2	6	1750742	1750747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144586
33254	NC_015581	A	6	6	1750818	1750823	100 %	0 %	0 %	0 %	334144586
33255	NC_015581	CGG	2	6	1750846	1750851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144586
33256	NC_015581	GGCG	2	8	1751010	1751017	0 %	0 %	75 %	25 %	334144586
33257	NC_015581	ACTTG	2	10	1751028	1751037	20 %	40 %	20 %	20 %	334144586
33258	NC_015581	CTG	2	6	1751048	1751053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144586
33259	NC_015581	GGT	2	6	1751057	1751062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144586
33260	NC_015581	CCATCG	2	12	1751073	1751084	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334144586
33261	NC_015581	TGG	2	6	1751131	1751136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144586
33262	NC_015581	GCG	2	6	1751229	1751234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144586
33263	NC_015581	GACT	2	8	1751259	1751266	25 %	25 %	25 %	25 %	334144586
33264	NC_015581	ATC	2	6	1751318	1751323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144586
33265	NC_015581	AAT	2	6	1751420	1751425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144586
33266	NC_015581	TTG	2	6	1751438	1751443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144586
33267	NC_015581	T	6	6	1751473	1751478	0 %	100 %	0 %	0 %	334144587
33268	NC_015581	T	8	8	1751517	1751524	0 %	100 %	0 %	0 %	334144587
33269	NC_015581	T	6	6	1751569	1751574	0 %	100 %	0 %	0 %	334144587
33270	NC_015581	GGC	2	6	1751605	1751610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144587
33271	NC_015581	GCC	2	6	1751627	1751632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144587
33272	NC_015581	TAG	2	6	1751672	1751677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144587
33273	NC_015581	AAG	2	6	1751692	1751697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144587
33274	NC_015581	T	6	6	1751698	1751703	0 %	100 %	0 %	0 %	334144587
33275	NC_015581	TTG	2	6	1751710	1751715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144587
33276	NC_015581	TTG	2	6	1751725	1751730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144587
33277	NC_015581	ATT	2	6	1751800	1751805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	334144587
33278	NC_015581	CAT	2	6	1751914	1751919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144587
33279	NC_015581	TGAT	2	8	1751965	1751972	25 %	50 %	25 %	0 %	334144587
33280	NC_015581	CAGG	2	8	1752371	1752378	25 %	0 %	50 %	25 %	334144588
33281	NC_015581	AAG	2	6	1752408	1752413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144588
33282	NC_015581	AGT	2	6	1752509	1752514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144588
33283	NC_015581	A	6	6	1752540	1752545	100 %	0 %	0 %	0 %	334144588
33284	NC_015581	GCTC	2	8	1752582	1752589	0 %	25 %	25 %	50 %	334144588
33285	NC_015581	CAA	2	6	1752599	1752604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144588
33286	NC_015581	CTT	2	6	1752626	1752631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144588
33287	NC_015581	TGT	2	6	1752643	1752648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334144588
33288	NC_015581	TAGGT	2	10	1752654	1752663	20 %	40 %	40 %	0 %	334144588
33289	NC_015581	ATC	2	6	1752780	1752785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144588
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33291	NC_015581	ATG	2	6	1752822	1752827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144588
33292	NC_015581	T	6	6	1752885	1752890	0 %	100 %	0 %	0 %	334144588
33293	NC_015581	T	7	7	1752927	1752933	0 %	100 %	0 %	0 %	334144588
33294	NC_015581	TGC	2	6	1752994	1752999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144588
33295	NC_015581	TCA	2	6	1753109	1753114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144588
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33297	NC_015581	AATC	2	8	1753191	1753198	50 %	25 %	0 %	25 %	334144588
33298	NC_015581	TGG	2	6	1753208	1753213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334144588
33299	NC_015581	CCG	2	6	1753228	1753233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334144588
33300	NC_015581	AAT	2	6	1753268	1753273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144588
33301	NC_015581	GAC	2	6	1753286	1753291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144588
33302	NC_015581	T	7	7	1753413	1753419	0 %	100 %	0 %	0 %	334144588
33303	NC_015581	TCC	2	6	1753489	1753494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334144588
33304	NC_015581	CAA	2	6	1753559	1753564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144588
33305	NC_015581	TTC	2	6	1753608	1753613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144588
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33307	NC_015581	CAT	2	6	1753649	1753654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144588
33308	NC_015581	TGC	2	6	1753752	1753757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144588
33309	NC_015581	ACC	3	9	1753773	1753781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144588
33310	NC_015581	TGA	2	6	1753851	1753856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144589
33311	NC_015581	CAA	2	6	1753933	1753938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144589
33312	NC_015581	GCT	2	6	1754009	1754014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144589
33313	NC_015581	ATC	2	6	1754045	1754050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144589
33314	NC_015581	CAAAG	2	10	1754066	1754075	60 %	0 %	20 %	20 %	334144589
33315	NC_015581	CTTGC	2	10	1754086	1754095	0 %	40 %	20 %	40 %	334144589
33316	NC_015581	ACCTG	2	10	1754235	1754244	20 %	20 %	20 %	40 %	334144589
33317	NC_015581	GCTGT	2	10	1754251	1754260	0 %	40 %	40 %	20 %	334144589
33318	NC_015581	TGC	2	6	1754274	1754279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144589
33319	NC_015581	GGC	2	6	1754324	1754329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144589
33320	NC_015581	ACA	2	6	1754332	1754337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144589
33321	NC_015581	CA	3	6	1754350	1754355	50 %	0 %	0 %	50 %	334144589
33322	NC_015581	CAT	2	6	1754359	1754364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144589
33323	NC_015581	ACG	2	6	1754399	1754404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144589
33324	NC_015581	ATC	2	6	1754426	1754431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144589
33325	NC_015581	GAA	2	6	1754434	1754439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334144589
33326	NC_015581	GCA	2	6	1754469	1754474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144589
33327	NC_015581	AAT	2	6	1754574	1754579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144589
33328	NC_015581	CCT	2	6	1754697	1754702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33329	NC_015581	ACT	2	6	1754830	1754835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334144590
33330	NC_015581	CAA	2	6	1754840	1754845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144590
33331	NC_015581	ACC	2	6	1754889	1754894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144590
33332	NC_015581	AAC	2	6	1754925	1754930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144590
33333	NC_015581	GGAAT	2	10	1755053	1755062	40 %	20 %	40 %	0 %	334144590
33334	NC_015581	GC	3	6	1755071	1755076	0 %	0 %	50 %	50 %	334144590
33335	NC_015581	CCA	2	6	1755103	1755108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144590
33336	NC_015581	TGC	2	6	1755144	1755149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144590
33337	NC_015581	CAC	2	6	1755152	1755157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144590
33338	NC_015581	TCAA	2	8	1755217	1755224	50 %	25 %	0 %	25 %	334144590
33339	NC_015581	AAC	2	6	1755294	1755299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144590
33340	NC_015581	AAT	2	6	1755347	1755352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	334144590
33341	NC_015581	AAC	3	9	1755384	1755392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	334144590
33342	NC_015581	A	6	6	1755454	1755459	100 %	0 %	0 %	0 %	334144590
33343	NC_015581	ATC	2	6	1755534	1755539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33344	NC_015581	TTTATA	2	12	1755551	1755562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33345	NC_015581	ACC	2	6	1755587	1755592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33346	NC_015581	AGA	2	6	1755619	1755624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33347	NC_015581	A	6	6	1755635	1755640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33348	NC_015581	TTA	2	6	1755652	1755657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33349	NC_015581	TTTTG	2	10	1755671	1755680	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33350	NC_015581	TTA	2	6	1755691	1755696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33351	NC_015581	GAG	2	6	1755715	1755720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33352	NC_015581	A	6	6	1755730	1755735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33353	NC_015581	GTAAA	2	10	1755839	1755848	60 %	20 %	20 %	0 %	334144591
33354	NC_015581	AC	3	6	1755855	1755860	50 %	0 %	0 %	50 %	334144591
33355	NC_015581	AACC	2	8	1755980	1755987	50 %	0 %	0 %	50 %	334144591
33356	NC_015581	CCA	2	6	1756108	1756113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334144591
33357	NC_015581	CTG	2	6	1756171	1756176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144591
33358	NC_015581	A	6	6	1756184	1756189	100 %	0 %	0 %	0 %	334144591
33359	NC_015581	CGT	2	6	1756198	1756203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144591
33360	NC_015581	ATG	2	6	1756206	1756211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144591
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33478	NC_015581	GCTT	2	8	1762267	1762274	0 %	50 %	25 %	25 %	334144596
33479	NC_015581	CGA	2	6	1762285	1762290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144596
33480	NC_015581	TGA	2	6	1762322	1762327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334144596
33481	NC_015581	GTTT	2	8	1762429	1762436	0 %	75 %	25 %	0 %	334144596
33482	NC_015581	CTT	2	6	1762463	1762468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	334144596
33483	NC_015581	CGG	2	6	1762491	1762496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334144596
33484	NC_015581	AGC	2	6	1762599	1762604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334144596
33485	NC_015581	CGCTCA	2	12	1762711	1762722	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334144596
33486	NC_015581	ACTG	2	8	1762741	1762748	25 %	25 %	25 %	25 %	334144596
33487	NC_015581	T	7	7	1762778	1762784	0 %	100 %	0 %	0 %	334144596
33488	NC_015581	CTG	2	6	1762839	1762844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334144596
33489	NC_015581	CCAA	2	8	1763012	1763019	50 %	0 %	0 %	50 %	334144596
33490	NC_015581	T	7	7	1763063	1763069	0 %	100 %	0 %	0 %	334144596
33491	NC_015581	GAAC	2	8	1763164	1763171	50 %	0 %	25 %	25 %	334144596
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33493	NC_015581	A	6	6	1763259	1763264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33494	NC_015581	CCAC	2	8	1763443	1763450	25 %	0 %	0 %	75 %	334144597
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33500	NC_015581	CG	3	6	1763707	1763712	0 %	0 %	50 %	50 %	334144597

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